MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_020558	AAC	2	6	2699902	2699907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211830
61502	NC_020558	AGT	2	6	2700020	2700025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211831
61503	NC_020558	GTTT	2	8	2700057	2700064	0 %	75 %	25 %	0 %	470211831
61504	NC_020558	CAA	2	6	2700084	2700089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211831
61505	NC_020558	TCG	2	6	2700108	2700113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211831
61506	NC_020558	TA	4	8	2700217	2700224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61507	NC_020558	T	6	6	2700272	2700277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61508	NC_020558	TAT	2	6	2700288	2700293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61509	NC_020558	CAAA	2	8	2700304	2700311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61510	NC_020558	CCAC	2	8	2700315	2700322	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61511	NC_020558	A	6	6	2700324	2700329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61512	NC_020558	ATT	2	6	2700367	2700372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211832
61513	NC_020558	TTTC	2	8	2700376	2700383	0 %	75 %	0 %	25 %	470211832
61514	NC_020558	ATC	2	6	2700393	2700398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211832
61515	NC_020558	TGT	2	6	2700425	2700430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211832
61516	NC_020558	CCA	2	6	2700480	2700485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211832
61517	NC_020558	TCA	2	6	2700549	2700554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211832
61518	NC_020558	T	7	7	2700556	2700562	0 %	100 %	0 %	0 %	470211832
61519	NC_020558	AAT	2	6	2700608	2700613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211832
61520	NC_020558	CTT	2	6	2700618	2700623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211832
61521	NC_020558	GCG	2	6	2700624	2700629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211832
61522	NC_020558	ATT	2	6	2700642	2700647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211832
61523	NC_020558	ATG	2	6	2700652	2700657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211832
61524	NC_020558	TTCC	2	8	2700667	2700674	0 %	50 %	0 %	50 %	470211832
61525	NC_020558	CCT	2	6	2700686	2700691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211833
61526	NC_020558	CCA	2	6	2700731	2700736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211833
61527	NC_020558	TAC	2	6	2700750	2700755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211833
61528	NC_020558	GTT	2	6	2700830	2700835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211833
61529	NC_020558	T	7	7	2700877	2700883	0 %	100 %	0 %	0 %	470211833
61530	NC_020558	TGCT	2	8	2700894	2700901	0 %	50 %	25 %	25 %	470211833
61531	NC_020558	CTT	2	6	2700930	2700935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211833
61532	NC_020558	AGT	2	6	2701107	2701112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211833
61533	NC_020558	CTT	2	6	2701113	2701118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211833
61534	NC_020558	ATT	2	6	2701392	2701397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211834
61535	NC_020558	CCG	2	6	2701432	2701437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211834
61536	NC_020558	T	6	6	2701561	2701566	0 %	100 %	0 %	0 %	470211834
61537	NC_020558	ACA	2	6	2701657	2701662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211834
61538	NC_020558	T	7	7	2701667	2701673	0 %	100 %	0 %	0 %	470211834
61539	NC_020558	CT	3	6	2701728	2701733	0 %	50 %	0 %	50 %	470211834
61540	NC_020558	AGC	2	6	2701734	2701739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211834
61541	NC_020558	GTT	2	6	2701751	2701756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211834
61542	NC_020558	TCT	2	6	2701783	2701788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211834
61543	NC_020558	GTT	2	6	2701799	2701804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211834
61544	NC_020558	TCA	2	6	2701852	2701857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211834
61545	NC_020558	TCA	2	6	2701867	2701872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211834
61546	NC_020558	TTC	2	6	2701893	2701898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211834
61547	NC_020558	T	6	6	2701965	2701970	0 %	100 %	0 %	0 %	470211834
61548	NC_020558	TAA	2	6	2701989	2701994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211834
61549	NC_020558	TCT	2	6	2702044	2702049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211835
61550	NC_020558	TGC	2	6	2702111	2702116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211835
61551	NC_020558	CAC	2	6	2702131	2702136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211835
61552	NC_020558	TC	3	6	2702170	2702175	0 %	50 %	0 %	50 %	470211835
61553	NC_020558	CCA	2	6	2702217	2702222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211835
61554	NC_020558	TGC	2	6	2702237	2702242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211835
61555	NC_020558	CGCT	2	8	2702272	2702279	0 %	25 %	25 %	50 %	470211835
61556	NC_020558	CGC	2	6	2702297	2702302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211835
61557	NC_020558	GC	3	6	2702349	2702354	0 %	0 %	50 %	50 %	470211835
61558	NC_020558	TCT	2	6	2702424	2702429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211835
61559	NC_020558	AGC	2	6	2702474	2702479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211835
61560	NC_020558	TAA	2	6	2702546	2702551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211835
61561	NC_020558	TTA	2	6	2702598	2702603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211835
61562	NC_020558	TCT	2	6	2702835	2702840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211835
61563	NC_020558	TTCT	2	8	2702886	2702893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61564	NC_020558	CCT	2	6	2702894	2702899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61565	NC_020558	A	6	6	2702904	2702909	100 %	0 %	0 %	0 %	470211836
61566	NC_020558	CATT	2	8	2702952	2702959	25 %	50 %	0 %	25 %	470211836
