MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 42095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_021235	GCGG	2	8	2060678	2060685	0 %	0 %	75 %	25 %	501675814
42002	NC_021235	CAA	2	6	2060697	2060702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675814
42003	NC_021235	CGG	2	6	2060714	2060719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675814
42004	NC_021235	GCTT	2	8	2060728	2060735	0 %	50 %	25 %	25 %	501675814
42005	NC_021235	T	6	6	2060753	2060758	0 %	100 %	0 %	0 %	501675814
42006	NC_021235	GTC	2	6	2060766	2060771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675814
42007	NC_021235	TTC	2	6	2060832	2060837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675814
42008	NC_021235	TCACG	2	10	2060840	2060849	20 %	20 %	20 %	40 %	501675814
42009	NC_021235	GTC	2	6	2060851	2060856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675814
42010	NC_021235	ATG	2	6	2060938	2060943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675814
42011	NC_021235	CCTT	2	8	2060974	2060981	0 %	50 %	0 %	50 %	501675814
42012	NC_021235	CGT	2	6	2061065	2061070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675814
42013	NC_021235	GGTTAA	2	12	2061306	2061317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675814
42014	NC_021235	C	6	6	2061345	2061350	0 %	0 %	0 %	100 %	501675814
42015	NC_021235	CCA	2	6	2061365	2061370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675814
42016	NC_021235	TCT	2	6	2061373	2061378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675814
42017	NC_021235	GAT	2	6	2061450	2061455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675814
42018	NC_021235	CAC	2	6	2061519	2061524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675814
42019	NC_021235	GAT	2	6	2061552	2061557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675814
42020	NC_021235	C	6	6	2061564	2061569	0 %	0 %	0 %	100 %	501675814
42021	NC_021235	A	6	6	2061648	2061653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42022	NC_021235	ACT	2	6	2061705	2061710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42023	NC_021235	TATT	2	8	2061735	2061742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42024	NC_021235	GCCC	2	8	2061754	2061761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42025	NC_021235	ATT	2	6	2061768	2061773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675815
42026	NC_021235	CCGC	2	8	2061927	2061934	0 %	0 %	25 %	75 %	501675815
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42029	NC_021235	GGCG	2	8	2062242	2062249	0 %	0 %	75 %	25 %	501675815
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42033	NC_021235	CGG	2	6	2062350	2062355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675815
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42040	NC_021235	ACTC	2	8	2062581	2062588	25 %	25 %	0 %	50 %	501675815
42041	NC_021235	A	8	8	2062605	2062612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42042	NC_021235	GCC	2	6	2062727	2062732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675816
42043	NC_021235	TGCTT	2	10	2062733	2062742	0 %	60 %	20 %	20 %	501675816
42044	NC_021235	CCG	2	6	2062750	2062755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675816
42045	NC_021235	ACC	2	6	2062811	2062816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675816
42046	NC_021235	GCC	2	6	2062832	2062837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675816
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42051	NC_021235	GT	3	6	2062991	2062996	0 %	50 %	50 %	0 %	501675816
42052	NC_021235	AAG	2	6	2063012	2063017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675816
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42055	NC_021235	GCT	2	6	2063157	2063162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675816
42056	NC_021235	T	7	7	2063192	2063198	0 %	100 %	0 %	0 %	501675816
42057	NC_021235	GCG	2	6	2063214	2063219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675816
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42061	NC_021235	GAT	3	9	2063284	2063292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675816
42062	NC_021235	GAT	3	9	2063299	2063307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675816
42063	NC_021235	ATA	2	6	2063345	2063350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675816
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42067	NC_021235	CT	3	6	2063503	2063508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42068	NC_021235	TTC	2	6	2063555	2063560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675817
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42072	NC_021235	ACCG	2	8	2063710	2063717	25 %	0 %	25 %	50 %	501675817
42073	NC_021235	GGTT	2	8	2063738	2063745	0 %	50 %	50 %	0 %	501675817
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42076	NC_021235	AGTC	2	8	2063856	2063863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42077	NC_021235	A	6	6	2063880	2063885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42078	NC_021235	ACA	2	6	2063905	2063910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42079	NC_021235	CTGCC	2	10	2063930	2063939	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42080	NC_021235	TAACG	2	10	2063955	2063964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42081	NC_021235	CTT	2	6	2064076	2064081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42082	NC_021235	CCT	2	6	2064112	2064117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42083	NC_021235	AGC	2	6	2064119	2064124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42084	NC_021235	T	7	7	2064128	2064134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42085	NC_021235	TTA	2	6	2064142	2064147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42086	NC_021235	CT	3	6	2064170	2064175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42087	NC_021235	GGGA	2	8	2064208	2064215	25 %	0 %	75 %	0 %	501675818
42088	NC_021235	A	7	7	2064235	2064241	100 %	0 %	0 %	0 %	501675818
42089	NC_021235	AAT	2	6	2064268	2064273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675818
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42091	NC_021235	GGT	2	6	2064352	2064357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675818
42092	NC_021235	CA	3	6	2064500	2064505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42093	NC_021235	GTT	2	6	2064508	2064513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42094	NC_021235	T	6	6	2064583	2064588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42095	NC_021235	AGG	2	6	2064608	2064613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.