MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 63216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_020558	A	6	6	2233497	2233502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51002	NC_020558	ATTA	2	8	2233512	2233519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51003	NC_020558	A	7	7	2233525	2233531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51004	NC_020558	A	7	7	2233574	2233580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51005	NC_020558	ATT	2	6	2233595	2233600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_020558	A	6	6	2233636	2233641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51007	NC_020558	AGA	2	6	2233650	2233655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51008	NC_020558	GAA	2	6	2233660	2233665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_020558	TTTTA	2	10	2233696	2233705	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_020558	TAA	2	6	2233715	2233720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51012	NC_020558	AAT	2	6	2233738	2233743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51013	NC_020558	GTA	2	6	2233745	2233750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51014	NC_020558	TA	3	6	2233758	2233763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51015	NC_020558	GGA	2	6	2233775	2233780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51016	NC_020558	GTTT	2	8	2233902	2233909	0 %	75 %	25 %	0 %	470211316
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51021	NC_020558	AT	3	6	2233967	2233972	50 %	50 %	0 %	0 %	470211316
51022	NC_020558	GAAA	2	8	2234010	2234017	75 %	0 %	25 %	0 %	470211316
51023	NC_020558	GAT	2	6	2234043	2234048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211316
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51025	NC_020558	CAG	2	6	2234155	2234160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211316
51026	NC_020558	ATTAT	2	10	2234167	2234176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51027	NC_020558	A	7	7	2234271	2234277	100 %	0 %	0 %	0 %	470211317
51028	NC_020558	ACTG	2	8	2234307	2234314	25 %	25 %	25 %	25 %	470211317
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51043	NC_020558	A	8	8	2235104	2235111	100 %	0 %	0 %	0 %	470211318
51044	NC_020558	T	6	6	2235117	2235122	0 %	100 %	0 %	0 %	470211318
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51047	NC_020558	A	7	7	2235258	2235264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51048	NC_020558	TA	3	6	2235276	2235281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51074	NC_020558	TA	3	6	2236227	2236232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51075	NC_020558	CA	3	6	2236245	2236250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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51107	NC_020558	ATTG	2	8	2237513	2237520	25 %	50 %	25 %	0 %	470211322
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51112	NC_020558	TTA	2	6	2237615	2237620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211322
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51122	NC_020558	TCT	2	6	2237851	2237856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51244	NC_020558	ACT	2	6	2242723	2242728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211327
51245	NC_020558	GCT	2	6	2242750	2242755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211327
51246	NC_020558	TGTT	3	12	2242760	2242771	0 %	75 %	25 %	0 %	470211327
51247	NC_020558	TGA	2	6	2242863	2242868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211327
51248	NC_020558	T	6	6	2242911	2242916	0 %	100 %	0 %	0 %	470211327
51249	NC_020558	AGC	2	6	2242950	2242955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211327
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51252	NC_020558	CTT	2	6	2243180	2243185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211327
51253	NC_020558	CTG	2	6	2243201	2243206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211327
51254	NC_020558	AGC	2	6	2243220	2243225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211327
51255	NC_020558	CTT	2	6	2243228	2243233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211327
51256	NC_020558	CAT	2	6	2243415	2243420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211328
51257	NC_020558	GCT	2	6	2243435	2243440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
51258	NC_020558	GTA	2	6	2243441	2243446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
51259	NC_020558	TAT	2	6	2243532	2243537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470211328
51260	NC_020558	TCA	2	6	2243588	2243593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211328
51261	NC_020558	AAT	2	6	2243659	2243664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470211328
51262	NC_020558	TAG	2	6	2243697	2243702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
51263	NC_020558	TTTG	2	8	2243720	2243727	0 %	75 %	25 %	0 %	470211328
51264	NC_020558	TCG	2	6	2243729	2243734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
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51266	NC_020558	T	6	6	2243830	2243835	0 %	100 %	0 %	0 %	470211328
51267	NC_020558	TTC	2	6	2243839	2243844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211328
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51269	NC_020558	GTA	2	6	2243916	2243921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
51270	NC_020558	AGT	2	6	2243974	2243979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470211328
51271	NC_020558	TTG	3	9	2243980	2243988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470211328
51272	NC_020558	CTT	2	6	2243995	2244000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211328
51273	NC_020558	CTG	2	6	2244001	2244006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211328
51274	NC_020558	TAT	2	6	2244087	2244092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51275	NC_020558	T	6	6	2244092	2244097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51276	NC_020558	CTA	2	6	2244134	2244139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51277	NC_020558	GTA	2	6	2244204	2244209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51278	NC_020558	CTT	2	6	2244211	2244216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51279	NC_020558	TGC	2	6	2244463	2244468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51280	NC_020558	TGC	2	6	2244481	2244486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51281	NC_020558	AGC	2	6	2244642	2244647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51282	NC_020558	ACC	2	6	2244652	2244657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51283	NC_020558	CTA	2	6	2244668	2244673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51284	NC_020558	CTG	2	6	2244689	2244694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51285	NC_020558	GCT	2	6	2244709	2244714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51286	NC_020558	TAA	2	6	2244728	2244733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51287	NC_020558	GTT	2	6	2244742	2244747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51290	NC_020558	ATA	2	6	2244822	2244827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51291	NC_020558	AAG	2	6	2244855	2244860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51292	NC_020558	CTG	2	6	2244877	2244882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51294	NC_020558	TTGA	2	8	2245035	2245042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51295	NC_020558	GCC	2	6	2245085	2245090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470211329
