MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8

Total Repeats: 59408

< Previous12...6263646566676869707172...118119Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_021224	ATA	2	6	1687594	1687599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_021224	GCT	2	6	1687793	1687798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146940
33005	NC_021224	TAG	2	6	1687812	1687817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146940
33006	NC_021224	TCA	2	6	1687877	1687882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146940
33007	NC_021224	GCG	2	6	1687970	1687975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	501146940
33008	NC_021224	TAC	2	6	1688028	1688033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146940
33009	NC_021224	TGC	2	6	1688240	1688245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146940
33010	NC_021224	ATC	2	6	1688407	1688412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146940
33011	NC_021224	TAA	2	6	1688421	1688426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146940
33012	NC_021224	ATA	2	6	1688449	1688454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146940
33013	NC_021224	AAT	2	6	1688472	1688477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146940
33014	NC_021224	CGC	2	6	1688494	1688499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501146940
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33020	NC_021224	TAT	2	6	1688679	1688684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146940
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33022	NC_021224	ATG	2	6	1688731	1688736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146940
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33027	NC_021224	TCAT	2	8	1688910	1688917	25 %	50 %	0 %	25 %	501146941
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33032	NC_021224	AAT	2	6	1689500	1689505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146941
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33039	NC_021224	CTC	3	9	1689692	1689700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33040	NC_021224	TAA	2	6	1689705	1689710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146942
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33065	NC_021224	TAA	2	6	1690702	1690707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146942
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33072	NC_021224	GTT	3	9	1691229	1691237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146942
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33081	NC_021224	CTAGT	2	10	1691590	1691599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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33083	NC_021224	CAA	2	6	1691729	1691734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33084	NC_021224	ATT	2	6	1691801	1691806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33092	NC_021224	AC	3	6	1692518	1692523	50 %	0 %	0 %	50 %	501146943
33093	NC_021224	A	6	6	1692529	1692534	100 %	0 %	0 %	0 %	501146943
33094	NC_021224	CGT	2	6	1692591	1692596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146943
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33102	NC_021224	GTC	2	6	1692976	1692981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146943
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33107	NC_021224	TAT	2	6	1693127	1693132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146943
33108	NC_021224	C	6	6	1693143	1693148	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33109	NC_021224	ATAA	2	8	1693149	1693156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33110	NC_021224	T	6	6	1693213	1693218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33111	NC_021224	TTAA	2	8	1693223	1693230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33112	NC_021224	TAA	2	6	1693268	1693273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_021224	ACA	2	6	1693315	1693320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33114	NC_021224	ATT	2	6	1693328	1693333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33115	NC_021224	GTT	2	6	1693352	1693357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33116	NC_021224	AATA	2	8	1693419	1693426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33117	NC_021224	CAG	2	6	1693434	1693439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33118	NC_021224	TTA	2	6	1693455	1693460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33119	NC_021224	GC	3	6	1693530	1693535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33120	NC_021224	CGT	2	6	1693587	1693592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33121	NC_021224	GTTGA	2	10	1693598	1693607	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33122	NC_021224	T	7	7	1693613	1693619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33123	NC_021224	A	6	6	1693687	1693692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33124	NC_021224	T	6	6	1693709	1693714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33125	NC_021224	A	6	6	1693787	1693792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33126	NC_021224	CACCTA	2	12	1693796	1693807	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33127	NC_021224	A	6	6	1693822	1693827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33128	NC_021224	AATG	2	8	1693878	1693885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33129	NC_021224	CCA	2	6	1693907	1693912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33130	NC_021224	ATT	2	6	1693913	1693918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33144	NC_021224	TGGC	2	8	1694416	1694423	0 %	25 %	50 %	25 %	501146945
