MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_020558	CCT	2	6	2543137	2543142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58002	NC_020558	T	6	6	2543151	2543156	0 %	100 %	0 %	0 %	470211654
58003	NC_020558	CTT	2	6	2543277	2543282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211654
58004	NC_020558	CAC	2	6	2543353	2543358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211655
58005	NC_020558	TTC	2	6	2543363	2543368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211655
58006	NC_020558	TG	3	6	2543401	2543406	0 %	50 %	50 %	0 %	470211655
58007	NC_020558	ACCTTT	2	12	2543507	2543518	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211655
58008	NC_020558	GCT	2	6	2543622	2543627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211655
58009	NC_020558	AAG	2	6	2543650	2543655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211655
58010	NC_020558	CG	3	6	2543708	2543713	0 %	0 %	50 %	50 %	470211655
58011	NC_020558	ACG	2	6	2543738	2543743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211655
58012	NC_020558	ATT	3	9	2543769	2543777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211655
58013	NC_020558	TCC	2	6	2543779	2543784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211656
58014	NC_020558	AGGA	2	8	2543806	2543813	50 %	0 %	50 %	0 %	470211656
58015	NC_020558	CTT	2	6	2543868	2543873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211656
58016	NC_020558	TCCGC	2	10	2543951	2543960	0 %	20 %	20 %	60 %	470211656
58017	NC_020558	GAC	2	6	2543964	2543969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211656
58018	NC_020558	ACG	2	6	2544037	2544042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211656
58019	NC_020558	ACC	2	6	2544190	2544195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211656
58020	NC_020558	AAG	2	6	2544335	2544340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211656
58021	NC_020558	CTTCA	2	10	2544442	2544451	20 %	40 %	0 %	40 %	470211657
58022	NC_020558	TTGCAC	2	12	2544489	2544500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470211657
58023	NC_020558	CAA	2	6	2544546	2544551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211657
58024	NC_020558	CTA	2	6	2544561	2544566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211657
58025	NC_020558	GTT	2	6	2544571	2544576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211657
58026	NC_020558	AAT	2	6	2544634	2544639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211657
58027	NC_020558	CTTG	2	8	2544690	2544697	0 %	50 %	25 %	25 %	470211657
58028	NC_020558	GAG	2	6	2544732	2544737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211657
58029	NC_020558	TCC	2	6	2544797	2544802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58030	NC_020558	T	7	7	2544821	2544827	0 %	100 %	0 %	0 %	470211658
58031	NC_020558	TCG	2	6	2544829	2544834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211658
58032	NC_020558	GTAC	2	8	2544849	2544856	25 %	25 %	25 %	25 %	470211658
58033	NC_020558	TCT	2	6	2544895	2544900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211658
58034	NC_020558	CAT	2	6	2544929	2544934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211658
58035	NC_020558	TTGT	2	8	2544944	2544951	0 %	75 %	25 %	0 %	470211658
58036	NC_020558	CAA	2	6	2544953	2544958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211658
58037	NC_020558	CGA	2	6	2544979	2544984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211658
58038	NC_020558	CTG	3	9	2545019	2545027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211658
58039	NC_020558	TCA	2	6	2545040	2545045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211658
58040	NC_020558	TCA	2	6	2545051	2545056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211658
58041	NC_020558	T	6	6	2545068	2545073	0 %	100 %	0 %	0 %	470211658
58042	NC_020558	ATT	2	6	2545175	2545180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211659
58043	NC_020558	T	6	6	2545179	2545184	0 %	100 %	0 %	0 %	470211659
58044	NC_020558	ACG	3	9	2545188	2545196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211659
58045	NC_020558	GTT	3	9	2545215	2545223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211659
58046	NC_020558	CAC	3	9	2545304	2545312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211659
58047	NC_020558	GTT	2	6	2545412	2545417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211659
58048	NC_020558	CTT	2	6	2545505	2545510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211659
58049	NC_020558	CAG	2	6	2545535	2545540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211659
58050	NC_020558	GAT	2	6	2545695	2545700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211659
58051	NC_020558	ATCA	2	8	2545812	2545819	50 %	25 %	0 %	25 %	470211659
58052	NC_020558	CCG	2	6	2545843	2545848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211659
58053	NC_020558	TGA	2	6	2545849	2545854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211659
58054	NC_020558	CTTT	2	8	2545889	2545896	0 %	75 %	0 %	25 %	470211659
58055	NC_020558	GTA	2	6	2545907	2545912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211659
58056	NC_020558	GTA	2	6	2545933	2545938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211659
