MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_020450	CTT	2	6	2317147	2317152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286368
54003	NC_020450	ACG	2	6	2317187	2317192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286368
54004	NC_020450	CTG	2	6	2317273	2317278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286368
54005	NC_020450	AAGA	2	8	2317339	2317346	75 %	0 %	25 %	0 %	459286368
54006	NC_020450	ATG	2	6	2317350	2317355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286368
54007	NC_020450	AAT	2	6	2317418	2317423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286368
54008	NC_020450	CTT	2	6	2317480	2317485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286368
54009	NC_020450	GTC	2	6	2317516	2317521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286368
54010	NC_020450	TTCC	2	8	2317537	2317544	0 %	50 %	0 %	50 %	459286368
54011	NC_020450	ATT	2	6	2317613	2317618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54012	NC_020450	TCA	2	6	2317630	2317635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54013	NC_020450	A	7	7	2317663	2317669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54014	NC_020450	TAA	2	6	2317674	2317679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54015	NC_020450	TG	3	6	2317685	2317690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_020450	TAT	2	6	2317697	2317702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54017	NC_020450	T	6	6	2317764	2317769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54018	NC_020450	T	6	6	2317823	2317828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54019	NC_020450	ATT	2	6	2317834	2317839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286369
54020	NC_020450	T	6	6	2317841	2317846	0 %	100 %	0 %	0 %	459286369
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54024	NC_020450	GGA	2	6	2318037	2318042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286369
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54031	NC_020450	AATG	2	8	2318314	2318321	50 %	25 %	25 %	0 %	459286369
54032	NC_020450	ATTT	2	8	2318335	2318342	25 %	75 %	0 %	0 %	459286369
54033	NC_020450	ACT	2	6	2318352	2318357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286369
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54040	NC_020450	TCT	2	6	2318613	2318618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286369
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54043	NC_020450	CGT	2	6	2318735	2318740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286369
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54053	NC_020450	T	6	6	2319044	2319049	0 %	100 %	0 %	0 %	459286369
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54102	NC_020450	AAT	2	6	2320753	2320758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54108	NC_020450	TA	3	6	2320908	2320913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54109	NC_020450	AT	3	6	2320914	2320919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54110	NC_020450	A	7	7	2320942	2320948	100 %	0 %	0 %	0 %	459286370
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54118	NC_020450	A	6	6	2321227	2321232	100 %	0 %	0 %	0 %	459286370
54119	NC_020450	TAAT	2	8	2321238	2321245	50 %	50 %	0 %	0 %	459286370
54120	NC_020450	TAA	2	6	2321325	2321330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286370
54121	NC_020450	ATG	2	6	2321379	2321384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286370
54122	NC_020450	A	6	6	2321421	2321426	100 %	0 %	0 %	0 %	459286370
54123	NC_020450	CAGA	2	8	2321427	2321434	50 %	0 %	25 %	25 %	459286370
54124	NC_020450	ATT	2	6	2321477	2321482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286370
54125	NC_020450	GAA	2	6	2321558	2321563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286370
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54127	NC_020450	TAG	2	6	2321695	2321700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286370
54128	NC_020450	AATA	2	8	2321727	2321734	75 %	25 %	0 %	0 %	459286370
54129	NC_020450	A	6	6	2321734	2321739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54130	NC_020450	T	7	7	2321753	2321759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54131	NC_020450	ACATC	2	10	2321770	2321779	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54132	NC_020450	A	8	8	2321802	2321809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54133	NC_020450	GAG	2	6	2321810	2321815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54134	NC_020450	CTC	2	6	2321822	2321827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54135	NC_020450	CCG	2	6	2321879	2321884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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54137	NC_020450	TTC	2	6	2321990	2321995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54138	NC_020450	CTTCCA	2	12	2322083	2322094	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54139	NC_020450	ATC	2	6	2322108	2322113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54140	NC_020450	TC	3	6	2322112	2322117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54141	NC_020450	TCCCT	2	10	2322191	2322200	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54142	NC_020450	AAC	2	6	2322230	2322235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54143	NC_020450	ACG	2	