MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 42095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37503	NC_021235	GTT	2	6	1841703	1841708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675607
37504	NC_021235	GCC	2	6	1841713	1841718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675607
37505	NC_021235	GGTC	2	8	1841729	1841736	0 %	25 %	50 %	25 %	501675607
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37512	NC_021235	CTG	2	6	1842081	1842086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675607
37513	NC_021235	GC	3	6	1842091	1842096	0 %	0 %	50 %	50 %	501675607
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37521	NC_021235	ATT	2	6	1842403	1842408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37522	NC_021235	CAT	2	6	1842418	1842423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37618	NC_021235	CAC	2	6	1847676	1847681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675613
37619	NC_021235	GGC	2	6	1847697	1847702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675613
37620	NC_021235	CAC	2	6	1847775	1847780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675613
37621	NC_021235	GTA	2	6	1847928	1847933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675613
37622	NC_021235	AAC	2	6	1847955	1847960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675613
37623	NC_021235	CGG	2	6	1848104	1848109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675613
37624	NC_021235	GAA	3	9	1848180	1848188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675613
37625	NC_021235	CCA	2	6	1848218	1848223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675613
37626	NC_021235	GCG	2	6	1848246	1848251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675613
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37634	NC_021235	CGT	2	6	1848611	1848616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675613
37635	NC_021235	AG	3	6	1848618	1848623	50 %	0 %	50 %	0 %	501675613
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37643	NC_021235	T	6	6	1849249	1849254	0 %	100 %	0 %	0 %	501675613
37644	NC_021235	GCAA	2	8	1849312	1849319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37645	NC_021235	A	7	7	1849394	1849400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37646	NC_021235	T	7	7	1849427	1849433	0 %	100 %	0 %	0 %	501675614
37647	NC_021235	T	7	7	1849500	1849506	0 %	100 %	0 %	0 %	501675614
37648	NC_021235	T	7	7	1849544	1849550	0 %	100 %	0 %	0 %	501675614
37649	NC_021235	AGAT	2	8	1849655	1849662	50 %	25 %	25 %	0 %	501675614
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37654	NC_021235	TGATT	2	10	1849914	1849923	20 %	60 %	20 %	0 %	501675614
37655	NC_021235	ATA	2	6	1849948	1849953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37656	NC_021235	GTG	2	6	1849969	1849974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37657	NC_021235	CGT	2	6	1850022	1850027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37658	NC_021235	CT	3	6	1850079	1850084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37659	NC_021235	ACGGA	2	10	1850189	1850198	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37660	NC_021235	AT	3	6	1850245	1850250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37661	NC_021235	CTT	2	6	1850282	1850287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37663	NC_021235	ATTA	2	8	1850376	1850383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37664	NC_021235	CA	3	6	1850390	1850395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37665	NC_021235	TTA	2	6	1850426	1850431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37678	NC_021235	GGC	2	6	1851170	1851175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675615
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37682	NC_021235	GCTA	2	8	1851311	1851318	25 %	25 %	25 %	25 %	501675615
37683	NC_021235	GTTGA	2	10	1851356	1851365	20 %	40 %	40 %	0 %	501675615
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37689	NC_021235	GTC	2	6	1851759	1851764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675615
37690	NC_021235	GTT	2	6	1851779	1851784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675615
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37692	NC_021235	TGG	3	9	1851910	1851918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675615
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37694	NC_021235	GGC	3	9	1851941	1851949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675615
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37721	NC_021235	CT	4	8	1853181	1853188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37722	NC_021235	ACCG	2	8	1853228	1853235	25 %	0 %	25 %	50 %	501675616
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37727	NC_021235	ATC	2	6	1853420	1853425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675616
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37729	NC_021235	GTC	2	6	1853527	1853532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675616
37730	NC_021235	CAA	2	6	1853550	1853555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675616
37731	NC_021235	GCT	2	6	1853623	1853628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675616
37732	NC_021235	AGG	2	6	1853636	1853641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675616
37733	NC_021235	TCG	2	6	1853645	1853650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675616
37734	NC_021235	GGT	2	6	1853683	1853688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675616
37735	NC_021235	CAG	2	6	1853689	1853694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675616
37736	NC_021235	TCA	2	6	1853700	1853705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675616
37737	NC_021235	CGGTT	2	10	1853727	1853736	0 %	40 %	40 %	20 %	501675616
37738	NC_021235	TCC	2	6	1853753	1853758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37739	NC_021235	TAT	2	6	1853831	1853836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37740	NC_021235	AGTT	2	8	1853863	1853870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37741	NC_021235	TCA	2	6	1853949	1853954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37742	NC_021235	TGC	2	6	1854080	1854085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675617
37743	NC_021235	CGG	2	6	1854111	1854116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675617
37744	NC_021235	TCC	2	6	1854136	1854141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675617
37745	NC_021235	CGG	3	9	1854213	1854221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675617
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37749	NC_021235	CGA	2	6	1854339	1854344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675617
