MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 59860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32619	NC_021514	TCT	2	6	1661314	1661319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841393
32620	NC_021514	ATT	2	6	1661429	1661434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32621	NC_021514	TAA	2	6	1661435	1661440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32622	NC_021514	CAG	2	6	1661477	1661482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32623	NC_021514	GTTA	2	8	1661489	1661496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32624	NC_021514	TTTC	2	8	1661572	1661579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32625	NC_021514	ATCA	2	8	1661601	1661608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32626	NC_021514	AAC	2	6	1661660	1661665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32628	NC_021514	A	7	7	1661698	1661704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32643	NC_021514	CTT	3	9	1662268	1662276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841395
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32647	NC_021514	TCCC	2	8	1662413	1662420	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32648	NC_021514	AAAT	2	8	1662534	1662541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32649	NC_021514	TAT	2	6	1662610	1662615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32650	NC_021514	TTTAT	2	10	1662656	1662665	20 %	80 %	0 %	0 %	513841396
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32662	NC_021514	T	6	6	1663539	1663544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32663	NC_021514	CAT	2	6	1663546	1663551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32683	NC_021514	TCC	2	6	1664328	1664333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32685	NC_021514	TCAA	2	8	1664405	1664412	50 %	25 %	0 %	25 %	513841398
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32719	NC_021514	ATTA	2	8	1666567	1666574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32720	NC_021514	ACTT	2	8	1666650	1666657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32721	NC_021514	AAC	2	6	1666687	1666692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32722	NC_021514	GTT	2	6	1666718	1666723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32724	NC_021514	GTG	2	6	1666830	1666835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32725	NC_021514	GTC	2	6	1666841	1666846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32726	NC_021514	TCA	2	6	1666923	1666928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841400
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32730	NC_021514	ATC	2	6	1667067	1667072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841400
32731	NC_021514	ACG	2	6	1667115	1667120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841400
32732	NC_021514	ATCA	2	8	1667139	1667146	50 %	25 %	0 %	25 %	513841400
32733	NC_021514	TAA	2	6	1667165	1667170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841400
32734	NC_021514	TCA	2	6	1667171	1667176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841400
32735	NC_021514	TCT	2	6	1667183	1667188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841400
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32737	NC_021514	AGCC	2	8	1667276	1667283	25 %	0 %	25 %	50 %	513841400
32738	NC_021514	CAATGA	2	12	1667285	1667296	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513841400
32739	NC_021514	ATA	2	6	1667362	1667367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841400
32740	NC_021514	ATG	2	6	1667449	1667454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841400
32741	NC_021514	ATA	2	6	1667494	1667499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841400
32742	NC_021514	ATCG	2	8	1667548	1667555	25 %	25 %	25 %	25 %	513841400
32743	NC_021514	AAT	2	6	1667562	1667567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841400
32744	NC_021514	CGC	2	6	1667598	1667603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841400
32745	NC_021514	GAA	2	6	1667621	1667626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513841400
32746	NC_021514	TCA	2	6	1667633	1667638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841400
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32749	NC_021514	TA	3	6	1667734	1667739	50 %	50 %	0 %	0 %	513841400
32750	NC_021514	CTG	2	6	1667784	1667789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841400
32751	NC_021514	ATC	2	6	1667793	1667798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841400
32752	NC_021514	AATC	2	8	1667919	1667926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32753	NC_021514	TTA	3	9	1667961	1667969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32754	NC_021514	CTT	2	6	1668063	1668068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513841401
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32757	NC_021514	CCG	2	6	1668217	1668222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841401
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32760	NC_021514	CGT	2	6	1668388	1668393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841401
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32765	NC_021514	GGTT	2	8	1668621	1668628	0 %	50 %	50 %	0 %	513841402
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32773	NC_021514	CAT	2	6	1669013	1669018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841402
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32822	NC_021514	GATT	2	8	1671966	1671973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32823	NC_021514	AT	3	6	1671975	1671980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32824	NC_021514	TCG	2	6	1672043	1672048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32825	NC_021514	T	7	7	1672057	1672063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32826	NC_021514	GCA	2	6	1672076	1672081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32841	NC_021514	AAT	3	9	1672967	1672975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841404
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32843	NC_021514	TAA	2	6	1673174	1673179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32844	NC_021514	AATT	2	8	1673181	1673188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32845	NC_021514	GCA	2	6	1673221	1673226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32846	NC_021514	AGG	2	6	1673227	1673232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32847	NC_021514	CACT	2	8	1673274	1673281	25 %	25 %	0 %	50 %	513841405
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32849	NC_021514	TCA	2	6	1673347	1673352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841405
32850	NC_021514	T	6	6	1673359	1673364	0 %	100 %	0 %	0 %	513841405
32851	NC_021514	ACG	2	6	1673382	1673387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841405
32852	NC_021514	CTTT	2	8	1673391	1673398	0 %	75 %	0 %	25 %	513841405
32853	NC_021514	ACT	2	6	1673422	1673427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841405
32854	NC_021514	ACGG	2	8	1673477	1673484	25 %	0 %	50 %	25 %	513841405
32855	NC_021514	TTA	2	6	1673492	1673497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841405