6	2322333	2322338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54145	NC_020450	ACC	2	6	2322528	2322533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54146	NC_020450	GATT	2	8	2322612	2322619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54147	NC_020450	CCAA	2	8	2322621	2322628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54148	NC_020450	AGG	2	6	2322664	2322669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54149	NC_020450	GTA	2	6	2322752	2322757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54150	NC_020450	CAA	2	6	2322761	2322766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54151	NC_020450	CCTA	2	8	2322804	2322811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54152	NC_020450	TC	3	6	2322924	2322929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54153	NC_020450	GCC	2	6	2323021	2323026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54154	NC_020450	CTC	2	6	2323071	2323076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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54156	NC_020450	GGCT	2	8	2323179	2323186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54157	NC_020450	TC	3	6	2323250	2323255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54158	NC_020450	AG	3	6	2323352	2323357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54159	NC_020450	CTT	2	6	2323655	2323660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54161	NC_020450	GCT	2	6	2323823	2323828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54163	NC_020450	GA	3	6	2324082	2324087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54164	NC_020450	CAT	2	6	2324232	2324237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54200	NC_020450	CTCTC	2	10	2326107	2326116	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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54219	NC_020450	TCCC	2	8	2327016	2327023	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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54222	NC_020450	T	7	7	2327092	2327098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54223	NC_020450	TCA	2	6	2327117	2327122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286371
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54228	NC_020450	CAA	2	6	2327409	2327414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286371
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54230	NC_020450	GCT	2	6	2327491	2327496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286371
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54232	NC_020450	TAAC	2	8	2327507	2327514	50 %	25 %	0 %	25 %	459286371
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54238	NC_020450	TAC	2	6	2327697	2327702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286371
54239	NC_020450	TTG	2	6	2327723	2327728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286371
54240	NC_020450	CAT	2	6	2327750	2327755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286371
54241	NC_020450	TCT	2	6	2327842	2327847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286371
54242	NC_020450	T	6	6	2327887	2327892	0 %	100 %	0 %	0 %	459286371
54243	NC_020450	ACA	2	6	2327893	2327898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286371
54244	NC_020450	T	6	6	2327916	2327921	0 %	100 %	0 %	0 %	459286371
54245	NC_020450	TGC	2	6	2327967	2327972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286371
54246	NC_020450	AAT	2	6	2327973	2327978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286371
54247	NC_020450	GCAATT	2	12	2328022	2328033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459286371
54248	NC_020450	CTG	2	6	2328077	2328082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286371
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54251	NC_020450	T	7	7	2328227	2328233	0 %	100 %	0 %	0 %	459286371
54252	NC_020450	TAA	2	6	2328245	2328250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286371
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54255	NC_020450	ATC	2	6	2328463	2328468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286371
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54257	NC_020450	ATCA	2	8	2328507	2328514	50 %	25 %	0 %	25 %	459286371
54258	NC_020450	T	6	6	2328519	2328524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54259	NC_020450	A	6	6	2328531	2328536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54260	NC_020450	T	6	6	2328604	2328609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54261	NC_020450	TCT	2	6	2328656	2328661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286372
54262	NC_020450	AG	4	8	2328705	2328712	50 %	0 %	50 %	0 %	459286372
54263	NC_020450	T	6	6	2328761	2328766	0 %	100 %	0 %	0 %	459286372
54264	NC_020450	ATA	2	6	2328851	2328856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286372
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54267	NC_020450	CT	3	6	2328884	2328889	0 %	50 %	0 %	50 %	459286372
54268	NC_020450	ATTG	2	8	2328895	2328902	25 %	50 %	25 %	0 %	459286372
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54282	NC_020450	TGC	2	6	2329470	2329475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286372
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54288	NC_020450	TACCTG	2	12	2329620	2329631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	459286372
