MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020558	GTAAAA	2	12	151151	151162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470208936
3502	NC_020558	GAA	2	6	151235	151240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208936
3503	NC_020558	AAC	2	6	151296	151301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208936
3504	NC_020558	A	6	6	151320	151325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020558	A	6	6	151332	151337	100 %	0 %	0 %	0 %	470208937
3506	NC_020558	TCAG	2	8	151350	151357	25 %	25 %	25 %	25 %	470208937
3507	NC_020558	GGA	2	6	151364	151369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208937
3508	NC_020558	GAA	2	6	151431	151436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208937
3509	NC_020558	CTTT	2	8	151479	151486	0 %	75 %	0 %	25 %	470208937
3510	NC_020558	GCA	2	6	151568	151573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208937
3511	NC_020558	AAGG	2	8	151620	151627	50 %	0 %	50 %	0 %	470208937
3512	NC_020558	ATG	2	6	151669	151674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208937
3513	NC_020558	A	6	6	151707	151712	100 %	0 %	0 %	0 %	470208937
3514	NC_020558	TGA	2	6	151796	151801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208938
3515	NC_020558	ATT	2	6	151810	151815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208938
3516	NC_020558	ATT	2	6	151836	151841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208938
3517	NC_020558	TTTC	2	8	151858	151865	0 %	75 %	0 %	25 %	470208938
3518	NC_020558	TCC	2	6	151879	151884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208938
3519	NC_020558	AAT	2	6	151922	151927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208938
3520	NC_020558	TTA	2	6	151959	151964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208938
3521	NC_020558	AAG	2	6	152033	152038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208938
3522	NC_020558	AGA	2	6	152057	152062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208938
3523	NC_020558	GC	3	6	152120	152125	0 %	0 %	50 %	50 %	470208938
3524	NC_020558	AGA	2	6	152231	152236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208938
3525	NC_020558	AGC	2	6	152249	152254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208938
3526	NC_020558	AAG	2	6	152386	152391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208938
3527	NC_020558	GGAA	2	8	152408	152415	50 %	0 %	50 %	0 %	470208938
3528	NC_020558	ACC	2	6	152447	152452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208938
3529	NC_020558	ATG	2	6	152464	152469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208938
3530	NC_020558	TGG	2	6	152568	152573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208939
3531	NC_020558	TTC	2	6	152588	152593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208939
3532	NC_020558	CGT	2	6	152644	152649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208939
3533	NC_020558	AAG	2	6	152685	152690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208939
3534	NC_020558	A	6	6	152719	152724	100 %	0 %	0 %	0 %	470208939
3535	NC_020558	GAG	3	9	152764	152772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208939
3536	NC_020558	AGA	2	6	152855	152860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3537	NC_020558	AAG	2	6	152890	152895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3538	NC_020558	ATT	2	6	152901	152906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208940
3539	NC_020558	ATC	2	6	152977	152982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208940
3540	NC_020558	AGA	2	6	153002	153007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3541	NC_020558	ATT	2	6	153012	153017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208940
3542	NC_020558	GTG	2	6	153039	153044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208940
3543	NC_020558	AGTG	2	8	153050	153057	25 %	25 %	50 %	0 %	470208940
3544	NC_020558	TGC	2	6	153152	153157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208940
3545	NC_020558	TTTTAC	2	12	153198	153209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470208940
3546	NC_020558	TTC	2	6	153214	153219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208940
3547	NC_020558	GGC	2	6	153260	153265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208940
3548	NC_020558	GAA	2	6	153270	153275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3549	NC_020558	CAC	2	6	153295	153300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208940
3550	NC_020558	GAA	2	6	153390	153395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3551	NC_020558	GAA	2	6	153441	153446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3552	NC_020558	CAC	2	6	153490	153495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208940
3553	NC_020558	AGA	2	6	153500	153505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208940
3554	NC_020558	TGG	2	6	153513	153518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208940
3555	NC_020558	AAATA	2	10	153649	153658	80 %	20 %	0 %	0 %	470208940
3556	NC_020558	T	7	7	153699	153705	0 %	100 %	0 %	0 %	470208941
3557	NC_020558	GCG	2	6	153722	153727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208941
3558	NC_020558	TTC	2	6	153734	153739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208941
3559	NC_020558	GCA	2	6	153750	153755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208941
3560	NC_020558	CTT	2	6	153757	153762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208941
3561	NC_020558	TTA	2	6	153795	153800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208941
3562	NC_020558	CAG	2	6	153838	153843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208941
3563	NC_020558	CTT	2	6	153848	153853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208941
