MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_020558	ATCAT	2	10	2496945	2496954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57002	NC_020558	TGA	2	6	2496974	2496979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57003	NC_020558	AAT	2	6	2497041	2497046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57004	NC_020558	TCGG	2	8	2497072	2497079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57005	NC_020558	CTTC	2	8	2497155	2497162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57006	NC_020558	TTG	3	9	2497171	2497179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57007	NC_020558	TCT	2	6	2497196	2497201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57008	NC_020558	TTCC	2	8	2497221	2497228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57009	NC_020558	GCCA	2	8	2497260	2497267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57010	NC_020558	CTAA	2	8	2497268	2497275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57011	NC_020558	AAT	2	6	2497333	2497338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57012	NC_020558	AAT	2	6	2497351	2497356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57013	NC_020558	TAA	2	6	2497464	2497469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57014	NC_020558	TCA	2	6	2497491	2497496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57015	NC_020558	TGC	2	6	2497594	2497599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57016	NC_020558	GCT	2	6	2497643	2497648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57017	NC_020558	AG	3	6	2497699	2497704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57018	NC_020558	CCA	2	6	2497751	2497756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57019	NC_020558	ATAA	2	8	2497799	2497806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57020	NC_020558	T	6	6	2497810	2497815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57021	NC_020558	ATGATT	2	12	2497831	2497842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57022	NC_020558	AT	3	6	2497928	2497933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57023	NC_020558	A	7	7	2497959	2497965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57024	NC_020558	TGGAA	2	10	2497980	2497989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57025	NC_020558	T	6	6	2497991	2497996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57026	NC_020558	T	7	7	2498010	2498016	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57027	NC_020558	AAT	2	6	2498321	2498326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57028	NC_020558	AGG	2	6	2498410	2498415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211604
57029	NC_020558	CGCAC	2	10	2498470	2498479	20 %	0 %	20 %	60 %	470211604
57030	NC_020558	AT	3	6	2498489	2498494	50 %	50 %	0 %	0 %	470211604
57031	NC_020558	ATT	2	6	2498637	2498642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
57032	NC_020558	TTTG	2	8	2498677	2498684	0 %	75 %	25 %	0 %	470211604
57033	NC_020558	TAA	2	6	2498759	2498764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57034	NC_020558	T	6	6	2498825	2498830	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57035	NC_020558	CA	3	6	2498860	2498865	50 %	0 %	0 %	50 %	470211604
57036	NC_020558	GTT	2	6	2498962	2498967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57037	NC_020558	TCA	2	6	2498999	2499004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57038	NC_020558	TAT	2	6	2499098	2499103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
57039	NC_020558	TTG	2	6	2499182	2499187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57040	NC_020558	TAA	2	6	2499297	2499302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57041	NC_020558	T	6	6	2499440	2499445	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57042	NC_020558	ATA	2	6	2499486	2499491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57043	NC_020558	TAGT	2	8	2499515	2499522	25 %	50 %	25 %	0 %	470211604
57044	NC_020558	T	6	6	2499665	2499670	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57045	NC_020558	CACT	2	8	2499761	2499768	25 %	25 %	0 %	50 %	470211604
57046	NC_020558	TCG	2	6	2499799	2499804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211604
57047	NC_020558	GTT	2	6	2499829	2499834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57048	NC_020558	TCA	2	6	2499850	2499855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57049	NC_020558	TTTA	2	8	2499915	2499922	25 %	75 %	0 %	0 %	470211604
57050	NC_020558	ATT	2	6	2499925	2499930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
57051	NC_020558	GTT	2	6	2499964	2499969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57052	NC_020558	T	6	6	2499992	2499997	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57053	NC_020558	GTT	2	6	2500057	2500062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57054	NC_020558	GATT	2	8	2500111	2500118	25 %	50 %	25 %	0 %	470211604
57055	NC_020558	CT	3	6	2500216	2500221	0 %	50 %	0 %	50 %	470211604
57056	NC_020558	GT	3	6	2500301	2500306	0 %	50 %	50 %	0 %	470211604
57057	NC_020558	GATT	2	8	2500339	2500346	25 %	50 %	25 %	0 %	470211604
57058	NC_020558	TTA	2	6	2500393	2500398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
57059	NC_020558	ATTT	2	8	2500403	2500410	25 %	75 %	0 %	0 %	470211604
57060	NC_020558	ATC	2	6	2500416	2500421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57061	NC_020558	CTT	2	6	2500451	2500456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211604
57062	NC_020558	T	6	6	2500551	2500556	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57063	NC_020558	TAA	2	6	2500562	2500567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57064	NC_020558	T	6	6	2500590	2500595	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57065	NC_020558	CAT	2	6	2500607	2500612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57066	NC_020558	CGG	2	6	2500620	2500625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211604
57067	NC_020558	TGAA	2	8	2500687	2500694	50 %	25 %	25 %	0 %	470211604
57068	NC_020558	AATT	2	8	2500761	2500768	50 %	50 %	0 %	0 %	470211604
