MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020558	ATTC	2	8	635514	635521	25 %	50 %	0 %	25 %	470209475
14502	NC_020558	T	6	6	635531	635536	0 %	100 %	0 %	0 %	470209475
14503	NC_020558	CAAA	2	8	635537	635544	75 %	0 %	0 %	25 %	470209475
14504	NC_020558	TC	3	6	635650	635655	0 %	50 %	0 %	50 %	470209475
14505	NC_020558	GAA	2	6	635788	635793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_020558	ATG	2	6	635821	635826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_020558	AGAA	2	8	635892	635899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_020558	A	7	7	635939	635945	100 %	0 %	0 %	0 %	470209476
14509	NC_020558	AGCAT	2	10	635979	635988	40 %	20 %	20 %	20 %	470209476
14510	NC_020558	CAA	2	6	636043	636048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209476
14511	NC_020558	AT	3	6	636081	636086	50 %	50 %	0 %	0 %	470209476
14512	NC_020558	A	6	6	636103	636108	100 %	0 %	0 %	0 %	470209476
14513	NC_020558	GT	3	6	636114	636119	0 %	50 %	50 %	0 %	470209476
14514	NC_020558	AGA	3	9	636124	636132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209476
14515	NC_020558	ATAA	2	8	636186	636193	75 %	25 %	0 %	0 %	470209476
14516	NC_020558	A	6	6	636211	636216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_020558	T	6	6	636237	636242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_020558	ATT	2	6	636247	636252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_020558	TCA	2	6	636255	636260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_020558	TTA	2	6	636289	636294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_020558	CAG	2	6	636307	636312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_020558	CGA	2	6	636319	636324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_020558	TTC	2	6	636436	636441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_020558	T	7	7	636444	636450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020558	TCCA	2	8	636488	636495	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14526	NC_020558	CTT	2	6	636516	636521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_020558	TAT	2	6	636569	636574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020558	A	6	6	636578	636583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_020558	TAT	2	6	636609	636614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209477
14530	NC_020558	TAT	2	6	636628	636633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209477
14531	NC_020558	GCT	2	6	636690	636695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209477
14532	NC_020558	CTTTTG	2	12	636706	636717	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470209477
14533	NC_020558	CTT	2	6	636724	636729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209477
14534	NC_020558	TGC	3	9	636764	636772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209477
14535	NC_020558	GA	3	6	636805	636810	50 %	0 %	50 %	0 %	470209477
14536	NC_020558	T	6	6	636811	636816	0 %	100 %	0 %	0 %	470209477
14537	NC_020558	ATAG	2	8	636824	636831	50 %	25 %	25 %	0 %	470209477
14538	NC_020558	CAT	2	6	636844	636849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209477
14539	NC_020558	GAT	2	6	636923	636928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209477
14540	NC_020558	T	7	7	636928	636934	0 %	100 %	0 %	0 %	470209477
14541	NC_020558	GCT	2	6	636936	636941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209477
14542	NC_020558	T	6	6	636941	636946	0 %	100 %	0 %	0 %	470209477
14543	NC_020558	ATC	2	6	636950	636955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_020558	TTG	2	6	637008	637013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14545	NC_020558	T	6	6	637105	637110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_020558	GTT	2	6	637203	637208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_020558	TTC	2	6	637308	637313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209478
14548	NC_020558	T	7	7	637379	637385	0 %	100 %	0 %	0 %	470209478
14549	NC_020558	TCC	2	6	637402	637407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14550	NC_020558	TAAA	2	8	637410	637417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_020558	GCT	2	6	637451	637456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209479
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14554	NC_020558	TCAT	2	8	637568	637575	25 %	50 %	0 %	25 %	470209479
14555	NC_020558	TCA	2	6	637598	637603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_020558	GTGA	2	8	637663	637670	25 %	25 %	50 %	0 %	470209480
14557	NC_020558	AGA	2	6	637689	637694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209480
14558	NC_020558	TTTG	2	8	637727	637734	0 %	75 %	25 %	0 %	470209480
14559	NC_020558	AGA	2	6	637758	637763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209480
14560	NC_020558	TTC	2	6	637854	637859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209480
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14562	NC_020558	TCAG	2	8	637996	638003	25 %	25 %	25 %	25 %	470209480
14563	NC_020558	ATCG	2	8	638034	638041	25 %	25 %	25 %	25 %	470209480
14564	NC_020558	ATTA	2	8	638124	638131	50 %	50 %	0 %	0 %	470209480
14565	NC_020558	CATA	2	8	638147	638154	50 %	25 %	0 %	25 %	470209480
14566	NC_020558	AGT	2	6	638245	638250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209480
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14568	NC_020558	ATA	2	6	638284	638289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209480
14569	NC_020558	TCC	2	6	638296	638301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14570	NC_020558	T	7	7	638331	638337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_020558	T	6	6	638370	638375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_020558	TTACT	2	10	638387	638396	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14573	NC_020558	GAATAA	2	12	638425	638436	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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14576	NC_020558	GAA	2	6	638529	638534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209481
14577	NC_020558	AG	3	6	638555	638560	50 %	0 %	50 %	0 %	470209481
14578	NC_020558	CGATG	2	10	638566	638575	20 %	20 %	40 %	20 %	470209481
14579	NC_020558	CGG	2	6	638614	638619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209481
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14584	NC_020558	TGT	2	6	638914	638919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209481
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14589	NC_020558	AAAGCA	2	12	639070	639081	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470209482
14590	NC_020558	TGC	2	6	639125	639130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209482
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14592	NC_020558	A	7	7	639295	639301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_020558	AAT	2	6	639303	639308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_020558	AGG	2	6	639435	639440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_020558	GTTG	2	8	639613	639620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_020558	AAG	2	6	639645	639650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_020558	AAT	2	6	639675	639680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_020558	ATT	2	6	639713	639718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020558	T	6	6	639717	639722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_020558	AGA	2	6	639866	639871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209483
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14605	NC_020558	CGGG	2	8	640195	640202	0 %	0 %	75 %	25 %	470209483
14606	NC_020558	CGC	2	6	640209	640214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209483
14607	NC_020558	TGA	2	6	640216	640221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209483
14608	NC_020558	CATG	2	8	640235	640242	25 %	25 %	25 %	25 %	470209483
14609	NC_020558	GCT	2	6	640250	640255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209483
14610	NC_020558	CTG	2	6	640273	640278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209483
14611	NC_020558	AG	3	6	640320	640325	50 %	0 %	50 %	0 %	470209483
14612	NC_020558	ATT	2	6	640347	640352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209483
14613	NC_020558	GAC	2	6	640355	640360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209483
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14615	NC_020558	AGA	2	6	640370	640375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209483
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14620	NC_020558	TGTC	2	8	640555	640562	0 %	50 %	25 %	25 %	470209483
14621	NC_020558	TAA	2	6	640640	640645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209483
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14623	NC_020558	GAA	2	6	640683	640688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209483
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14879	NC_020558	ATC	2	6	650583	650588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209496
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14882	NC_020558	GCA	2	6	650706	650711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209496
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