MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020558	CCG	2	6	2319920	2319925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53002	NC_020558	TAA	2	6	2319960	2319965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53003	NC_020558	AAAC	2	8	2319991	2319998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53004	NC_020558	TACG	2	8	2320002	2320009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53005	NC_020558	CGATGG	2	12	2320053	2320064	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53006	NC_020558	TAA	2	6	2320141	2320146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53007	NC_020558	AAAC	2	8	2320172	2320179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53008	NC_020558	TACG	2	8	2320183	2320190	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53009	NC_020558	GC	3	6	2320209	2320214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53010	NC_020558	AAG	2	6	2320407	2320412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211406
53011	NC_020558	A	6	6	2320421	2320426	100 %	0 %	0 %	0 %	470211406
53012	NC_020558	GAT	2	6	2320427	2320432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211406
53013	NC_020558	ATA	2	6	2320443	2320448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211406
53014	NC_020558	ACAA	2	8	2320460	2320467	75 %	0 %	0 %	25 %	470211406
53015	NC_020558	AAAC	2	8	2320489	2320496	75 %	0 %	0 %	25 %	470211406
53016	NC_020558	AGCA	2	8	2320501	2320508	50 %	0 %	25 %	25 %	470211406
53017	NC_020558	ACAA	2	8	2320528	2320535	75 %	0 %	0 %	25 %	470211406
53018	NC_020558	CAA	2	6	2320559	2320564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211406
53019	NC_020558	CT	3	6	2320658	2320663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53020	NC_020558	AG	3	6	2320677	2320682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53021	NC_020558	TTTG	2	8	2320685	2320692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53022	NC_020558	ACT	2	6	2320709	2320714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53023	NC_020558	GAA	2	6	2320812	2320817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211407
53024	NC_020558	A	6	6	2320847	2320852	100 %	0 %	0 %	0 %	470211407
53025	NC_020558	TCCG	2	8	2320855	2320862	0 %	25 %	25 %	50 %	470211407
53026	NC_020558	CA	3	6	2320904	2320909	50 %	0 %	0 %	50 %	470211407
53027	NC_020558	ACT	2	6	2320931	2320936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211407
53028	NC_020558	A	6	6	2321005	2321010	100 %	0 %	0 %	0 %	470211407
53029	NC_020558	GTT	2	6	2321028	2321033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211407
53030	NC_020558	T	6	6	2321038	2321043	0 %	100 %	0 %	0 %	470211407
53031	NC_020558	ATAC	2	8	2321129	2321136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53032	NC_020558	AGG	2	6	2321144	2321149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53033	NC_020558	TAT	2	6	2321246	2321251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211408
53034	NC_020558	ACA	2	6	2321256	2321261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211408
53035	NC_020558	TTC	2	6	2321315	2321320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211408
53036	NC_020558	TGATG	2	10	2321364	2321373	20 %	40 %	40 %	0 %	470211408
53037	NC_020558	TGA	2	6	2321421	2321426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211408
53038	NC_020558	CA	3	6	2321569	2321574	50 %	0 %	0 %	50 %	470211408
53039	NC_020558	TGA	2	6	2321580	2321585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211408
53040	NC_020558	GTC	2	6	2321618	2321623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211408
53041	NC_020558	ACG	2	6	2321639	2321644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211408
53042	NC_020558	TTAA	2	8	2321651	2321658	50 %	50 %	0 %	0 %	470211408
53043	NC_020558	TCC	2	6	2321687	2321692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211409
53044	NC_020558	TTTTC	2	10	2321705	2321714	0 %	80 %	0 %	20 %	470211409
53045	NC_020558	GAAC	2	8	2321756	2321763	50 %	0 %	25 %	25 %	470211409
53046	NC_020558	TCA	2	6	2321792	2321797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211409
53047	NC_020558	CATC	2	8	2321827	2321834	25 %	25 %	0 %	50 %	470211409
53048	NC_020558	AAT	2	6	2321914	2321919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211409
53049	NC_020558	CTT	2	6	2321964	2321969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211409
53050	NC_020558	CAA	2	6	2321979	2321984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211409
53051	NC_020558	TCT	2	6	2321999	2322004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211409
53052	NC_020558	CCG	2	6	2322026	2322031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211409
53053	NC_020558	TGC	2	6	2322068	2322073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211409
53054	NC_020558	TAA	2	6	2322129	2322134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211409
53055	NC_020558	ATA	2	6	2322212	2322217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211409