57069	NC_020558	AC	3	6	2500799	2500804	50 %	0 %	0 %	50 %	470211604
57070	NC_020558	CTG	2	6	2500868	2500873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211604
57071	NC_020558	ATT	2	6	2500893	2500898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
57072	NC_020558	TAA	2	6	2500955	2500960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57073	NC_020558	CTA	2	6	2501014	2501019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57074	NC_020558	AAC	2	6	2501034	2501039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211604
57075	NC_020558	CCG	2	6	2501048	2501053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211604
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57081	NC_020558	T	7	7	2501222	2501228	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57082	NC_020558	TGAT	2	8	2501309	2501316	25 %	50 %	25 %	0 %	470211604
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57086	NC_020558	TCA	2	6	2501506	2501511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
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57090	NC_020558	AAT	2	6	2501622	2501627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57091	NC_020558	TAC	2	6	2501643	2501648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57092	NC_020558	CTT	2	6	2501663	2501668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211604
57093	NC_020558	TCA	2	6	2501674	2501679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57094	NC_020558	TTA	2	6	2501713	2501718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211604
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57102	NC_020558	TCA	2	6	2502221	2502226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57103	NC_020558	TGT	2	6	2502234	2502239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211604
57104	NC_020558	AAG	2	6	2502257	2502262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211604
57105	NC_020558	ACG	2	6	2502388	2502393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211604
57106	NC_020558	CTA	2	6	2502413	2502418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57107	NC_020558	CTAT	2	8	2502439	2502446	25 %	50 %	0 %	25 %	470211604
57108	NC_020558	TCTA	2	8	2502459	2502466	25 %	50 %	0 %	25 %	470211604
57109	NC_020558	ATG	2	6	2502513	2502518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211604
57110	NC_020558	A	6	6	2502527	2502532	100 %	0 %	0 %	0 %	470211604
57111	NC_020558	ATC	2	6	2502535	2502540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211604
57112	NC_020558	A	6	6	2502550	2502555	100 %	0 %	0 %	0 %	470211604
57113	NC_020558	TAA	2	6	2502561	2502566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211604
57114	NC_020558	T	6	6	2502576	2502581	0 %	100 %	0 %	0 %	470211604
57115	NC_020558	AAGT	2	8	2502617	2502624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57116	NC_020558	GC	3	6	2502683	2502688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57117	NC_020558	A	6	6	2502689	2502694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57118	NC_020558	A	7	7	2502765	2502771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57119	NC_020558	ATTAG	2	10	2502777	2502786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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57121	NC_020558	ATAA	2	8	2502833	2502840	75 %	25 %	0 %	0 %	470211605
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57238	NC_020558	ACT	2	6	2508340	2508345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211612
57239	NC_020558	GAC	2	6	2508355	2508360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211612
57240	NC_020558	TCC	2	6	2508406	2508411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211613
57241	NC_020558	CGC	2	6	2508425	2508430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211613
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57243	NC_020558	CAT	2	6	2508518	2508523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211613
57244	NC_020558	AATT	2	8	2508546	2508553	50 %	50 %	0 %	0 %	470211613
57245	NC_020558	T	6	6	2508659	2508664	0 %	100 %	0 %	0 %	470211613
57246	NC_020558	GCTT	2	8	2508702	2508709	0 %	50 %	25 %	25 %	470211613
57247	NC_020558	ATC	2	6	2508780	2508785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211613
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57249	NC_020558	GC	3	6	2508868	2508873	0 %	0 %	50 %	50 %	470211613
57250	NC_020558	T	6	6	2508875	2508880	0 %	100 %	0 %	0 %	470211613
57251	NC_020558	CCAT	2	8	2508895	2508902	25 %	25 %	0 %	50 %	470211613
57252	NC_020558	CAT	2	6	2508909	2508914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211613
57253	NC_020558	T	6	6	2508956	2508961	0 %	100 %	0 %	0 %	470211613
57254	NC_020558	ATC	3	9	2509044	2509052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211613
57255	NC_020558	TAC	2	6	2509053	2509058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211613
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57257	NC_020558	TGT	2	6	2509180	2509185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211614
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57261	NC_020558	AT	3	6	2509354	2509359	50 %	50 %	0 %	0 %	470211614
57262	NC_020558	CTG	2	6	2509394	2509399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211614
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57269	NC_020558	T	6	6	2509881	2509886	0 %	100 %	0 %	0 %	470211614
57270	NC_020558	CTC	2	6	2509915	2509920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57271	NC_020558	CTT	2	6	2509987	2509992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211615
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57274	NC_020558	GCA	2	6	2510109	2510114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211615
