MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020557	GCTC	2	8	216547	216554	0 %	25 %	25 %	50 %	470205864
5002	NC_020557	GAT	2	6	216556	216561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205864
5003	NC_020557	TA	3	6	216627	216632	50 %	50 %	0 %	0 %	470205864
5004	NC_020557	GAA	2	6	216633	216638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205864
5005	NC_020557	TA	3	6	216671	216676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020557	ATT	2	6	216684	216689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205865
5007	NC_020557	ATGGC	2	10	216711	216720	20 %	20 %	40 %	20 %	470205865
5008	NC_020557	GCA	2	6	216731	216736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205865
5009	NC_020557	AAC	2	6	216739	216744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205865
5010	NC_020557	AAG	2	6	216756	216761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5011	NC_020557	AGA	2	6	216767	216772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5012	NC_020557	AGA	2	6	216850	216855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5013	NC_020557	A	6	6	216858	216863	100 %	0 %	0 %	0 %	470205865
5014	NC_020557	CCG	2	6	217000	217005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470205865
5015	NC_020557	GAT	2	6	217178	217183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205865
5016	NC_020557	GGT	2	6	217199	217204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205865
5017	NC_020557	ACT	2	6	217216	217221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205865
5018	NC_020557	TGA	2	6	217246	217251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205865
5019	NC_020557	A	7	7	217257	217263	100 %	0 %	0 %	0 %	470205865
5020	NC_020557	GCGG	2	8	217337	217344	0 %	0 %	75 %	25 %	470205865
5021	NC_020557	AGA	2	6	217345	217350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5022	NC_020557	A	6	6	217368	217373	100 %	0 %	0 %	0 %	470205865
5023	NC_020557	AGA	2	6	217441	217446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5024	NC_020557	AGA	2	6	217462	217467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5025	NC_020557	GCAGAA	2	12	217478	217489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470205865
5026	NC_020557	AGA	3	9	217522	217530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5027	NC_020557	GAA	2	6	217547	217552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205865
5028	NC_020557	AATT	2	8	217627	217634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_020557	ATAG	2	8	217656	217663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020557	TAA	2	6	217672	217677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205866
5031	NC_020557	GGT	2	6	217794	217799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205866
5032	NC_020557	ATT	2	6	217875	217880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205866
5033	NC_020557	AGC	3	9	217922	217930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205866
5034	NC_020557	CGT	2	6	217980	217985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205866
5035	NC_020557	GGA	2	6	218063	218068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205866
5036	NC_020557	CAA	2	6	218100	218105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205866
5037	NC_020557	GAA	2	6	218136	218141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205866
5038	NC_020557	AGA	2	6	218288	218293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205866
5039	NC_020557	TCTCCA	2	12	218316	218327	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470205866
5040	NC_020557	A	6	6	218445	218450	100 %	0 %	0 %	0 %	470205866
5041	NC_020557	TTC	2	6	218471	218476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205866
5042	NC_020557	AGC	2	6	218492	218497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205866
5043	NC_020557	A	6	6	218529	218534	100 %	0 %	0 %	0 %	470205866
5044	NC_020557	CGC	2	6	218578	218583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470205866
5045	NC_020557	TAA	2	6	218601	218606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205866
5046	NC_020557	AG	3	6	218609	218614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020557	T	6	6	218633	218638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020557	A	8	8	218642	218649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020557	CAG	2	6	218685	218690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_020557	CTTT	2	8	218694	218701	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_020557	AT	3	6	218711	218716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020557	AAC	2	6	218728	218733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_020557	T	6	6	218825	218830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020557	GAAAA	2	10	218843	218852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020557	CCA	2	6	218895	218900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_020557	AT	3	6	218913	218918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020557	AAC	2	6	218930	218935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_020557	T	6	6	219028	219033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020557	GAAAA	2	10	219046	219055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_020557	CCA	2	6	219098	219103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_020557	AT	3	6	219116	219121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020557	AAC	2	6	219133	219138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_020557	T	6	6	219231	219236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020557	A	6	6	219242	219247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020557	GAAAA	2	10	219249	219258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020557	AT	3	6	219319	219324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020557	AAC	2	6	219336	219341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_020557	AAACA	2	10	219342	219351	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5069	NC_020557	TTC	2	6	219358	219363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_020557	C	6	6	219365	219370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5071	NC_020557	T	6	6	219397	219402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_020557	T	7	7	219436	219442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020557	TAA	2	6	219470	219475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020557	GAA	2	6	219501	219506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020557	AT	3	6	219582	219587	50 %	50 %	0 %	0 %	470205867
