MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020557	ACG	2	6	2321196	2321201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208270
53002	NC_020557	TTAA	2	8	2321208	2321215	50 %	50 %	0 %	0 %	470208270
53003	NC_020557	TCC	2	6	2321244	2321249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208271
53004	NC_020557	TTTTC	2	10	2321262	2321271	0 %	80 %	0 %	20 %	470208271
53005	NC_020557	GAAC	2	8	2321313	2321320	50 %	0 %	25 %	25 %	470208271
53006	NC_020557	TCA	2	6	2321349	2321354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208271
53007	NC_020557	CATC	2	8	2321384	2321391	25 %	25 %	0 %	50 %	470208271
53008	NC_020557	AAT	2	6	2321471	2321476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208271
53009	NC_020557	CTT	2	6	2321521	2321526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208271
53010	NC_020557	CAA	2	6	2321536	2321541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208271
53011	NC_020557	TCT	2	6	2321556	2321561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208271
53012	NC_020557	CCG	2	6	2321583	2321588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208271
53013	NC_020557	TGC	2	6	2321625	2321630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208271
53014	NC_020557	TAA	2	6	2321686	2321691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208271
53015	NC_020557	ATA	2	6	2321769	2321774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208271
53016	NC_020557	ATCTTC	2	12	2321783	2321794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470208271
53017	NC_020557	ATATG	2	10	2321808	2321817	40 %	40 %	20 %	0 %	470208271
53018	NC_020557	ATC	2	6	2321874	2321879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208271
53019	NC_020557	ATC	2	6	2321892	2321897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208271
53020	NC_020557	CTT	2	6	2321899	2321904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208271
53021	NC_020557	AAT	2	6	2321993	2321998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208271
53022	NC_020557	TCGG	2	8	2322006	2322013	0 %	25 %	50 %	25 %	470208271
53023	NC_020557	GC	3	6	2322131	2322136	0 %	0 %	50 %	50 %	470208271
53024	NC_020557	AAATCG	2	12	2322238	2322249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470208271
53025	NC_020557	CTGGCA	2	12	2322265	2322276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470208271
53026	NC_020557	AAT	2	6	2322285	2322290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208271
53027	NC_020557	CCAA	2	8	2322295	2322302	50 %	0 %	0 %	50 %	470208271
53028	NC_020557	ACCC	2	8	2322324	2322331	25 %	0 %	0 %	75 %	470208271
53029	NC_020557	GCG	2	6	2322342	2322347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208271
53030	NC_020557	TCAT	2	8	2322381	2322388	25 %	50 %	0 %	25 %	470208271
53031	NC_020557	T	7	7	2322401	2322407	0 %	100 %	0 %	0 %	470208271
53032	NC_020557	TCGC	2	8	2322415	2322422	0 %	25 %	25 %	50 %	470208271
53033	NC_020557	CTA	2	6	2322436	2322441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208271
53034	NC_020557	TCC	2	6	2322557	2322562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53035	NC_020557	GCTG	2	8	2322713	2322720	0 %	25 %	50 %	25 %	470208272
53036	NC_020557	AAT	2	6	2322745	2322750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208272
53037	NC_020557	CCG	2	6	2322767	2322772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208272
53038	NC_020557	CAT	2	6	2322828	2322833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208272
53039	NC_020557	TTC	2	6	2322904	2322909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208272
53040	NC_020557	T	6	6	2322954	2322959	0 %	100 %	0 %	0 %	470208272
53041	NC_020557	CCT	2	6	2323037	2323042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53042	NC_020557	A	7	7	2323050	2323056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53043	NC_020557	AGTT	2	8	2323096	2323103	25 %	50 %	25 %	0 %	470208273
53044	NC_020557	TTTC	2	8	2323128	2323135	0 %	75 %	0 %	25 %	470208273
53045	NC_020557	TAA	2	6	2323138	2323143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208273
53046	NC_020557	CTT	2	6	2323146	2323151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208273
53047	NC_020557	ATA	2	6	2323208	2323213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208273
53048	NC_020557	CCA	2	6	2323233	2323238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208273
53049	NC_020557	TGCT	2	8	2323276	2323283	0 %	50 %	25 %	25 %	470208273
53050	NC_020557	ATA	2	6	2323286	2323291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208273
