MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60002	NC_020558	CAC	2	6	2631150	2631155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211755
60003	NC_020558	ATCA	2	8	2631211	2631218	50 %	25 %	0 %	25 %	470211755
60004	NC_020558	AAT	2	6	2631247	2631252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211755
60005	NC_020558	T	6	6	2631258	2631263	0 %	100 %	0 %	0 %	470211755
60006	NC_020558	CAT	2	6	2631306	2631311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211755
60007	NC_020558	GTT	2	6	2631368	2631373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211755
60008	NC_020558	AAT	2	6	2631418	2631423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211755
60009	NC_020558	CTT	2	6	2631444	2631449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211755
60010	NC_020558	AAG	2	6	2631611	2631616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211755
60011	NC_020558	GAC	2	6	2631629	2631634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211755
60012	NC_020558	TCATGG	2	12	2631704	2631715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470211755
60013	NC_020558	AG	3	6	2631772	2631777	50 %	0 %	50 %	0 %	470211755
60014	NC_020558	T	7	7	2631811	2631817	0 %	100 %	0 %	0 %	470211755
60015	NC_020558	AAT	2	6	2631832	2631837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211755
60016	NC_020558	ATC	2	6	2631866	2631871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211755
60017	NC_020558	AGTCC	2	10	2631886	2631895	20 %	20 %	20 %	40 %	470211755
60018	NC_020558	AAT	2	6	2631928	2631933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211755
60019	NC_020558	TCA	2	6	2631942	2631947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211755
60020	NC_020558	AAT	2	6	2631968	2631973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211756
60021	NC_020558	GCA	2	6	2632102	2632107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211756
60022	NC_020558	T	6	6	2632125	2632130	0 %	100 %	0 %	0 %	470211756
60023	NC_020558	AAAT	2	8	2632215	2632222	75 %	25 %	0 %	0 %	470211756
60024	NC_020558	GCA	2	6	2632264	2632269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211756
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60026	NC_020558	TAG	2	6	2632392	2632397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211757
60027	NC_020558	TCA	2	6	2632450	2632455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211757
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60030	NC_020558	TAA	2	6	2632753	2632758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211757
60031	NC_020558	ACG	2	6	2632778	2632783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211757
60032	NC_020558	TCT	3	9	2632800	2632808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211757
60033	NC_020558	TGTAA	2	10	2632886	2632895	40 %	40 %	20 %	0 %	470211757
60034	NC_020558	CATA	2	8	2632909	2632916	50 %	25 %	0 %	25 %	470211757
60035	NC_020558	ATA	2	6	2632960	2632965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211757
60036	NC_020558	TAC	2	6	2632990	2632995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211757
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60038	NC_020558	TAA	2	6	2633090	2633095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211757
60039	NC_020558	ATA	2	6	2633111	2633116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211757
60040	NC_020558	TTG	2	6	2633128	2633133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211757
60041	NC_020558	GAA	3	9	2633300	2633308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211757
60042	NC_020558	T	6	6	2633430	2633435	0 %	100 %	0 %	0 %	470211758
60043	NC_020558	TGA	2	6	2633523	2633528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211758
60044	NC_020558	T	6	6	2633685	2633690	0 %	100 %	0 %	0 %	470211758
60045	NC_020558	CAAG	2	8	2633695	2633702	50 %	0 %	25 %	25 %	470211758
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60049	NC_020558	TCT	2	6	2633921	2633926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211758
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60051	NC_020558	TGC	2	6	2633997	2634002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211758
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60053	NC_020558	AAG	2	6	2634115	2634120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211758
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60055	NC_020558	AAG	2	6	2634247	2634252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211758
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60061	NC_020558	CCAA	2	8	2634395	2634402	50 %	0 %	0 %	50 %	470211759
60062	NC_020558	GTG	2	6	2634463	2634468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211759
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60067	NC_020558	TTTC	2	8	2634610	2634617	0 %	75 %	0 %	25 %	470211759
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60070	NC_020558	TGC	2	6	2634775	2634780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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60073	NC_020558	ATA	2	6	2634877	2634882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60074	NC_020558	AAGA	2	8	2634919	2634926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60075	NC_020558	ATTT	2	8	2634982	2634989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60076	NC_020558	TTAG	2	8	2635013	2635020	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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60083	NC_020558	GCCC	2	8	2635436	2635443	0 %	0 %	25 %	75 %	470211760
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60089	NC_020558	TTGGA	2	10	2635600	2635609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60090	NC_020558	AAT	2	6	2635616	2635621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60091	NC_020558	AT	3	6	2635673	2635678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60092	NC_020558	CGA	2	6	2635785	2635790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211761