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33152	NC_021224	GCTA	2	8	1694636	1694643	25 %	25 %	25 %	25 %	501146946
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33194	NC_021224	TTG	2	6	1697357	1697362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146950
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33234	NC_021224	CCT	2	6	1699602	1699607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501146951
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33236	NC_021224	TGC	2	6	1699717	1699722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146952
33237	NC_021224	TCG	2	6	1699743	1699748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146952
33238	NC_021224	TGT	2	6	1699843	1699848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146952
33239	NC_021224	TA	3	6	1699945	1699950	50 %	50 %	0 %	0 %	501146952
33240	NC_021224	CAT	2	6	1699975	1699980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33241	NC_021224	CAT	2	6	1699993	1699998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33242	NC_021224	CA	3	6	1700017	1700022	50 %	0 %	0 %	50 %	501146952
33243	NC_021224	GTAC	2	8	1700023	1700030	25 %	25 %	25 %	25 %	501146952
33244	NC_021224	TCA	3	9	1700094	1700102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33245	NC_021224	CTT	2	6	1700206	1700211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501146952
33246	NC_021224	GCC	2	6	1700234	1700239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	501146952
33247	NC_021224	ATC	2	6	1700250	1700255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33248	NC_021224	ATT	2	6	1700273	1700278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146952
33249	NC_021224	GGT	2	6	1700303	1700308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501146952
33250	NC_021224	TA	3	6	1700336	1700341	50 %	50 %	0 %	0 %	501146952
33251	NC_021224	TAT	2	6	1700572	1700577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146952
33252	NC_021224	AAAT	2	8	1700587	1700594	75 %	25 %	0 %	0 %	501146952
33253	NC_021224	GTG	2	6	1700667	1700672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501146952
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33256	NC_021224	GGT	2	6	1700983	1700988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	501146952
33257	NC_021224	TCA	3	9	1701114	1701122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33258	NC_021224	CTG	2	6	1701148	1701153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146952
33259	NC_021224	GTT	2	6	1701210	1701215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146952
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33261	NC_021224	TAA	2	6	1701377	1701382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146952
33262	NC_021224	TGCT	2	8	1701385	1701392	0 %	50 %	25 %	25 %	501146952
33263	NC_021224	TCA	2	6	1701424	1701429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33264	NC_021224	TAG	2	6	1701433	1701438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146952
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33266	NC_021224	ATG	2	6	1701530	1701535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146952
33267	NC_021224	GT	3	6	1701541	1701546	0 %	50 %	50 %	0 %	501146952
33268	NC_021224	TAG	2	6	1701586	1701591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146952
33269	NC_021224	TTC	2	6	1701605	1701610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501146952
33270	NC_021224	TA	3	6	1701618	1701623	50 %	50 %	0 %	0 %	501146952
33271	NC_021224	AGAT	2	8	1701644	1701651	50 %	25 %	25 %	0 %	501146952
33272	NC_021224	ATA	2	6	1701656	1701661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146952
33273	NC_021224	ACT	2	6	1701681	1701686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33274	NC_021224	CAT	2	6	1701802	1701807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146952
33275	NC_021224	TAG	2	6	1701874	1701879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146952
33276	NC_021224	CCT	2	6	1701960	1701965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33277	NC_021224	GTT	2	6	1702012	1702017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146953
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33294	NC_021224	GTCAT	2	10	1703397	1703406	20 %	40 %	20 %	20 %	501146953
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33298	NC_021224	TTGA	2	8	1703842	1703849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33299	NC_021224	CAT	2	6	1703867	1703872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146954
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33302	NC_021224	AATG	2	8	1703936	1703943	50 %	25 %	25 %	0 %	501146954
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33306	NC_021224	TTG	2	6	1704129	1704134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146954
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33308	NC_021224	TGA	2	6	1704166	1704171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146954
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33310	NC_021224	TAGCGT	2	12	1704370	1704381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	501146954