53051	NC_020557	AATA	2	8	2323309	2323316	75 %	25 %	0 %	0 %	470208273
53052	NC_020557	TCG	2	6	2323410	2323415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208273
53053	NC_020557	ACA	2	6	2323496	2323501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208273
53054	NC_020557	T	6	6	2323584	2323589	0 %	100 %	0 %	0 %	470208273
53055	NC_020557	CAT	2	6	2323603	2323608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208273
53056	NC_020557	CGT	2	6	2323630	2323635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208273
53057	NC_020557	TTGT	2	8	2323712	2323719	0 %	75 %	25 %	0 %	470208273
53058	NC_020557	AAAT	2	8	2323723	2323730	75 %	25 %	0 %	0 %	470208273
53059	NC_020557	TTC	2	6	2323838	2323843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208273
53060	NC_020557	T	6	6	2323874	2323879	0 %	100 %	0 %	0 %	470208274
53061	NC_020557	AT	3	6	2323920	2323925	50 %	50 %	0 %	0 %	470208274
53062	NC_020557	TGT	2	6	2323945	2323950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208274
53063	NC_020557	TA	3	6	2324024	2324029	50 %	50 %	0 %	0 %	470208274
53064	NC_020557	AATCGT	2	12	2324126	2324137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470208274
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53066	NC_020557	T	7	7	2324163	2324169	0 %	100 %	0 %	0 %	470208275
53067	NC_020557	AGT	2	6	2324195	2324200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208275
53068	NC_020557	TA	3	6	2324208	2324213	50 %	50 %	0 %	0 %	470208275
53069	NC_020557	CTT	2	6	2324214	2324219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208275
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53071	NC_020557	CTTT	2	8	2324430	2324437	0 %	75 %	0 %	25 %	470208275
53072	NC_020557	CTC	2	6	2324467	2324472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208275
53073	NC_020557	TGG	2	6	2324519	2324524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208275
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53077	NC_020557	ACT	2	6	2324687	2324692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208275
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53079	NC_020557	GC	3	6	2324708	2324713	0 %	0 %	50 %	50 %	470208275
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53083	NC_020557	AT	3	6	2324843	2324848	50 %	50 %	0 %	0 %	470208275
53084	NC_020557	CTG	2	6	2324862	2324867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208275
53085	NC_020557	GT	3	6	2324918	2324923	0 %	50 %	50 %	0 %	470208275
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53089	NC_020557	GCT	2	6	2325177	2325182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208275
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53094	NC_020557	CGTT	2	8	2325345	2325352	0 %	50 %	25 %	25 %	470208275
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53097	NC_020557	CAT	2	6	2325492	2325497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208275
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53099	NC_020557	T	6	6	2325573	2325578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53100	NC_020557	TTATG	2	10	2325617	2325626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53101	NC_020557	AT	3	6	2325632	2325637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53102	NC_020557	T	7	7	2325657	2325663	0 %	100 %	0 %	0 %	470208276
53103	NC_020557	TGG	2	6	2325736	2325741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208276
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53105	NC_020557	TAT	2	6	2325811	2325816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208276
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53109	NC_020557	TTA	2	6	2326083	2326088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_020557	CTG	2	6	2326136	2326141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53111	NC_020557	AGTA	2	8	2326248	2326255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_020557	ATG	2	6	2326273	2326278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53114	NC_020557	ATT	2	6	2326426	2326431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53115	NC_020557	A	6	6	2326504	2326509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53116	NC_020557	GAA	2	6	2326510	2326515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53117	NC_020557	GC	3	6	2326541	2326546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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53119	NC_020557	ATG	2	6	2326687	2326692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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