MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020558	A	6	6	65569	65574	100 %	0 %	0 %	0 %	470208838
1502	NC_020558	AGAA	2	8	65587	65594	75 %	0 %	25 %	0 %	470208838
1503	NC_020558	ACTT	2	8	65635	65642	25 %	50 %	0 %	25 %	470208838
1504	NC_020558	GAC	2	6	65703	65708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208838
1505	NC_020558	AACAA	2	10	65732	65741	80 %	0 %	0 %	20 %	470208838
1506	NC_020558	ACA	2	6	65763	65768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208838
1507	NC_020558	GCG	2	6	65773	65778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208838
1508	NC_020558	GAA	2	6	65808	65813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208838
1509	NC_020558	ACA	2	6	65868	65873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208838
1510	NC_020558	AG	3	6	65911	65916	50 %	0 %	50 %	0 %	470208839
1511	NC_020558	TTA	2	6	65920	65925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1512	NC_020558	GCA	2	6	65940	65945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1513	NC_020558	AAC	2	6	66075	66080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208839
1514	NC_020558	TCTA	2	8	66125	66132	25 %	50 %	0 %	25 %	470208839
1515	NC_020558	ATG	2	6	66158	66163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208839
1516	NC_020558	ATG	2	6	66206	66211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208839
1517	NC_020558	GAT	2	6	66220	66225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208839
1518	NC_020558	AGA	2	6	66390	66395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1519	NC_020558	TGC	2	6	66450	66455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1520	NC_020558	ATTC	2	8	66461	66468	25 %	50 %	0 %	25 %	470208839
1521	NC_020558	ACC	2	6	66488	66493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208839
1522	NC_020558	ATT	2	6	66505	66510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1523	NC_020558	AGA	2	6	66522	66527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1524	NC_020558	A	6	6	66527	66532	100 %	0 %	0 %	0 %	470208839
1525	NC_020558	TTAA	2	8	66580	66587	50 %	50 %	0 %	0 %	470208839
1526	NC_020558	ACC	2	6	66597	66602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208839
1527	NC_020558	TAT	3	9	66660	66668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1528	NC_020558	CAG	2	6	66683	66688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1529	NC_020558	A	6	6	66730	66735	100 %	0 %	0 %	0 %	470208839
1530	NC_020558	AAC	2	6	66752	66757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208839
1531	NC_020558	A	6	6	66869	66874	100 %	0 %	0 %	0 %	470208839
1532	NC_020558	A	6	6	66905	66910	100 %	0 %	0 %	0 %	470208839
1533	NC_020558	CCA	2	6	66918	66923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208839
1534	NC_020558	CGA	2	6	66954	66959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1535	NC_020558	AGA	2	6	67023	67028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1536	NC_020558	ATCA	2	8	67056	67063	50 %	25 %	0 %	25 %	470208839
1537	NC_020558	AAC	2	6	67136	67141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208839
1538	NC_020558	TTA	2	6	67179	67184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1539	NC_020558	TTA	2	6	67196	67201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1540	NC_020558	AGA	3	9	67212	67220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1541	NC_020558	CG	3	6	67307	67312	0 %	0 %	50 %	50 %	470208839
1542	NC_020558	CGA	2	6	67428	67433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1543	NC_020558	CA	3	6	67450	67455	50 %	0 %	0 %	50 %	470208839
1544	NC_020558	TTC	2	6	67465	67470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208839
1545	NC_020558	ATT	2	6	67585	67590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208839
1546	NC_020558	CAG	2	6	67640	67645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208839
1547	NC_020558	AAG	2	6	67655	67660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1548	NC_020558	GAA	2	6	67704	67709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208839
1549	NC_020558	GAG	2	6	67762	67767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208839
1550	NC_020558	AAC	2	6	67905	67910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208839
1551	NC_020558	GC	3	6	68075	68080	0 %	0 %	50 %	50 %	470208839
1552	NC_020558	ACAA	2	8	68183	68190	75 %	0 %	0 %	25 %	470208839
1553	NC_020558	AAC	2	6	68258	68263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208839
1554	NC_020558	GCG	2	6	68341	68346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_020558	GCA	2	6	68442	68447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208840