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33323	NC_021224	TTGT	2	8	1704975	1704982	0 %	75 %	25 %	0 %	501146954
33324	NC_021224	CTAGAA	2	12	1705014	1705025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	501146954
33325	NC_021224	ACC	2	6	1705069	1705074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146954
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33333	NC_021224	TAG	2	6	1705516	1705521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146954
33334	NC_021224	ACCAGT	2	12	1705556	1705567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	501146954
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33337	NC_021224	AGT	2	6	1705981	1705986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146954
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33340	NC_021224	AGAAA	2	10	1706075	1706084	80 %	0 %	20 %	0 %	501146954
33341	NC_021224	CTT	2	6	1706192	1706197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501146954
33342	NC_021224	AAG	2	6	1706211	1706216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501146954
33343	NC_021224	ATT	2	6	1706246	1706251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146954
33344	NC_021224	TTA	2	6	1706424	1706429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146954
33345	NC_021224	CAG	2	6	1706494	1706499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501146954
33346	NC_021224	TAA	2	6	1706525	1706530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146954
33347	NC_021224	ATA	2	6	1706680	1706685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	501146954
33348	NC_021224	ACC	2	6	1706849	1706854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146954
33349	NC_021224	CAA	2	6	1706977	1706982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	501146954
33350	NC_021224	T	6	6	1707080	1707085	0 %	100 %	0 %	0 %	501146954
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33352	NC_021224	TAG	2	6	1707247	1707252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	501146954
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33468	NC_021224	TTATCC	2	12	1712995	1713006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	501146963
33469	NC_021224	TCA	2	6	1713023	1713028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33470	NC_021224	TTA	2	6	1713031	1713036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146963
33471	NC_021224	TTG	2	6	1713084	1713089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146963
33472	NC_021224	GCCA	2	8	1713345	1713352	25 %	0 %	25 %	50 %	501146963
33473	NC_021224	CCA	2	6	1713460	1713465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146963
33474	NC_021224	TTC	2	6	1713489	1713494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501146963
33475	NC_021224	ATC	2	6	1713495	1713500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33476	NC_021224	CGT	2	6	1713503	1713508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146963
33477	NC_021224	TCA	2	6	1713526	1713531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33478	NC_021224	CTG	2	6	1713563	1713568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146963
33479	NC_021224	ATC	2	6	1713603	1713608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33480	NC_021224	ATC	2	6	1713625	1713630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33481	NC_021224	CTTT	2	8	1713632	1713639	0 %	75 %	0 %	25 %	501146963
33482	NC_021224	TCA	2	6	1713641	1713646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146963
33483	NC_021224	CCT	2	6	1713653	1713658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	501146963
33484	NC_021224	TTG	2	6	1713679	1713684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	501146964
33485	NC_021224	CTG	2	6	1713733	1713738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146964
33486	NC_021224	ATT	2	6	1713757	1713762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146964
33487	NC_021224	TGC	2	6	1713799	1713804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146964
33488	NC_021224	CAG	2	6	1713828	1713833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501146964
33489	NC_021224	TTA	2	6	1713866	1713871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	501146964
33490	NC_021224	CAGCT	2	10	1713874	1713883	20 %	20 %	20 %	40 %	501146964
33491	NC_021224	CCA	2	6	1714103	1714108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146964
33492	NC_021224	TCT	2	6	1714158	1714163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	501146964
33493	NC_021224	AGC	2	6	1714169	1714174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	501146964
33494	NC_021224	ATAG	2	8	1714187	1714194	50 %	25 %	25 %	0 %	501146964
33495	NC_021224	ACTC	2	8	1714266	1714273	25 %	25 %	0 %	50 %	501146964
33496	NC_021224	ACC	2	6	1714306	1714311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146964
33497	NC_021224	GAA	2	6	1714362	1714367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	501146964
33498	NC_021224	TCA	2	6	1714382	1714387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	501146964
33499	NC_021224	CAC	2	6	1714512	1714517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	501146964
33500	NC_021224	CTG	2	6	1714656	1714661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	501146964

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