MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 1184

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021503	CTTC	2	8	44377	44384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_021503	ACT	2	6	44432	44437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021503	CAC	2	6	44457	44462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_021503	TA	3	6	44489	44494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021503	A	6	6	44494	44499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021503	CAA	2	6	44537	44542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656389
1007	NC_021503	CAT	2	6	44558	44563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656389
1008	NC_021503	GTT	2	6	44712	44717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656389
1009	NC_021503	TCA	2	6	44791	44796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656389
1010	NC_021503	ATATA	2	10	44821	44830	60 %	40 %	0 %	0 %	512656389
1011	NC_021503	T	6	6	44850	44855	0 %	100 %	0 %	0 %	512656390
1012	NC_021503	TAT	2	6	44870	44875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656390
1013	NC_021503	TTG	2	6	44883	44888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656390
1014	NC_021503	GTT	2	6	44892	44897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656390
1015	NC_021503	CAG	2	6	44902	44907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656390
1016	NC_021503	TAC	2	6	44912	44917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656390
1017	NC_021503	CAT	2	6	44952	44957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656390
1018	NC_021503	AGA	2	6	44971	44976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656390
1019	NC_021503	TAA	2	6	45043	45048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021503	TCA	2	6	45056	45061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656391
1021	NC_021503	TTGT	2	8	45063	45070	0 %	75 %	25 %	0 %	512656391
1022	NC_021503	TCA	2	6	45141	45146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656391
1023	NC_021503	ATATA	2	10	45171	45180	60 %	40 %	0 %	0 %	512656391
1024	NC_021503	T	6	6	45200	45205	0 %	100 %	0 %	0 %	512656392
1025	NC_021503	TAT	2	6	45220	45225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656392
1026	NC_021503	TTG	2	6	45233	45238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656392
1027	NC_021503	GTT	2	6	45242	45247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656392
1028	NC_021503	CAT	2	6	45284	45289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656392
1029	NC_021503	AGA	2	6	45303	45308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656392
1030	NC_021503	CCT	2	6	45345	45350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_021503	TAA	2	6	45366	45371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021503	TCA	2	6	45379	45384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021503	GAC	2	6	45448	45453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656393
1034	NC_021503	GCA	2	6	45466	45471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656393
1035	NC_021503	ACA	2	6	45506	45511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656393
1036	NC_021503	CCA	2	6	45555	45560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656393
1037	NC_021503	CAACA	2	10	45639	45648	60 %	0 %	0 %	40 %	512656393
1038	NC_021503	ACCA	2	8	45738	45745	50 %	0 %	0 %	50 %	512656393
1039	NC_021503	TGA	2	6	45746	45751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656393
1040	NC_021503	AAT	2	6	45780	45785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656393
1041	NC_021503	ATC	2	6	45795	45800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1042	NC_021503	TAAT	2	8	45917	45924	50 %	50 %	0 %	0 %	512656393
1043	NC_021503	AGC	2	6	46014	46019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656393
1044	NC_021503	CAG	2	6	46028	46033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656393
1045	NC_021503	AATT	2	8	46217	46224	50 %	50 %	0 %	0 %	512656393
1046	NC_021503	GGC	2	6	46230	46235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512656393
1047	NC_021503	TAA	2	6	46245	46250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656393
1048	NC_021503	GTT	2	6	46252	46257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656393
1049	NC_021503	CAT	2	6	46268	46273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1050	NC_021503	TAG	3	9	46406	46414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656393
1051	NC_021503	ATGC	2	8	46448	46455	25 %	25 %	25 %	25 %	512656393
1052	NC_021503	GCAA	2	8	46458	46465	50 %	0 %	25 %	25 %	512656393
1053	NC_021503	AAAG	2	8	46524	46531	75 %	0 %	25 %	0 %	512656393
1054	NC_021503	AAT	2	6	46533	46538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656393
1055	NC_021503	TCT	2	6	46591	46596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656393
1056	NC_021503	TTG	2	6	46699	46704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656393
1057	NC_021503	ACC	2	6	46710	46715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656393
1058	NC_021503	GCA	2	6	46747	46752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656393
1059	NC_021503	TTCA	2	8	46773	46780	25 %	50 %	0 %	25 %	512656393