32856	NC_021514	TCA	3	9	1673557	1673565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841405
32857	NC_021514	ACA	2	6	1673659	1673664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841405
32858	NC_021514	ACA	2	6	1673746	1673751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513841405
32859	NC_021514	GATC	2	8	1673854	1673861	25 %	25 %	25 %	25 %	513841405
32860	NC_021514	GA	3	6	1673883	1673888	50 %	0 %	50 %	0 %	513841405
32861	NC_021514	GAC	2	6	1673902	1673907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841405
32862	NC_021514	TGG	2	6	1673914	1673919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841405
32863	NC_021514	TAT	2	6	1674005	1674010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841405
32864	NC_021514	TA	3	6	1674136	1674141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32865	NC_021514	T	6	6	1674143	1674148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32866	NC_021514	ATC	2	6	1674156	1674161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32867	NC_021514	AAAT	2	8	1674274	1674281	75 %	25 %	0 %	0 %	513841406
32868	NC_021514	CACC	2	8	1674330	1674337	25 %	0 %	0 %	75 %	513841406
32869	NC_021514	AATA	2	8	1674374	1674381	75 %	25 %	0 %	0 %	513841406
32870	NC_021514	AGC	2	6	1674421	1674426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841406
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32873	NC_021514	ACC	2	6	1674517	1674522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841406
32874	NC_021514	GGC	2	6	1674565	1674570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841406
32875	NC_021514	GCCC	2	8	1674607	1674614	0 %	0 %	25 %	75 %	513841406
32876	NC_021514	ACTG	2	8	1674671	1674678	25 %	25 %	25 %	25 %	513841406
32877	NC_021514	TAA	2	6	1674829	1674834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32878	NC_021514	CGC	2	6	1675045	1675050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841407
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32884	NC_021514	TTG	2	6	1675457	1675462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841408
32885	NC_021514	ATT	2	6	1675504	1675509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841408
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32920	NC_021514	TGC	2	6	1677149	1677154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841408
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32929	NC_021514	TAA	2	6	1677642	1677647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32930	NC_021514	CCCA	2	8	1677663	1677670	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32931	NC_021514	CG	3	6	1677702	1677707	0 %	0 %	50 %	50 %	513841409
32932	NC_021514	ATAG	2	8	1677785	1677792	50 %	25 %	25 %	0 %	513841409
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32942	NC_021514	ACC	2	6	1678080	1678085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32943	NC_021514	AGTA	2	8	1678130	1678137	50 %	25 %	25 %	0 %	513841410
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32954	NC_021514	GC	3	6	1678748	1678753	0 %	0 %	50 %	50 %	513841410
32955	NC_021514	TGT	2	6	1678919	1678924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841411
32956	NC_021514	GTC	2	6	1678952	1678957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841411
32957	NC_021514	GAC	2	6	1678960	1678965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513841411
32958	NC_021514	ATC	2	6	1678975	1678980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841411
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32962	NC_021514	ATA	2	6	1679078	1679083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841411
32963	NC_021514	CAC	2	6	1679283	1679288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841411
32964	NC_021514	TGGT	2	8	1679398	1679405	0 %	50 %	50 %	0 %	513841411
32965	NC_021514	T	6	6	1679464	1679469	0 %	100 %	0 %	0 %	513841411
32966	NC_021514	TCAG	2	8	1679543	1679550	25 %	25 %	25 %	25 %	513841411
32967	NC_021514	GCT	2	6	1679562	1679567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841411
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32970	NC_021514	GAT	2	6	1679662	1679667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841411
32971	NC_021514	CAT	2	6	1679709	1679714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841411
32972	NC_021514	TCC	2	6	1679824	1679829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32973	NC_021514	TA	3	6	1679892	1679897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32974	NC_021514	ATG	2	6	1679938	1679943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841412
32975	NC_021514	TTG	2	6	1680032	1680037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841412
32976	NC_021514	CAATTC	2	12	1680039	1680050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513841412
32977	NC_021514	GCT	2	6	1680207	1680212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841412
32978	NC_021514	ATAAAT	2	12	1680322	1680333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513841412
32979	NC_021514	GCG	2	6	1680366	1680371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513841412
32980	NC_021514	TGG	2	6	1680374	1680379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513841412
32981	NC_021514	TTCTGT	2	12	1680424	1680435	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	513841412
32982	NC_021514	CGC	2	6	1680496	1680501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513841412
32983	NC_021514	GTCC	2	8	1680598	1680605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32984	NC_021514	ATT	2	6	1680622	1680627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513841413
32985	NC_021514	AACCG	2	10	1680713	1680722	40 %	0 %	20 %	40 %	513841413
32986	NC_021514	TTGATT	2	12	1680731	1680742	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	513841413
32987	NC_021514	ACC	2	6	1680773	1680778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513841413
32988	NC_021514	TTG	2	6	1680782	1680787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513841413
32989	NC_021514	AT	3	6	1680845	1680850	50 %	50 %	0 %	0 %	513841413
32990	NC_021514	TC	3	6	1680915	1680920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32991	NC_021514	ATA	2	6	1680944	1680949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32992	NC_021514	AATT	2	8	1680950	1680957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32993	NC_021514	TAT	3	9	1680985	1680993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32994	NC_021514	AGT	2	6	1681009	1681014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32995	NC_021514	TGA	2	6	1681159	1681164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841414
32996	NC_021514	TCG	2	6	1681184	1681189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513841414
32997	NC_021514	A	6	6	1681332	1681337	100 %	0 %	0 %	0 %	513841414
32998	NC_021514	GAT	2	6	1681434	1681439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513841414
32999	NC_021514	AGA	2	6	1681466	1681471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33000	NC_021514	T	7	7	1681532	1681538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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