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51298	NC_020558	T	6	6	2245241	2245246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51304	NC_020558	TCT	3	9	2245437	2245445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51305	NC_020558	TCT	2	6	2245458	2245463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51306	NC_020558	TAT	2	6	2245480	2245485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51308	NC_020558	ATTT	2	8	2245495	2245502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51309	NC_020558	TCT	2	6	2245516	2245521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51312	NC_020558	ATT	2	6	2245640	2245645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51326	NC_020558	AT	3	6	2246234	2246239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51327	NC_020558	TAAA	2	8	2246264	2246271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51328	NC_020558	AAAAGA	2	12	2246314	2246325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51329	NC_020558	TTGT	2	8	2246353	2246360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51330	NC_020558	GTT	2	6	2246439	2246444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51331	NC_020558	ATGACA	2	12	2246458	2246469	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51332	NC_020558	CTC	2	6	2246479	2246484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51333	NC_020558	GT	3	6	2246513	2246518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51334	NC_020558	TCAT	2	8	2246570	2246577	25 %	50 %	0 %	25 %	470211331
51335	NC_020558	ATTA	2	8	2246625	2246632	50 %	50 %	0 %	0 %	470211331
51336	NC_020558	CTTT	2	8	2246647	2246654	0 %	75 %	0 %	25 %	470211331
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51341	NC_020558	CAT	2	6	2246818	2246823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51342	NC_020558	CTATCA	2	12	2246826	2246837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51343	NC_020558	GATTT	3	15	2246849	2246863	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51344	NC_020558	TCT	3	9	2246915	2246923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51345	NC_020558	TAC	2	6	2246995	2247000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51346	NC_020558	TTC	2	6	2247085	2247090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51347	NC_020558	AGCT	2	8	2247119	2247126	25 %	25 %	25 %	25 %	470211332
51348	NC_020558	CCGC	2	8	2247135	2247142	0 %	0 %	25 %	75 %	470211332
51349	NC_020558	TTTC	2	8	2247197	2247204	0 %	75 %	0 %	25 %	470211332
51350	NC_020558	TTC	2	6	2247217	2247222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211332
51351	NC_020558	CAAA	2	8	2247268	2247275	75 %	0 %	0 %	25 %	470211332
51352	NC_020558	GCTT	2	8	2247410	2247417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51353	NC_020558	T	8	8	2247438	2247445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51354	NC_020558	ATC	2	6	2247455	2247460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51355	NC_020558	GTT	2	6	2247523	2247528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51356	NC_020558	TCT	2	6	2247555	2247560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51357	NC_020558	GAT	2	6	2247579	2247584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51358	NC_020558	AATA	2	8	2247639	2247646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51359	NC_020558	TATT	2	8	2247653	2247660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51360	NC_020558	TTC	2	6	2247679	2247684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51361	NC_020558	AACA	2	8	2247692	2247699	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51362	NC_020558	CAT	2	6	2247771	2247776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51363	NC_020558	ATTC	3	12	2247777	2247788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51364	NC_020558	CCAG	2	8	2247956	2247963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51365	NC_020558	ATG	2	6	2247986	2247991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51366	NC_020558	CTTG	2	8	2248007	2248014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51367	NC_020558	TTGA	2	8	2248027	2248034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51368	NC_020558	GCA	2	6	2248105	2248110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470211333
51369	NC_020558	A	6	6	2248184	2248189	100 %	0 %	0 %	0 %	470211333
51370	NC_020558	CTT	2	6	2248191	2248196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470211333
51371	NC_020558	TTTA	2	8	2248224	2248231	25 %	75 %	0 %	0 %	470211333
51372	NC_020558	GTC	2	6	2248322	2248327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470211333
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51374	NC_020558	GTC	2	6	2248502	2248507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51375	NC_020558	ACT	2	6	2248535	2248540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470211334
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51378	NC_020558	TCAAG	2	10	2248912	2248921	40 %	20 %	20 %	20 %	470211335
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51380	NC_020558	ATAA	2	8	2249009	2249016	75 %	25 %	0 %	0 %	470211335
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51386	NC_020558	GA	3	6	2249222	2249227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51387	NC_020558	TTC	2	6	2249328	2249333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51396	NC_020558	T	6	6	2249815	2249820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51397	NC_020558	CGT	2	6	2249975	2249980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51414	NC_020558	A	6	6	2250401	2250406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51479	NC_020558	T	6	6	2253142	2253147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51480	NC_020558	AATT	2	8	2253169	2253176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51481	NC_020558	TTAG	2	8	2253270	2253277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51482	NC_020558	T	7	7	2253298	2253304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51483	NC_020558	CCT	2	6	2253315	2253320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51484	NC_020558	TA	3	6	2253324	2253329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51485	NC_020558	GAA	2	6	2253330	2253335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51486	NC_020558	AAAAG	2	10	2253336	2253345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51487	NC_020558	TATAA	2	10	2253361	2253370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51488	NC_020558	A	7	7	2253386	2253392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51489	NC_020558	A	7	7	2253413	2253419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51490	NC_020558	ATG	2	6	2253421	2253426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51491	NC_020558	CTT	2	6	2253451	2253456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51492	NC_020558	TTCA	2	8	2253458	2253465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51493	NC_020558	A	6	6	2253470	2253475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51494	NC_020558	TAG	2	6	2253497	2253502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51495	NC_020558	AGA	2	6	2253584	2253589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51496	NC_020558	AGA	2	6	2253593	2253598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51497	NC_020558	ATATG	2	10	2253627	2253636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51498	NC_020558	AGT	2	6	2253681	2253686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51499	NC_020558	AAAAT	2	10	2253719	2253728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51500	NC_020558	AATGAA	2	12	2253739	2253750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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