MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 59860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_021514	CTT	2	6	2088666	2088671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841813
41002	NC_021514	ATG	3	9	2088683	2088691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841813
41003	NC_021514	TGCTT	2	10	2088758	2088767	0 %	60 %	20 %	20 %	513841813
41004	NC_021514	TAA	2	6	2088810	2088815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841813
41005	NC_021514	GTG	2	6	2088827	2088832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841813
41006	NC_021514	CTA	2	6	2088949	2088954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841813
41007	NC_021514	ATCA	2	8	2088970	2088977	50 %	25 %	0 %	25 %	513841813
41008	NC_021514	CTAA	2	8	2089057	2089064	50 %	25 %	0 %	25 %	513841813
41009	NC_021514	A	7	7	2089220	2089226	100 %	0 %	0 %	0 %	513841813
41010	NC_021514	CTG	2	6	2089275	2089280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41011	NC_021514	GGT	2	6	2089335	2089340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_021514	AT	3	6	2089354	2089359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41013	NC_021514	AAAC	2	8	2089396	2089403	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41014	NC_021514	AGG	2	6	2089415	2089420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41015	NC_021514	TTAAT	2	10	2089429	2089438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41016	NC_021514	ATA	2	6	2089492	2089497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41017	NC_021514	T	6	6	2089641	2089646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41018	NC_021514	ATAG	2	8	2089685	2089692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41019	NC_021514	CTGT	2	8	2089699	2089706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41020	NC_021514	TGT	2	6	2089756	2089761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841814
41021	NC_021514	GAT	2	6	2089884	2089889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841814
41022	NC_021514	AGA	2	6	2089903	2089908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841814
41023	NC_021514	AAC	2	6	2089988	2089993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841814
41024	NC_021514	GCG	2	6	2090015	2090020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841815
41025	NC_021514	CAAAT	2	10	2090036	2090045	60 %	20 %	0 %	20 %	513841815
41026	NC_021514	CTA	2	6	2090084	2090089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841815
41027	NC_021514	CGTC	2	8	2090198	2090205	0 %	25 %	25 %	50 %	513841815
41028	NC_021514	GGT	2	6	2090216	2090221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841815
41029	NC_021514	TGG	2	6	2090246	2090251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841815
41030	NC_021514	T	6	6	2090327	2090332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41031	NC_021514	TCA	2	6	2090386	2090391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841816
41032	NC_021514	TCG	2	6	2090422	2090427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841816
41033	NC_021514	TTC	2	6	2090445	2090450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841816
41034	NC_021514	CGA	2	6	2090515	2090520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841816
41035	NC_021514	TTG	2	6	2090554	2090559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841816
41036	NC_021514	GAA	2	6	2090590	2090595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841816
41037	NC_021514	TAG	2	6	2090659	2090664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841816
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41039	NC_021514	TCG	2	6	2090782	2090787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841816
41040	NC_021514	CTT	2	6	2090796	2090801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841816
41041	NC_021514	TCA	2	6	2090813	2090818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841816
41042	NC_021514	CAT	2	6	2090854	2090859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41043	NC_021514	CAA	2	6	2090860	2090865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41044	NC_021514	ATA	2	6	2090998	2091003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841817
41045	NC_021514	ATC	2	6	2091027	2091032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841817
41046	NC_021514	AC	3	6	2091119	2091124	50 %	0 %	0 %	50 %	513841817
41047	NC_021514	TGT	3	9	2091130	2091138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841817
41048	NC_021514	ACC	2	6	2091152	2091157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841817
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41050	NC_021514	CTT	2	6	2091200	2091205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841817
41051	NC_021514	AATTG	2	10	2091217	2091226	40 %	40 %	20 %	0 %	513841817
41052	NC_021514	TAC	2	6	2091239	2091244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841817
41053	NC_021514	TGAC	2	8	2091335	2091342	25 %	25 %	25 %	25 %	513841817
41054	NC_021514	GCA	2	6	2091352	2091357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841817
41055	NC_021514	CGA	2	6	2091370	2091375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841817
41056	NC_021514	AAGT	2	8	2091394	2091401	50 %	25 %	25 %	0 %	513841817
41057	NC_021514	CCG	2	6	2091454	2091459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841817
41058	NC_021514	GTA	2	6	2091576	2091581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841817
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41068	NC_021514	TTCC	2	8	2092056	2092063	0 %	50 %	0 %	50 %	513841817
41069	NC_021514	TGCT	2	8	2092152	2092159	0 %	50 %	25 %	25 %	513841817
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41082	NC_021514	AGC	2	6	2092761	2092766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841817
41083	NC_021514	CTC	2	6	2092858	2092863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41084	NC_021514	AAT	2	6	2092928	2092933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41116	NC_021514	TTG	2	6	2094407	2094412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841818
41117	NC_021514	AGC	2	6	2094459	2094464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841818
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41234	NC_021514	TAA	2	6	2099465	2099470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841827
41235	NC_021514	GAT	2	6	2099501	2099506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841827
41236	NC_021514	TCG	2	6	2099551	2099556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841827
41237	NC_021514	ACA	2	6	2099842	2099847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841827
