MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 63174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_020557	GCGT	2	8	2234580	2234587	0 %	25 %	50 %	25 %	470208181
51003	NC_020557	AAAT	2	8	2234602	2234609	75 %	25 %	0 %	0 %	470208181
51004	NC_020557	A	8	8	2234631	2234638	100 %	0 %	0 %	0 %	470208181
51005	NC_020557	T	6	6	2234644	2234649	0 %	100 %	0 %	0 %	470208181
51006	NC_020557	GAT	2	6	2234669	2234674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208181
51007	NC_020557	T	7	7	2234774	2234780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51008	NC_020557	A	7	7	2234785	2234791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_020557	TA	3	6	2234803	2234808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_020557	GA	3	6	2234863	2234868	50 %	0 %	50 %	0 %	470208182
51011	NC_020557	T	8	8	2234888	2234895	0 %	100 %	0 %	0 %	470208182
51012	NC_020557	ATGTA	2	10	2234898	2234907	40 %	40 %	20 %	0 %	470208182
51013	NC_020557	TAT	3	9	2234921	2234929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208182
51014	NC_020557	A	6	6	2234981	2234986	100 %	0 %	0 %	0 %	470208182
51015	NC_020557	A	6	6	2235076	2235081	100 %	0 %	0 %	0 %	470208182
51016	NC_020557	TAA	2	6	2235082	2235087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208182
51017	NC_020557	ATA	2	6	2235130	2235135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208182
51018	NC_020557	TAT	2	6	2235152	2235157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208182
51019	NC_020557	TTGCGG	2	12	2235176	2235187	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470208182
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51022	NC_020557	ATC	2	6	2235234	2235239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208182
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51025	NC_020557	TAA	2	6	2235330	2235335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208182
51026	NC_020557	ATA	2	6	2235422	2235427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51027	NC_020557	GGAT	2	8	2235435	2235442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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51029	NC_020557	CGT	2	6	2235519	2235524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51033	NC_020557	TAA	2	6	2235704	2235709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51034	NC_020557	A	6	6	2235708	2235713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51035	NC_020557	TA	3	6	2235754	2235759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51036	NC_020557	CA	3	6	2235772	2235777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51037	NC_020557	ATT	2	6	2235788	2235793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51038	NC_020557	CTT	2	6	2235805	2235810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51039	NC_020557	AATG	2	8	2235814	2235821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51040	NC_020557	T	6	6	2236067	2236072	0 %	100 %	0 %	0 %	470208183
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51092	NC_020557	T	6	6	2237595	2237600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51093	NC_020557	TCT	2	6	2237642	2237647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51104	NC_020557	ATC	2	6	2238239	2238244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208186
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51115	NC_020557	ATC	2	6	2238539	2238544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208186
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51117	NC_020557	GATTT	2	10	2238668	2238677	20 %	60 %	20 %	0 %	470208186
51118	NC_020557	GTA	2	6	2238719	2238724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208187
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51120	NC_020557	TTG	2	6	2238810	2238815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208187
51121	NC_020557	GAC	2	6	2238845	2238850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208187
51122	NC_020557	ATA	2	6	2238851	2238856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208187
51123	NC_020557	GATT	2	8	2238899	2238906	25 %	50 %	25 %	0 %	470208187
51124	NC_020557	ATT	3	9	2239006	2239014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208187
51125	NC_020557	ATG	2	6	2239061	2239066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208187
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51127	NC_020557	GTT	2	6	2239109	2239114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208187
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51131	NC_020557	CCT	2	6	2239229	2239234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208187
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51150	NC_020557	ACA	2	6	2239975	2239980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51151	NC_020557	TATCAA	2	12	2240126	2240137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51152	NC_020557	TGTAT	2	10	2240151	2240160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51153	NC_020557	TGA	2	6	2240168	2240173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51158	NC_020557	TAT	2	6	2240299	2240304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51233	NC_020557	TTG	3	9	2243557	2243565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208191