58057	NC_020558	CTC	2	6	2546018	2546023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58058	NC_020558	ATTT	2	8	2546029	2546036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58059	NC_020558	GAATT	2	10	2546062	2546071	40 %	40 %	20 %	0 %	470211660
58060	NC_020558	GTAACA	2	12	2546087	2546098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470211660
58061	NC_020558	TTC	2	6	2546203	2546208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211660
58062	NC_020558	TCG	2	6	2546270	2546275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211660
58063	NC_020558	TTC	2	6	2546290	2546295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211660
58064	NC_020558	ATG	2	6	2546315	2546320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211660
58065	NC_020558	CCT	2	6	2546345	2546350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211661
58066	NC_020558	GCT	2	6	2546365	2546370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211661
58067	NC_020558	TAAT	2	8	2546378	2546385	50 %	50 %	0 %	0 %	470211661
58068	NC_020558	TTTCAC	2	12	2546474	2546485	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211661
58069	NC_020558	TTC	2	6	2546595	2546600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211661
58070	NC_020558	AGA	2	6	2546610	2546615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211661
58071	NC_020558	ACG	2	6	2546637	2546642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211661
58072	NC_020558	ACC	2	6	2546697	2546702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211661
58073	NC_020558	CCA	2	6	2546779	2546784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211661
58074	NC_020558	T	6	6	2546800	2546805	0 %	100 %	0 %	0 %	470211661
58075	NC_020558	CAA	3	9	2546855	2546863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211661
58076	NC_020558	TAAG	2	8	2546936	2546943	50 %	25 %	25 %	0 %	470211661
58077	NC_020558	TCC	2	6	2546965	2546970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58078	NC_020558	ATT	2	6	2546982	2546987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211662
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58080	NC_020558	T	6	6	2547022	2547027	0 %	100 %	0 %	0 %	470211662
58081	NC_020558	AGT	2	6	2547134	2547139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211662
58082	NC_020558	CGA	2	6	2547188	2547193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211662
58083	NC_020558	TAA	2	6	2547243	2547248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211662
58084	NC_020558	GAT	2	6	2547289	2547294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211662
58085	NC_020558	AGT	2	6	2547388	2547393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211662
58086	NC_020558	GTTT	2	8	2547423	2547430	0 %	75 %	25 %	0 %	470211662
58087	NC_020558	CT	3	6	2547441	2547446	0 %	50 %	0 %	50 %	470211662
58088	NC_020558	TGC	2	6	2547520	2547525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211662
58089	NC_020558	TTACTG	2	12	2547531	2547542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470211662
58090	NC_020558	CCT	2	6	2547621	2547626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58091	NC_020558	TTAAT	2	10	2547628	2547637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_020558	AT	3	6	2547636	2547641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58093	NC_020558	TTA	2	6	2547644	2547649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211663
58094	NC_020558	TG	3	6	2547745	2547750	0 %	50 %	50 %	0 %	470211663
58095	NC_020558	CGCA	2	8	2547794	2547801	25 %	0 %	25 %	50 %	470211663
58096	NC_020558	CTG	2	6	2547889	2547894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211663
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58098	NC_020558	T	6	6	2547940	2547945	0 %	100 %	0 %	0 %	470211663
58099	NC_020558	CCT	2	6	2547963	2547968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58100	NC_020558	GT	3	6	2548039	2548044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58101	NC_020558	TCA	2	6	2548060	2548065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58102	NC_020558	TAT	2	6	2548141	2548146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58103	NC_020558	GTA	2	6	2548160	2548165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58104	NC_020558	A	6	6	2548181	2548186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58105	NC_020558	TA	3	6	2548214	2548219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58106	NC_020558	A	6	6	2548288	2548293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58107	NC_020558	CCT	2	6	2548425	2548430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211664
58108	NC_020558	TTC	2	6	2548463	2548468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211664
58109	NC_020558	ACA	2	6	2548512	2548517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211664
58110	NC_020558	TCCAC	2	10	2548554	2548563	20 %	20 %	0 %	60 %	470211664
58111	NC_020558	AAAAC	2	10	2548761	2548770	80 %	0 %	0 %	20 %	470211664
58112	NC_020558	AAATAC	2	12	2548775	2548786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470211664
58113	NC_020558	AGA	2	6	2548805	2548810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211664
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58115	NC_020558	TAC	2	6	2548871	2548876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211664
58116	NC_020558	TAAA	2	8	2548879	2548886	75 %	25 %	0 %	0 %	470211664
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