MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_020558	TCC	2	6	2520736	2520741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57502	NC_020558	CTC	2	6	2520782	2520787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57503	NC_020558	GC	4	8	2520869	2520876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57504	NC_020558	GCT	2	6	2520926	2520931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57505	NC_020558	TTC	2	6	2520999	2521004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57506	NC_020558	AAC	2	6	2521008	2521013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57507	NC_020558	CTT	2	6	2521035	2521040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57508	NC_020558	GCG	2	6	2521048	2521053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57509	NC_020558	CTG	2	6	2521094	2521099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57510	NC_020558	CAGG	2	8	2521322	2521329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57511	NC_020558	TCC	2	6	2521382	2521387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57512	NC_020558	GTTC	2	8	2521388	2521395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57513	NC_020558	CGC	2	6	2521415	2521420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57514	NC_020558	CT	3	6	2521448	2521453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57515	NC_020558	TTGAAT	2	12	2521466	2521477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57516	NC_020558	AATTA	2	10	2521530	2521539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57517	NC_020558	GTTT	2	8	2521543	2521550	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57518	NC_020558	TCT	3	9	2521619	2521627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57519	NC_020558	TTG	2	6	2521656	2521661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57520	NC_020558	ATT	2	6	2521758	2521763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211621
57521	NC_020558	CCATTT	2	12	2521830	2521841	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211621
57522	NC_020558	GTT	2	6	2521849	2521854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211621
57523	NC_020558	GCA	2	6	2521893	2521898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211621
57524	NC_020558	TAAGA	2	10	2521954	2521963	60 %	20 %	20 %	0 %	470211621
57525	NC_020558	GAT	2	6	2521982	2521987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211621
57526	NC_020558	T	6	6	2521998	2522003	0 %	100 %	0 %	0 %	470211621
57527	NC_020558	AT	3	6	2522010	2522015	50 %	50 %	0 %	0 %	470211621
57528	NC_020558	GGT	2	6	2522124	2522129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211621
57529	NC_020558	CTT	2	6	2522167	2522172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211621
57530	NC_020558	A	7	7	2522240	2522246	100 %	0 %	0 %	0 %	470211621
57531	NC_020558	GT	3	6	2522270	2522275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57532	NC_020558	GAT	2	6	2522285	2522290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57533	NC_020558	G	6	6	2522308	2522313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57534	NC_020558	GTT	2	6	2522319	2522324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57535	NC_020558	AT	4	8	2522351	2522358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57536	NC_020558	TAA	2	6	2522366	2522371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57537	NC_020558	T	7	7	2522378	2522384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57538	NC_020558	TTG	2	6	2522387	2522392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57539	NC_020558	CTTG	2	8	2522502	2522509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57540	NC_020558	CTG	2	6	2522527	2522532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57541	NC_020558	GGTA	2	8	2522535	2522542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57542	NC_020558	ATTT	2	8	2522555	2522562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57543	NC_020558	TTC	2	6	2522588	2522593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57544	NC_020558	TAT	2	6	2522596	2522601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57545	NC_020558	CTG	2	6	2522623	2522628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57546	NC_020558	GTACTT	2	12	2522661	2522672	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470211622
57547	NC_020558	TCT	2	6	2522690	2522695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211622
57548	NC_020558	TGT	2	6	2522747	2522752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211622
57549	NC_020558	ATAA	2	8	2522762	2522769	75 %	25 %	0 %	0 %	470211622
57550	NC_020558	AATG	2	8	2522781	2522788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57551	NC_020558	ATT	2	6	2522802	2522807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57552	NC_020558	TAT	2	6	2522823	2522828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57553	NC_020558	GAA	2	6	2522867	2522872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57554	NC_020558	T	6	6	2522974	2522979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57555	NC_020558	T	6	6	2522984	2522989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57556	NC_020558	ATA	2	6	2522991	2522996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57557	NC_020558	AT	3	6	2523006	2523011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57558	NC_020558	AGG	2	6	2523115	2523120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57559	NC_020558	ACT	2	6	2523146	2523151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57560	NC_020558	CAA	2	6	2523155	2523160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57561	NC_020558	TGA	2	6	2523169	2523174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57562	NC_020558	GGAT	2	8	2523193	2523200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57563	NC_020558	CGCT	2	8	2523231	2523238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57564	NC_020558	TAA	2	6	2523289	2523294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57565	