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51236	NC_020557	TAT	2	6	2243657	2243662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51237	NC_020557	T	6	6	2243662	2243667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51238	NC_020557	CTA	2	6	2243704	2243709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51239	NC_020557	GTA	2	6	2243774	2243779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51240	NC_020557	CTT	2	6	2243781	2243786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51241	NC_020557	TGC	2	6	2244024	2244029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51242	NC_020557	TGC	2	6	2244042	2244047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51243	NC_020557	AGC	2	6	2244206	2244211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208192
51244	NC_020557	ACC	2	6	2244216	2244221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208192
51245	NC_020557	CTA	2	6	2244232	2244237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208192
51246	NC_020557	CTG	2	6	2244253	2244258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208192
51247	NC_020557	GCT	2	6	2244273	2244278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208192
51248	NC_020557	TAA	2	6	2244292	2244297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208192
51249	NC_020557	GTT	2	6	2244306	2244311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208192
51250	NC_020557	AGC	2	6	2244326	2244331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208192
51251	NC_020557	GGAT	2	8	2244355	2244362	25 %	25 %	50 %	0 %	470208192
51252	NC_020557	ATA	2	6	2244396	2244401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208192
51253	NC_020557	AAG	2	6	2244429	2244434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51254	NC_020557	CTG	2	6	2244451	2244456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51255	NC_020557	AGC	2	6	2244506	2244511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51256	NC_020557	TTGA	2	8	2244615	2244622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51257	NC_020557	GCC	2	6	2244665	2244670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51258	NC_020557	TAC	2	6	2244747	2244752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51259	NC_020557	GA	3	6	2244794	2244799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51260	NC_020557	T	6	6	2244820	2244825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51261	NC_020557	TGT	2	6	2244863	2244868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51262	NC_020557	CTT	2	6	2244963	2244968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51263	NC_020557	TAA	2	6	2244972	2244977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51264	NC_020557	CTT	2	6	2245001	2245006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51265	NC_020557	TCT	3	9	2245012	2245020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51266	NC_020557	TCT	2	6	2245033	2245038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51267	NC_020557	TAT	2	6	2245055	2245060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51268	NC_020557	TGT	2	6	2245064	2245069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51269	NC_020557	ATTT	2	8	2245070	2245077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51270	NC_020557	TCT	2	6	2245091	2245096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51271	NC_020557	TCA	2	6	2245135	2245140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51272	NC_020557	TTC	2	6	2245191	2245196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51273	NC_020557	ATT	2	6	2245215	2245220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51274	NC_020557	TCC	2	6	2245238	2245243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51275	NC_020557	CTA	2	6	2245257	2245262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51281	NC_020557	CTT	2	6	2245434	2245439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208193
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51287	NC_020557	AT	3	6	2245833	2245838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51288	NC_020557	TAAA	2	8	2245863	2245870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51289	NC_020557	AAAAGA	2	12	2245913	2245924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51290	NC_020557	TTGT	2	8	2245952	2245959	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51291	NC_020557	GTT	2	6	2246038	2246043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51292	NC_020557	CTC	2	6	2246081	2246086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51293	NC_020557	GT	3	6	2246115	2246120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51294	NC_020557	TCAT	2	8	2246172	2246179	25 %	50 %	0 %	25 %	470208194
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51296	NC_020557	CTTT	2	8	2246249	2246256	0 %	75 %	0 %	25 %	470208194
51297	NC_020557	T	6	6	2246261	2246266	0 %	100 %	0 %	0 %	470208194
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51300	NC_020557	A	7	7	2246370	2246376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51301	NC_020557	CAT	2	6	2246412	2246417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51302	NC_020557	CTATCA	2	12	2246420	2246431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51303	NC_020557	GATTT	3	15	2246443	2246457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51304	NC_020557	TCT	3	9	2246509	2246517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51305	NC_020557	TAC	2	6	2246589	2246594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51306	NC_020557	TTC	2	6	2246679	2246684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51307	NC_020557	AGCT	2	8	2246713	2246720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51308	NC_020557	CCGC	2	8	2246729	2246736	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51309	NC_020557	TTTC	2	8	2246791	2246798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51310	NC_020557	TTC	2	6	2246821	2246826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51311	NC_020557	TCA	2	6	2246852	2246857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51312	NC_020557	CAAA	2	8	2246876	2246883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51313	NC_020557	GCTT	2	8	2247018	2247025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51314	NC_020557	T	8	8	2247046	2247053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51315	NC_020557	ATC	2	6	2247063	2247068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51316	NC_020557	GTT	2	6	2247131	2247136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51317	NC_020557	TCT	2	6	2247163	2247168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51318	NC_020557	GAT	2	6	2247187	2247192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208195