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37752	NC_021235	ACCA	2	8	1854476	1854483	50 %	0 %	0 %	50 %	501675617
37753	NC_021235	CAAC	2	8	1854497	1854504	50 %	0 %	0 %	50 %	501675617
37754	NC_021235	CGA	3	9	1854525	1854533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675617
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37756	NC_021235	GGC	2	6	1854703	1854708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675617
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37763	NC_021235	GTG	2	6	1855000	1855005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675617
37764	NC_021235	TTC	2	6	1855088	1855093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37765	NC_021235	GGC	2	6	1855198	1855203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37766	NC_021235	CCA	2	6	1855223	1855228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37767	NC_021235	A	7	7	1855232	1855238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37768	NC_021235	T	7	7	1855255	1855261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37769	NC_021235	GGC	2	6	1855273	1855278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675618
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37773	NC_021235	GCT	2	6	1855615	1855620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675618
37774	NC_021235	CGT	3	9	1855678	1855686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675618
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37803	NC_021235	TGGC	2	8	1856511	1856518	0 %	25 %	50 %	25 %	501675619
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37807	NC_021235	TTG	2	6	1856588	1856593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675619
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37837	NC_021235	TCC	2	6	1858097	1858102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675622
37838	NC_021235	ACG	2	6	1858235	1858240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675622
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37840	NC_021235	TAA	2	6	1858299	1858304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37841	NC_021235	GGT	2	6	1858353	1858358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37842	NC_021235	ACTG	2	8	1858438	1858445	25 %	25 %	25 %	25 %	501675623
37843	NC_021235	TGA	2	6	1858455	1858460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675623
37844	NC_021235	AGC	2	6	1858516	1858521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675623
37845	NC_021235	ATG	2	6	1858524	1858529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675623
37846	NC_021235	CCGGG	2	10	1858530	1858539	0 %	0 %	60 %	40 %	501675623
37847	NC_021235	GCC	2	6	1858562	1858567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675623
37848	NC_021235	ATC	2	6	1858667	1858672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675623
37849	NC_021235	TGGGC	2	10	1858683	1858692	0 %	20 %	60 %	20 %	501675623
37850	NC_021235	GGC	2	6	1858741	1858746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675623
37851	NC_021235	TCG	2	6	1858839	1858844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675623
37852	NC_021235	CAA	2	6	1858909	1858914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675623
37853	NC_021235	TGA	2	6	1858923	1858928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675623
37854	NC_021235	GTT	2	6	1858966	1858971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675623
37855	NC_021235	TCA	2	6	1858974	1858979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675623
37856	NC_021235	ACC	2	6	1858992	1858997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675623
37857	NC_021235	CTT	2	6	1858999	1859004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675623
37858	NC_021235	TGGG	2	8	1859016	1859023	0 %	25 %	75 %	0 %	501675623
37859	NC_021235	CGA	2	6	1859037	1859042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675623
37860	NC_021235	TCT	2	6	1859046	1859051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675623
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37864	NC_021235	ATC	2	6	1859129	1859134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675623
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37866	NC_021235	CTC	3	9	1859329	1859337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675623
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37870	NC_021235	CGC	2	6	1859449	1859454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675623
37871	NC_021235	G	6	6	1859458	1859463	0 %	0 %	100 %	0 %	501675623
37872	NC_021235	CTG	2	6	1859510	1859515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675623
37873	NC_021235	ATC	2	6	1859540	1859545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675623
37874	NC_021235	GCGCAA	2	12	1859551	1859562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675623
37875	NC_021235	G	6	6	1859578	1859583	0 %	0 %	100 %	0 %	501675623
37876	NC_021235	ATT	2	6	1859702	1859707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675623
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37879	NC_021235	AGCA	2	8	1859786	1859793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37880	NC_021235	TGA	2	6	1859800	1859805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37881	NC_021235	TAA	2	6	1859936	1859941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675624
37882	NC_021235	TTAG	2	8	1859947	1859954	25 %	50 %	25 %	0 %	501675624
37883	NC_021235	GTG	2	6	1859985	1859990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675624
37884	NC_021235	CTG	2	6	1860047	1860052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675624
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37887	NC_021235	TAG	2	6	1860488	1860493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675624
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37889	NC_021235	GA	3	6	1860586	1860591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37890	NC_021235	CAAT	2	8	1860793	1860800	50 %	25 %	0 %	25 %	501675625
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37929	NC_021235	ATA	2	6	1863128	1863133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37930	NC_021235	AG	3	6	1863149	1863154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37931	NC_021235	TC	3	6	1863175	1863180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37932	NC_021235	TTG	2	6	1863187	1863192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37962	NC_021235	ACG	2	6	1864322	1864327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675628
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37967	NC_021235	CCA	2	6	1864721	1864726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675628
37968	NC_021235	GCC	2	6	1864762	1864767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675628
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