MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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60120	NC_020557	CGA	2	6	2638800	2638805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208619
60121	NC_020557	GTCACT	2	12	2638850	2638861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470208619
60122	NC_020557	GCT	2	6	2638870	2638875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208619
60123	NC_020557	AAAG	2	8	2638885	2638892	75 %	0 %	25 %	0 %	470208619
60124	NC_020557	TTGG	2	8	2638951	2638958	0 %	50 %	50 %	0 %	470208619
60125	NC_020557	CTT	2	6	2638968	2638973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208619
60126	NC_020557	GAAT	2	8	2638978	2638985	50 %	25 %	25 %	0 %	470208619
60127	NC_020557	AAAT	2	8	2638993	2639000	75 %	25 %	0 %	0 %	470208619
60128	NC_020557	CTT	2	6	2639124	2639129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208619
60129	NC_020557	ATA	2	6	2639131	2639136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208619
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60131	NC_020557	GAA	2	6	2639365	2639370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208620
60132	NC_020557	GAT	2	6	2639404	2639409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208620
60133	NC_020557	ATA	2	6	2639426	2639431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208620
60134	NC_020557	TTG	2	6	2639493	2639498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208620
60135	NC_020557	AGC	2	6	2639500	2639505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208620
60136	NC_020557	GTT	2	6	2639528	2639533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208620
60137	NC_020557	CGA	2	6	2639697	2639702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208621
60138	NC_020557	TG	3	6	2639717	2639722	0 %	50 %	50 %	0 %	470208621
60139	NC_020557	ATTG	2	8	2639728	2639735	25 %	50 %	25 %	0 %	470208621
60140	NC_020557	ACGA	2	8	2639744	2639751	50 %	0 %	25 %	25 %	470208621
60141	NC_020557	CCA	2	6	2639788	2639793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208621
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60143	NC_020557	CAT	2	6	2639844	2639849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208621
60144	NC_020557	AAT	2	6	2640075	2640080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208621
60145	NC_020557	ATT	2	6	2640126	2640131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208621
60146	NC_020557	CATCGC	2	12	2640132	2640143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470208621
60147	NC_020557	AAG	2	6	2640181	2640186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208621
60148	NC_020557	TAA	2	6	2640230	2640235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208621
60149	NC_020557	CTTGTT	2	12	2640323	2640334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470208621
60150	NC_020557	CGAG	2	8	2640344	2640351	25 %	0 %	50 %	25 %	470208621
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60152	NC_020557	CAC	2	6	2640368	2640373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208621
60153	NC_020557	CAA	2	6	2640432	2640437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60154	NC_020557	TAT	2	6	2640438	2640443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60155	NC_020557	AACA	2	8	2640454	2640461	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60156	NC_020557	TTCA	2	8	2640536	2640543	25 %	50 %	0 %	25 %	470208622
60157	NC_020557	CTT	2	6	2640625	2640630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208622
60158	NC_020557	TTC	2	6	2640725	2640730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208622
60159	NC_020557	TCT	2	6	2640807	2640812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208622
60160	NC_020557	T	6	6	2640869	2640874	0 %	100 %	0 %	0 %	470208622
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60162	NC_020557	CTC	2	6	2640955	2640960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60163	NC_020557	A	7	7	2640963	2640969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60164	NC_020557	GCG	2	6	2640988	2640993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60165	NC_020557	TATAG	2	10	2641002	2641011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60166	NC_020557	AAT	2	6	2641053	2641058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208623
60167	NC_020557	TCTT	2	8	2641070	2641077	0 %	75 %	0 %	25 %	470208623
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60169	NC_020557	A	6	6	2641163	2641168	100 %	0 %	0 %	0 %	470208623
60170	NC_020557	T	6	6	2641199	2641204	0 %	100 %	0 %	0 %	470208623
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60176	NC_020557	ACAACT	2	12	2641363	2641374	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60177	NC_020557	T	6	6	2641413	2641418	0 %	100 %	0 %	0 %	470208624
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60179	NC_020557	TA	3	6	2641543	2641548	50 %	50 %	0 %	0 %	470208624
60180	NC_020557	T	6	6	2641557	2641562	0 %	100 %	0 %	0 %	470208624
60181	NC_020557	AGA	2	6	2641611	2641616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208624
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60183	NC_020557	GAAA	2	8	2641698	2641705	75 %	0 %	25 %	0 %	470208624
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60185	NC_020557	TATC	2	8	2641912	2641919	25 %	50 %	0 %	25 %	470208624
60186	NC_020557	CAAA	2	8	2641927	2641934	75 %	0 %	0 %	25 %	470208624
60187	NC_020557	GAATA	2	10	2641998	2642007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60188	NC_020557	ATA	2	6	2642048	2642053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208625
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60191	NC_020557	A	6	6	2642114	2642119	100 %	0 %	0 %	0 %	470208625
60192	NC_020557	CTA	2	6	2642145	2642150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208625
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60194	NC_020557	TTTA	2	8	2642232	2642239	25 %	75 %	0 %	0 %	470208625
60195	NC_020557	AC	4	8	2642313	2642320	50 %	0 %	0 %	50 %	470208625
60196	NC_020557	A	6	6	2642364	2642369	100 %	0 %	0 %	0 %	470208625
