MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_020229	ATCA	2	8	2108626	2108633	50 %	25 %	0 %	25 %	448821590
41502	NC_020229	TCC	2	6	2108644	2108649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41503	NC_020229	GTA	2	6	2108655	2108660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41504	NC_020229	TGC	2	6	2108874	2108879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821591
41505	NC_020229	ATGA	2	8	2108899	2108906	50 %	25 %	25 %	0 %	448821591
41506	NC_020229	TTGC	2	8	2108930	2108937	0 %	50 %	25 %	25 %	448821591
41507	NC_020229	AAC	2	6	2109044	2109049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41508	NC_020229	TAC	2	6	2109052	2109057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41509	NC_020229	CTT	2	6	2109090	2109095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41510	NC_020229	GAT	2	6	2109114	2109119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821592
41511	NC_020229	TTA	2	6	2109146	2109151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821592
41512	NC_020229	ATC	2	6	2109313	2109318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821592
41513	NC_020229	TTC	2	6	2109476	2109481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821592
41514	NC_020229	TAA	2	6	2109493	2109498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821592
41515	NC_020229	CAT	2	6	2109529	2109534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821592
41516	NC_020229	ATC	2	6	2109575	2109580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821592
41517	NC_020229	TAA	2	6	2109603	2109608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821592
41518	NC_020229	CGA	2	6	2109683	2109688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821592
41519	NC_020229	GGT	2	6	2109792	2109797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821592
41520	NC_020229	T	6	6	2109840	2109845	0 %	100 %	0 %	0 %	448821592
41521	NC_020229	GTA	2	6	2109876	2109881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821592
41522	NC_020229	GACC	2	8	2110021	2110028	25 %	0 %	25 %	50 %	448821593
41523	NC_020229	CTT	2	6	2110030	2110035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821593
41524	NC_020229	TTGT	2	8	2110080	2110087	0 %	75 %	25 %	0 %	448821593
41525	NC_020229	TA	3	6	2110305	2110310	50 %	50 %	0 %	0 %	448821593
41526	NC_020229	ACCTA	2	10	2110329	2110338	40 %	20 %	0 %	40 %	448821593
41527	NC_020229	ACCTA	2	10	2110344	2110353	40 %	20 %	0 %	40 %	448821593
41528	NC_020229	ATC	3	9	2110599	2110607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821593
41529	NC_020229	TCA	3	9	2110657	2110665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821593
41530	NC_020229	GCAT	2	8	2110666	2110673	25 %	25 %	25 %	25 %	448821593
41531	NC_020229	TAG	2	6	2110689	2110694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821593
41532	NC_020229	TCC	2	6	2110777	2110782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41533	NC_020229	TAG	2	6	2110792	2110797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41534	NC_020229	CCAC	2	8	2110803	2110810	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41535	NC_020229	CTG	2	6	2110826	2110831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41536	NC_020229	T	10	10	2110834	2110843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41537	NC_020229	TAATGC	2	12	2110944	2110955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41538	NC_020229	ATT	2	6	2111132	2111137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41539	NC_020229	ATT	2	6	2111187	2111192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41540	NC_020229	AGC	2	6	2111200	2111205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41541	NC_020229	TGT	2	6	2111272	2111277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41542	NC_020229	CT	3	6	2111314	2111319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41543	NC_020229	AT	3	6	2111355	2111360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41544	NC_020229	AG	3	6	2111413	2111418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41545	NC_020229	CTT	2	6	2111448	2111453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41546	NC_020229	ATC	2	6	2111479	2111484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41547	NC_020229	CTA	2	6	2111510	2111515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41548	NC_020229	T	7	7	2111524	2111530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41549	NC_020229	CTT	2	6	2111567	2111572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41550	NC_020229	ATT	2	6	2111578	2111583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41551	NC_020229	CCT	2	6	2111584	2111589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821594
41552	NC_020229	TAA	2	6	2111614	2111619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821594
41553	NC_020229	T	7	7	2111686	2111692	0 %	100 %	0 %	0 %	448821594
41554	NC_020229	ACT	2	6	2111700	2111705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821594
41555	NC_020229	ACTC	2	8	2111759	2111766	25 %	25 %	0 %	50 %	448821594
41556	NC_020229	TCC	2	6	2111795	2111800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821595
41557	NC_020229	TGG	2	6	2111809	2111814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821595
41558	NC_020229	TCA	2	6	2111834	2111839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821595
41559	NC_020229	TTC	2	6	2111896	2111901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821595
41560	NC_020229	TCT	2	6	2112026	2112031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821595
41561	NC_020229	CATA	2	8	2112033	2112040	50 %	25 %	0 %	25 %	448821595
41562	NC_020229	TCC	2	6	2112046	2112051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41563	NC_020229	GTT	2	6	2112098	2112103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41564	NC_020229	TCC	2	6	2112142	2112147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41565	NC_020229	CAT	2	6	2112161	2112166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41566	NC_020229	TGA	2	6	2112198	2112203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821596
41567	NC_020229	CTG	2	6	2112223	2112228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821596
41568	NC_020229	TCT	3	9	2112246	2112254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821596
41569	NC_020229	CTT	2	6	2112268	2112273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821596
41570	NC_020229	GAAT	2	8	2112293	2112300	50 %	25 %	25 %	0 %	448821596
41571	NC_020229	ATGG	2	8	2112500	2112507	25 %	25 %	50 %	0 %	448821597
41572	NC_020229	CAA	2	6	2112544	2112549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821597
41573	NC_020229	ATTT	2	8	2112591	2112598	25 %	75 %	0 %	0 %	448821597