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57284	NC_020558	TCT	2	6	2510519	2510524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57285	NC_020558	GC	3	6	2510536	2510541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57286	NC_020558	T	6	6	2510583	2510588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57287	NC_020558	TTTG	2	8	2510608	2510615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57288	NC_020558	TTCAT	2	10	2510712	2510721	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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57291	NC_020558	TTC	2	6	2510943	2510948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57292	NC_020558	A	6	6	2511003	2511008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57293	NC_020558	GAT	2	6	2511047	2511052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57294	NC_020558	TTC	2	6	2511068	2511073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57295	NC_020558	AAT	2	6	2511096	2511101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57298	NC_020558	TGGAG	2	10	2511261	2511270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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57304	NC_020558	ATCA	2	8	2511561	2511568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57305	NC_020558	CAAA	2	8	2511592	2511599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57306	NC_020558	ATT	2	6	2511629	2511634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57307	NC_020558	TTCAT	2	10	2511680	2511689	20 %	60 %	0 %	20 %	470211617
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57317	NC_020558	AC	3	6	2512125	2512130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57318	NC_020558	CA	3	6	2512136	2512141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57319	NC_020558	ATC	3	9	2512179	2512187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57320	NC_020558	GGCT	2	8	2512201	2512208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57321	NC_020558	CAAT	2	8	2512216	2512223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57322	NC_020558	CGT	2	6	2512383	2512388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57323	NC_020558	TTCC	2	8	2512632	2512639	0 %	50 %	0 %	50 %	470211618
57324	NC_020558	CGCCA	2	10	2512651	2512660	20 %	0 %	20 %	60 %	470211618
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57326	NC_020558	TTATA	2	10	2512731	2512740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57327	NC_020558	CTTA	2	8	2512747	2512754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57328	NC_020558	CTA	2	6	2512799	2512804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57329	NC_020558	TC	3	6	2512812	2512817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57330	NC_020558	TTA	2	6	2512865	2512870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57331	NC_020558	ACG	2	6	2512878	2512883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57332	NC_020558	ACG	2	6	2512892	2512897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57333	NC_020558	T	6	6	2512902	2512907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57334	NC_020558	AG	3	6	2512913	2512918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57335	NC_020558	CTG	2	6	2512925	2512930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57336	NC_020558	A	6	6	2512940	2512945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57337	NC_020558	AAAT	2	8	2513073	2513080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57340	NC_020558	TTTTA	2	10	2513145	2513154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57341	NC_020558	TTG	2	6	2513337	2513342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57342	NC_020558	AGCG	2	8	2513361	2513368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57343	NC_020558	AGA	2	6	2513382	2513387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57344	NC_020558	ATTAT	2	10	2513393	2513402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57345	NC_020558	AAG	2	6	2513445	2513450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57346	NC_020558	TGAT	2	8	2513457	2513464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57347	NC_020558	GAA	2	6	2513465	2513470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57348	NC_020558	A	7	7	2513469	2513475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57349	NC_020558	TCG	2	6	2513521	2513526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57350	NC_020558	ATCA	2	8	2513536	2513543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57351	NC_020558	GTTC	2	8	2513546	2513553	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57352	NC_020558	CGGCAC	2	12	2513571	2513582	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470211619
57353	NC_020558	A	6	6	2513602	2513607	100 %	0 %	0 %	0 %	470211619
57354	NC_020558	A	6	6	2513612	2513617	100 %	0 %	0 %	0 %	470211619
57355	NC_020558	TTTTAT	2	12	2513630	2513641	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470211619
57356	NC_020558	TAA	2	6	2513789	2513794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211619
57357	NC_020558	TAT	2	6	2513834	2513839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211619
57358	NC_020558	CAT	2	6	2513904	2513909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211619
57359	NC_020558	GAA	2	6	2513925	2513930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211619
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57486	NC_020558	AGA	2	6	2519873	2519878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57487	NC_020558	TTTCCT	2	12	2519894	2519905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57488	NC_020558	AGG	2	6	2519911	2519916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57489	NC_020558	CGG	2	6	2519984	2519989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57490	NC_020558	GTG	2	6	2520038	2520043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57491	NC_020558	GT	3	6	2520053	2520058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57492	NC_020558	GT	3	6	2520222	2520227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57493	NC_020558	ATG	2	6	2520247	2520252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57494	NC_020558	TCC	2	6	2520273	2520278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57495	NC_020558	CACGA	2	10	2520371	2520380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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57500	NC_020558	AG	3	6	2520711	2520716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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