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5077	NC_020557	AGC	2	6	219636	219641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205867
5078	NC_020557	ATT	2	6	219643	219648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205867
5079	NC_020557	GGA	2	6	219655	219660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205867
5080	NC_020557	GAA	2	6	219700	219705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205867
5081	NC_020557	AT	3	6	219755	219760	50 %	50 %	0 %	0 %	470205867
5082	NC_020557	TGATA	2	10	219819	219828	40 %	40 %	20 %	0 %	470205867
5083	NC_020557	A	6	6	219847	219852	100 %	0 %	0 %	0 %	470205867
5084	NC_020557	TGC	2	6	219873	219878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205867
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5086	NC_020557	AGA	2	6	219942	219947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205867
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5088	NC_020557	AGC	2	6	219987	219992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205867
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5091	NC_020557	ACG	2	6	220071	220076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205867
5092	NC_020557	TGA	2	6	220080	220085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205867
5093	NC_020557	ACT	2	6	220156	220161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205867
5094	NC_020557	GGAA	2	8	220176	220183	50 %	0 %	50 %	0 %	470205867
5095	NC_020557	CAA	2	6	220190	220195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205867
5096	NC_020557	ATG	2	6	220238	220243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205867
5097	NC_020557	ATTT	2	8	220337	220344	25 %	75 %	0 %	0 %	470205868
5098	NC_020557	A	6	6	220442	220447	100 %	0 %	0 %	0 %	470205868
5099	NC_020557	AGA	2	6	220468	220473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205868
5100	NC_020557	TAG	2	6	220515	220520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205868
5101	NC_020557	A	6	6	220557	220562	100 %	0 %	0 %	0 %	470205868
5102	NC_020557	AGA	2	6	220597	220602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205868
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5107	NC_020557	TTA	2	6	220869	220874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020557	ATT	2	6	220916	220921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205869
5109	NC_020557	ATTGAT	2	12	220941	220952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470205869
5110	NC_020557	TAT	2	6	220957	220962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205869
5111	NC_020557	ATG	3	9	220963	220971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205869
5112	NC_020557	TGA	2	6	221032	221037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205869
5113	NC_020557	A	6	6	221062	221067	100 %	0 %	0 %	0 %	470205869
5114	NC_020557	GAA	2	6	221097	221102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205869
5115	NC_020557	A	6	6	221120	221125	100 %	0 %	0 %	0 %	470205869
5116	NC_020557	A	6	6	221157	221162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020557	AGT	2	6	221253	221258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205870
5118	NC_020557	TA	3	6	221393	221398	50 %	50 %	0 %	0 %	470205870
5119	NC_020557	TGA	2	6	221400	221405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205870
5120	NC_020557	CGG	2	6	221436	221441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205870
5121	NC_020557	GAAA	2	8	221445	221452	75 %	0 %	25 %	0 %	470205870
5122	NC_020557	ATT	2	6	221500	221505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205870
5123	NC_020557	GCT	2	6	221599	221604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205870
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5125	NC_020557	TGC	2	6	221691	221696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205870
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5127	NC_020557	GAT	2	6	221919	221924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205870
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5133	NC_020557	GCT	2	6	222118	222123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205870
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5179	NC_020557	CAA	2	6	224176	224181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5243	NC_020557	GA	3	6	227844	227849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_020557	CGG	2	6	228002	228007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_020557	GA	3	6	228100	228105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_020557	TAGG	2	8	228218	228225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_020557	GAG	2	6	228254	228259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_020557	TGG	2	6	228264	228269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_020557	TAC	2	6	228272	228277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5250	NC_020557	CCT	2	6	228360	228365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_020557	ATGG	2	8	228401	228408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_020557	GGT	2	6	228496	228501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5254	NC_020557	CGT	2	6	228691	228696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_020557	GAG	2	6	228740	228745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_020557	AC	3	6	228775	228780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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