MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 59860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_021514	AAC	2	6	1731456	1731461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841460
34002	NC_021514	CAATT	2	10	1731535	1731544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34003	NC_021514	T	6	6	1731552	1731557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_021514	CCG	2	6	1731626	1731631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34005	NC_021514	A	6	6	1731731	1731736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_021514	TCA	3	9	1731738	1731746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34007	NC_021514	TCG	2	6	1731823	1731828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34008	NC_021514	ACC	2	6	1731857	1731862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34009	NC_021514	TTG	2	6	1731866	1731871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_021514	AAC	2	6	1731874	1731879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34011	NC_021514	GA	3	6	1731888	1731893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34012	NC_021514	TGG	2	6	1731954	1731959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34013	NC_021514	GCG	2	6	1731982	1731987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34014	NC_021514	TTA	2	6	1732036	1732041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34015	NC_021514	TGT	2	6	1732140	1732145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841461
34016	NC_021514	ATT	2	6	1732183	1732188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841461
34017	NC_021514	GGT	3	9	1732214	1732222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841461
34018	NC_021514	GC	3	6	1732322	1732327	0 %	0 %	50 %	50 %	513841461
34019	NC_021514	CAT	2	6	1732332	1732337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841461
34020	NC_021514	CG	3	6	1732427	1732432	0 %	0 %	50 %	50 %	513841461
34021	NC_021514	TGAA	2	8	1732449	1732456	50 %	25 %	25 %	0 %	513841461
34022	NC_021514	CCAA	2	8	1732544	1732551	50 %	0 %	0 %	50 %	513841461
34023	NC_021514	CAC	2	6	1732615	1732620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841461
34024	NC_021514	T	6	6	1732810	1732815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34025	NC_021514	TTG	2	6	1732824	1732829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841462
34026	NC_021514	GTT	2	6	1732844	1732849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841462
34027	NC_021514	ATC	2	6	1732884	1732889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841462
34028	NC_021514	ATC	2	6	1732908	1732913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841462
34029	NC_021514	TGA	2	6	1732930	1732935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841462
34030	NC_021514	CGA	3	9	1732972	1732980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841462
34031	NC_021514	AAT	2	6	1733077	1733082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841462
34032	NC_021514	TCAG	2	8	1733113	1733120	25 %	25 %	25 %	25 %	513841462
34033	NC_021514	GT	3	6	1733309	1733314	0 %	50 %	50 %	0 %	513841462
34034	NC_021514	AAT	2	6	1733363	1733368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841462
34035	NC_021514	CAC	2	6	1733522	1733527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841462
34036	NC_021514	GT	3	6	1733546	1733551	0 %	50 %	50 %	0 %	513841462
34037	NC_021514	CGC	2	6	1733646	1733651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841462
34038	NC_021514	CTT	2	6	1733660	1733665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841462
34039	NC_021514	CGA	2	6	1733759	1733764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841462
34040	NC_021514	TAA	2	6	1733766	1733771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841462
34041	NC_021514	GCA	2	6	1733812	1733817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841462
34042	NC_021514	AGC	2	6	1733820	1733825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841462
34043	NC_021514	CGG	2	6	1733847	1733852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841462
34044	NC_021514	ACCAAT	2	12	1733874	1733885	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	513841462
34045	NC_021514	TCC	2	6	1733994	1733999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34046	NC_021514	AGC	2	6	1734082	1734087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841463
34047	NC_021514	CAA	2	6	1734121	1734126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841463
34048	NC_021514	CGC	2	6	1734149	1734154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841463
34049	NC_021514	A	6	6	1734157	1734162	100 %	0 %	0 %	0 %	513841463
34050	NC_021514	TCA	2	6	1734168	1734173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841463
34051	NC_021514	CAT	2	6	1734275	1734280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841463
34052	NC_021514	ACT	2	6	1734305	1734310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841463
34053	NC_021514	GTG	2	6	1734370	1734375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841463
34054	NC_021514	ACC	2	6	1734420	1734425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34055	NC_021514	CGTT	2	8	1734427	1734434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34056	NC_021514	TAT	2	6	1734457	1734462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_021514	TTA	2	6	1734529	1734534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34058	NC_021514	TCA	2	6	1734593	1734598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841464
34059	NC_021514	CAA	2	6	1734666	1734671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841464
34060	NC_021514	CAA	2	6	1734818	1734823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841464
34061	NC_021514	AAT	2	6	1734963	1734968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841464