NC_020558	GTCT	2	8	2523328	2523335	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57566	NC_020558	CAA	2	6	2523363	2523368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57567	NC_020558	CA	3	6	2523416	2523421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57568	NC_020558	GC	3	6	2523440	2523445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57569	NC_020558	TGG	2	6	2523502	2523507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57570	NC_020558	TAG	2	6	2523540	2523545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57571	NC_020558	ATT	2	6	2523548	2523553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57572	NC_020558	ATG	2	6	2523576	2523581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57573	NC_020558	AATC	2	8	2523605	2523612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57574	NC_020558	AGC	2	6	2523616	2523621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57575	NC_020558	TAA	2	6	2523691	2523696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57576	NC_020558	AAC	2	6	2523788	2523793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57577	NC_020558	TTGG	2	8	2523801	2523808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57578	NC_020558	ATC	2	6	2523837	2523842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57579	NC_020558	AGA	2	6	2523847	2523852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57581	NC_020558	A	7	7	2523980	2523986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57582	NC_020558	CGG	2	6	2523994	2523999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57583	NC_020558	AGTA	2	8	2524120	2524127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57584	NC_020558	A	6	6	2524168	2524173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57585	NC_020558	CAC	2	6	2524188	2524193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57586	NC_020558	TAA	2	6	2524204	2524209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57587	NC_020558	TTG	2	6	2524284	2524289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57588	NC_020558	AGA	2	6	2524336	2524341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57589	NC_020558	CAA	2	6	2524407	2524412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57590	NC_020558	TAT	2	6	2524439	2524444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57591	NC_020558	ATT	2	6	2524450	2524455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57592	NC_020558	GGAT	2	8	2524526	2524533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57593	NC_020558	TAAA	2	8	2524556	2524563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57594	NC_020558	A	7	7	2524561	2524567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57595	NC_020558	T	7	7	2524590	2524596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57596	NC_020558	CCAT	2	8	2524623	2524630	25 %	25 %	0 %	50 %	470211623
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57599	NC_020558	TTCT	2	8	2524749	2524756	0 %	75 %	0 %	25 %	470211623
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57608	NC_020558	TGA	2	6	2525238	2525243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211623
57609	NC_020558	CTT	2	6	2525292	2525297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211623
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57611	NC_020558	TCC	2	6	2525459	2525464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57612	NC_020558	TC	3	6	2525673	2525678	0 %	50 %	0 %	50 %	470211624
57613	NC_020558	TTC	2	6	2525741	2525746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211624
57614	NC_020558	TGG	2	6	2525812	2525817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211624
57615	NC_020558	ATA	2	6	2525836	2525841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211624
57616	NC_020558	TCC	2	6	2525895	2525900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211624
57617	NC_020558	TCGTT	2	10	2525907	2525916	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57618	NC_020558	CAAGG	2	10	2525953	2525962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57619	NC_020558	GTTT	2	8	2525970	2525977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57620	NC_020558	T	7	7	2525975	2525981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57621	NC_020558	GAAAA	2	10	2525984	2525993	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57622	NC_020558	A	6	6	2525990	2525995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57623	NC_020558	CT	3	6	2525996	2526001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57624	NC_020558	GA	3	6	2526008	2526013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57626	NC_020558	T	6	6	2526037	2526042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57856	NC_020558	TCA	2	6	2536558	2536563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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57859	NC_020558	CTC	2	6	2536666	2536671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211641
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57861	NC_020558	T	6	6	2536687	2536692	0 %	100 %	0 %	0 %	470211641
57862	NC_020558	TTATG	2	10	2536732	2536741	20 %	60 %	20 %	0 %	470211641
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57983	NC_020558	CCT	2	6	2542389	2542394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57984	NC_020558	T	6	6	2542412	2542417	0 %	100 %	0 %	0 %	470211652
57985	NC_020558	GTT	2	6	2542455	2542460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211652
57986	NC_020558	TCA	2	6	2542543	2542548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211652
57987	NC_020558	GAC	2	6	2542571	2542576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211652
57988	NC_020558	ACGA	2	8	2542593	2542600	50 %	0 %	25 %	25 %	470211652
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57991	NC_020558	CGC	2	6	2542634	2542639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211652
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