MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 42095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_021235	AAGT	2	8	1280901	1280908	50 %	25 %	25 %	0 %	501675043
26003	NC_021235	CCA	2	6	1280914	1280919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675043
26004	NC_021235	ACC	2	6	1280931	1280936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675043
26005	NC_021235	GCC	2	6	1281114	1281119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675043
26006	NC_021235	TCA	2	6	1281150	1281155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675043
26007	NC_021235	A	6	6	1281202	1281207	100 %	0 %	0 %	0 %	501675043
26008	NC_021235	CAC	2	6	1281284	1281289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675043
26009	NC_021235	CCA	2	6	1281398	1281403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675043
26010	NC_021235	GCC	2	6	1281505	1281510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675043
26011	NC_021235	TTC	2	6	1281524	1281529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675043
26012	NC_021235	AAT	2	6	1281535	1281540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675044
26013	NC_021235	AGCCG	2	10	1281563	1281572	20 %	0 %	40 %	40 %	501675044
26014	NC_021235	CTC	2	6	1281663	1281668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675044
26015	NC_021235	TTGC	2	8	1281695	1281702	0 %	50 %	25 %	25 %	501675044
26016	NC_021235	CG	3	6	1281707	1281712	0 %	0 %	50 %	50 %	501675044
26017	NC_021235	CCG	2	6	1281713	1281718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675044
26018	NC_021235	TTTCC	2	10	1281719	1281728	0 %	60 %	0 %	40 %	501675044
26019	NC_021235	CCG	2	6	1281734	1281739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675044
26020	NC_021235	ACC	3	9	1281781	1281789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675044
26021	NC_021235	CCGT	2	8	1281806	1281813	0 %	25 %	25 %	50 %	501675044
26022	NC_021235	CCA	2	6	1281830	1281835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675044
26023	NC_021235	TCT	2	6	1281910	1281915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675044
26024	NC_021235	TCG	2	6	1281964	1281969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675044
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26028	NC_021235	TTGG	2	8	1282167	1282174	0 %	50 %	50 %	0 %	501675044
26029	NC_021235	TTG	2	6	1282189	1282194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675044
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26031	NC_021235	GTA	2	6	1282218	1282223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675044
26032	NC_021235	TAA	2	6	1282327	1282332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675044
26033	NC_021235	CGA	2	6	1282374	1282379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675044
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26035	NC_021235	GCC	2	6	1282483	1282488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675044
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26037	NC_021235	ACT	2	6	1282561	1282566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675044
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26039	NC_021235	ATG	2	6	1282636	1282641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675044
26040	NC_021235	ATC	2	6	1282650	1282655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675044
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26042	NC_021235	TCA	2	6	1282679	1282684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675044
26043	NC_021235	TAA	2	6	1282750	1282755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675044
26044	NC_021235	CGCT	2	8	1282768	1282775	0 %	25 %	25 %	50 %	501675044
26045	NC_021235	ATC	2	6	1282794	1282799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675044
26046	NC_021235	C	6	6	1282817	1282822	0 %	0 %	0 %	100 %	501675044
26047	NC_021235	GTC	2	6	1282854	1282859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675044
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26049	NC_021235	TGG	3	9	1282877	1282885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675044
26050	NC_021235	TCCC	2	8	1283055	1283062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26051	NC_021235	A	7	7	1283067	1283073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26052	NC_021235	T	6	6	1283086	1283091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26053	NC_021235	A	7	7	1283135	1283141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26054	NC_021235	AG	3	6	1283148	1283153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26055	NC_021235	GA	3	6	1283165	1283170	50 %	0 %	50 %	0 %	501675045
26056	NC_021235	CGAC	2	8	1283341	1283348	25 %	0 %	25 %	50 %	501675045
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26107	NC_021235	CCT	2	6	1285361	1285366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26108	NC_021235	GAA	2	6	1285433	1285438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26110	NC_021235	GAG	2	6	1285489	1285494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26111	NC_021235	CCCA	2	8	1285502	1285509	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
26112	NC_021235	GTA	2	6	1285521	1285526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26117	NC_021235	TCG	2	6	1285891	1285896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675047
26118	NC_021235	TTG	2	6	1285921	1285926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675047
26119	NC_021235	TCT	2	6	1285930	1285935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675047
26120	NC_021235	CTTG	2	8	1285940	1285947	0 %	50 %	25 %	25 %	501675047
26121	NC_021235	GTTG	2	8	1285994	1286001	0 %	50 %	50 %	0 %	501675047
26122	NC_021235	GTC	2	6	1286037	1286042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675047