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51320	NC_020557	TATT	2	8	2247261	2247268	25 %	75 %	0 %	0 %	470208195
51321	NC_020557	TTC	2	6	2247287	2247292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208195
51322	NC_020557	AACA	2	8	2247300	2247307	75 %	0 %	0 %	25 %	470208195
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51326	NC_020557	ATG	2	6	2247594	2247599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208195
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51331	NC_020557	CTT	2	6	2247802	2247807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51332	NC_020557	TTTA	2	8	2247835	2247842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51333	NC_020557	GTC	2	6	2247933	2247938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51334	NC_020557	GC	3	6	2248044	2248049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51335	NC_020557	GTC	2	6	2248127	2248132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51336	NC_020557	ACT	2	6	2248160	2248165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208196
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51339	NC_020557	TGAATT	2	12	2248470	2248481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470208197
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51341	NC_020557	AAGTT	2	10	2248563	2248572	40 %	40 %	20 %	0 %	470208197
51342	NC_020557	ATAA	2	8	2248600	2248607	75 %	25 %	0 %	0 %	470208197
51343	NC_020557	ACA	2	6	2248659	2248664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208197
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51346	NC_020557	CATT	2	8	2248727	2248734	25 %	50 %	0 %	25 %	470208197
51347	NC_020557	TC	3	6	2248803	2248808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51348	NC_020557	GA	3	6	2248813	2248818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51349	NC_020557	TTC	2	6	2248919	2248924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51350	NC_020557	CGTT	2	8	2248932	2248939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51351	NC_020557	ATC	2	6	2248975	2248980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51352	NC_020557	AAG	2	6	2249008	2249013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51353	NC_020557	TCA	2	6	2249154	2249159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208198
51354	NC_020557	T	6	6	2249171	2249176	0 %	100 %	0 %	0 %	470208198
51355	NC_020557	ATA	2	6	2249373	2249378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51356	NC_020557	CA	4	8	2249402	2249409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51357	NC_020557	CGT	2	6	2249570	2249575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51358	NC_020557	TCT	2	6	2249576	2249581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51359	NC_020557	TCT	2	6	2249594	2249599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51360	NC_020557	TCA	2	6	2249629	2249634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51361	NC_020557	AGT	2	6	2249643	2249648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51362	NC_020557	ATC	3	9	2249664	2249672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51363	NC_020557	TCT	2	6	2249679	2249684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51364	NC_020557	GTCA	2	8	2249696	2249703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51365	NC_020557	GGA	2	6	2249708	2249713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51367	NC_020557	TCT	2	6	2249847	2249852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51368	NC_020557	TGA	2	6	2249868	2249873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51369	NC_020557	GAC	2	6	2249876	2249881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51370	NC_020557	AGA	2	6	2249887	2249892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51381	NC_020557	CTT	2	6	2250293	2250298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51386	NC_020557	ATTC	2	8	2250356	2250363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51387	NC_020557	ATTG	2	8	2250384	2250391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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51493	NC_020557	AAT	2	6	2254444	2254449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208203
51494	NC_020557	CTC	2	6	2254488	2254493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208203
51495	NC_020557	AATG	2	8	2254618	2254625	50 %	25 %	25 %	0 %	470208203
51496	NC_020557	AGTT	2	8	2254641	2254648	25 %	50 %	25 %	0 %	470208203
51497	NC_020557	ATTT	2	8	2254677	2254684	25 %	75 %	0 %	0 %	470208203
51498	NC_020557	GTG	2	6	2254716	2254721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208203
51499	NC_020557	TACCA	2	10	2254723	2254732	40 %	20 %	0 %	40 %	470208203
51500	NC_020557	TTG	2	6	2254740	2254745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208203

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