MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_020558	A	7	7	2298647	2298653	100 %	0 %	0 %	0 %	470211380
52502	NC_020558	TTTC	2	8	2298690	2298697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52503	NC_020558	A	6	6	2299029	2299034	100 %	0 %	0 %	0 %	470211381
52504	NC_020558	TGC	2	6	2299052	2299057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211381
52505	NC_020558	TTC	2	6	2299214	2299219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211381
52506	NC_020558	GATG	2	8	2299256	2299263	25 %	25 %	50 %	0 %	470211381
52507	NC_020558	GTT	2	6	2299329	2299334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211381
52508	NC_020558	ATG	2	6	2299533	2299538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211381
52509	NC_020558	TTC	2	6	2299542	2299547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211381
52510	NC_020558	ATT	2	6	2299554	2299559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211381
52511	NC_020558	ATTT	2	8	2299565	2299572	25 %	75 %	0 %	0 %	470211381
52512	NC_020558	TTC	2	6	2299581	2299586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211381
52513	NC_020558	A	6	6	2299603	2299608	100 %	0 %	0 %	0 %	470211381
52514	NC_020558	TAT	2	6	2299667	2299672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211381
52515	NC_020558	GTG	2	6	2299680	2299685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211381
52516	NC_020558	ATT	2	6	2299686	2299691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211381
52517	NC_020558	ATT	2	6	2299695	2299700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211381
52518	NC_020558	CAT	2	6	2299742	2299747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211381
52519	NC_020558	TTC	2	6	2299806	2299811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211381
52520	NC_020558	GAG	2	6	2299882	2299887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211381
52521	NC_020558	TGA	2	6	2299889	2299894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211381
52522	NC_020558	CTA	2	6	2299907	2299912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211382
52523	NC_020558	ATT	2	6	2299955	2299960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211382
52524	NC_020558	A	6	6	2299991	2299996	100 %	0 %	0 %	0 %	470211382
52525	NC_020558	TTG	2	6	2300013	2300018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211382
52526	NC_020558	ATCT	2	8	2300118	2300125	25 %	50 %	0 %	25 %	470211382
52527	NC_020558	AACA	2	8	2300133	2300140	75 %	0 %	0 %	25 %	470211382
52528	NC_020558	AGA	2	6	2300152	2300157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211382
52529	NC_020558	AGC	2	6	2300176	2300181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211382
52530	NC_020558	CTTA	2	8	2300193	2300200	25 %	50 %	0 %	25 %	470211382
52531	NC_020558	GCG	2	6	2300249	2300254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470211382
52532	NC_020558	CG	3	6	2300306	2300311	0 %	0 %	50 %	50 %	470211382
52533	NC_020558	CG	3	6	2300366	2300371	0 %	0 %	50 %	50 %	470211382
52534	NC_020558	TTA	2	6	2300373	2300378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211382
52535	NC_020558	AAG	2	6	2300431	2300436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211382
52536	NC_020558	ATG	2	6	2300505	2300510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211382
52537	NC_020558	A	6	6	2300577	2300582	100 %	0 %	0 %	0 %	470211382
52538	NC_020558	CA	3	6	2300601	2300606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52539	NC_020558	T	7	7	2300609	2300615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52540	NC_020558	CAG	2	6	2300725	2300730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211383
52541	NC_020558	TCA	2	6	2300736	2300741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211383
52542	NC_020558	T	7	7	2300746	2300752	0 %	100 %	0 %	0 %	470211383
52543	NC_020558	ACA	2	6	2300781	2300786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211383
52544	NC_020558	TTAC	2	8	2300805	2300812	25 %	50 %	0 %	25 %	470211383
52545	NC_020558	TTC	2	6	2300855	2300860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211383
52546	NC_020558	TGC	2	6	2300861	2300866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211383
52547	NC_020558	TTG	2	6	2300893	2300898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211383
52548	NC_020558	CTTTC	2	10	2300942	2300951	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52549	NC_020558	GCT	2	6	2300960	2300965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52550	NC_020558	T	7	7	2300965	2300971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52551	NC_020558	TTA	2	6	2300980	2300985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52552	NC_020558	ACT	2	6	2301015	2301020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52553	NC_020558	GA	3	6	2301027	2301032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52554	NC_020558	AAT	2	6	2301034	2301039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52555	NC_020558	A	6	6	2301050	2301055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52556	NC_020558	ATA	2	6	2301082	2301087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52557	NC_020558	CAT	2	6	2301123	2301128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52558	NC_020558	AAC	2	6	2301134	2301139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52559	NC_020558	A	6	6	2301153	2301158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52560	NC_020558	GT	3	6	2301171	2301176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52561	NC_020558	GGA	2	6	2301254	2301259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211384
