MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 42095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_021235	CTG	2	6	2012127	2012132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675765
41002	NC_021235	TGC	3	9	2012242	2012250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675765
41003	NC_021235	C	6	6	2012250	2012255	0 %	0 %	0 %	100 %	501675765
41004	NC_021235	GTC	2	6	2012286	2012291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675765
41005	NC_021235	T	6	6	2012301	2012306	0 %	100 %	0 %	0 %	501675765
41006	NC_021235	T	6	6	2012435	2012440	0 %	100 %	0 %	0 %	501675765
41007	NC_021235	AATC	2	8	2012483	2012490	50 %	25 %	0 %	25 %	501675765
41008	NC_021235	ATCG	2	8	2012499	2012506	25 %	25 %	25 %	25 %	501675765
41009	NC_021235	CGT	2	6	2012592	2012597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675765
41010	NC_021235	CGTCA	2	10	2012619	2012628	20 %	20 %	20 %	40 %	501675765
41011	NC_021235	GTG	2	6	2012637	2012642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675765
41012	NC_021235	ATC	2	6	2012677	2012682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675765
41013	NC_021235	AGT	2	6	2012727	2012732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675766
41014	NC_021235	AGA	2	6	2012757	2012762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675766
41015	NC_021235	GTT	2	6	2012809	2012814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675766
41016	NC_021235	GCG	2	6	2012910	2012915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675766
41017	NC_021235	CAG	2	6	2013019	2013024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675766
41018	NC_021235	AGA	2	6	2013129	2013134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675766
41019	NC_021235	CCGC	2	8	2013195	2013202	0 %	0 %	25 %	75 %	501675766
41020	NC_021235	GAT	2	6	2013295	2013300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675766
41021	NC_021235	A	6	6	2013333	2013338	100 %	0 %	0 %	0 %	501675766
41022	NC_021235	GAC	2	6	2013445	2013450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41023	NC_021235	ACTT	2	8	2013473	2013480	25 %	50 %	0 %	25 %	501675767
41024	NC_021235	CTT	2	6	2013517	2013522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675767
41025	NC_021235	TTG	2	6	2013557	2013562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675767
41026	NC_021235	TTG	2	6	2013581	2013586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675767
41027	NC_021235	CTT	2	6	2013639	2013644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675767
41028	NC_021235	GTA	2	6	2013679	2013684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675767
41029	NC_021235	AAG	2	6	2013686	2013691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675767
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41031	NC_021235	GCCC	2	8	2013719	2013726	0 %	0 %	25 %	75 %	501675767
41032	NC_021235	CTT	2	6	2013787	2013792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675767
41033	NC_021235	GGC	3	9	2013820	2013828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675767
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41038	NC_021235	TCT	2	6	2014050	2014055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675767
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41040	NC_021235	GCT	2	6	2014192	2014197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675767
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41042	NC_021235	AGC	2	6	2014237	2014242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675767
41043	NC_021235	CTT	2	6	2014267	2014272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675767
41044	NC_021235	CCT	2	6	2014286	2014291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41045	NC_021235	TTC	2	6	2014300	2014305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41046	NC_021235	AATTTT	2	12	2014388	2014399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41047	NC_021235	CTTA	2	8	2014409	2014416	25 %	50 %	0 %	25 %	501675768
41048	NC_021235	GCC	2	6	2014420	2014425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675768
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41050	NC_021235	CTT	2	6	2014527	2014532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675768
41051	NC_021235	CGT	3	9	2014578	2014586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675768
41052	NC_021235	CGG	2	6	2014635	2014640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675768
41053	NC_021235	CTTGGG	2	12	2014680	2014691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	501675768
41054	NC_021235	CTT	2	6	2014707	2014712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675768
41055	NC_021235	TCA	2	6	2014772	2014777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41056	NC_021235	ACCT	2	8	2014866	2014873	25 %	25 %	0 %	50 %	501675769
41057	NC_021235	TCC	2	6	2014894	2014899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675769
41058	NC_021235	CAT	2	6	2014916	2014921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675769
41059	NC_021235	CTC	2	6	2014950	2014955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675769
41060	NC_021235	GCG	2	6	2014971	2014976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675769
41061	NC_021235	GT	3	6	2014990	2014995	0 %	50 %	50 %	0 %	501675769
41062	NC_021235	GAC	2	6	2015004	2015009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675769
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41066	NC_021235	CAA	2	6	2015152	2015157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675769
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41084	NC_021235	CGAC	2	8	2015863	2015870	25 %	0 %	25 %	50 %	501675770
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41096	NC_021235	T	7	7	2016354	2016360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41097	NC_021235	GAA	2	6	2016576	2016581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675771
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41099	NC_021235	TC	3	6	2016668	2016673	0 %	50 %	0 %	50 %	501675771
41100	NC_021235	CAT	2	6	2016678	2016683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675771
41101	NC_021235	CGG	2	6	2016770	2016775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675771
41102	NC_021235	CAT	2	6	2016840	2016845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675771
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41117	NC_021235	GCCT	2	8	2017309	2017316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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41235	NC_021235	ATC	2	6	2022976	2022981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675777