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41575	NC_020229	GAT	2	6	2112641	2112646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821597
41576	NC_020229	TGA	2	6	2112685	2112690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821597
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41579	NC_020229	T	6	6	2112883	2112888	0 %	100 %	0 %	0 %	448821598
41580	NC_020229	CCT	2	6	2112938	2112943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821599
41581	NC_020229	GCTG	2	8	2112946	2112953	0 %	25 %	50 %	25 %	448821599
41582	NC_020229	GCT	2	6	2112991	2112996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821599
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41584	NC_020229	CAAG	2	8	2113109	2113116	50 %	0 %	25 %	25 %	448821599
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41586	NC_020229	TCGAA	2	10	2113179	2113188	40 %	20 %	20 %	20 %	448821600
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41591	NC_020229	TG	3	6	2113356	2113361	0 %	50 %	50 %	0 %	448821600
41592	NC_020229	TTC	2	6	2113502	2113507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821600
41593	NC_020229	TC	3	6	2113534	2113539	0 %	50 %	0 %	50 %	448821600
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41601	NC_020229	TCAT	2	8	2113854	2113861	25 %	50 %	0 %	25 %	448821600
41602	NC_020229	ACC	2	6	2113936	2113941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821601
41603	NC_020229	GGC	2	6	2114028	2114033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821601
41604	NC_020229	AATTTC	2	12	2114053	2114064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	448821601
41605	NC_020229	TTGT	2	8	2114082	2114089	0 %	75 %	25 %	0 %	448821601
41606	NC_020229	CTC	2	6	2114103	2114108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41607	NC_020229	TCA	2	6	2114124	2114129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41608	NC_020229	TAA	2	6	2114161	2114166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41609	NC_020229	TCA	2	6	2114198	2114203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41610	NC_020229	TGC	2	6	2114245	2114250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41611	NC_020229	TGA	2	6	2114260	2114265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41612	NC_020229	TAA	2	6	2114288	2114293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41613	NC_020229	A	6	6	2114367	2114372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41614	NC_020229	AAG	2	6	2114378	2114383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41615	NC_020229	TGC	2	6	2114397	2114402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41616	NC_020229	TCT	2	6	2114518	2114523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41617	NC_020229	AATT	2	8	2114583	2114590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41618	NC_020229	AT	3	6	2114610	2114615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41620	NC_020229	TCG	2	6	2114668	2114673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41742	NC_020229	ATC	2	6	2120397	2120402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821609
41743	NC_020229	GCCA	2	8	2120466	2120473	25 %	0 %	25 %	50 %	448821609
41744	NC_020229	TGC	2	6	2120503	2120508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821609
41745	NC_020229	CTT	2	6	2120510	2120515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821609
41746	NC_020229	CCT	2	6	2120550	2120555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41747	NC_020229	TCA	2	6	2120579	2120584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41748	NC_020229	AGG	2	6	2120641	2120646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41749	NC_020229	GGGC	2	8	2120767	2120774	0 %	0 %	75 %	25 %	448821610
41750	NC_020229	GGC	2	6	2120790	2120795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821610
41751	NC_020229	GAA	2	6	2120823	2120828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821610
41752	NC_020229	CG	3	6	2120830	2120835	0 %	0 %	50 %	50 %	448821610
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41754	NC_020229	TGG	2	6	2121059	2121064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41755	NC_020229	ACC	2	6	2121118	2121123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821611
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41757	NC_020229	TCG	2	6	2121222	2121227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821611
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41771	NC_020229	TAA	2	6	2122026	2122031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821611
41772	NC_020229	ACC	2	6	2122083	2122088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821611
41773	NC_020229	CG	3	6	2122202	2122207	0 %	0 %	50 %	50 %	448821611
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41776	NC_020229	TAAA	2	8	2122342	2122349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41777	NC_020229	AC	3	6	2122434	2122439	50 %	0 %	0 %	50 %	448821612
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41793	NC_020229	CTAA	2	8	2123061	2123068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41794	NC_020229	A	6	6	2123089	2123094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41795	NC_020229	TAA	2	6	2123107	2123112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41824	NC_020229	CAT	3	9	2124860	2124868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821614
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41851	NC_020229	CAA	2	6	2126030	2126035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41852	NC_020229	CTTA	2	8	2126036	2126043	25 %	50 %	0 %	25 %	448821615
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41854	NC_020229	TGGT	2	8	2126054	2126061	0 %	50 %	50 %	0 %	448821615
41855	NC_020229	TAT	2	6	2126093	2126098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821615
41856	NC_020229	GCT	2	6	2126158	2126163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821615
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41976	NC_020229	AAAG	2	8	2132211	2132218	75 %	0 %	25 %	0 %	448821622
41977	NC_020229	TTA	2	6	2132249	2132254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821623
41978	NC_020229	TGA	2	6	2132308	2132313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821623
41979	NC_020229	ATC	2	6	2132342	2132347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821623
41980	NC_020229	ATG	2	6	2132349	2132354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821623
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41982	NC_020229	CAT	2	6	2132374	2132379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821623
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