MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_020558	TCT	2	6	2408158	2408163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211505
55002	NC_020558	TTC	3	9	2408172	2408180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211505
55003	NC_020558	TC	3	6	2408179	2408184	0 %	50 %	0 %	50 %	470211505
55004	NC_020558	CGA	2	6	2408197	2408202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211505
55005	NC_020558	TGC	2	6	2408214	2408219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211505
55006	NC_020558	CTT	2	6	2408228	2408233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211505
55007	NC_020558	T	6	6	2408232	2408237	0 %	100 %	0 %	0 %	470211505
55008	NC_020558	CTT	2	6	2408264	2408269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211505
55009	NC_020558	ATA	2	6	2408278	2408283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211505
55010	NC_020558	TACGTT	2	12	2408306	2408317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470211505
55011	NC_020558	TCC	2	6	2408335	2408340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55012	NC_020558	GCTT	2	8	2408366	2408373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55013	NC_020558	TAT	2	6	2408411	2408416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55014	NC_020558	GAT	2	6	2408451	2408456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55015	NC_020558	TTTG	2	8	2408459	2408466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55016	NC_020558	GGT	2	6	2408474	2408479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55017	NC_020558	ATT	2	6	2408535	2408540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211506
55018	NC_020558	T	6	6	2408539	2408544	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55019	NC_020558	TTC	2	6	2408563	2408568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55020	NC_020558	T	7	7	2408623	2408629	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55021	NC_020558	GAGC	2	8	2408630	2408637	25 %	0 %	50 %	25 %	470211506
55022	NC_020558	T	6	6	2408640	2408645	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55023	NC_020558	AAT	2	6	2408662	2408667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55024	NC_020558	CCA	2	6	2408675	2408680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211506
55025	NC_020558	ATCA	2	8	2408701	2408708	50 %	25 %	0 %	25 %	470211506
55026	NC_020558	TCT	2	6	2408771	2408776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55027	NC_020558	ATC	2	6	2408812	2408817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211506
55028	NC_020558	TAC	2	6	2408868	2408873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211506
55029	NC_020558	CAC	2	6	2408913	2408918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211506
55030	NC_020558	TTGG	3	12	2409000	2409011	0 %	50 %	50 %	0 %	470211506
55031	NC_020558	TCCT	2	8	2409025	2409032	0 %	50 %	0 %	50 %	470211506
55032	NC_020558	TGA	2	6	2409165	2409170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211506
55033	NC_020558	T	6	6	2409229	2409234	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55034	NC_020558	ATC	2	6	2409283	2409288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211506
55035	NC_020558	TTC	2	6	2409327	2409332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55036	NC_020558	T	6	6	2409360	2409365	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55037	NC_020558	GTA	2	6	2409447	2409452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211506
55038	NC_020558	TTCA	2	8	2409454	2409461	25 %	50 %	0 %	25 %	470211506
55039	NC_020558	ACCTGA	2	12	2409475	2409486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470211506
55040	NC_020558	ATT	2	6	2409544	2409549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211506
55041	NC_020558	AAT	2	6	2409562	2409567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55042	NC_020558	T	6	6	2409619	2409624	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55043	NC_020558	TAT	2	6	2409657	2409662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211506
55044	NC_020558	CTT	2	6	2409669	2409674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55045	NC_020558	CAA	2	6	2409690	2409695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211506
55046	NC_020558	CCG	2	6	2409701	2409706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211506
55047	NC_020558	CAT	2	6	2409751	2409756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211506
55048	NC_020558	TGA	2	6	2409845	2409850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211506
55049	NC_020558	CCA	2	6	2409938	2409943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211506
55050	NC_020558	T	6	6	2409992	2409997	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55051	NC_020558	AAG	2	6	2409998	2410003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211506
55052	NC_020558	CTT	2	6	2410020	2410025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55053	NC_020558	GAA	2	6	2410078	2410083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211506
55054	NC_020558	ATG	2	6	2410126	2410131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211506
55055	NC_020558	TCT	2	6	2410157	2410162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55056	NC_020558	AT	3	6	2410205	2410210	50 %	50 %	0 %	0 %	470211506
55057	NC_020558	ATA	2	6	2410367	2410372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55058	NC_020558	TTC	2	6	2410378	2410383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55059	NC_020558	GTA	2	6	2410456	2410461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211506