53056	NC_020558	ATCTTC	2	12	2322226	2322237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470211409
53057	NC_020558	ATATG	2	10	2322251	2322260	40 %	40 %	20 %	0 %	470211409
53058	NC_020558	ATC	2	6	2322317	2322322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211409
53059	NC_020558	ATC	2	6	2322335	2322340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211409
53060	NC_020558	CTT	2	6	2322342	2322347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211409
53061	NC_020558	AAT	2	6	2322436	2322441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211409
53062	NC_020558	TCGG	2	8	2322449	2322456	0 %	25 %	50 %	25 %	470211409
53063	NC_020558	GC	3	6	2322574	2322579	0 %	0 %	50 %	50 %	470211409
53064	NC_020558	AAATCG	2	12	2322681	2322692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470211409
53065	NC_020558	CTGGCA	2	12	2322708	2322719	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470211409
53066	NC_020558	AAT	2	6	2322728	2322733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211409
53067	NC_020558	CCAA	2	8	2322738	2322745	50 %	0 %	0 %	50 %	470211409
53068	NC_020558	ACCC	2	8	2322767	2322774	25 %	0 %	0 %	75 %	470211409
53069	NC_020558	GCG	2	6	2322785	2322790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211409
53070	NC_020558	TCAT	2	8	2322824	2322831	25 %	50 %	0 %	25 %	470211409
53071	NC_020558	T	7	7	2322844	2322850	0 %	100 %	0 %	0 %	470211409
53072	NC_020558	TCGC	2	8	2322858	2322865	0 %	25 %	25 %	50 %	470211409
53073	NC_020558	CTA	2	6	2322879	2322884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211409
53074	NC_020558	TCC	2	6	2323000	2323005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53075	NC_020558	GCTG	2	8	2323156	2323163	0 %	25 %	50 %	25 %	470211410
53076	NC_020558	AAT	2	6	2323188	2323193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211410
53077	NC_020558	CCG	2	6	2323210	2323215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211410
53078	NC_020558	CAT	2	6	2323271	2323276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211410
53079	NC_020558	TTC	2	6	2323347	2323352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211410
53080	NC_020558	T	6	6	2323397	2323402	0 %	100 %	0 %	0 %	470211410
53081	NC_020558	CCT	2	6	2323480	2323485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53082	NC_020558	A	7	7	2323493	2323499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53083	NC_020558	AGTT	2	8	2323539	2323546	25 %	50 %	25 %	0 %	470211411
53084	NC_020558	TTTC	2	8	2323571	2323578	0 %	75 %	0 %	25 %	470211411
53085	NC_020558	TAA	2	6	2323581	2323586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211411
53086	NC_020558	CTT	2	6	2323589	2323594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211411
53087	NC_020558	ATA	2	6	2323651	2323656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211411
53088	NC_020558	CCA	2	6	2323676	2323681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211411
53089	NC_020558	TGCT	2	8	2323719	2323726	0 %	50 %	25 %	25 %	470211411
53090	NC_020558	ATA	2	6	2323729	2323734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211411
53091	NC_020558	AATA	2	8	2323752	2323759	75 %	25 %	0 %	0 %	470211411
53092	NC_020558	TCG	2	6	2323853	2323858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211411
53093	NC_020558	ACA	2	6	2323939	2323944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211411
53094	NC_020558	T	6	6	2324027	2324032	0 %	100 %	0 %	0 %	470211411
53095	NC_020558	CAT	2	6	2324046	2324051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211411
53096	NC_020558	CGT	2	6	2324073	2324078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211411
53097	NC_020558	TTGT	2	8	2324155	2324162	0 %	75 %	25 %	0 %	470211411
53098	NC_020558	AAAT	2	8	2324166	2324173	75 %	25 %	0 %	0 %	470211411
53099	NC_020558	TTC	2	6	2324281	2324286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211411
53100	NC_020558	T	6	6	2324317	2324322	0 %	100 %	0 %	0 %	470211412
53101	NC_020558	AT	3	6	2324363	2324368	50 %	50 %	0 %	0 %	470211412
53102	NC_020558	TGT	2	6	2324388	2324393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211412
53103	NC_020558	TA	3	6	2324467	2324472	50 %	50 %	0 %	0 %	470211412
53104	NC_020558	AATCGT	2	12	2324569	2324580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470211412
53105	NC_020558	TCC	2	6	2324590	2324595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211413
53106	NC_020558	T	7	7	2324606	2324612	0 %	100 %	0 %	0 %	470211413
53107	NC_020558	AGT	2	6	2324638	2324643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211413
53108	NC_020558	TA	3	6	2324651	2324656	50 %	50 %	0 %	0 %	470211413
53109	NC_020558	CTT	2	6	2324657	2324662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211413
53110	NC_020558	TAT	2	6	2324756	2324761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211413