61567	NC_020558	T	7	7	2703080	2703086	0 %	100 %	0 %	0 %	470211836
61568	NC_020558	TTC	2	6	2703133	2703138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211836
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61571	NC_020558	AAG	2	6	2703270	2703275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211837
61572	NC_020558	GC	3	6	2703313	2703318	0 %	0 %	50 %	50 %	470211837
61573	NC_020558	GTC	2	6	2703361	2703366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211837
61574	NC_020558	TCG	2	6	2703407	2703412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211837
61575	NC_020558	TAAACA	2	12	2703423	2703434	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470211837
61576	NC_020558	ATA	2	6	2703448	2703453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61577	NC_020558	TAC	2	6	2703498	2703503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211837
61578	NC_020558	AAAT	2	8	2703578	2703585	75 %	25 %	0 %	0 %	470211837
61579	NC_020558	TAA	3	9	2703591	2703599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61580	NC_020558	CCA	2	6	2703616	2703621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211837
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61582	NC_020558	TAA	2	6	2703656	2703661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61583	NC_020558	AAT	2	6	2703849	2703854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61584	NC_020558	AAT	2	6	2703886	2703891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61585	NC_020558	ACT	2	6	2703895	2703900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211837
61586	NC_020558	AAAT	2	8	2703908	2703915	75 %	25 %	0 %	0 %	470211837
61587	NC_020558	CTG	2	6	2703971	2703976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211837
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61589	NC_020558	TAA	2	6	2704277	2704282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61590	NC_020558	TAA	3	9	2704376	2704384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61591	NC_020558	TTA	2	6	2704387	2704392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211837
61592	NC_020558	ATA	2	6	2704417	2704422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211837
61593	NC_020558	TAG	2	6	2704433	2704438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211837
61594	NC_020558	T	6	6	2704524	2704529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61595	NC_020558	CCT	2	6	2704533	2704538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61596	NC_020558	CTTT	2	8	2704562	2704569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61597	NC_020558	TAAA	2	8	2704574	2704581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61598	NC_020558	A	7	7	2704621	2704627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61599	NC_020558	TC	3	6	2704642	2704647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61600	NC_020558	A	6	6	2704649	2704654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61601	NC_020558	TTC	2	6	2704700	2704705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211838
61602	NC_020558	CTA	2	6	2704750	2704755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211838
61603	NC_020558	TAA	2	6	2704762	2704767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211838
61604	NC_020558	GCT	2	6	2704786	2704791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211838
61605	NC_020558	GTT	2	6	2704792	2704797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211838
61606	NC_020558	T	6	6	2704803	2704808	0 %	100 %	0 %	0 %	470211838
61607	NC_020558	ATAC	2	8	2704875	2704882	50 %	25 %	0 %	25 %	470211838
61608	NC_020558	GGTGC	2	10	2704918	2704927	0 %	20 %	60 %	20 %	470211838
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61610	NC_020558	CAA	2	6	2704999	2705004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211838
61611	NC_020558	TAT	2	6	2705005	2705010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211838
61612	NC_020558	TTC	2	6	2705115	2705120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211838
61613	NC_020558	TCA	2	6	2705134	2705139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211838
61614	NC_020558	CA	3	6	2705239	2705244	50 %	0 %	0 %	50 %	470211838
61615	NC_020558	CTT	2	6	2705482	2705487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211838
61616	NC_020558	CAAC	2	8	2705491	2705498	50 %	0 %	0 %	50 %	470211838
61617	NC_020558	T	6	6	2705535	2705540	0 %	100 %	0 %	0 %	470211838
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61976	NC_020558	AAT	2	6	2721521	2721526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211858
61977	NC_020558	A	6	6	2721591	2721596	100 %	0 %	0 %	0 %	470211858
61978	NC_020558	T	6	6	2721692	2721697	0 %	100 %	0 %	0 %	470211858
61979	NC_020558	CTT	2	6	2721709	2721714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211858
61980	NC_020558	CTA	2	6	2721865	2721870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211858
61981	NC_020558	TCT	2	6	2721976	2721981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211859
61982	NC_020558	T	6	6	2721986	2721991	0 %	100 %	0 %	0 %	470211859
61983	NC_020558	GGT	2	6	2722011	2722016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211859
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61988	NC_020558	TCG	3	9	2722168	2722176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211859
61989	NC_020558	TTC	2	6	2722197	2722202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211859
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61991	NC_020558	GT	3	6	2722295	2722300	0 %	50 %	50 %	0 %	470211859
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61994	NC_020558	CAA	2	6	2722382	2722387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61995	NC_020558	CTT	2	6	2722418	2722423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61996	NC_020558	ATC	2	6	2722445	2722450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211860
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62000	NC_020558	TCT	2	6	2722605	2722610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211860

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