41238	NC_021514	CTT	2	6	2099870	2099875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841827
41239	NC_021514	GTT	2	6	2099935	2099940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841827
41240	NC_021514	ATT	2	6	2100144	2100149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841828
41241	NC_021514	ATC	2	6	2100184	2100189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841828
41242	NC_021514	ACC	2	6	2100220	2100225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841828
41243	NC_021514	TCT	2	6	2100397	2100402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841828
41244	NC_021514	ACCATA	2	12	2100423	2100434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	513841828
41245	NC_021514	GCT	2	6	2100574	2100579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841828
41246	NC_021514	ATC	2	6	2100651	2100656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841828
41247	NC_021514	CTT	2	6	2100662	2100667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841828
41248	NC_021514	GC	3	6	2100795	2100800	0 %	0 %	50 %	50 %	513841828
41249	NC_021514	TGA	2	6	2100964	2100969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841828
41250	NC_021514	GTT	2	6	2100980	2100985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841828
41251	NC_021514	TGT	3	9	2101024	2101032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841828
41252	NC_021514	TCA	2	6	2101069	2101074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841828
41253	NC_021514	AAG	2	6	2101093	2101098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841828
41254	NC_021514	GTT	2	6	2101202	2101207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841828
41255	NC_021514	CATA	2	8	2101328	2101335	50 %	25 %	0 %	25 %	513841828
41256	NC_021514	TCA	3	9	2101348	2101356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841828
41257	NC_021514	ATG	2	6	2101377	2101382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841828
41258	NC_021514	AAT	2	6	2101438	2101443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841828
41259	NC_021514	TAA	2	6	2101502	2101507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841828
41260	NC_021514	GCC	2	6	2101572	2101577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841829
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41262	NC_021514	TGA	2	6	2101609	2101614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841829
41263	NC_021514	ACTG	2	8	2101619	2101626	25 %	25 %	25 %	25 %	513841829
41264	NC_021514	GCC	2	6	2101631	2101636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841829
41265	NC_021514	TGC	2	6	2101643	2101648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841829
41266	NC_021514	TTAA	2	8	2101674	2101681	50 %	50 %	0 %	0 %	513841829
41267	NC_021514	CGG	2	6	2101741	2101746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841829
41268	NC_021514	GC	3	6	2101815	2101820	0 %	0 %	50 %	50 %	513841829
41269	NC_021514	ACA	2	6	2101866	2101871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841829
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41271	NC_021514	CTT	2	6	2101997	2102002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841829
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41273	NC_021514	ATC	2	6	2102153	2102158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841829
41274	NC_021514	CTGA	2	8	2102189	2102196	25 %	25 %	25 %	25 %	513841829
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41280	NC_021514	TG	3	6	2102421	2102426	0 %	50 %	50 %	0 %	513841829
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41284	NC_021514	GCT	2	6	2102553	2102558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841829
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41286	NC_021514	TCT	2	6	2102602	2102607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841829
41287	NC_021514	TAC	2	6	2102701	2102706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841829
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41303	NC_021514	AT	3	6	2103528	2103533	50 %	50 %	0 %	0 %	513841829
41304	NC_021514	TTA	2	6	2103548	2103553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41305	NC_021514	TAA	2	6	2103583	2103588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41306	NC_021514	ATG	2	6	2103607	2103612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41308	NC_021514	ATC	2	6	2103661	2103666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41309	NC_021514	TAA	2	6	2103675	2103680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41310	NC_021514	T	6	6	2103744	2103749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41311	NC_021514	CAG	2	6	2103793	2103798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41312	NC_021514	CA	3	6	2103817	2103822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41313	NC_021514	ACTG	2	8	2103861	2103868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41314	NC_021514	CAG	2	6	2103923	2103928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41315	NC_021514	A	6	6	2103940	2103945	100 %	0 %	0 %	0 %	513841830
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41317	NC_021514	TCACT	2	10	2104050	2104059	20 %	40 %	0 %	40 %	513841830
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41319	NC_021514	CTC	2	6	2104132	2104137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41320	NC_021514	CA	3	6	2104146	2104151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41321	NC_021514	CATG	2	8	2104169	2104176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41322	NC_021514	TAT	2	6	2104204	2104209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41323	NC_021514	CTG	2	6	2104217	2104222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41324	NC_021514	CAA	2	6	2104383	2104388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41325	NC_021514	CGA	2	6	2104416	2104421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41326	NC_021514	AGC	2	6	2104480	2104485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41327	NC_021514	CAGC	2	8	2104490	2104497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41328	NC_021514	GTT	2	6	2104503	2104508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41329	NC_021514	CTT	2	6	2104575	2104580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841831
41330	NC_021514	TTC	2	6	2104587	2104592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841831
41331	NC_021514	TGT	2	6	2104622	2104627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841831
41332	NC_021514	GGTT	2	8	2104648	2104655	0 %	50 %	50 %	0 %	513841831