41236	NC_021235	GCC	2	6	2022998	2023003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675777
41237	NC_021235	CGC	2	6	2023036	2023041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675777
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41239	NC_021235	G	6	6	2023164	2023169	0 %	0 %	100 %	0 %	501675777
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41241	NC_021235	TTC	2	6	2023207	2023212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675777
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41246	NC_021235	ACC	2	6	2023439	2023444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675777
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41248	NC_021235	CAGT	2	8	2023496	2023503	25 %	25 %	25 %	25 %	501675777
41249	NC_021235	CGG	2	6	2023545	2023550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675777
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41265	NC_021235	CGC	2	6	2024211	2024216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675778
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41282	NC_021235	AAGG	2	8	2025146	2025153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41283	NC_021235	AAG	2	6	2025157	2025162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41284	NC_021235	A	6	6	2025224	2025229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41285	NC_021235	TTTAG	2	10	2025262	2025271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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41340	NC_021235	GTG	2	6	2027721	2027726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675784
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41342	NC_021235	TGG	2	6	2027796	2027801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675784
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41347	NC_021235	CTT	2	6	2028008	2028013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41351	NC_021235	GGC	2	6	2028157	2028162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675785
41352	NC_021235	TCT	2	6	2028185	2028190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675785
41353	NC_021235	CCG	2	6	2028225	2028230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675785
41354	NC_021235	GTC	3	9	2028296	2028304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675785
41355	NC_021235	AGTA	2	8	2028306	2028313	50 %	25 %	25 %	0 %	501675785
41356	NC_021235	GTG	2	6	2028325	2028330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675785
41357	NC_021235	ACCGCT	2	12	2028334	2028345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	501675785
41358	NC_021235	GTA	3	9	2028361	2028369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675785
41359	NC_021235	CCAG	2	8	2028480	2028487	25 %	0 %	25 %	50 %	501675785
41360	NC_021235	CCA	3	9	2028495	2028503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675785
41361	NC_021235	AAC	2	6	2028620	2028625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675785
41362	NC_021235	TTA	2	6	2028670	2028675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41363	NC_021235	AAAT	2	8	2028692	2028699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41364	NC_021235	AGG	2	6	2028823	2028828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41365	NC_021235	CAT	2	6	2028868	2028873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675786
41366	NC_021235	TGAT	2	8	2028897	2028904	25 %	50 %	25 %	0 %	501675786
41367	NC_021235	CAAG	2	8	2028962	2028969	50 %	0 %	25 %	25 %	501675786
41368	NC_021235	GAA	4	12	2028980	2028991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675786
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41370	NC_021235	TC	3	6	2029059	2029064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41371	NC_021235	CAC	2	6	2029193	2029198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675787
41372	NC_021235	TCG	2	6	2029320	2029325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675787
41373	NC_021235	GTGA	2	8	2029465	2029472	25 %	25 %	50 %	0 %	501675787
41374	NC_021235	GGC	2	6	2029523	2029528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675787
41375	NC_021235	C	6	6	2029538	2029543	0 %	0 %	0 %	100 %	501675787
41376	NC_021235	CAC	2	6	2029562	2029567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675787
41377	NC_021235	TGG	2	6	2029587	2029592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675787
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41379	NC_021235	TTGG	2	8	2029673	2029680	0 %	50 %	50 %	0 %	501675787
41380	NC_021235	GTC	2	6	2029715	2029720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675787
41381	NC_021235	GGT	2	6	2029727	2029732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675787
41382	NC_021235	GAT	2	6	2029736	2029741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675787
41383	NC_021235	TTC	2	6	2029769	2029774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675787
41384	NC_021235	TGA	2	6	2029841	2029846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675787
41385	NC_021235	TGA	2	6	2029951	2029956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675787
41386	NC_021235	CCCG	2	8	2029983	2029990	0 %	0 %	25 %	75 %	501675787
41387	NC_021235	A	6	6	2030107	2030112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41388	NC_021235	ACC	2	6	2030163	2030168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41389	NC_021235	CACTT	2	10	2030193	2030202	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41390	NC_021235	ATG	2	6	2030230	2030235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41391	NC_021235	ATCA	2	8	2030250	2030257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41392	NC_021235	GT	3	6	2030260	2030265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41393	NC_021235	AAATTA	2	12	2030267	2030278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41394	NC_021235	CTA	3	9	2030287	2030295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41395	NC_021235	A	6	6	2030364	2030369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41396	NC_021235	AGA	2	6	2030420	2030425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41397	NC_021235	AAC	2	6	2030547	2030552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675788
41398	NC_021235	TCT	2	6	2030581	2030586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675788
41399	NC_021235	CTAGTT	2	12	2030729	2030740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	501675788