1060	NC_021503	TAA	2	6	46799	46804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656393
1061	NC_021503	CTT	2	6	46877	46882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656393
1062	NC_021503	GCC	2	6	46930	46935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512656393
1063	NC_021503	CATT	2	8	46970	46977	25 %	50 %	0 %	25 %	512656393
1064	NC_021503	CGAA	2	8	47024	47031	50 %	0 %	25 %	25 %	512656393
1065	NC_021503	AAG	2	6	47059	47064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656393
1066	NC_021503	TTG	2	6	47065	47070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656393
1067	NC_021503	TCA	2	6	47129	47134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1068	NC_021503	AAAGT	2	10	47196	47205	60 %	20 %	20 %	0 %	512656393
1069	NC_021503	CAAA	2	8	47213	47220	75 %	0 %	0 %	25 %	512656393
1070	NC_021503	GAT	2	6	47223	47228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656393
1071	NC_021503	CAA	2	6	47234	47239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656393
1072	NC_021503	CAT	2	6	47358	47363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1073	NC_021503	CAT	3	9	47376	47384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1074	NC_021503	CCATAT	2	12	47396	47407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656393
1075	NC_021503	ATT	2	6	47481	47486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656393
1076	NC_021503	TG	3	6	47609	47614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021503	CCA	2	6	47639	47644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_021503	ATGA	2	8	47691	47698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021503	GCA	2	6	47759	47764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021503	TTG	2	6	47928	47933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656394
1081	NC_021503	CA	3	6	47949	47954	50 %	0 %	0 %	50 %	512656394
1082	NC_021503	CAAA	2	8	47961	47968	75 %	0 %	0 %	25 %	512656394
1083	NC_021503	CTGCCG	2	12	47973	47984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	512656394
1084	NC_021503	CAA	2	6	48003	48008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656394
1085	NC_021503	GCC	2	6	48034	48039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512656394
1086	NC_021503	TGC	2	6	48041	48046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656394
1087	NC_021503	GTT	2	6	48089	48094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656394
1088	NC_021503	CCAT	2	8	48180	48187	25 %	25 %	0 %	50 %	512656394
1089	NC_021503	TCC	2	6	48232	48237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_021503	TTA	2	6	48279	48284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021503	AAT	2	6	48303	48308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021503	A	7	7	48341	48347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_021503	ATA	2	6	48355	48360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021503	AT	3	6	48382	48387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021503	TCT	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021503	T	7	7	48509	48515	0 %	100 %	0 %	0 %	512656395
1097	NC_021503	ATC	3	9	48519	48527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656395
1098	NC_021503	AGT	2	6	48536	48541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656395
1099	NC_021503	T	6	6	48557	48562	0 %	100 %	0 %	0 %	512656395
1100	NC_021503	CAT	2	6	48581	48586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656395
1101	NC_021503	TGA	2	6	48601	48606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656395
1102	NC_021503	TAC	2	6	48620	48625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656395
1103	NC_021503	AT	3	6	48634	48639	50 %	50 %	0 %	0 %	512656395
1104	NC_021503	TAT	2	6	48851	48856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656396
1105	NC_021503	TTAA	2	8	48857	48864	50 %	50 %	0 %	0 %	512656396
1106	NC_021503	ACC	2	6	48907	48912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656396
1107	NC_021503	TAA	2	6	49009	49014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656396
1108	NC_021503	TTA	2	6	49044	49049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656396
1109	NC_021503	TAA	2	6	49071	49076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656396
1110	NC_021503	AAT	2	6	49088	49093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656396
1111	NC_021503	CAC	2	6	49107	49112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656396
1112	NC_021503	ATT	2	6	49150	49155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656396
1113	NC_021503	T	6	6	49188	49193	0 %	100 %	0 %	0 %	512656396
1114	NC_021503	ATT	2	6	49244	49249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656396
1115	NC_021503	TAA	2	6	49261	49266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656396
1116	NC_021503	ACTA	2	8	49309	49316	50 %	25 %	0 %	25 %	512656396
1117	NC_021503	TA	3	6	49348	49353	50 %	50 %	0 %	0 %	512656396
1118	NC_021503	A	8	8	49390	49397	100 %	0 %	0 %	0 %	512656396
1119	NC_021503	ATT	2	6	49406	49411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656396
1120	NC_021503	CAC	2	6	49441	49446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656396
1121	NC_021503	AAT	2	6	49453	49458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656396