3564	NC_020558	CTT	2	6	153918	153923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208941
3565	NC_020558	TCG	2	6	153954	153959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208941
3566	NC_020558	CTT	2	6	153997	154002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_020558	AGA	2	6	154080	154085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020558	A	6	6	154098	154103	100 %	0 %	0 %	0 %	470208942
3569	NC_020558	GTT	2	6	154157	154162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208942
3570	NC_020558	TGG	2	6	154171	154176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208942
3571	NC_020558	CAA	2	6	154187	154192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208942
3572	NC_020558	ATT	2	6	154193	154198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208942
3573	NC_020558	TTTTTA	2	12	154236	154247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470208942
3574	NC_020558	ATT	3	9	154271	154279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208942
3575	NC_020558	TAG	2	6	154389	154394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208942
3576	NC_020558	ATT	2	6	154478	154483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208942
3577	NC_020558	CAA	2	6	154508	154513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208942
3578	NC_020558	A	6	6	154544	154549	100 %	0 %	0 %	0 %	470208942
3579	NC_020558	TTC	2	6	154570	154575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208942
3580	NC_020558	GTGG	2	8	154623	154630	0 %	25 %	75 %	0 %	470208942
3581	NC_020558	ATT	3	9	154672	154680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208942
3582	NC_020558	GAA	2	6	154694	154699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208942
3583	NC_020558	CTA	2	6	154769	154774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208942
3584	NC_020558	AAAT	2	8	154780	154787	75 %	25 %	0 %	0 %	470208942
3585	NC_020558	CAA	2	6	154839	154844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208942
3586	NC_020558	GGA	2	6	154847	154852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208942
3587	NC_020558	TTCTT	2	10	154854	154863	0 %	80 %	0 %	20 %	470208942
3588	NC_020558	GA	3	6	154866	154871	50 %	0 %	50 %	0 %	470208942
3589	NC_020558	A	7	7	154871	154877	100 %	0 %	0 %	0 %	470208942
3590	NC_020558	AAGA	2	8	154880	154887	75 %	0 %	25 %	0 %	470208942
3591	NC_020558	AGT	2	6	154909	154914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208942
3592	NC_020558	GAT	2	6	154936	154941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208942
3593	NC_020558	CTAAA	2	10	155002	155011	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3594	NC_020558	GGT	2	6	155012	155017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_020558	AATG	2	8	155027	155034	50 %	25 %	25 %	0 %	470208943
3596	NC_020558	TTTA	2	8	155077	155084	25 %	75 %	0 %	0 %	470208943
3597	NC_020558	AGA	2	6	155129	155134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208943
3598	NC_020558	AC	3	6	155149	155154	50 %	0 %	0 %	50 %	470208943
3599	NC_020558	CAG	2	6	155176	155181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208943
3600	NC_020558	GAC	2	6	155241	155246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208943
3601	NC_020558	TGT	2	6	155255	155260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208943
3602	NC_020558	A	6	6	155279	155284	100 %	0 %	0 %	0 %	470208943
3603	NC_020558	CTA	2	6	155288	155293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208943
3604	NC_020558	AGT	2	6	155324	155329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208943
3605	NC_020558	AACG	2	8	155340	155347	50 %	0 %	25 %	25 %	470208943
3606	NC_020558	A	6	6	155388	155393	100 %	0 %	0 %	0 %	470208943
3607	NC_020558	TTCCA	2	10	155405	155414	20 %	40 %	0 %	40 %	470208943
3608	NC_020558	AAAGTG	2	12	155448	155459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470208943
3609	NC_020558	GAC	2	6	155481	155486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208943
3610	NC_020558	ATA	2	6	155536	155541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208943
3611	NC_020558	AGA	2	6	155597	155602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208943
3612	NC_020558	AGA	2	6	155618	155623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208943
3613	NC_020558	CTG	2	6	155625	155630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208943
3614	NC_020558	AGC	2	6	155657	155662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208943
3615	NC_020558	TGA	2	6	155711	155716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208943
3616	NC_020558	AAG	2	6	155749	155754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208943
3617	NC_020558	ATT	2	6	155862	155867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208943
3618	NC_020558	GGT	2	6	155874	155879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208943
3619	NC_020558	AAG	2	6	155899	155904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208943
3620	NC_020558	GAT	2	6	155934	155939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208943
3621	NC_020558	CAG	2	6	155980	155985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208943
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3623	NC_020558	TA	3	6	156031	156036	50 %	50 %	0 %	0 %	470208943
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3998	NC_020558	ATT	2	6	173008	173013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208958
3999	NC_020558	ATA	2	6	173045	173050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208958
4000	NC_020558	ACA	2	6	173107	173112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208958

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