26123	NC_021235	CTT	2	6	1286075	1286080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26124	NC_021235	CAAAC	2	10	1286137	1286146	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26125	NC_021235	CTT	2	6	1286184	1286189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675048
26126	NC_021235	ATG	2	6	1286213	1286218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675048
26127	NC_021235	TCCCCG	2	12	1286322	1286333	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	501675048
26128	NC_021235	TTC	2	6	1286335	1286340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675048
26129	NC_021235	TGT	2	6	1286421	1286426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675048
26130	NC_021235	GGC	2	6	1286527	1286532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675048
26131	NC_021235	CGG	2	6	1286592	1286597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675048
26132	NC_021235	CTT	2	6	1286727	1286732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675048
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26134	NC_021235	GTT	2	6	1286748	1286753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675048
26135	NC_021235	TATC	2	8	1286830	1286837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26136	NC_021235	AGG	2	6	1286920	1286925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26142	NC_021235	GCC	2	6	1287090	1287095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675049
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26166	NC_021235	GGTG	2	8	1288348	1288355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26167	NC_021235	TTC	2	6	1288421	1288426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26172	NC_021235	GCCA	2	8	1288712	1288719	25 %	0 %	25 %	50 %	501675051
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26203	NC_021235	TCC	2	6	1290095	1290100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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26205	NC_021235	TAAA	2	8	1290108	1290115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26206	NC_021235	AAT	2	6	1290124	1290129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26207	NC_021235	ATT	2	6	1290189	1290194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26208	NC_021235	AGA	2	6	1290245	1290250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26209	NC_021235	ACT	2	6	1290328	1290333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675053
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26211	NC_021235	TGG	2	6	1290387	1290392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675053
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26220	NC_021235	CAAG	2	8	1290775	1290782	50 %	0 %	25 %	25 %	501675053
26221	NC_021235	GCA	2	6	1290871	1290876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675053
26222	NC_021235	GGC	2	6	1290916	1290921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675053
26223	NC_021235	CTG	2	6	1290926	1290931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675053
26224	NC_021235	CTT	2	6	1290964	1290969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675053
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26226	NC_021235	CGACC	2	10	1291048	1291057	20 %	0 %	20 %	60 %	501675053
26227	NC_021235	CTA	2	6	1291105	1291110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675053
26228	NC_021235	CGC	2	6	1291111	1291116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675053
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26231	NC_021235	CGA	2	6	1291243	1291248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675053
26232	NC_021235	CTG	2	6	1291268	1291273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675053
26233	NC_021235	ACC	2	6	1291274	1291279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675053
26234	NC_021235	ACG	2	6	1291332	1291337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675053
26235	NC_021235	ACA	2	6	1291413	1291418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675053
26236	NC_021235	AAC	2	6	1291449	1291454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675053
26237	NC_021235	ACT	2	6	1291479	1291484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675053
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26240	NC_021235	AAC	2	6	1291670	1291675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675053
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26242	NC_021235	CGT	2	6	1291756	1291761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675053
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26246	NC_021235	AGG	2	6	1292149	1292154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26247	NC_021235	ACC	2	6	1292161	1292166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26248	NC_021235	GGC	3	9	1292237	1292245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501675054
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26251	NC_021235	CCGT	2	8	1292344	1292351	0 %	25 %	25 %	50 %	501675054
26252	NC_021235	TAAG	2	8	1292680	1292687	50 %	25 %	25 %	0 %	501675054
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26275	NC_021235	C	6	6	1294431	1294436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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26277	NC_021235	G	6	6	1294458	1294463	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26278	NC_021235	TTTTTC	2	12	1294581	1294592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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26280	NC_021235	ATTAG	2	10	1294696	1294705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26281	NC_021235	ATCA	2	8	1294725	1294732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26282	NC_021235	CTG	2	6	1294743	1294748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26284	NC_021235	GGAA	2	8	1294842	1294849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26285	NC_021235	T	7	7	1294916	1294922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26286	NC_021235	ATA	2	6	1294943	1294948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501675056