1556	NC_020558	TCGT	2	8	68465	68472	0 %	50 %	25 %	25 %	470208840
1557	NC_020558	TAA	2	6	68486	68491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208840
1558	NC_020558	AAG	2	6	68640	68645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208840
1559	NC_020558	GAT	2	6	68646	68651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208840
1560	NC_020558	GAGT	2	8	68666	68673	25 %	25 %	50 %	0 %	470208840
1561	NC_020558	GGA	2	6	68756	68761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208840
1562	NC_020558	AAC	2	6	68821	68826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208840
1563	NC_020558	CAA	2	6	68836	68841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208840
1564	NC_020558	ATTT	2	8	69009	69016	25 %	75 %	0 %	0 %	470208840
1565	NC_020558	A	6	6	69051	69056	100 %	0 %	0 %	0 %	470208840
1566	NC_020558	TCG	2	6	69116	69121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208840
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1569	NC_020558	AAG	2	6	69431	69436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208840
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1572	NC_020558	ATT	2	6	69555	69560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208840
1573	NC_020558	A	6	6	69562	69567	100 %	0 %	0 %	0 %	470208840
1574	NC_020558	AC	3	6	69769	69774	50 %	0 %	0 %	50 %	470208840
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1576	NC_020558	AT	3	6	69913	69918	50 %	50 %	0 %	0 %	470208840
1577	NC_020558	ATGT	2	8	70035	70042	25 %	50 %	25 %	0 %	470208840
1578	NC_020558	GAA	2	6	70044	70049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208840
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1583	NC_020558	CAAA	2	8	70232	70239	75 %	0 %	0 %	25 %	470208840
1584	NC_020558	A	6	6	70237	70242	100 %	0 %	0 %	0 %	470208840
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1588	NC_020558	AAT	2	6	70387	70392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208840
1589	NC_020558	ATG	2	6	70408	70413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208841
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1591	NC_020558	A	6	6	70498	70503	100 %	0 %	0 %	0 %	470208841
1592	NC_020558	ATG	2	6	70505	70510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208841
1593	NC_020558	A	6	6	70511	70516	100 %	0 %	0 %	0 %	470208841
1594	NC_020558	A	7	7	70604	70610	100 %	0 %	0 %	0 %	470208841
1595	NC_020558	AGC	2	6	70625	70630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208841
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1599	NC_020558	AAGA	2	8	70756	70763	75 %	0 %	25 %	0 %	470208841
1600	NC_020558	A	6	6	70771	70776	100 %	0 %	0 %	0 %	470208841
1601	NC_020558	GAGAG	2	10	70781	70790	40 %	0 %	60 %	0 %	470208841
1602	NC_020558	A	6	6	70841	70846	100 %	0 %	0 %	0 %	470208842
1603	NC_020558	A	6	6	70863	70868	100 %	0 %	0 %	0 %	470208842
1604	NC_020558	A	6	6	70886	70891	100 %	0 %	0 %	0 %	470208842
1605	NC_020558	AATT	2	8	70968	70975	50 %	50 %	0 %	0 %	470208842
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1607	NC_020558	AAAG	2	8	71017	71024	75 %	0 %	25 %	0 %	470208842
1608	NC_020558	AGA	2	6	71038	71043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208842
1609	NC_020558	T	6	6	71196	71201	0 %	100 %	0 %	0 %	470208843
1610	NC_020558	GGC	3	9	71287	71295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208843
1611	NC_020558	TGAT	2	8	71300	71307	25 %	50 %	25 %	0 %	470208843
1612	NC_020558	A	6	6	71375	71380	100 %	0 %	0 %	0 %	470208843
1613	NC_020558	ACT	2	6	71391	71396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208843
1614	NC_020558	GAAT	2	8	71441	71448	50 %	25 %	25 %	0 %	470208843
1615	NC_020558	TTTC	2	8	71478	71485	0 %	75 %	0 %	25 %	470208843
1616	NC_020558	AG	3	6	71512	71517	50 %	0 %	50 %	0 %	470208843
1617	NC_020558	AGA	2	6	71532	71537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208843
1618	NC_020558	TTA	2	6	71591	71596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208843
1619	NC_020558	A	7	7	71633	71639	100 %	0 %	0 %	0 %	470208843
1620	NC_020558	TAC	2	6	71650	71655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208843
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1622	NC_020558	TGT	2	6	71703	71708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208843
1623	NC_020558	ATT	2	6	71751	71756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208843
1624	NC_020558	TGA	2	6	71760	71765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208843
1625	NC_020558	GAG	2	6	71782	71787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208843
1626	NC_020558	CAA	2	6	71803	71808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208844
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