MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 42095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_021235	CTT	2	6	1328846	1328851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675086
27003	NC_021235	CGGCCT	2	12	1328852	1328863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	501675086
27004	NC_021235	GCC	2	6	1328866	1328871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675086
27005	NC_021235	GCC	2	6	1328881	1328886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675086
27006	NC_021235	CCGTT	2	10	1328961	1328970	0 %	40 %	20 %	40 %	501675086
27007	NC_021235	AAG	2	6	1329035	1329040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675086
27008	NC_021235	A	7	7	1329089	1329095	100 %	0 %	0 %	0 %	501675086
27009	NC_021235	CG	3	6	1329104	1329109	0 %	0 %	50 %	50 %	501675086
27010	NC_021235	TGG	2	6	1329179	1329184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675086
27011	NC_021235	GCC	2	6	1329274	1329279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675086
27012	NC_021235	GATG	2	8	1329372	1329379	25 %	25 %	50 %	0 %	501675086
27013	NC_021235	GAC	2	6	1329421	1329426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675086
27014	NC_021235	TGG	2	6	1329467	1329472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675086
27015	NC_021235	GAATT	2	10	1329491	1329500	40 %	40 %	20 %	0 %	501675086
27016	NC_021235	CTAA	2	8	1329539	1329546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27017	NC_021235	GGT	2	6	1329598	1329603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675087
27018	NC_021235	GCC	2	6	1329696	1329701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675087
27019	NC_021235	GCC	2	6	1329729	1329734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675087
27020	NC_021235	TGG	2	6	1329747	1329752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675087
27021	NC_021235	GAA	2	6	1329806	1329811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675087
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27024	NC_021235	AAG	2	6	1329887	1329892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675087
27025	NC_021235	CGG	3	9	1329909	1329917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675087
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27028	NC_021235	GCC	2	6	1330043	1330048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675087
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27030	NC_021235	CTG	2	6	1330196	1330201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675087
27031	NC_021235	CAA	2	6	1330271	1330276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675087
27032	NC_021235	ACC	2	6	1330284	1330289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675087
27033	NC_021235	GAT	2	6	1330324	1330329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675087
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27035	NC_021235	TTA	2	6	1330439	1330444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675087
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27038	NC_021235	GGC	2	6	1330475	1330480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675087
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27042	NC_021235	CCG	2	6	1330624	1330629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675087
27043	NC_021235	GGCG	2	8	1330669	1330676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27044	NC_021235	T	6	6	1330693	1330698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27045	NC_021235	AGG	2	6	1330699	1330704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27046	NC_021235	TCAAGC	2	12	1330852	1330863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501675088
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27050	NC_021235	CCTC	2	8	1330948	1330955	0 %	25 %	0 %	75 %	501675088
27051	NC_021235	ACG	2	6	1331017	1331022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675088
27052	NC_021235	GGC	2	6	1331024	1331029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675088
27053	NC_021235	GGGC	2	8	1331092	1331099	0 %	0 %	75 %	25 %	501675088
27054	NC_021235	GACGCC	2	12	1331139	1331150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	501675088
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27059	NC_021235	CCT	2	6	1331444	1331449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675088
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27061	NC_021235	GGC	2	6	1331493	1331498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675088
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27069	NC_021235	GTAA	2	8	1331832	1331839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27070	NC_021235	AAG	2	6	1331893	1331898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27071	NC_021235	CTT	2	6	1331926	1331931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27072	NC_021235	T	6	6	1331930	1331935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27073	NC_021235	AGT	2	6	1332065	1332070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675089
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27083	NC_021235	GAT	2	6	1332510	1332515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675089
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27086	NC_021235	ACC	2	6	1332738	1332743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27087	NC_021235	ATC	2	6	1332776	1332781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27092	NC_021235	GTA	2	6	1333072	1333077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675090
