MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_020450	GATT	2	8	1451119	1451126	25 %	50 %	25 %	0 %	459285545
34002	NC_020450	AAT	2	6	1451133	1451138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285545
34003	NC_020450	ATC	2	6	1451154	1451159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285545
34004	NC_020450	CCAAA	2	10	1451183	1451192	60 %	0 %	0 %	40 %	459285545
34005	NC_020450	AAT	2	6	1451221	1451226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285545
34006	NC_020450	T	6	6	1451232	1451237	0 %	100 %	0 %	0 %	459285545
34007	NC_020450	C	6	6	1451246	1451251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34008	NC_020450	T	6	6	1451263	1451268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_020450	GA	3	6	1451291	1451296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_020450	GCT	2	6	1451301	1451306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34011	NC_020450	TAT	2	6	1451316	1451321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285546
34012	NC_020450	GTA	2	6	1451361	1451366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285546
34013	NC_020450	CTG	2	6	1451389	1451394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285546
34014	NC_020450	TACCT	2	10	1451420	1451429	20 %	40 %	0 %	40 %	459285546
34015	NC_020450	AAC	2	6	1451621	1451626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285546
34016	NC_020450	CAT	2	6	1451797	1451802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285546
34017	NC_020450	CAT	2	6	1451893	1451898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285546
34018	NC_020450	TCG	2	6	1452025	1452030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285546
34019	NC_020450	TTG	2	6	1452067	1452072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285546
34020	NC_020450	T	7	7	1452121	1452127	0 %	100 %	0 %	0 %	459285546
34021	NC_020450	TTTGAC	2	12	1452271	1452282	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	459285547
34022	NC_020450	T	8	8	1452326	1452333	0 %	100 %	0 %	0 %	459285547
34023	NC_020450	AT	3	6	1452432	1452437	50 %	50 %	0 %	0 %	459285547
34024	NC_020450	TCCT	2	8	1452454	1452461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34025	NC_020450	T	6	6	1452498	1452503	0 %	100 %	0 %	0 %	459285548
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34028	NC_020450	TCT	2	6	1452589	1452594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285548
34029	NC_020450	T	6	6	1452594	1452599	0 %	100 %	0 %	0 %	459285548
34030	NC_020450	ATA	2	6	1452681	1452686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285548
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34032	NC_020450	ACT	2	6	1452748	1452753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285548
34033	NC_020450	AAC	2	6	1452780	1452785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285548
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34035	NC_020450	TTCT	2	8	1452870	1452877	0 %	75 %	0 %	25 %	459285548
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34038	NC_020450	CT	3	6	1452997	1453002	0 %	50 %	0 %	50 %	459285548
34039	NC_020450	CTT	2	6	1453052	1453057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285548
34040	NC_020450	CTT	2	6	1453127	1453132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285548
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34044	NC_020450	ATT	4	12	1453236	1453247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285548
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34051	NC_020450	T	6	6	1453491	1453496	0 %	100 %	0 %	0 %	459285548
34052	NC_020450	TCC	2	6	1453504	1453509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34053	NC_020450	ATG	2	6	1453513	1453518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285549
34054	NC_020450	TAT	2	6	1453579	1453584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285549
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34063	NC_020450	ATTC	2	8	1454099	1454106	25 %	50 %	0 %	25 %	459285549
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34099	NC_020450	T	6	6	1456143	1456148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34100	NC_020450	TAA	2	6	1456161	1456166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34101	NC_020450	CTTT	2	8	1456171	1456178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34102	NC_020450	T	7	7	1456223	1456229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34103	NC_020450	TAAAAA	2	12	1456233	1456244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34104	NC_020450	A	7	7	1456240	1456246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34105	NC_020450	CTT	2	6	1456260	1456265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34117	NC_020450	CG	3	6	1456957	1456962	0 %	0 %	50 %	50 %	459285551
34118	NC_020450	TTC	2	6	1456990	1456995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285551
34119	NC_020450	TCA	2	6	1457016	1457021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285551
34120	NC_020450	CAA	2	6	1457064	1457069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285551
34121	NC_020450	AAT	2	6	1457077	1457082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285551
34122	NC_020450	GAA	3	9	1457169	1457177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285551
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34135	NC_020450	ATT	2	6	1457804	1457809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285551
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34139	NC_020450	TTC	2	6	1458005	1458010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285551
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34148	NC_020450	CTT	2	6	1458234	1458239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285551
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34180	NC_020450	ATTA	2	8	1459774	1459781	50 %	50 %	0 %	0 %	459285552
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34186	NC_020450	ATT	2	6	1460279	1460284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34191	NC_020450	TCA	2	6	1460604	1460609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285553
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34198	NC_020450	CTG	2	6	1461177	1461182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285554
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34202	NC_020450	GCA	2	6	1461347	1461352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285554
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34205	NC_020450	CAAT	2	8	1461459	1461466	50 %	25 %	0 %	25 %	459285554
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34215	NC_020450	TCAG	2	8	1462004	1462011	25 %	25 %	25 %	25 %	459285554
34216	NC_020450	TCA	2	6	1462053	1462058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285554
34217	NC_020450	T	7	7	1462132	1462138	0 %	100 %	0 %	0 %	459285554
34218	NC_020450	AATCA	2	10	1462204	1462213	60 %	20 %	0 %	20 %	459285554
34219	NC_020450	ATC	2	6	1462243	1462248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285554
34220	NC_020450	TCCA	2	8	1462357	1462364	25 %	25 %	0 %	50 %	459285554
34221	NC_020450	ATTG	2	8	1462441	1462448	25 %	50 %	25 %	0 %	459285554
34222	NC_020450	GTG	2	6	1462494	1462499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459285554
34223	NC_020450	CTT	2	6	1462587	1462592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285554
34224	NC_020450	ATG	2	6	1462599	1462604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285554
34225	NC_020450	AAGA	2	8	1462691	1462698	75 %	0 %	25 %	0 %	459285554
34226	NC_020450	CAA	2	6	1462701	1462706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285554
34227	NC_020450	TTTTG	2	10	1462713	1462722	0 %	80 %	20 %	0 %	459285554
34228	NC_020450	AAC	2	6	1462849	1462854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285554
34229	NC_020450	TGA	2	6	1462855	1462860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285554
34230	NC_020450	GCA	2	6	1462877	1462882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285554
34231	NC_020450	GCAACT	2	12	1462886	1462897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459285554
34232	NC_020450	ATGA	2	8	1462904	1462911	50 %	25 %	25 %	0 %	459285554
34233	NC_020450	TTG	2	6	1463041	1463046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285554
34234	NC_020450	GTTT	2	8	1463054	1463061	0 %	75 %	25 %	0 %	459285554
34235	NC_020450	ACA	2	6	1463150	1463155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285554
34236	NC_020450	CTT	2	6	1463259	1463264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285554
34237	NC_020450	CTG	2	6	1463301	1463306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285554
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34249	NC_020450	CAA	2	6	1463850	1463855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34273	NC_020450	TTA	2	6	1464813	1464818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34347	NC_020450	TA	3	6	1467680	1467685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34348	NC_020450	TTAT	2	8	1467725	1467732	25 %	75 %	0 %	0 %	459285560
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34353	NC_020450	ATAAA	2	10	1467910	1467919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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