55060	NC_020558	AAT	2	6	2410486	2410491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55061	NC_020558	AGAC	2	8	2410507	2410514	50 %	0 %	25 %	25 %	470211506
55062	NC_020558	ATA	2	6	2410671	2410676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55063	NC_020558	CAA	2	6	2410698	2410703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211506
55064	NC_020558	AGC	2	6	2410729	2410734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211506
55065	NC_020558	AAT	2	6	2410789	2410794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211506
55066	NC_020558	TCAATT	2	12	2410823	2410834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470211506
55067	NC_020558	CTT	2	6	2410884	2410889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211506
55068	NC_020558	T	6	6	2410888	2410893	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55069	NC_020558	T	6	6	2410924	2410929	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55070	NC_020558	ATT	2	6	2410949	2410954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211506
55071	NC_020558	T	6	6	2410965	2410970	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55072	NC_020558	CCA	2	6	2410992	2410997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211506
55073	NC_020558	TTG	2	6	2411130	2411135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211506
55074	NC_020558	T	6	6	2411136	2411141	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55075	NC_020558	AAGC	2	8	2411277	2411284	50 %	0 %	25 %	25 %	470211506
55076	NC_020558	ACCTGA	2	12	2411293	2411304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470211506
55077	NC_020558	ACT	2	6	2411318	2411323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211506
55078	NC_020558	T	6	6	2411354	2411359	0 %	100 %	0 %	0 %	470211506
55079	NC_020558	CAG	2	6	2411455	2411460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211507
55080	NC_020558	GCT	2	6	2411484	2411489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211507
55081	NC_020558	TTTCA	2	10	2411492	2411501	20 %	60 %	0 %	20 %	470211507
55082	NC_020558	TTCT	2	8	2411531	2411538	0 %	75 %	0 %	25 %	470211507
55083	NC_020558	GAT	2	6	2411603	2411608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211507
55084	NC_020558	T	6	6	2411621	2411626	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
55085	NC_020558	ACG	2	6	2411678	2411683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211507
55086	NC_020558	AGC	2	6	2411765	2411770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211507
55087	NC_020558	CTT	2	6	2411815	2411820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
55088	NC_020558	CAA	2	6	2411839	2411844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211507
55089	NC_020558	AAGT	2	8	2411876	2411883	50 %	25 %	25 %	0 %	470211507
55090	NC_020558	CAT	2	6	2411899	2411904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55091	NC_020558	AC	3	6	2411905	2411910	50 %	0 %	0 %	50 %	470211507
55092	NC_020558	CTT	2	6	2411989	2411994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
55093	NC_020558	T	7	7	2412022	2412028	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
55094	NC_020558	GGT	2	6	2412035	2412040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211507
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55098	NC_020558	T	7	7	2412180	2412186	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
55099	NC_020558	TGAT	2	8	2412228	2412235	25 %	50 %	25 %	0 %	470211507
55100	NC_020558	TTC	2	6	2412248	2412253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
55101	NC_020558	TAT	2	6	2412268	2412273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211507
55102	NC_020558	TCA	2	6	2412375	2412380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55103	NC_020558	ATC	2	6	2412395	2412400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55104	NC_020558	CAT	2	6	2412500	2412505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55105	NC_020558	TTCG	2	8	2412519	2412526	0 %	50 %	25 %	25 %	470211507
55106	NC_020558	TAT	2	6	2412556	2412561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211507
55107	NC_020558	T	6	6	2412617	2412622	0 %	100 %	0 %	0 %	470211507
55108	NC_020558	ATA	2	6	2412624	2412629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211507
55109	NC_020558	TCA	2	6	2412732	2412737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55110	NC_020558	ACA	2	6	2412792	2412797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211507
55111	NC_020558	CTA	2	6	2412859	2412864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55112	NC_020558	TC	3	6	2412922	2412927	0 %	50 %	0 %	50 %	470211507
55113	NC_020558	GCA	2	6	2413005	2413010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211507
55114	NC_020558	TCA	2	6	2413038	2413043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211507
55115	NC_020558	AT	3	6	2413065	2413070	50 %	50 %	0 %	0 %	470211507
55116	NC_020558	CTT	2	6	2413225	2413230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211507
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55118	NC_020558	AACT	2	8	2413367	2413374	50 %	25 %	0 %	25 %	470211507
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55236	NC_020558	TAA	2	6	2418584	2418589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55499	NC_020558	GTT	2	6	2430595	2430600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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