27093	NC_021235	GCTTT	2	10	1333115	1333124	0 %	60 %	20 %	20 %	501675090
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27102	NC_021235	TAT	2	6	1333703	1333708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501675090
27103	NC_021235	GTTA	2	8	1333728	1333735	25 %	50 %	25 %	0 %	501675090
27104	NC_021235	T	6	6	1333745	1333750	0 %	100 %	0 %	0 %	501675091
27105	NC_021235	TCT	2	6	1333905	1333910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675091
27106	NC_021235	TAGT	2	8	1333954	1333961	25 %	50 %	25 %	0 %	501675091
27107	NC_021235	TTG	2	6	1334093	1334098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675091
27108	NC_021235	AGC	2	6	1334110	1334115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675091
27109	NC_021235	CCT	2	6	1334171	1334176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27110	NC_021235	TGATA	2	10	1334181	1334190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27111	NC_021235	ATG	2	6	1334201	1334206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27112	NC_021235	A	6	6	1334245	1334250	100 %	0 %	0 %	0 %	501675092
27113	NC_021235	TCG	2	6	1334270	1334275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675092
27114	NC_021235	GCA	2	6	1334375	1334380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675092
27115	NC_021235	ATGACA	2	12	1334389	1334400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	501675092
27116	NC_021235	T	7	7	1334515	1334521	0 %	100 %	0 %	0 %	501675092
27117	NC_021235	ATC	2	6	1334527	1334532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675092
27118	NC_021235	TA	3	6	1334586	1334591	50 %	50 %	0 %	0 %	501675092
27119	NC_021235	AAG	2	6	1334614	1334619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675092
27120	NC_021235	AT	3	6	1334630	1334635	50 %	50 %	0 %	0 %	501675092
27121	NC_021235	AAAC	2	8	1334656	1334663	75 %	0 %	0 %	25 %	501675092
27122	NC_021235	ATCC	2	8	1334697	1334704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27123	NC_021235	ATTA	2	8	1334736	1334743	50 %	50 %	0 %	0 %	501675093
27124	NC_021235	GAA	2	6	1334762	1334767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675093
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27127	NC_021235	CCA	2	6	1334911	1334916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675093
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27130	NC_021235	TTC	2	6	1334976	1334981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675093
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27133	NC_021235	TTG	2	6	1335137	1335142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675093
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27142	NC_021235	TCT	2	6	1335414	1335419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675093
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27148	NC_021235	TCAT	2	8	1335753	1335760	25 %	50 %	0 %	25 %	501675093
27149	NC_021235	C	6	6	1335786	1335791	0 %	0 %	0 %	100 %	501675093
27150	NC_021235	GCG	2	6	1335795	1335800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675093
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27153	NC_021235	GC	3	6	1336170	1336175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27154	NC_021235	CAC	2	6	1336278	1336283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675094
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27170	NC_021235	TTC	2	6	1337120	1337125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27230	NC_021235	GGCGG	2	10	1340878	1340887	0 %	0 %	80 %	20 %	501675096
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27235	NC_021235	GCC	2	6	1341173	1341178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675096
27236	NC_021235	CTC	2	6	1341271	1341276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675096
27237	NC_021235	AGGC	2	8	1341287	1341294	25 %	0 %	50 %	25 %	501675096
27238	NC_021235	GAT	3	9	1341331	1341339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675096
27239	NC_021235	CT	3	6	1341401	1341406	0 %	50 %	0 %	50 %	501675097
27240	NC_021235	TCA	2	6	1341433	1341438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675097
27241	NC_021235	GCT	2	6	1341443	1341448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675097
27242	NC_021235	CGT	2	6	1341536	1341541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675097
27243	NC_021235	GGT	2	6	1341656	1341661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675097
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27319	NC_021235	TAA	2	6	1345005	1345010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27320	NC_021235	G	6	6	1345026	1345031	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27321	NC_021235	TCA	2	6	1345045	1345050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27327	NC_021235	GCCG	2	8	1345470	1345477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27328	NC_021235	ACT	2	6	1345520	1345525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27330	NC_021235	TGA	2	6	1345696	1345701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675101
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27333	NC_021235	TGT	2	6	1345965	1345970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675101
