MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 56398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50003	NC_020450	TTC	2	6	2147834	2147839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286202
50004	NC_020450	CAA	2	6	2147854	2147859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286202
50005	NC_020450	T	6	6	2147948	2147953	0 %	100 %	0 %	0 %	459286202
50006	NC_020450	ATC	2	6	2147961	2147966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286202
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50008	NC_020450	TCA	2	6	2148015	2148020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286202
50009	NC_020450	ATC	2	6	2148060	2148065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286202
50010	NC_020450	TAA	2	6	2148137	2148142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286202
50011	NC_020450	TTC	2	6	2148224	2148229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286202
50012	NC_020450	TTG	2	6	2148287	2148292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286202
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50014	NC_020450	TTG	2	6	2148358	2148363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286202
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50018	NC_020450	TATT	2	8	2148514	2148521	25 %	75 %	0 %	0 %	459286203
50019	NC_020450	ATC	3	9	2148563	2148571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286203
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50028	NC_020450	T	6	6	2148896	2148901	0 %	100 %	0 %	0 %	459286203
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50114	NC_020450	A	7	7	2151621	2151627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50115	NC_020450	T	6	6	2151646	2151651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50119	NC_020450	AGC	2	6	2151752	2151757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286207
50120	NC_020450	CAA	2	6	2151790	2151795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286207
50121	NC_020450	TTC	2	6	2151884	2151889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286207
50122	NC_020450	CAA	2	6	2151976	2151981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286207
50123	NC_020450	CAT	2	6	2151986	2151991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286207
50124	NC_020450	AAC	2	6	2152007	2152012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286207
50125	NC_020450	TCA	2	6	2152053	2152058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286207
50126	NC_020450	GCT	2	6	2152080	2152085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286207
50127	NC_020450	CTT	2	6	2152090	2152095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286207
50128	NC_020450	TTG	2	6	2152175	2152180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286207
50129	NC_020450	T	6	6	2152187	2152192	0 %	100 %	0 %	0 %	459286207
50130	NC_020450	CTT	2	6	2152273	2152278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286207
50131	NC_020450	T	6	6	2152306	2152311	0 %	100 %	0 %	0 %	459286207
50132	NC_020450	GC	3	6	2152320	2152325	0 %	0 %	50 %	50 %	459286207
50133	NC_020450	T	7	7	2152336	2152342	0 %	100 %	0 %	0 %	459286207
50134	NC_020450	TGTC	2	8	2152378	2152385	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50135	NC_020450	TTG	2	6	2152390	2152395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50136	NC_020450	CTG	2	6	2152412	2152417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50137	NC_020450	CTC	2	6	2152484	2152489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50138	NC_020450	AAC	2	6	2152520	2152525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50139	NC_020450	TG	3	6	2152549	2152554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50140	NC_020450	TG	3	6	2152562	2152567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50141	NC_020450	CCTA	2	8	2152637	2152644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50142	NC_020450	TGA	2	6	2152753	2152758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286208
50143	NC_020450	TTTTG	2	10	2152825	2152834	0 %	80 %	20 %	0 %	459286208
50144	NC_020450	CTG	2	6	2152863	2152868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286208
50145	NC_020450	T	6	6	2152870	2152875	0 %	100 %	0 %	0 %	459286208
50146	NC_020450	CTG	3	9	2152884	2152892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286208
50147	NC_020450	GAG	2	6	2152893	2152898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286208
50148	NC_020450	TGA	2	6	2152905	2152910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286208
50149	NC_020450	TCA	2	6	2152925	2152930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286208
50150	NC_020450	AAC	2	6	2152942	2152947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286208
50151	NC_020450	GAT	2	6	2152951	2152956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286208
50152	NC_020450	ATG	2	6	2153006	2153011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286208
50153	NC_020450	TGG	2	6	2153044	2153049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459286208
