MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_020558	A	6	6	2253749	2253754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51502	NC_020558	AAAG	2	8	2253760	2253767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51503	NC_020558	CTTTT	2	10	2253776	2253785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51504	NC_020558	A	6	6	2253791	2253796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51505	NC_020558	AGG	2	6	2253812	2253817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51506	NC_020558	TAA	2	6	2253992	2253997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51507	NC_020558	TAA	2	6	2254047	2254052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51508	NC_020558	A	6	6	2254094	2254099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51509	NC_020558	ATG	2	6	2254105	2254110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51510	NC_020558	ACCA	2	8	2254146	2254153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51511	NC_020558	TGC	2	6	2254158	2254163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51512	NC_020558	TTA	2	6	2254176	2254181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51513	NC_020558	GAA	2	6	2254204	2254209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51514	NC_020558	TAAA	2	8	2254249	2254256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51515	NC_020558	TAG	2	6	2254271	2254276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51516	NC_020558	T	6	6	2254297	2254302	0 %	100 %	0 %	0 %	470211342
51517	NC_020558	TAA	2	6	2254336	2254341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211342
51518	NC_020558	GTAT	2	8	2254354	2254361	25 %	50 %	25 %	0 %	470211342
51519	NC_020558	AAAGG	2	10	2254406	2254415	60 %	0 %	40 %	0 %	470211342
51520	NC_020558	CAT	2	6	2254449	2254454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211342
51521	NC_020558	TAA	2	6	2254456	2254461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211342
51522	NC_020558	GTT	3	9	2254469	2254477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211342
51523	NC_020558	CGGT	2	8	2254516	2254523	0 %	25 %	50 %	25 %	470211342
51524	NC_020558	CGC	2	6	2254573	2254578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211342
51525	NC_020558	GTT	2	6	2254581	2254586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211342
51526	NC_020558	TTTC	2	8	2254603	2254610	0 %	75 %	0 %	25 %	470211342
51527	NC_020558	AATT	2	8	2254618	2254625	50 %	50 %	0 %	0 %	470211342
51528	NC_020558	TCACT	2	10	2254652	2254661	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51529	NC_020558	AAT	3	9	2254804	2254812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
51530	NC_020558	AAT	2	6	2254816	2254821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
51531	NC_020558	CTC	2	6	2254860	2254865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211343
51532	NC_020558	AATG	2	8	2254990	2254997	50 %	25 %	25 %	0 %	470211343
51533	NC_020558	AGTT	2	8	2255013	2255020	25 %	50 %	25 %	0 %	470211343
51534	NC_020558	ATTT	2	8	2255049	2255056	25 %	75 %	0 %	0 %	470211343
51535	NC_020558	GTG	2	6	2255088	2255093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211343
51536	NC_020558	TACCA	2	10	2255095	2255104	40 %	20 %	0 %	40 %	470211343
51537	NC_020558	TTG	2	6	2255112	2255117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
51538	NC_020558	AT	3	6	2255175	2255180	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
51539	NC_020558	AGC	2	6	2255182	2255187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
51540	NC_020558	TTA	2	6	2255189	2255194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211343
51541	NC_020558	CAT	2	6	2255218	2255223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
51542	NC_020558	CGTT	2	8	2255253	2255260	0 %	50 %	25 %	25 %	470211343
51543	NC_020558	AAG	2	6	2255276	2255281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470211343
51544	NC_020558	ACT	2	6	2255375	2255380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
51545	NC_020558	TAAT	2	8	2255424	2255431	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
51546	NC_020558	ACC	2	6	2255455	2255460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
51547	NC_020558	CAC	2	6	2255484	2255489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
51548	NC_020558	AT	3	6	2255558	2255563	50 %	50 %	0 %	0 %	470211343
51549	NC_020558	GCGATA	2	12	2255702	2255713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470211343
51550	NC_020558	CCA	2	6	2255717	2255722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211343
51551	NC_020558	TTG	2	6	2255773	2255778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
51552	NC_020558	CTT	2	6	2255859	2255864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
51553	NC_020558	AAT	2	6	2255962	2255967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
51554	NC_020558	TTA	2	6	2256059	2256064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211343
51555	NC_020558	CAA	2	6	2256171	2256176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211343
51556	NC_020558	TCT	2	6	2256182	2256187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
51557	NC_020558	TCT	2	6	2256191	2256196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
51558	NC_020558	TTG	2	6	2256203	2256208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211343