41333	NC_021514	AAG	2	6	2104705	2104710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841831
41334	NC_021514	ATA	2	6	2104792	2104797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841831
41335	NC_021514	TAG	2	6	2104898	2104903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841831
41336	NC_021514	ACG	2	6	2104938	2104943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841831
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41338	NC_021514	AT	3	6	2104954	2104959	50 %	50 %	0 %	0 %	513841831
41339	NC_021514	AGTC	2	8	2104976	2104983	25 %	25 %	25 %	25 %	513841831
41340	NC_021514	TGA	2	6	2104995	2105000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841831
41341	NC_021514	CCA	2	6	2105052	2105057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841831
41342	NC_021514	GTG	2	6	2105104	2105109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841831
41343	NC_021514	AGC	2	6	2105139	2105144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841831
41344	NC_021514	GCA	2	6	2105203	2105208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841831
41345	NC_021514	CGC	2	6	2105231	2105236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841831
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41347	NC_021514	CAT	2	6	2105294	2105299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841831
41348	NC_021514	CTT	2	6	2105336	2105341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841831
41349	NC_021514	AGC	2	6	2105391	2105396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841831
41350	NC_021514	TTC	2	6	2105397	2105402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841831
41351	NC_021514	CGT	2	6	2105457	2105462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841831
41352	NC_021514	ATG	2	6	2105479	2105484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841831
41353	NC_021514	TGA	2	6	2105598	2105603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841831
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41355	NC_021514	TCT	2	6	2105699	2105704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841831
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41369	NC_021514	TAAT	2	8	2106099	2106106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41370	NC_021514	T	6	6	2106106	2106111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41382	NC_021514	ATT	2	6	2107093	2107098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41383	NC_021514	T	7	7	2107181	2107187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41384	NC_021514	CA	3	6	2107210	2107215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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41458	NC_021514	CTAT	2	8	2111005	2111012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41459	NC_021514	AAC	2	6	2111052	2111057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41460	NC_021514	TAA	2	6	2111062	2111067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41463	NC_021514	CA	3	6	2111143	2111148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41464	NC_021514	CAT	2	6	2111220	2111225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41465	NC_021514	CGT	2	6	2111368	2111373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841836
41466	NC_021514	CCG	2	6	2111475	2111480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841836
41467	NC_021514	TTGTT	2	10	2111481	2111490	0 %	80 %	20 %	0 %	513841836
41468	NC_021514	ATC	2	6	2111495	2111500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841836
41469	NC_021514	ATC	2	6	2111522	2111527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841836
41470	NC_021514	AC	3	6	2111587	2111592	50 %	0 %	0 %	50 %	513841836
41471	NC_021514	ATC	2	6	2111648	2111653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841836
41472	NC_021514	CTT	2	6	2111725	2111730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841836
41473	NC_021514	CAT	2	6	2111736	2111741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841836
41474	NC_021514	CGC	2	6	2111755	2111760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841836
41475	NC_021514	GTT	2	6	2111762	2111767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841836
41476	NC_021514	TTC	2	6	2111797	2111802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841836
41477	NC_021514	CAA	2	6	2111856	2111861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841836
41478	NC_021514	CAA	2	6	2111901	2111906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841836
41479	NC_021514	TCT	2	6	2111937	2111942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841836
41480	NC_021514	TCGA	2	8	2111963	2111970	25 %	25 %	25 %	25 %	513841836
41481	NC_021514	CTT	2	6	2111982	2111987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841836
41482	NC_021514	TAA	2	6	2112030	2112035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841836
41483	NC_021514	TCG	2	6	2112086	2112091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841836
41484	NC_021514	ACCG	2	8	2112172	2112179	25 %	0 %	25 %	50 %	513841836
41485	NC_021514	CGG	2	6	2112252	2112257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841836
41486	NC_021514	ACC	2	6	2112319	2112324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841836
41487	NC_021514	CAAT	2	8	2112408	2112415	50 %	25 %	0 %	25 %	513841836
41488	NC_021514	TGA	2	6	2112444	2112449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841836
41489	NC_021514	CTT	2	6	2112465	2112470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841836
41490	NC_021514	T	6	6	2112528	2112533	0 %	100 %	0 %	0 %	513841836
41491	NC_021514	CCA	2	6	2112618	2112623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841836
41492	NC_021514	GCC	2	6	2112659	2112664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41493	NC_021514	CGC	2	6	2112748	2112753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841837
41494	NC_021514	GCC	2	6	2112758	2112763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841837
41495	NC_021514	CCG	2	6	2112792	2112797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841837
41496	NC_021514	CAT	2	6	2112802	2112807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841837
41497	NC_021514	TAA	2	6	2112921	2112926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841837
41498	NC_021514	CAT	2	6	2112958	2112963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841837
41499	NC_021514	TCATA	2	10	2112981	2112990	40 %	40 %	0 %	20 %	513841837
41500	NC_021514	TTC	2	6	2112998	2113003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841837

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