41400	NC_021235	CTA	2	6	2030756	2030761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675788
41401	NC_021235	CCA	2	6	2030774	2030779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675788
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41403	NC_021235	CTC	2	6	2030859	2030864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675788
41404	NC_021235	GCG	2	6	2030872	2030877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675788
41405	NC_021235	TCC	2	6	2030896	2030901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675788
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41414	NC_021235	CAA	2	6	2031531	2031536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675788
41415	NC_021235	CCA	2	6	2031545	2031550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675788
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41419	NC_021235	AAC	2	6	2031646	2031651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675788
41420	NC_021235	GCG	2	6	2031715	2031720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675788
41421	NC_021235	CCA	2	6	2031740	2031745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675788
41422	NC_021235	CCA	2	6	2031773	2031778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675788
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41424	NC_021235	CGG	2	6	2031851	2031856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675788
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41432	NC_021235	ACA	2	6	2032238	2032243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675788
41433	NC_021235	CGG	2	6	2032250	2032255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675788
41434	NC_021235	CTT	2	6	2032328	2032333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675788
41435	NC_021235	CAC	3	9	2032338	2032346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675788
41436	NC_021235	GCC	2	6	2032411	2032416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675788
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41438	NC_021235	AAC	2	6	2032453	2032458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675788
41439	NC_021235	TTAAT	2	10	2032509	2032518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41440	NC_021235	CAA	2	6	2032522	2032527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41441	NC_021235	ACC	2	6	2032664	2032669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675789
41442	NC_021235	CTG	2	6	2032733	2032738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675789
41443	NC_021235	CAA	2	6	2032751	2032756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675789
41444	NC_021235	CCA	2	6	2032813	2032818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675789
41445	NC_021235	GTT	2	6	2032874	2032879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675789
41446	NC_021235	ATC	2	6	2032910	2032915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675789
41447	NC_021235	CGT	2	6	2032921	2032926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675789
41448	NC_021235	TAAA	2	8	2032939	2032946	75 %	25 %	0 %	0 %	501675789
41449	NC_021235	TTC	2	6	2032998	2033003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41450	NC_021235	T	6	6	2033099	2033104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41451	NC_021235	ACC	2	6	2033117	2033122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41452	NC_021235	ATC	2	6	2033155	2033160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41453	NC_021235	GTC	2	6	2033233	2033238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41454	NC_021235	GCTAG	2	10	2033287	2033296	20 %	20 %	40 %	20 %	501675790
41455	NC_021235	GTCC	2	8	2033402	2033409	0 %	25 %	25 %	50 %	501675790
41456	NC_021235	GTA	2	6	2033451	2033456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675790
41457	NC_021235	GCTTT	2	10	2033494	2033503	0 %	60 %	20 %	20 %	501675790
41458	NC_021235	GCCA	2	8	2033530	2033537	25 %	0 %	25 %	50 %	501675790
41459	NC_021235	CTC	2	6	2033594	2033599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675790
41460	NC_021235	CTA	3	9	2033602	2033610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675790
41461	NC_021235	TTG	2	6	2033642	2033647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675790
41462	NC_021235	T	7	7	2033747	2033753	0 %	100 %	0 %	0 %	501675790
41463	NC_021235	GTT	2	6	2033758	2033763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675790
41464	NC_021235	AAG	2	6	2033859	2033864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675790
41465	NC_021235	AAG	2	6	2033955	2033960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675790
41466	NC_021235	TAT	2	6	2034082	2034087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675790
41467	NC_021235	GTTA	2	8	2034107	2034114	25 %	50 %	25 %	0 %	501675790
41468	NC_021235	T	6	6	2034124	2034129	0 %	100 %	0 %	0 %	501675790
41469	NC_021235	TCT	2	6	2034282	2034287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675790
41470	NC_021235	TAGT	2	8	2034331	2034338	25 %	50 %	25 %	0 %	501675790
41471	NC_021235	TTG	2	6	2034470	2034475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675790
41472	NC_021235	AGC	2	6	2034487	2034492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675790
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41475	NC_021235	CAT	2	6	2034569	2034574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41477	NC_021235	A	6	6	2034594	2034599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41478	NC_021235	A	6	6	2034622	2034627	100 %	0 %	0 %	0 %	501675791
41479	NC_021235	TCG	2	6	2034647	2034652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675791
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41481	NC_021235	ATGACA	2	12	2034766	2034777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	501675791
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41483	NC_021235	ATC	2	6	2034904	2034909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675791
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41489	NC_021235	TCA	2	6	2035254	2035259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675792
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41494	NC_021235	ACC	2	6	2035341	2035346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675792
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41499	NC_021235	GAAT	2	8	2035452	2035459	50 %	25 %	25 %	0 %	501675792
41500	NC_021235	CGA	2	6	2035486	2035491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675792

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