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52568	NC_020558	TTTAAA	2	12	2301570	2301581	50 %	50 %	0 %	0 %	470211384
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52570	NC_020558	GTTT	2	8	2301676	2301683	0 %	75 %	25 %	0 %	470211384
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52573	NC_020558	CTTA	2	8	2301900	2301907	25 %	50 %	0 %	25 %	470211384
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52584	NC_020558	TA	3	6	2302507	2302512	50 %	50 %	0 %	0 %	470211384
52585	NC_020558	TAAAA	2	10	2302539	2302548	80 %	20 %	0 %	0 %	470211384
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52591	NC_020558	CTCG	2	8	2302699	2302706	0 %	25 %	25 %	50 %	470211385
52592	NC_020558	TTA	2	6	2302708	2302713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211385
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52599	NC_020558	TGGG	2	8	2302961	2302968	0 %	25 %	75 %	0 %	470211385
52600	NC_020558	ATT	3	9	2303001	2303009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211385
52601	NC_020558	A	6	6	2303023	2303028	100 %	0 %	0 %	0 %	470211385
52602	NC_020558	TTCA	2	8	2303057	2303064	25 %	50 %	0 %	25 %	470211385
52603	NC_020558	TCT	2	6	2303079	2303084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211386
52604	NC_020558	CTA	2	6	2303145	2303150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211386
52605	NC_020558	TG	3	6	2303182	2303187	0 %	50 %	50 %	0 %	470211386
52606	NC_020558	CGTC	2	8	2303189	2303196	0 %	25 %	25 %	50 %	470211386
52607	NC_020558	CAG	2	6	2303277	2303282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211386
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52610	NC_020558	GTA	2	6	2303497	2303502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211386
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52612	NC_020558	CTT	2	6	2303663	2303668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52613	NC_020558	ATA	2	6	2303702	2303707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52614	NC_020558	AAC	2	6	2303716	2303721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52615	NC_020558	T	7	7	2303772	2303778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52616	NC_020558	AAT	2	6	2303854	2303859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52617	NC_020558	GAT	2	6	2303869	2303874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52618	NC_020558	TC	3	6	2303968	2303973	0 %	50 %	0 %	50 %	470211387
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52620	NC_020558	T	7	7	2304149	2304155	0 %	100 %	0 %	0 %	470211387
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52976	NC_020558	TCCT	2	8	2318878	2318885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52977	NC_020558	CAC	2	6	2318898	2318903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52978	NC_020558	ATC	2	6	2318911	2318916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52979	NC_020558	ATCC	2	8	2318927	2318934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52980	NC_020558	ATGC	2	8	2318999	2319006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52981	NC_020558	TCCT	2	8	2319026	2319033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52982	NC_020558	CAC	2	6	2319046	2319051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52983	NC_020558	ATC	2	6	2319059	2319064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52984	NC_020558	CCA	2	6	2319067	2319072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52985	NC_020558	ATCC	2	8	2319075	2319082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52986	NC_020558	ATGC	2	8	2319147	2319154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52987	NC_020558	ATCC	2	8	2319187	2319194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52988	NC_020558	AAT	2	6	2319243	2319248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52989	NC_020558	CCG	2	6	2319330	2319335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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52992	NC_020558	TACG	2	8	2319412	2319419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52993	NC_020558	CGATGG	2	12	2319463	2319474	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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52997	NC_020558	GC	3	6	2319632	2319637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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52999	NC_020558	AAAC	2	8	2319792	2319799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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