1122	NC_021503	TCC	2	6	49479	49484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_021503	ATA	2	6	49488	49493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021503	AT	4	8	49499	49506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021503	ATT	2	6	49513	49518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021503	TAA	2	6	49565	49570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021503	ACC	2	6	49609	49614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_021503	ATT	2	6	49712	49717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021503	ACC	2	6	49779	49784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021503	CA	3	6	49836	49841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_021503	A	6	6	49847	49852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021503	CG	3	6	49871	49876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_021503	A	7	7	49885	49891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021503	ATT	2	6	49949	49954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021503	ATA	2	6	49979	49984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021503	TAT	2	6	49988	49993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021503	TG	3	6	50114	50119	0 %	50 %	50 %	0 %	512656397
1138	NC_021503	CAAC	2	8	50152	50159	50 %	0 %	0 %	50 %	512656397
1139	NC_021503	TCA	2	6	50166	50171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656397
1140	NC_021503	GTAA	2	8	50206	50213	50 %	25 %	25 %	0 %	512656397
1141	NC_021503	TTA	3	9	50261	50269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656397
1142	NC_021503	ATT	2	6	50383	50388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021503	ATTT	2	8	50475	50482	25 %	75 %	0 %	0 %	512656398
1144	NC_021503	A	6	6	50594	50599	100 %	0 %	0 %	0 %	512656398
1145	NC_021503	TCAT	2	8	50638	50645	25 %	50 %	0 %	25 %	512656398
1146	NC_021503	TTG	2	6	50668	50673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656398
1147	NC_021503	ATT	2	6	50689	50694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656398
1148	NC_021503	GAAT	2	8	50775	50782	50 %	25 %	25 %	0 %	512656398
1149	NC_021503	GTTG	2	8	50814	50821	0 %	50 %	50 %	0 %	512656398
1150	NC_021503	TCT	2	6	50846	50851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656398
1151	NC_021503	TTA	2	6	50873	50878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656398
1152	NC_021503	GTT	2	6	50892	50897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512656398
1153	NC_021503	ATT	2	6	51004	51009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656398
1154	NC_021503	AGT	2	6	51123	51128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656398
1155	NC_021503	CCGTT	2	10	51158	51167	0 %	40 %	20 %	40 %	512656398
1156	NC_021503	ACT	2	6	51168	51173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656398
1157	NC_021503	TTA	2	6	51194	51199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656398
1158	NC_021503	TAA	2	6	51270	51275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512656398
1159	NC_021503	TGA	2	6	51371	51376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512656398
1160	NC_021503	CT	3	6	51395	51400	0 %	50 %	0 %	50 %	512656398
1161	NC_021503	GAA	2	6	51431	51436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1162	NC_021503	T	6	6	51443	51448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_021503	ATT	2	6	51631	51636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512656399
1164	NC_021503	CTG	2	6	51643	51648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656399
1165	NC_021503	CA	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	512656399
1166	NC_021503	A	6	6	51766	51771	100 %	0 %	0 %	0 %	512656399
1167	NC_021503	AAC	2	6	51805	51810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512656399
1168	NC_021503	AATT	2	8	51820	51827	50 %	50 %	0 %	0 %	512656399
1169	NC_021503	AT	3	6	51866	51871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_021503	AGAA	2	8	52007	52014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_021503	CAC	2	6	52028	52033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656400
1172	NC_021503	ACT	2	6	52108	52113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512656400
1173	NC_021503	CGAA	2	8	52196	52203	50 %	0 %	25 %	25 %	512656400
1174	NC_021503	TCG	2	6	52397	52402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512656400
1175	NC_021503	GAG	2	6	52452	52457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512656400
1176	NC_021503	CAGT	2	8	52604	52611	25 %	25 %	25 %	25 %	512656400
1177	NC_021503	CTAG	2	8	52635	52642	25 %	25 %	25 %	25 %	512656400
1178	NC_021503	AGC	2	6	52714	52719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512656400
1179	NC_021503	CAC	2	6	52756	52761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512656400
1180	NC_021503	GAA	2	6	52830	52835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512656400
1181	NC_021503	TCT	2	6	52921	52926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512656400
1182	NC_021503	ATAA	2	8	52977	52984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1183	NC_021503	A	6	6	52983	52988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1184	NC_021503	GTA	2	6	53011	53016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous 1 23Next >