51559	NC_020558	GCT	2	6	2256290	2256295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211343
51560	NC_020558	GCA	2	6	2256332	2256337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
51561	NC_020558	GCTG	2	8	2256356	2256363	0 %	25 %	50 %	25 %	470211343
51562	NC_020558	CAT	2	6	2256375	2256380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
51563	NC_020558	ACA	2	6	2256410	2256415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211343
51564	NC_020558	CTT	2	6	2256507	2256512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211343
51565	NC_020558	TCA	2	6	2256524	2256529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211343
51566	NC_020558	AGC	2	6	2256574	2256579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211343
51567	NC_020558	TAA	2	6	2256625	2256630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211343
51568	NC_020558	TCC	2	6	2256652	2256657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470211344
51569	NC_020558	GCA	2	6	2256759	2256764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211344
51570	NC_020558	TC	3	6	2256780	2256785	0 %	50 %	0 %	50 %	470211344
51571	NC_020558	CAA	2	6	2256802	2256807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211344
51572	NC_020558	TCT	2	6	2256882	2256887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211344
51573	NC_020558	GC	3	6	2256937	2256942	0 %	0 %	50 %	50 %	470211344
51574	NC_020558	T	6	6	2256956	2256961	0 %	100 %	0 %	0 %	470211344
51575	NC_020558	TTC	2	6	2256977	2256982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211344
51576	NC_020558	GTG	2	6	2257022	2257027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470211344
51577	NC_020558	ATCA	2	8	2257088	2257095	50 %	25 %	0 %	25 %	470211344
51578	NC_020558	T	8	8	2257106	2257113	0 %	100 %	0 %	0 %	470211344
51579	NC_020558	ATT	2	6	2257128	2257133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211344
51580	NC_020558	AGG	2	6	2257160	2257165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470211344
51581	NC_020558	TGGC	2	8	2257249	2257256	0 %	25 %	50 %	25 %	470211344
51582	NC_020558	TCT	2	6	2257278	2257283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211344
51583	NC_020558	A	6	6	2257395	2257400	100 %	0 %	0 %	0 %	470211344
51584	NC_020558	CTG	2	6	2257440	2257445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211344
51585	NC_020558	CCA	2	6	2257461	2257466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470211344
51586	NC_020558	GCC	2	6	2257499	2257504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211344
51587	NC_020558	ATT	2	6	2257583	2257588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211345
51588	NC_020558	T	6	6	2257593	2257598	0 %	100 %	0 %	0 %	470211345
51589	NC_020558	CTT	2	6	2257650	2257655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211345
51590	NC_020558	ACA	2	6	2257709	2257714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211345
51591	NC_020558	GCA	2	6	2257739	2257744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211345
51592	NC_020558	CTT	2	6	2257758	2257763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211345
51593	NC_020558	AAT	2	6	2257867	2257872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211345
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51599	NC_020558	T	6	6	2258080	2258085	0 %	100 %	0 %	0 %	470211345
51600	NC_020558	TCAT	2	8	2258111	2258118	25 %	50 %	0 %	25 %	470211345
51601	NC_020558	CCG	2	6	2258156	2258161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211345
51602	NC_020558	TTC	2	6	2258185	2258190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211345
51603	NC_020558	TAATT	2	10	2258254	2258263	40 %	60 %	0 %	0 %	470211345
51604	NC_020558	ATA	2	6	2258288	2258293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211345
51605	NC_020558	GTT	2	6	2258295	2258300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211345
51606	NC_020558	ATT	2	6	2258318	2258323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211345
51607	NC_020558	CTC	2	6	2258325	2258330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51608	NC_020558	AGTT	2	8	2258338	2258345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51609	NC_020558	ATC	2	6	2258347	2258352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51610	NC_020558	TTTC	2	8	2258355	2258362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51611	NC_020558	TTCA	2	8	2258376	2258383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51612	NC_020558	AGA	2	6	2258504	2258509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51613	NC_020558	T	7	7	2258513	2258519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51614	NC_020558	AGG	2	6	2258520	2258525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51615	NC_020558	TAT	2	6	2258620	2258625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211346
51616	NC_020558	AGC	2	6	2258641	2258646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211346
51617	NC_020558	CAA	3	9	2258723	2258731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470211346
51618	NC_020558	GCA	2	6	2258753	2258758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211346
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52000	NC_020558	TCA	2	6	2275959	2275964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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