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26313	NC_021235	AAT	2	6	1296126	1296131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26315	NC_021235	TGG	2	6	1296191	1296196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26323	NC_021235	TAT	2	6	1296439	1296444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26329	NC_021235	T	6	6	1296710	1296715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26330	NC_021235	A	6	6	1296764	1296769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26331	NC_021235	CCAAA	2	10	1296805	1296814	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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26335	NC_021235	TA	3	6	1296967	1296972	50 %	50 %	0 %	0 %	501675057
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26337	NC_021235	A	6	6	1297109	1297114	100 %	0 %	0 %	0 %	501675057
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26339	NC_021235	TGA	2	6	1297176	1297181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675057
26340	NC_021235	TACGC	2	10	1297255	1297264	20 %	20 %	20 %	40 %	501675057
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26345	NC_021235	AG	3	6	1297554	1297559	50 %	0 %	50 %	0 %	501675057
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26349	NC_021235	AAGA	2	8	1297884	1297891	75 %	0 %	25 %	0 %	501675057
26350	NC_021235	TGG	2	6	1297896	1297901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675057
26351	NC_021235	TCT	2	6	1297906	1297911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675057
26352	NC_021235	ACC	2	6	1298093	1298098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675058
26353	NC_021235	GAG	2	6	1298103	1298108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	501675058
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26355	NC_021235	GTC	2	6	1298172	1298177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675058
26356	NC_021235	CAA	2	6	1298180	1298185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501675058
26357	NC_021235	GTT	2	6	1298258	1298263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675058
26358	NC_021235	CGAT	2	8	1298317	1298324	25 %	25 %	25 %	25 %	501675058
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26362	NC_021235	TTG	2	6	1298541	1298546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26462	NC_021235	TGATC	2	10	1303459	1303468	20 %	40 %	20 %	20 %	501675062
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26467	NC_021235	TCGA	2	8	1303863	1303870	25 %	25 %	25 %	25 %	501675062
26468	NC_021235	TGA	2	6	1303954	1303959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675062
26469	NC_021235	ACC	2	6	1303992	1303997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675062
26470	NC_021235	CCGTC	2	10	1304044	1304053	0 %	20 %	20 %	60 %	501675062
26471	NC_021235	TCCC	2	8	1304086	1304093	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26472	NC_021235	TCATC	2	10	1304094	1304103	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26473	NC_021235	GGT	2	6	1304289	1304294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675063
26474	NC_021235	TGG	2	6	1304321	1304326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675063
26475	NC_021235	CCA	2	6	1304352	1304357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675063
26476	NC_021235	ACC	3	9	1304417	1304425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675063
26477	NC_021235	CTT	2	6	1304431	1304436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501675063
26478	NC_021235	ATC	2	6	1304471	1304476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675063
26479	NC_021235	CGA	2	6	1304653	1304658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675063
26480	NC_021235	CAC	2	6	1304722	1304727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675063
26481	NC_021235	GAC	2	6	1304746	1304751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501675063
26482	NC_021235	CAC	2	6	1304836	1304841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675063
26483	NC_021235	CAT	2	6	1304904	1304909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675063
26484	NC_021235	CCGT	2	8	1304987	1304994	0 %	25 %	25 %	50 %	501675063
26485	NC_021235	GTT	2	6	1305011	1305016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501675063
26486	NC_021235	TCC	2	6	1305030	1305035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501675064
26487	NC_021235	ATG	3	9	1305042	1305050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675064
26488	NC_021235	GTA	2	6	1305115	1305120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501675064
26489	NC_021235	TGG	2	6	1305147	1305152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501675064
26490	NC_021235	CGAT	2	8	1305156	1305163	25 %	25 %	25 %	25 %	501675064
26491	NC_021235	TCA	2	6	1305235	1305240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675064
26492	NC_021235	CAC	2	6	1305251	1305256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675064
26493	NC_021235	CTG	2	6	1305290	1305295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675064
26494	NC_021235	GCC	2	6	1305315	1305320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675064
26495	NC_021235	CGT	2	6	1305322	1305327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501675064
26496	NC_021235	GGTT	2	8	1305334	1305341	0 %	50 %	50 %	0 %	501675064
26497	NC_021235	TCA	2	6	1305555	1305560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501675065
26498	NC_021235	CGC	2	6	1305564	1305569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501675065
26499	NC_021235	CAC	2	6	1305628	1305633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501675065
26500	NC_021235	T	6	6	1305676	1305681	0 %	100 %	0 %	0 %	501675065

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