MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_020450	TGG	2	6	518469	518474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284705
12006	NC_020450	AGTG	2	8	518637	518644	25 %	25 %	50 %	0 %	459284705
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12123	NC_020450	A	6	6	523589	523594	100 %	0 %	0 %	0 %	459284711
12124	NC_020450	TGA	2	6	523650	523655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284711
12125	NC_020450	TTA	2	6	523779	523784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284711
12126	NC_020450	ATG	2	6	523817	523822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284711
12127	NC_020450	A	6	6	523879	523884	100 %	0 %	0 %	0 %	459284711
12128	NC_020450	ATC	2	6	523895	523900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284711
12129	NC_020450	TGA	2	6	523926	523931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284711
12130	NC_020450	A	7	7	523931	523937	100 %	0 %	0 %	0 %	459284711
12131	NC_020450	AAT	2	6	523963	523968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284711
12132	NC_020450	CCTT	2	8	524019	524026	0 %	50 %	0 %	50 %	459284711
12133	NC_020450	ATG	2	6	524066	524071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284711
12134	NC_020450	ATT	2	6	524140	524145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284711
12135	NC_020450	TGAA	2	8	524159	524166	50 %	25 %	25 %	0 %	459284711
12136	NC_020450	TCA	2	6	524179	524184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284711
12137	NC_020450	ATG	2	6	524185	524190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284711
12138	NC_020450	CCG	2	6	524233	524238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459284711
12139	NC_020450	GGT	2	6	524290	524295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284711
12140	NC_020450	A	7	7	524298	524304	100 %	0 %	0 %	0 %	459284711
12141	NC_020450	GAA	2	6	524308	524313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284711
12142	NC_020450	TTG	2	6	524335	524340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284711
12143	NC_020450	TGT	2	6	524412	524417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284711
12144	NC_020450	CCAAG	2	10	524428	524437	40 %	0 %	20 %	40 %	459284711
12145	NC_020450	GAA	2	6	524467	524472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284711
12146	NC_020450	GGA	2	6	524509	524514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284711
12147	NC_020450	GTT	2	6	524554	524559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284711
12148	NC_020450	ATA	2	6	524629	524634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284712
12149	NC_020450	ATTT	2	8	524708	524715	25 %	75 %	0 %	0 %	459284712
12150	NC_020450	GTGCTG	2	12	524773	524784	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	459284712
12151	NC_020450	TAA	2	6	524789	524794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284712
12152	NC_020450	TGG	2	6	524846	524851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284712
12153	NC_020450	ATG	2	6	524886	524891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284712
12154	NC_020450	CAAA	2	8	524920	524927	75 %	0 %	0 %	25 %	459284712
12155	NC_020450	GAT	2	6	524949	524954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284712
12156	NC_020450	GGT	2	6	524969	524974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284712
12157	NC_020450	ATG	2	6	525067	525072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284712
12158	NC_020450	CAT	2	6	525144	525149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284712
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12160	NC_020450	GAGAT	2	10	525298	525307	40 %	20 %	40 %	0 %	459284712
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12162	NC_020450	TGA	2	6	525338	525343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284712
12163	NC_020450	T	6	6	525357	525362	0 %	100 %	0 %	0 %	459284712
12164	NC_020450	ATC	3	9	525391	525399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284712
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12172	NC_020450	TACTT	2	10	525680	525689	20 %	60 %	0 %	20 %	459284712
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12176	NC_020450	AGTTT	2	10	525786	525795	20 %	60 %	20 %	0 %	459284712
12177	NC_020450	A	6	6	525796	525801	100 %	0 %	0 %	0 %	459284712
12178	NC_020450	GAA	2	6	525814	525819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12179	NC_020450	GATG	2	8	525844	525851	25 %	25 %	50 %	0 %	459284713
12180	NC_020450	ATTG	2	8	525862	525869	25 %	50 %	25 %	0 %	459284713
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12183	NC_020450	GCC	2	6	525938	525943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459284713
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12185	NC_020450	GCTTT	2	10	525989	525998	0 %	60 %	20 %	20 %	459284713
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12189	NC_020450	A	6	6	526483	526488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12190	NC_020450	T	6	6	526565	526570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12191	NC_020450	TTC	2	6	526702	526707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284714
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12193	NC_020450	TCA	2	6	526754	526759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284714
12194	NC_020450	CCT	2	6	526877	526882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12195	NC_020450	TTG	2	6	526892	526897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12196	NC_020450	ATA	2	6	526903	526908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12197	NC_020450	TAT	2	6	526926	526931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12198	NC_020450	CCAA	2	8	526996	527003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12199	NC_020450	ACA	2	6	527084	527089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12200	NC_020450	CAATG	2	10	527104	527113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12201	NC_020450	ATC	2	6	527175	527180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284715
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12204	NC_020450	AAG	2	6	527206	527211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284715
12205	NC_020450	A	7	7	527228	527234	100 %	0 %	0 %	0 %	459284715
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12213	NC_020450	GAC	2	6	527726	527731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284715
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12217	NC_020450	TCA	2	6	528023	528028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12219	NC_020450	ATT	2	6	528069	528074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12220	NC_020450	GAA	2	6	528087	528092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12221	NC_020450	TAT	2	6	528167	528172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12222	NC_020450	GAT	2	6	528183	528188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12223	NC_020450	AAAT	2	8	528300	528307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12224	NC_020450	A	6	6	528308	528313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12225	NC_020450	GCC	2	6	528376	528381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459284716
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12229	NC_020450	TCA	2	6	528517	528522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284716
12230	NC_020450	AAC	2	6	528545	528550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284716
12231	NC_020450	TTC	2	6	528585	528590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284716
12232	NC_020450	TCACCG	2	12	528619	528630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	459284716
12233	NC_020450	ATCAGC	2	12	528657	528668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459284716
12234	NC_020450	AGA	2	6	528687	528692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284716
12235	NC_020450	TTC	2	6	528723	528728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284716
12236	NC_020450	T	6	6	528806	528811	0 %	100 %	0 %	0 %	459284716
12237	NC_020450	ATCT	2	8	528880	528887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12238	NC_020450	ATT	2	6	528888	528893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12239	NC_020450	AATTC	2	10	528899	528908	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12240	NC_020450	A	6	6	528918	528923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12241	NC_020450	CTT	2	6	528967	528972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284717
12242	NC_020450	CGC	2	6	529120	529125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459284717
12243	NC_020450	TAGTT	2	10	529135	529144	20 %	60 %	20 %	0 %	459284717
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12245	NC_020450	TCA	2	6	529296	529301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284717
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12359	NC_020450	AAT	2	6	534033	534038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12366	NC_020450	TTG	2	6	534291	534296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284722
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