50154	NC_020450	ATG	2	6	2153150	2153155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50155	NC_020450	A	8	8	2153215	2153222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50156	NC_020450	TGA	2	6	2153267	2153272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50157	NC_020450	T	7	7	2153280	2153286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50158	NC_020450	A	7	7	2153357	2153363	100 %	0 %	0 %	0 %	459286209
50159	NC_020450	TTA	2	6	2153394	2153399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286209
50160	NC_020450	TTA	2	6	2153463	2153468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286209
50161	NC_020450	ATT	2	6	2153543	2153548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286209
50162	NC_020450	TGC	2	6	2153567	2153572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286209
50163	NC_020450	GAG	2	6	2153592	2153597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286209
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50184	NC_020450	TGA	2	6	2154395	2154400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286209
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50190	NC_020450	TGA	2	6	2154587	2154592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286209
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50193	NC_020450	CAA	2	6	2154732	2154737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286209
50194	NC_020450	TCAG	2	8	2154745	2154752	25 %	25 %	25 %	25 %	459286209
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50197	NC_020450	CT	3	6	2155021	2155026	0 %	50 %	0 %	50 %	459286209
50198	NC_020450	TTG	2	6	2155027	2155032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286209
50199	NC_020450	TCTT	2	8	2155036	2155043	0 %	75 %	0 %	25 %	459286209
50200	NC_020450	A	7	7	2155173	2155179	100 %	0 %	0 %	0 %	459286209
50201	NC_020450	ATC	2	6	2155291	2155296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286210
50202	NC_020450	A	6	6	2155357	2155362	100 %	0 %	0 %	0 %	459286210
50203	NC_020450	TTG	2	6	2155363	2155368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286210
50204	NC_020450	A	7	7	2155374	2155380	100 %	0 %	0 %	0 %	459286210
50205	NC_020450	A	6	6	2155383	2155388	100 %	0 %	0 %	0 %	459286210
50206	NC_020450	ATT	3	9	2155395	2155403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286210
50207	NC_020450	TTA	2	6	2155422	2155427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286210
50208	NC_020450	ATC	2	6	2155497	2155502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286210
50209	NC_020450	TGAT	2	8	2155573	2155580	25 %	50 %	25 %	0 %	459286210
50210	NC_020450	ATT	2	6	2155619	2155624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286210
50211	NC_020450	A	6	6	2155671	2155676	100 %	0 %	0 %	0 %	459286210
50212	NC_020450	GCT	2	6	2155683	2155688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286210
50213	NC_020450	GAT	2	6	2155716	2155721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286210
50214	NC_020450	GAA	2	6	2155866	2155871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286210
50215	NC_020450	ATT	2	6	2155878	2155883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286210
50216	NC_020450	AGA	2	6	2155928	2155933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286210
50217	NC_020450	A	8	8	2155956	2155963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50218	NC_020450	T	8	8	2155982	2155989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50219	NC_020450	TTTAA	2	10	2156010	2156019	40 %	60 %	0 %	0 %	459286211
50220	NC_020450	TAAAA	2	10	2156063	2156072	80 %	20 %	0 %	0 %	459286211
50221	NC_020450	TCA	2	6	2156104	2156109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286211
50222	NC_020450	CAT	2	6	2156171	2156176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286211
50223	NC_020450	TAT	2	6	2156236	2156241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50224	NC_020450	ATTA	2	8	2156256	2156263	50 %	50 %	0 %	0 %	459286212
50225	NC_020450	A	6	6	2156283	2156288	100 %	0 %	0 %	0 %	459286212
50226	NC_020450	TTGA	2	8	2156305	2156312	25 %	50 %	25 %	0 %	459286212
50227	NC_020450	TCT	2	6	2156319	2156324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286212
50228	NC_020450	T	8	8	2156328	2156335	0 %	100 %	0 %	0 %	459286212
50229	NC_020450	TCT	2	6	2156355	2156360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286212
50230	NC_020450	GCTTT	2	10	2156436	2156445	0 %	60 %	20 %	20 %	459286212
50231	NC_020450	T	6	6	2156455	2156460	0 %	100 %	0 %	0 %	459286212
50232	NC_020450	TTC	2	6	2156465	2156470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286212
50233	NC_020450	CAA	2	6	2156476	2156481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286212
50234	NC_020450	CAA	2	6	2156563	2156568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286212
50235	NC_020450	TAT	2	6	2156590	2156595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286212
50236	NC_020450	AAT	2	6	2156600	2156605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286212
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50238	NC_020450	TTC	2	6	2156714	2156719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286212
