MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020558	GTC	2	6	549671	549676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209387
12502	NC_020558	A	7	7	549710	549716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020558	TGT	2	6	549730	549735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020558	A	6	6	549761	549766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020558	AAT	2	6	549770	549775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020558	A	7	7	549789	549795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_020558	AACG	2	8	549852	549859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12508	NC_020558	TAT	2	6	549887	549892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020558	AAATAA	2	12	549930	549941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020558	A	6	6	549940	549945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020558	TAAA	2	8	549954	549961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020558	TAAA	2	8	549976	549983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020558	TAA	2	6	549991	549996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020558	ATA	2	6	550003	550008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020558	TGG	2	6	550051	550056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209388
12516	NC_020558	GCA	2	6	550063	550068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209388
12517	NC_020558	GCA	2	6	550090	550095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209388
12518	NC_020558	AGA	2	6	550209	550214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209388
12519	NC_020558	AAAC	2	8	550228	550235	75 %	0 %	0 %	25 %	470209388
12520	NC_020558	TGA	2	6	550338	550343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209388
12521	NC_020558	ATT	2	6	550447	550452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020558	TAC	2	6	550579	550584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209389
12523	NC_020558	CGT	2	6	550668	550673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209389
12524	NC_020558	AAG	2	6	550678	550683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209389
12525	NC_020558	AGC	2	6	550705	550710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209389
12526	NC_020558	ATT	2	6	550788	550793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020558	GAA	2	6	550824	550829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_020558	ACA	2	6	550849	550854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_020558	TAC	2	6	550878	550883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_020558	CGT	2	6	550890	550895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_020558	ATA	2	6	551055	551060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209390
12532	NC_020558	GAA	2	6	551139	551144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020558	ACC	2	6	551160	551165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_020558	ATAAA	2	10	551283	551292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020558	TAT	2	6	551295	551300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020558	GAA	2	6	551357	551362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209391
12537	NC_020558	TGA	2	6	551413	551418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209391
12538	NC_020558	GTACTT	2	12	551477	551488	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470209391
12539	NC_020558	TTA	2	6	551616	551621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209391
12540	NC_020558	GAA	2	6	551657	551662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209391
12541	NC_020558	TTC	2	6	551709	551714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209391
12542	NC_020558	AC	3	6	551752	551757	50 %	0 %	0 %	50 %	470209391
12543	NC_020558	TTTGA	2	10	551800	551809	20 %	60 %	20 %	0 %	470209391
12544	NC_020558	ACAA	2	8	551831	551838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12545	NC_020558	TTTA	2	8	551920	551927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_020558	AAC	2	6	551928	551933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_020558	TAC	2	6	551986	551991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_020558	T	6	6	552020	552025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_020558	ATA	2	6	552103	552108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_020558	GAAA	2	8	552192	552199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_020558	ATT	2	6	552221	552226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_020558	T	6	6	552289	552294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_020558	AT	3	6	552300	552305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_020558	TTG	2	6	552308	552313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020558	GAG	2	6	552387	552392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020558	GAA	2	6	552405	552410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209392
12557	NC_020558	A	6	6	552409	552414	100 %	0 %	0 %	0 %	470209392
12558	NC_020558	CTTT	2	8	552417	552424	0 %	75 %	0 %	25 %	470209392
12559	NC_020558	ATT	2	6	552441	552446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209392
12560	NC_020558	TGC	2	6	552483	552488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209392
12561	NC_020558	A	7	7	552551	552557	100 %	0 %	0 %	0 %	470209392
12562	NC_020558	TAT	2	6	552561	552566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209392
12563	NC_020558	ATT	2	6	552608	552613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209392
12564	NC_020558	A	7	7	552626	552632	100 %	0 %	0 %	0 %	470209392
12565	NC_020558	ATA	2	6	552659	552664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209392
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12567	NC_020558	TTTAT	2	10	552748	552757	20 %	80 %	0 %	0 %	470209392
12568	NC_020558	CTT	2	6	552775	552780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209392
12569	NC_020558	A	7	7	552787	552793	100 %	0 %	0 %	0 %	470209392
12570	NC_020558	GCT	2	6	552807	552812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209392
12571	NC_020558	TTG	2	6	552821	552826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209392
12572	NC_020558	GTA	2	6	552836	552841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209392
12573	NC_020558	GAAA	2	8	552924	552931	75 %	0 %	25 %	0 %	470209392
12574	NC_020558	AAC	2	6	552935	552940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209392
12575	NC_020558	AT	3	6	552972	552977	50 %	50 %	0 %	0 %	470209392
12576	NC_020558	AC	3	6	552978	552983	50 %	0 %	0 %	50 %	470209392
12577	NC_020558	ATA	2	6	552992	552997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209392
12578	NC_020558	ACTGTA	2	12	553021	553032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470209392
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12582	NC_020558	ATG	2	6	553307	553312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209392
12583	NC_020558	TA	5	10	553420	553429	50 %	50 %	0 %	0 %	470209392
12584	NC_020558	AAG	2	6	553433	553438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209392
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12590	NC_020558	AGT	2	6	553735	553740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209392
12591	NC_020558	GA	3	6	553750	553755	50 %	0 %	50 %	0 %	470209392
12592	NC_020558	TGG	2	6	553814	553819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209392
12593	NC_020558	ATT	2	6	553876	553881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_020558	ATA	2	6	553884	553889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_020558	A	6	6	553889	553894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_020558	T	6	6	553916	553921	0 %	100 %	0 %	0 %	470209393
12597	NC_020558	GCT	2	6	553990	553995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209393
12598	NC_020558	T	7	7	554141	554147	0 %	100 %	0 %	0 %	470209393
12599	NC_020558	A	6	6	554157	554162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_020558	TAA	2	6	554263	554268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209394
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12602	NC_020558	CCT	2	6	554343	554348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_020558	AAC	2	6	554367	554372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209395
12604	NC_020558	AAG	2	6	554396	554401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209395
12605	NC_020558	TTCCG	2	10	554412	554421	0 %	40 %	20 %	40 %	470209395
12606	NC_020558	ATC	2	6	554515	554520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209395
12607	NC_020558	CCAA	2	8	554538	554545	50 %	0 %	0 %	50 %	470209395
12608	NC_020558	GTA	2	6	554631	554636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209395
12609	NC_020558	A	6	6	554636	554641	100 %	0 %	0 %	0 %	470209395
12610	NC_020558	TAA	2	6	554642	554647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209395
12611	NC_020558	AACC	2	8	554686	554693	50 %	0 %	0 %	50 %	470209395
12612	NC_020558	CCA	2	6	554695	554700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470209395
12613	NC_020558	ACTA	2	8	554721	554728	50 %	25 %	0 %	25 %	470209395
12614	NC_020558	AAT	2	6	554739	554744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209395
12615	NC_020558	TGTA	2	8	554796	554803	25 %	50 %	25 %	0 %	470209395
12616	NC_020558	T	6	6	554967	554972	0 %	100 %	0 %	0 %	470209395
12617	NC_020558	CAT	2	6	555039	555044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209395
12618	NC_020558	TGT	2	6	555084	555089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209395
12619	NC_020558	AATCA	2	10	555145	555154	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12620	NC_020558	T	6	6	555178	555183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_020558	ATT	2	6	555260	555265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_020558	AGA	2	6	555292	555297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209396
12623	NC_020558	TAT	2	6	555306	555311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209396
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12999	NC_020558	GTTT	2	8	570830	570837	0 %	75 %	25 %	0 %	470209411
13000	NC_020558	GC	3	6	570847	570852	0 %	0 %	50 %	50 %	470209411

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