53111	NC_020558	CTTT	2	8	2324873	2324880	0 %	75 %	0 %	25 %	470211413
53112	NC_020558	CTC	2	6	2324910	2324915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211413
53113	NC_020558	TGG	2	6	2324962	2324967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211413
53114	NC_020558	TCA	2	6	2325023	2325028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211413
53115	NC_020558	TTCA	2	8	2325063	2325070	25 %	50 %	0 %	25 %	470211413
53116	NC_020558	TCA	2	6	2325091	2325096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211413
53117	NC_020558	ACT	2	6	2325130	2325135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211413
53118	NC_020558	AG	3	6	2325141	2325146	50 %	0 %	50 %	0 %	470211413
53119	NC_020558	GC	3	6	2325151	2325156	0 %	0 %	50 %	50 %	470211413
53120	NC_020558	GAA	2	6	2325165	2325170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211413
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53122	NC_020558	ATT	2	6	2325252	2325257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211413
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53124	NC_020558	CTG	2	6	2325305	2325310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211413
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53142	NC_020558	T	7	7	2326100	2326106	0 %	100 %	0 %	0 %	470211414
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53210	NC_020558	CTT	2	6	2329651	2329656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211419
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53230	NC_020558	CAT	2	6	2330592	2330597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211421
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53233	NC_020558	TGC	2	6	2330712	2330717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211422
53234	NC_020558	T	7	7	2330791	2330797	0 %	100 %	0 %	0 %	470211422
53235	NC_020558	TCT	3	9	2330823	2330831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211422
53236	NC_020558	AT	3	6	2330838	2330843	50 %	50 %	0 %	0 %	470211422
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53238	NC_020558	ATG	2	6	2330897	2330902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211422
53239	NC_020558	AGT	2	6	2330984	2330989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211422
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53350	NC_020558	CTT	2	6	2335604	2335609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211427
53351	NC_020558	TC	3	6	2335618	2335623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53352	NC_020558	T	6	6	2335625	2335630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53353	NC_020558	T	7	7	2335645	2335651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53354	NC_020558	TTC	2	6	2335660	2335665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53355	NC_020558	ATA	2	6	2335744	2335749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211428
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53479	NC_020558	AGC	2	6	2340813	2340818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53480	NC_020558	T	6	6	2340877	2340882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53481	NC_020558	A	6	6	2340901	2340906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53482	NC_020558	TCAC	2	8	2340915	2340922	25 %	25 %	0 %	50 %	470211434
53483	NC_020558	CAT	2	6	2340950	2340955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211434
53484	NC_020558	GGC	2	6	2341115	2341120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211434
53485	NC_020558	CA	3	6	2341139	2341144	50 %	0 %	0 %	50 %	470211434
53486	NC_020558	A	6	6	2341152	2341157	100 %	0 %	0 %	0 %	470211434
53487	NC_020558	AAC	2	6	2341161	2341166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211434
53488	NC_020558	T	8	8	2341179	2341186	0 %	100 %	0 %	0 %	470211434
53489	NC_020558	CTTT	2	8	2341201	2341208	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53490	NC_020558	CCT	2	6	2341232	2341237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53491	NC_020558	A	6	6	2341241	2341246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53492	NC_020558	CCT	2	6	2341273	2341278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53493	NC_020558	CTT	2	6	2341337	2341342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211435
53494	NC_020558	CTT	2	6	2341346	2341351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211435
53495	NC_020558	ATTA	2	8	2341389	2341396	50 %	50 %	0 %	0 %	470211435
53496	NC_020558	TCT	2	6	2341408	2341413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211435
53497	NC_020558	ACT	2	6	2341432	2341437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211435
53498	NC_020558	CAA	2	6	2341538	2341543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211435
53499	NC_020558	ATAAC	2	10	2341588	2341597	60 %	20 %	0 %	20 %	470211435
53500	NC_020558	TTC	2	6	2341626	2341631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211435

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