34062	NC_021514	AAT	2	6	1735099	1735104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34063	NC_021514	GTT	2	6	1735152	1735157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34064	NC_021514	T	7	7	1735156	1735162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34065	NC_021514	ACT	2	6	1735167	1735172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34066	NC_021514	TGG	2	6	1735232	1735237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34067	NC_021514	CAT	2	6	1735260	1735265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34068	NC_021514	CTTT	2	8	1735342	1735349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34069	NC_021514	TTG	2	6	1735433	1735438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841465
34070	NC_021514	ACT	2	6	1735531	1735536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841465
34071	NC_021514	ATG	2	6	1735553	1735558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841465
34072	NC_021514	GAC	2	6	1735567	1735572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841465
34073	NC_021514	TAC	2	6	1735583	1735588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841465
34074	NC_021514	CGC	2	6	1735599	1735604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841465
34075	NC_021514	TTA	2	6	1735663	1735668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841465
34076	NC_021514	AC	3	6	1735680	1735685	50 %	0 %	0 %	50 %	513841465
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34080	NC_021514	CCGCT	2	10	1736031	1736040	0 %	20 %	20 %	60 %	513841465
34081	NC_021514	AC	3	6	1736047	1736052	50 %	0 %	0 %	50 %	513841465
34082	NC_021514	ATT	2	6	1736075	1736080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841465
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34086	NC_021514	CGG	2	6	1736253	1736258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841465
34087	NC_021514	TCTG	2	8	1736270	1736277	0 %	50 %	25 %	25 %	513841465
34088	NC_021514	AAG	2	6	1736350	1736355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841465
34089	NC_021514	ATGGT	2	10	1736402	1736411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34090	NC_021514	ATGA	2	8	1736448	1736455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34091	NC_021514	ATT	3	9	1736457	1736465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34092	NC_021514	TGA	2	6	1736502	1736507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34093	NC_021514	ATA	2	6	1736513	1736518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_021514	ACC	2	6	1736635	1736640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34095	NC_021514	TTA	2	6	1736706	1736711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34096	NC_021514	CTTA	2	8	1736779	1736786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34097	NC_021514	GTTT	2	8	1736787	1736794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34098	NC_021514	TACAGA	2	12	1736840	1736851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34099	NC_021514	ATG	2	6	1736891	1736896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34100	NC_021514	TTA	2	6	1736904	1736909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34101	NC_021514	TGT	2	6	1737006	1737011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34102	NC_021514	T	6	6	1737033	1737038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34103	NC_021514	T	6	6	1737043	1737048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34104	NC_021514	AAG	2	6	1737052	1737057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34105	NC_021514	CCT	2	6	1737063	1737068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513841466
34106	NC_021514	T	6	6	1737129	1737134	0 %	100 %	0 %	0 %	513841466
34107	NC_021514	TCCA	2	8	1737147	1737154	25 %	25 %	0 %	50 %	513841466
34108	NC_021514	TGG	3	9	1737183	1737191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841466
34109	NC_021514	GCT	2	6	1737242	1737247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841466
34110	NC_021514	TCAC	2	8	1737263	1737270	25 %	25 %	0 %	50 %	513841466
34111	NC_021514	TTC	2	6	1737298	1737303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841466
34112	NC_021514	TCC	2	6	1737353	1737358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513841466
34113	NC_021514	ACT	2	6	1737406	1737411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841466
34114	NC_021514	TCA	2	6	1737413	1737418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841466
34115	NC_021514	AT	3	6	1737458	1737463	50 %	50 %	0 %	0 %	513841466
34116	NC_021514	TGA	2	6	1737528	1737533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841466
34117	NC_021514	T	6	6	1737588	1737593	0 %	100 %	0 %	0 %	513841466
34118	NC_021514	AAT	2	6	1737604	1737609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841466
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34120	NC_021514	GCT	2	6	1737846	1737851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841467
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34240	NC_021514	TCAAA	2	10	1743694	1743703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34241	NC_021514	CTAC	2	8	1743727	1743734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34242	NC_021514	TAC	2	6	1743759	1743764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34243	NC_021514	ACC	2	6	1743843	1743848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34244	NC_021514	GCT	2	6	1743890	1743895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34245	NC_021514	TTG	2	6	1743903	1743908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34246	NC_021514	AATTCA	2	12	1743915	1743926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34247	NC_021514	TTA	2	6	1743941	1743946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34248	NC_021514	AAT	2	6	1743962	1743967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34249	NC_021514	CAA	2	6	1743977	1743982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34250	NC_021514	ATCA	2	8	1743984	1743991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34251	NC_021514	A	6	6	1744018	1744023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34252	NC_021514	GAAC	2	8	1744091	1744098	50 %	0 %	25 %	25 %	513841471
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34257	NC_021514	TAT	2	6	1744316	1744321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34260	NC_021514	ATA	2	6	1744593	1744598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841472