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60112	NC_020558	CA	3	6	2636822	2636827	50 %	0 %	0 %	50 %	470211763
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60119	NC_020558	TCT	2	6	2637208	2637213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211764
60120	NC_020558	T	6	6	2637234	2637239	0 %	100 %	0 %	0 %	470211764
60121	NC_020558	GCT	2	6	2637247	2637252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211764
60122	NC_020558	T	6	6	2637252	2637257	0 %	100 %	0 %	0 %	470211764
60123	NC_020558	CTT	2	6	2637281	2637286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211764
60124	NC_020558	GTA	2	6	2637321	2637326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211764
60125	NC_020558	CGC	2	6	2637347	2637352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211764
60126	NC_020558	CCAATT	2	12	2637469	2637480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211764
60127	NC_020558	CCAC	2	8	2637496	2637503	25 %	0 %	0 %	75 %	470211764
60128	NC_020558	TAA	2	6	2637658	2637663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211764
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60131	NC_020558	CTG	2	6	2637737	2637742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211764
60132	NC_020558	GTT	2	6	2637799	2637804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211764
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60135	NC_020558	T	6	6	2637935	2637940	0 %	100 %	0 %	0 %	470211765
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60147	NC_020558	AGCG	2	8	2638516	2638523	25 %	0 %	50 %	25 %	470211765
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60151	NC_020558	TTC	2	6	2638765	2638770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211766
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60159	NC_020558	A	6	6	2639151	2639156	100 %	0 %	0 %	0 %	470211766
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60198	NC_020558	TTCA	2	8	2640954	2640961	25 %	50 %	0 %	25 %	470211770
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60200	NC_020558	TTC	2	6	2641143	2641148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60201	NC_020558	TCT	2	6	2641225	2641230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60207	NC_020558	TATAG	2	10	2641420	2641429	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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60209	NC_020558	TCTT	2	8	2641488	2641495	0 %	75 %	0 %	25 %	470211771
60210	NC_020558	A	6	6	2641551	2641556	100 %	0 %	0 %	0 %	470211771
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60220	NC_020558	TTA	2	6	2641881	2641886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60221	NC_020558	TA	3	6	2641959	2641964	50 %	50 %	0 %	0 %	470211772
60222	NC_020558	T	6	6	2641973	2641978	0 %	100 %	0 %	0 %	470211772
60223	NC_020558	AGA	2	6	2642027	2642032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211772
60224	NC_020558	ATA	2	6	2642050	2642055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211772
60225	NC_020558	GAAA	2	8	2642114	2642121	75 %	0 %	25 %	0 %	470211772
60226	NC_020558	CAAA	2	8	2642283	2642290	75 %	0 %	0 %	25 %	470211772
60227	NC_020558	TATC	2	8	2642328	2642335	25 %	50 %	0 %	25 %	470211772
60228	NC_020558	CAAA	2	8	2642343	2642350	75 %	0 %	0 %	25 %	470211772
60229	NC_020558	GAATA	2	10	2642414	2642423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60230	NC_020558	ATA	2	6	2642464	2642469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211773
60231	NC_020558	GAA	2	6	2642496	2642501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211773
60232	NC_020558	AAG	2	6	2642518	2642523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211773
60233	NC_020558	A	6	6	2642530	2642535	100 %	0 %	0 %	0 %	470211773
60234	NC_020558	CTA	2	6	2642561	2642566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211773
60235	NC_020558	AGA	2	6	2642630	2642635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211773
60236	NC_020558	TTTA	2	8	2642648	2642655	25 %	75 %	0 %	0 %	470211773
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60461	NC_020558	A	7	7	2653075	2653081	100 %	0 %	0 %	0 %	470211783
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60463	NC_020558	CG	3	6	2653267	2653272	0 %	0 %	50 %	50 %	470211783
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60468	NC_020558	TCT	3	9	2653445	2653453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211783
60469	NC_020558	GAT	2	6	2653545	2653550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211783
60470	NC_020558	TCC	2	6	2653667	2653672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211783
60471	NC_020558	GTC	2	6	2653709	2653714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211783
60472	NC_020558	A	6	6	2653780	2653785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60473	NC_020558	TTTTAT	2	12	2653812	2653823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60474	NC_020558	CAT	2	6	2653891	2653896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211784
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60476	NC_020558	CTA	3	9	2653933	2653941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211784
60477	NC_020558	ATC	2	6	2653946	2653951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211784
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60480	NC_020558	GTC	2	6	2654075	2654080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211785
60481	NC_020558	TCA	2	6	2654081	2654086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211785
60482	NC_020558	CTTCA	2	10	2654092	2654101	20 %	40 %	0 %	40 %	470211785
60483	NC_020558	CAT	2	6	2654112	2654117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211785
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