60197	NC_020557	AAG	2	6	2642387	2642392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208625
60198	NC_020557	TCGA	2	8	2642396	2642403	25 %	25 %	25 %	25 %	470208625
60199	NC_020557	AAG	2	6	2642450	2642455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208625
60200	NC_020557	AGA	2	6	2642588	2642593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208626
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60202	NC_020557	CGG	2	6	2642666	2642671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208626
60203	NC_020557	CTA	2	6	2642702	2642707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208626
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60207	NC_020557	A	6	6	2642892	2642897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60208	NC_020557	TTCA	2	8	2642908	2642915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60209	NC_020557	TTAC	2	8	2642937	2642944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60210	NC_020557	TCT	2	6	2642958	2642963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60211	NC_020557	TGT	2	6	2643002	2643007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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60213	NC_020557	CT	3	6	2643104	2643109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60214	NC_020557	ACA	2	6	2643255	2643260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60215	NC_020557	CTT	2	6	2643313	2643318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60218	NC_020557	ATT	2	6	2643528	2643533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60219	NC_020557	CCT	2	6	2643552	2643557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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60222	NC_020557	ATTT	2	8	2643699	2643706	25 %	75 %	0 %	0 %	470208627
60223	NC_020557	CTT	2	6	2643749	2643754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208627
60224	NC_020557	T	6	6	2643804	2643809	0 %	100 %	0 %	0 %	470208627
60225	NC_020557	CCT	2	6	2643935	2643940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60226	NC_020557	TA	3	6	2643950	2643955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60227	NC_020557	ATG	2	6	2643966	2643971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60228	NC_020557	T	8	8	2644019	2644026	0 %	100 %	0 %	0 %	470208628
60229	NC_020557	ATG	3	9	2644076	2644084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208628
60230	NC_020557	CTC	2	6	2644106	2644111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208628
60231	NC_020557	ATAA	2	8	2644121	2644128	75 %	25 %	0 %	0 %	470208628
60232	NC_020557	ATT	2	6	2644163	2644168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208628
60233	NC_020557	ATA	3	9	2644251	2644259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208628
60234	NC_020557	ATC	2	6	2644265	2644270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208628
60235	NC_020557	CAA	2	6	2644276	2644281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208628
60236	NC_020557	AAT	2	6	2644298	2644303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208628
60237	NC_020557	GAAT	2	8	2644304	2644311	50 %	25 %	25 %	0 %	470208628
60238	NC_020557	TCG	2	6	2644426	2644431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208628
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60359	NC_020557	A	7	7	2649723	2649729	100 %	0 %	0 %	0 %	470208632
60360	NC_020557	A	7	7	2649765	2649771	100 %	0 %	0 %	0 %	470208632
60361	NC_020557	TTA	2	6	2649825	2649830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208632
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60387	NC_020557	A	6	6	2651326	2651331	100 %	0 %	0 %	0 %	470208633
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60432	NC_020557	TTTTAT	2	12	2653404	2653415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60473	NC_020557	AAT	2	6	2655151	2655156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208638
60474	NC_020557	ACT	2	6	2655222	2655227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208638
60475	NC_020557	T	6	6	2655227	2655232	0 %	100 %	0 %	0 %	470208638
60476	NC_020557	TAA	2	6	2655271	2655276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208638
60477	NC_020557	AT	3	6	2655383	2655388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60478	NC_020557	T	6	6	2655493	2655498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60479	NC_020557	TTCA	2	8	2655505	2655512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60480	NC_020557	ATTC	2	8	2655517	2655524	25 %	50 %	0 %	25 %	470208639
60481	NC_020557	TGT	2	6	2655546	2655551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208639
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60483	NC_020557	TC	3	6	2655659	2655664	0 %	50 %	0 %	50 %	470208639
60484	NC_020557	TTC	2	6	2655705	2655710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208639
60485	NC_020557	T	7	7	2655763	2655769	0 %	100 %	0 %	0 %	470208639
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60487	NC_020557	TC	3	6	2655815	2655820	0 %	50 %	0 %	50 %	470208640
60488	NC_020557	ATAAAA	2	12	2655862	2655873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470208640
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60491	NC_020557	CG	3	6	2656001	2656006	0 %	0 %	50 %	50 %	470208640
60492	NC_020557	T	6	6	2656012	2656017	0 %	100 %	0 %	0 %	470208640
60493	NC_020557	TAA	2	6	2656065	2656070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208640
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60495	NC_020557	ATC	2	6	2656194	2656199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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60497	NC_020557	CACG	2	8	2656240	2656247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60498	NC_020557	ATC	3	9	2656286	2656294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208641
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60500	NC_020557	CTT	2	6	2656347	2656352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208641

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