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34265	NC_021514	CGG	2	6	1744895	1744900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841472
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34273	NC_021514	TGC	2	6	1745158	1745163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841472
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34276	NC_021514	TCA	2	6	1745234	1745239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34305	NC_021514	TAAA	2	8	1746859	1746866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34306	NC_021514	AC	3	6	1746951	1746956	50 %	0 %	0 %	50 %	513841475
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34322	NC_021514	CTAA	2	8	1747578	1747585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34323	NC_021514	A	6	6	1747606	1747611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34324	NC_021514	TAA	2	6	1747624	1747629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34335	NC_021514	TTC	2	6	1748265	1748270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841477
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34343	NC_021514	CCCA	2	8	1748689	1748696	25 %	0 %	0 %	75 %	513841477
34344	NC_021514	T	6	6	1748733	1748738	0 %	100 %	0 %	0 %	513841477
34345	NC_021514	TGG	2	6	1748749	1748754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841477
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34352	NC_021514	AAAT	2	8	1749330	1749337	75 %	25 %	0 %	0 %	513841477
34353	NC_021514	CAT	3	9	1749377	1749385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841477
34354	NC_021514	GGTT	2	8	1749402	1749409	0 %	50 %	50 %	0 %	513841477
34355	NC_021514	CGA	2	6	1749437	1749442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841477
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34358	NC_021514	GCACTG	2	12	1749529	1749540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	513841477
34359	NC_021514	ATTG	2	8	1749575	1749582	25 %	50 %	25 %	0 %	513841477
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34362	NC_021514	TGC	2	6	1749750	1749755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841477
34363	NC_021514	GTC	2	6	1749769	1749774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841477
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34370	NC_021514	CAT	2	6	1750253	1750258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841477
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34381	NC_021514	CAA	2	6	1750547	1750552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34382	NC_021514	CTTA	2	8	1750553	1750560	25 %	50 %	0 %	25 %	513841478
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34418	NC_021514	ACCG	2	8	1752761	1752768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34419	NC_021514	AAGC	2	8	1752779	1752786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34420	NC_021514	CTC	2	6	1752799	1752804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34422	NC_021514	AAC	2	6	1752826	1752831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34423	NC_021514	GCT	2	6	1752832	1752837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34424	NC_021514	ATTTT	2	10	1752839	1752848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34425	NC_021514	CTGC	2	8	1752902	1752909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34426	NC_021514	A	6	6	1752930	1752935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34427	NC_021514	TTCA	2	8	1752979	1752986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34428	NC_021514	TCG	2	6	1753192	1753197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841481
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34435	NC_021514	ATT	2	6	1753444	1753449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34462	NC_021514	ATT	2	6	1754837	1754842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34463	NC_021514	ATC	2	6	1754935	1754940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34464	NC_021514	TGA	2	6	1754965	1754970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34465	NC_021514	ATT	2	6	1754981	1754986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34466	NC_021514	TTG	2	6	1755007	1755012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34467	NC_021514	TAT	3	9	1755035	1755043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34472	NC_021514	AGA	2	6	1755188	1755193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841483
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34475	NC_021514	ATGA	2	8	1755261	1755268	50 %	25 %	25 %	0 %	513841483
34476	NC_021514	GCA	2	6	1755308	1755313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841483
34477	NC_021514	TGA	2	6	1755335	1755340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841483
34478	NC_021514	ATTT	2	8	1755345	1755352	25 %	75 %	0 %	0 %	513841483
34479	NC_021514	ACCT	2	8	1755468	1755475	25 %	25 %	0 %	50 %	513841483
34480	NC_021514	TGG	2	6	1755479	1755484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841483
34481	NC_021514	CAC	2	6	1755497	1755502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841483
34482	NC_021514	CAA	2	6	1755554	1755559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841483
34483	NC_021514	GTC	2	6	1755627	1755632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841483
34484	NC_021514	A	7	7	1755633	1755639	100 %	0 %	0 %	0 %	513841483
34485	NC_021514	GAA	2	6	1755657	1755662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841483
34486	NC_021514	ACA	2	6	1755679	1755684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841483
34487	NC_021514	CGTTT	2	10	1755698	1755707	0 %	60 %	20 %	20 %	513841483
34488	NC_021514	GC	3	6	1755708	1755713	0 %	0 %	50 %	50 %	513841483
34489	NC_021514	CAT	2	6	1755737	1755742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841483
34490	NC_021514	AGG	2	6	1755799	1755804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513841483
34491	NC_021514	GTG	2	6	1755851	1755856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841484
34492	NC_021514	CA	3	6	1755897	1755902	50 %	0 %	0 %	50 %	513841484
34493	NC_021514	CCAAC	2	10	1755961	1755970	40 %	0 %	0 %	60 %	513841484
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