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54298	NC_020450	TCA	3	9	2330209	2330217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54300	NC_020450	T	6	6	2330239	2330244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54326	NC_020450	AGG	2	6	2331539	2331544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54330	NC_020450	A	7	7	2331722	2331728	100 %	0 %	0 %	0 %	459286374
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54334	NC_020450	A	6	6	2331844	2331849	100 %	0 %	0 %	0 %	459286374
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54343	NC_020450	ATT	2	6	2332169	2332174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286374
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54346	NC_020450	GAA	2	6	2332241	2332246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286374
54347	NC_020450	ATTTC	2	10	2332247	2332256	20 %	60 %	0 %	20 %	459286374
54348	NC_020450	ATG	2	6	2332313	2332318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286374
54349	NC_020450	AATGAA	2	12	2332324	2332335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	459286374
54350	NC_020450	GAC	2	6	2332456	2332461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286375
54351	NC_020450	TAT	2	6	2332523	2332528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286375
54352	NC_020450	ACA	2	6	2332624	2332629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286375
54353	NC_020450	CAA	2	6	2332633	2332638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286375
54354	NC_020450	ATA	2	6	2332702	2332707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286375
54355	NC_020450	TAAAA	2	10	2332780	2332789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54356	NC_020450	A	7	7	2332786	2332792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54357	NC_020450	A	7	7	2332794	2332800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54358	NC_020450	T	7	7	2332822	2332828	0 %	100 %	0 %	0 %	459286376
54359	NC_020450	GTA	2	6	2332833	2332838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286376
54360	NC_020450	ACT	2	6	2332950	2332955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286376
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54362	NC_020450	AGAA	2	8	2333016	2333023	75 %	0 %	25 %	0 %	459286376
54363	NC_020450	TCA	2	6	2333143	2333148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286376
54364	NC_020450	TGA	2	6	2333181	2333186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286376
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54366	NC_020450	TCA	3	9	2333248	2333256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286376
54367	NC_020450	T	6	6	2333341	2333346	0 %	100 %	0 %	0 %	459286376
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54369	NC_020450	A	6	6	2333378	2333383	100 %	0 %	0 %	0 %	459286376
54370	NC_020450	T	6	6	2333424	2333429	0 %	100 %	0 %	0 %	459286376
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54375	NC_020450	CGGA	2	8	2333710	2333717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54376	NC_020450	A	7	7	2333768	2333774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54377	NC_020450	AGC	2	6	2333784	2333789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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54382	NC_020450	GCC	2	6	2334022	2334027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286377
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54386	NC_020450	ACG	2	6	2334099	2334104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54387	NC_020450	TTA	2	6	2334105	2334110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54388	NC_020450	ATA	2	6	2334133	2334138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54390	NC_020450	ATT	2	6	2334205	2334210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54393	NC_020450	TAT	2	6	2334329	2334334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286378
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54473	NC_020450	CTAAA	2	10	2337499	2337508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54474	NC_020450	TGAGTC	2	12	2337521	2337532	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459286383
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54481	NC_020450	ATT	2	6	2337988	2337993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286383
54482	NC_020450	CAAT	2	8	2338001	2338008	50 %	25 %	0 %	25 %	459286383
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54484	NC_020450	ATT	2	6	2338087	2338092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286383
54485	NC_020450	GGA	2	6	2338174	2338179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286383
54486	NC_020450	ACT	2	6	2338192	2338197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286383
54487	NC_020450	TCT	2	6	2338322	2338327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286383
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54489	NC_020450	GGC	2	6	2338368	2338373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286383
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54491	NC_020450	GCT	2	6	2338417	2338422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286383
54492	NC_020450	TC	3	6	2338458	2338463	0 %	50 %	0 %	50 %	459286383
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