MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020557	TGG	2	6	550265	550270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470206249
12502	NC_020557	GCA	2	6	550277	550282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470206249
12503	NC_020557	GCA	2	6	550304	550309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470206249
12504	NC_020557	AGA	2	6	550423	550428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206249
12505	NC_020557	AAAC	2	8	550442	550449	75 %	0 %	0 %	25 %	470206249
12506	NC_020557	TGA	2	6	550552	550557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470206249
12507	NC_020557	GGC	2	6	550631	550636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470206249
12508	NC_020557	TAC	2	6	550776	550781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470206250
12509	NC_020557	CGT	2	6	550865	550870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470206250
12510	NC_020557	AAG	2	6	550875	550880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206250
12511	NC_020557	AGC	2	6	550902	550907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470206250
12512	NC_020557	ATT	2	6	550985	550990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206251
12513	NC_020557	GAA	2	6	551021	551026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206251
12514	NC_020557	ACA	2	6	551046	551051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470206251
12515	NC_020557	TAC	2	6	551075	551080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470206251
12516	NC_020557	CGT	2	6	551087	551092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470206251
12517	NC_020557	ATA	2	6	551247	551252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206251
12518	NC_020557	GAA	2	6	551331	551336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020557	ACC	2	6	551356	551361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_020557	ATAAA	2	10	551479	551488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_020557	TAT	2	6	551491	551496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020557	GAA	2	6	551553	551558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206252
12523	NC_020557	TGA	2	6	551609	551614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470206252
12524	NC_020557	GTACTT	2	12	551673	551684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470206252
12525	NC_020557	TTA	2	6	551812	551817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206252
12526	NC_020557	GAA	2	6	551853	551858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206252
12527	NC_020557	TTC	2	6	551905	551910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470206252
12528	NC_020557	AC	3	6	551948	551953	50 %	0 %	0 %	50 %	470206252
12529	NC_020557	TTTGA	2	10	551996	552005	20 %	60 %	20 %	0 %	470206252
12530	NC_020557	ACAA	2	8	552027	552034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12531	NC_020557	TTTA	2	8	552116	552123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020557	AAC	2	6	552124	552129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_020557	TAC	2	6	552182	552187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_020557	T	6	6	552235	552240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020557	ATA	2	6	552318	552323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020557	GAAA	2	8	552407	552414	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_020557	ATT	2	6	552436	552441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_020557	T	6	6	552504	552509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020557	AT	3	6	552515	552520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020557	TTG	2	6	552523	552528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_020557	GAG	2	6	552602	552607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020557	GAA	2	6	552620	552625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206253
12543	NC_020557	A	6	6	552624	552629	100 %	0 %	0 %	0 %	470206253
12544	NC_020557	CTTT	2	8	552632	552639	0 %	75 %	0 %	25 %	470206253
12545	NC_020557	ATT	2	6	552656	552661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206253
12546	NC_020557	TGC	2	6	552698	552703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470206253
12547	NC_020557	A	7	7	552766	552772	100 %	0 %	0 %	0 %	470206253
12548	NC_020557	TAT	2	6	552776	552781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206253
12549	NC_020557	ATT	2	6	552823	552828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206253
12550	NC_020557	A	7	7	552841	552847	100 %	0 %	0 %	0 %	470206253
12551	NC_020557	ATA	2	6	552874	552879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206253
12552	NC_020557	AAT	2	6	552888	552893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206253
12553	NC_020557	TTTAT	2	10	552963	552972	20 %	80 %	0 %	0 %	470206253
12554	NC_020557	CTT	2	6	552990	552995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470206253
12555	NC_020557	A	7	7	553002	553008	100 %	0 %	0 %	0 %	470206253
12556	NC_020557	GCT	2	6	553022	553027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470206253
12557	NC_020557	TTG	2	6	553036	553041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470206253
12558	NC_020557	GTA	2	6	553051	553056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470206253
12559	NC_020557	GAAA	2	8	553139	553146	75 %	0 %	25 %	0 %	470206253
12560	NC_020557	AAC	2	6	553150	553155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470206253
12561	NC_020557	AT	3	6	553187	553192	50 %	50 %	0 %	0 %	470206253
12562	NC_020557	AC	3	6	553193	553198	50 %	0 %	0 %	50 %	470206253
12563	NC_020557	ATA	2	6	553207	553212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206253
12564	NC_020557	ACTGTA	2	12	553236	553247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470206253
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12569	NC_020557	TA	5	10	553635	553644	50 %	50 %	0 %	0 %	470206253
12570	NC_020557	AAG	2	6	553648	553653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206253
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12578	NC_020557	TGG	2	6	554029	554034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470206253
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12580	NC_020557	ATA	2	6	554099	554104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_020557	A	6	6	554104	554109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_020557	T	6	6	554131	554136	0 %	100 %	0 %	0 %	470206254
12583	NC_020557	GCT	2	6	554205	554210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470206254
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12585	NC_020557	A	6	6	554372	554377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12589	NC_020557	AAC	2	6	554582	554587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470206256
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12594	NC_020557	GTA	2	6	554846	554851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470206256
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12596	NC_020557	TAA	2	6	554857	554862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206256
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12598	NC_020557	CCA	2	6	554910	554915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470206256
12599	NC_020557	ACTA	2	8	554936	554943	50 %	25 %	0 %	25 %	470206256
12600	NC_020557	AAT	2	6	554954	554959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470206256
12601	NC_020557	TGTA	2	8	555011	555018	25 %	50 %	25 %	0 %	470206256
12602	NC_020557	T	6	6	555182	555187	0 %	100 %	0 %	0 %	470206256
12603	NC_020557	CAT	2	6	555254	555259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470206256
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12605	NC_020557	AATCA	2	10	555360	555369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12606	NC_020557	T	6	6	555393	555398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020557	ATT	2	6	555475	555480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020557	AGA	2	6	555507	555512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206257
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12610	NC_020557	CG	3	6	555534	555539	0 %	0 %	50 %	50 %	470206257
12611	NC_020557	TAAA	2	8	555557	555564	75 %	25 %	0 %	0 %	470206257
12612	NC_020557	AGA	2	6	555612	555617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470206257
12613	NC_020557	TGA	2	6	555651	555656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470206257
12614	NC_020557	A	7	7	555672	555678	100 %	0 %	0 %	0 %	470206257
12615	NC_020557	AGAATG	2	12	555703	555714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470206258
12616	NC_020557	G	7	7	555793	555799	0 %	0 %	100 %	0 %	470206258
12617	NC_020557	GAC	2	6	555818	555823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470206258
12618	NC_020557	ATT	2	6	555828	555833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206258
12619	NC_020557	GTT	2	6	555850	555855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470206258
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12621	NC_020557	TA	3	6	555943	555948	50 %	50 %	0 %	0 %	470206258
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12623	NC_020557	TAT	2	6	556120	556125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206258
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12997	NC_020557	ATT	2	6	571337	571342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206275
12998	NC_020557	GGTC	2	8	571434	571441	0 %	25 %	50 %	25 %	470206275
12999	NC_020557	ATT	2	6	571455	571460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470206275
13000	NC_020557	TGG	2	6	571478	571483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470206275

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