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50357	NC_020450	CAA	2	6	2161476	2161481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286218
50358	NC_020450	AATT	2	8	2161519	2161526	50 %	50 %	0 %	0 %	459286218
50359	NC_020450	AATT	2	8	2161534	2161541	50 %	50 %	0 %	0 %	459286218
50360	NC_020450	TAA	2	6	2161549	2161554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286218
50361	NC_020450	CAA	2	6	2161575	2161580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286218
50362	NC_020450	TTC	2	6	2161600	2161605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286218
50363	NC_020450	GTT	2	6	2161619	2161624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286218
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50369	NC_020450	ATTTC	2	10	2161808	2161817	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50370	NC_020450	TCC	2	6	2161818	2161823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50371	NC_020450	TAAAAA	2	12	2161861	2161872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50374	NC_020450	AGAA	2	8	2162062	2162069	75 %	0 %	25 %	0 %	459286219
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50399	NC_020450	CCTT	2	8	2163104	2163111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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50402	NC_020450	A	6	6	2163209	2163214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50403	NC_020450	A	7	7	2163251	2163257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50429	NC_020450	T	6	6	2164229	2164234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50430	NC_020450	CAAAAT	2	12	2164246	2164257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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50432	NC_020450	AATC	3	12	2164301	2164312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50433	NC_020450	ATTT	2	8	2164313	2164320	25 %	75 %	0 %	0 %	459286221
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50443	NC_020450	AAT	2	6	2164631	2164636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50444	NC_020450	T	6	6	2164670	2164675	0 %	100 %	0 %	0 %	459286222
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50451	NC_020450	GTTT	2	8	2164850	2164857	0 %	75 %	25 %	0 %	459286222
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50459	NC_020450	GAT	2	6	2165237	2165242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286222
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50462	NC_020450	TGA	2	6	2165317	2165322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286222
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50468	NC_020450	AATCA	2	10	2165663	2165672	60 %	20 %	0 %	20 %	459286222
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50470	NC_020450	GAA	2	6	2165711	2165716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286222
50471	NC_020450	CCAATA	2	12	2165814	2165825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	459286222
50472	NC_020450	TCA	2	6	2165877	2165882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286222
50473	NC_020450	GAT	2	6	2165912	2165917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286222
50474	NC_020450	TG	3	6	2165939	2165944	0 %	50 %	50 %	0 %	459286222
50475	NC_020450	TGA	2	6	2165972	2165977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286222
50476	NC_020450	ATTG	2	8	2165984	2165991	25 %	50 %	25 %	0 %	459286222
50477	NC_020450	AAC	2	6	2166002	2166007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286222
50478	NC_020450	TCA	2	6	2166027	2166032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286222
50479	NC_020450	TCA	2	6	2166063	2166068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286222
50480	NC_020450	TTA	2	6	2166105	2166110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286222
50481	NC_020450	ACA	2	6	2166111	2166116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286222
50482	NC_020450	T	6	6	2166146	2166151	0 %	100 %	0 %	0 %	459286222
50483	NC_020450	CAAAA	2	10	2166152	2166161	80 %	0 %	0 %	20 %	459286222
50484	NC_020450	ATA	2	6	2166225	2166230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286222
50485	NC_020450	GT	3	6	2166265	2166270	0 %	50 %	50 %	0 %	459286222
50486	NC_020450	CTG	2	6	2166304	2166309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286222
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50488	NC_020450	TA	3	6	2166521	2166526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50489	NC_020450	T	7	7	2166592	2166598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50490	NC_020450	T	7	7	2166646	2166652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50491	NC_020450	TAAT	2	8	2166654	2166661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50492	NC_020450	TGT	2	6	2166682	2166687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286223
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50495	NC_020450	AT	3	6	2166760	2166765	50 %	50 %	0 %	0 %	459286223
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50499	NC_020450	ATTT	2	8	2166915	2166922	25 %	75 %	0 %	0 %	459286223
50500	NC_020450	TGA	2	6	2166988	2166993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286223

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