27334	NC_021235	GTAA	2	8	1345979	1345986	50 %	25 %	25 %	0 %	501675101
27335	NC_021235	GTT	2	6	1346009	1346014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675101
27336	NC_021235	GCTT	2	8	1346161	1346168	0 %	50 %	25 %	25 %	501675101
27337	NC_021235	AGT	2	6	1346309	1346314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675101
27338	NC_021235	TTC	2	6	1346417	1346422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675101
27339	NC_021235	GACC	3	12	1346442	1346453	25 %	0 %	25 %	50 %	501675101
27340	NC_021235	GGC	2	6	1346469	1346474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675101
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27342	NC_021235	CAC	2	6	1346550	1346555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675101
27343	NC_021235	ATTC	2	8	1346622	1346629	25 %	50 %	0 %	25 %	501675101
27344	NC_021235	TTG	3	9	1346742	1346750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675101
27345	NC_021235	TAAT	2	8	1346783	1346790	50 %	50 %	0 %	0 %	501675101
27346	NC_021235	CCT	2	6	1346809	1346814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675102
27347	NC_021235	ATC	2	6	1346825	1346830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675102
27348	NC_021235	ATA	2	6	1346879	1346884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675102
27349	NC_021235	GAC	2	6	1346902	1346907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675102
27350	NC_021235	ATG	2	6	1346988	1346993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675102
27351	NC_021235	ACAG	2	8	1347000	1347007	50 %	0 %	25 %	25 %	501675102
27352	NC_021235	CTT	2	6	1347118	1347123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675102
27353	NC_021235	TTA	2	6	1347144	1347149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27354	NC_021235	TGT	2	6	1347216	1347221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27355	NC_021235	A	6	6	1347224	1347229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27356	NC_021235	TCT	2	6	1347405	1347410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675103
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27372	NC_021235	TA	3	6	1348197	1348202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27373	NC_021235	AGT	2	6	1348203	1348208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27376	NC_021235	TAG	2	6	1348568	1348573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27469	NC_021235	TCAC	2	8	1355905	1355912	25 %	25 %	0 %	50 %	501675110
27470	NC_021235	TTC	2	6	1355937	1355942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27471	NC_021235	GTT	2	6	1356002	1356007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675110
27472	NC_021235	TGACT	2	10	1356078	1356087	20 %	40 %	20 %	20 %	501675110
27473	NC_021235	TTC	2	6	1356090	1356095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27474	NC_021235	GT	3	6	1356119	1356124	0 %	50 %	50 %	0 %	501675110
27475	NC_021235	TTCC	2	8	1356180	1356187	0 %	50 %	0 %	50 %	501675110
27476	NC_021235	TAGCG	2	10	1356290	1356299	20 %	20 %	40 %	20 %	501675110
27477	NC_021235	TGA	2	6	1356309	1356314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675110
27478	NC_021235	CAT	2	6	1356333	1356338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675110
27479	NC_021235	TCT	2	6	1356358	1356363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27480	NC_021235	ATC	3	9	1356366	1356374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675110
27481	NC_021235	AGC	2	6	1356441	1356446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675110
27482	NC_021235	GAC	2	6	1356505	1356510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675110
27483	NC_021235	TCA	2	6	1356550	1356555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675110
27484	NC_021235	TCT	2	6	1356635	1356640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27485	NC_021235	CTT	2	6	1356645	1356650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27486	NC_021235	TCA	2	6	1356703	1356708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675110
27487	NC_021235	CTT	2	6	1356726	1356731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27488	NC_021235	GAA	2	6	1356844	1356849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675110
27489	NC_021235	ATC	2	6	1356900	1356905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675110
27490	NC_021235	AGA	2	6	1356918	1356923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501675110
27491	NC_021235	TTC	2	6	1356961	1356966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675110
27492	NC_021235	AGT	2	6	1357009	1357014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675111
27493	NC_021235	ACT	2	6	1357055	1357060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675111
27494	NC_021235	CCT	2	6	1357110	1357115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675111
27495	NC_021235	TTAC	2	8	1357194	1357201	25 %	50 %	0 %	25 %	501675111
27496	NC_021235	ACCG	2	8	1357243	1357250	25 %	0 %	25 %	50 %	501675111
27497	NC_021235	TC	4	8	1357273	1357280	0 %	50 %	0 %	50 %	501675111
27498	NC_021235	TTC	2	6	1357307	1357312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675111
27499	NC_021235	CTG	2	6	1357319	1357324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675111
27500	NC_021235	TA	3	6	1357516	1357521	50 %	50 %	0 %	0 %	501675111

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