MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_020229	CCA	2	6	1668443	1668448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821135
33003	NC_020229	GGA	2	6	1668455	1668460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448821135
33004	NC_020229	GAG	2	6	1668490	1668495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448821135
33005	NC_020229	ACA	2	6	1668518	1668523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821135
33006	NC_020229	ATT	2	6	1668537	1668542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821135
33007	NC_020229	TTA	2	6	1668618	1668623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821135
33008	NC_020229	TGAC	2	8	1668649	1668656	25 %	25 %	25 %	25 %	448821135
33009	NC_020229	ACG	2	6	1668681	1668686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821135
33010	NC_020229	TGG	2	6	1668737	1668742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821135
33011	NC_020229	ACA	2	6	1668748	1668753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821135
33012	NC_020229	GCT	2	6	1668761	1668766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821135
33013	NC_020229	TGA	2	6	1668937	1668942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33014	NC_020229	ACG	2	6	1668983	1668988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821136
33015	NC_020229	GAA	2	6	1669031	1669036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821136
33016	NC_020229	GGAT	2	8	1669074	1669081	25 %	25 %	50 %	0 %	448821136
33017	NC_020229	CCGTTA	2	12	1669109	1669120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	448821136
33018	NC_020229	CAT	2	6	1669135	1669140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821136
33019	NC_020229	ATA	2	6	1669179	1669184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821136
33020	NC_020229	TGA	2	6	1669222	1669227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33021	NC_020229	ATT	2	6	1669320	1669325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821136
33022	NC_020229	ATT	2	6	1669388	1669393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821136
33023	NC_020229	AATGC	2	10	1669469	1669478	40 %	20 %	20 %	20 %	448821136
33024	NC_020229	CGT	2	6	1669525	1669530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821136
33025	NC_020229	TGCT	2	8	1669605	1669612	0 %	50 %	25 %	25 %	448821136
33026	NC_020229	ATG	2	6	1669659	1669664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33027	NC_020229	AGC	2	6	1669696	1669701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821136
33028	NC_020229	AGCA	2	8	1669748	1669755	50 %	0 %	25 %	25 %	448821136
33029	NC_020229	CAGA	2	8	1669793	1669800	50 %	0 %	25 %	25 %	448821136
33030	NC_020229	TGA	2	6	1669804	1669809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33031	NC_020229	GCG	2	6	1669852	1669857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821136
33032	NC_020229	CTC	2	6	1669862	1669867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448821136
33033	NC_020229	TAT	2	6	1669879	1669884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821136
33034	NC_020229	TTA	2	6	1669889	1669894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821136
33035	NC_020229	TCG	2	6	1669908	1669913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821136
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33038	NC_020229	ATCAA	2	10	1670063	1670072	60 %	20 %	0 %	20 %	448821136
33039	NC_020229	ATG	2	6	1670178	1670183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33040	NC_020229	CGG	2	6	1670202	1670207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821136
33041	NC_020229	CGT	2	6	1670235	1670240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821136
33042	NC_020229	GCA	2	6	1670246	1670251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821136
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33050	NC_020229	ATG	2	6	1670646	1670651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821136
33051	NC_020229	AGA	2	6	1670787	1670792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821136
33052	NC_020229	CAA	2	6	1670811	1670816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821136
33053	NC_020229	T	6	6	1670847	1670852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33054	NC_020229	ATA	2	6	1670883	1670888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33055	NC_020229	GGT	2	6	1670894	1670899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33056	NC_020229	GCG	2	6	1671004	1671009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821137
33057	NC_020229	GCG	2	6	1671047	1671052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821137
33058	NC_020229	GCC	2	6	1671109	1671114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821137
33059	NC_020229	TGGCAG	2	12	1671204	1671215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	448821137
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33061	NC_020229	CGAA	2	8	1671328	1671335	50 %	0 %	25 %	25 %	448821137
33062	NC_020229	GCC	2	6	1671350	1671355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821137
33063	NC_020229	CTGG	2	8	1671377	1671384	0 %	25 %	50 %	25 %	448821137
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33070	NC_020229	GATG	2	8	1671916	1671923	25 %	25 %	50 %	0 %	448821138
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33083	NC_020229	TTCGG	2	10	1672872	1672881	0 %	40 %	40 %	20 %	448821139
33084	NC_020229	TTCT	2	8	1672882	1672889	0 %	75 %	0 %	25 %	448821139
33085	NC_020229	GAAG	2	8	1672911	1672918	50 %	0 %	50 %	0 %	448821139
33086	NC_020229	GCT	2	6	1672996	1673001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821139
33087	NC_020229	TGA	2	6	1673100	1673105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821139
33088	NC_020229	CGGT	2	8	1673155	1673162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33089	NC_020229	TCA	2	6	1673174	1673179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33090	NC_020229	ACG	2	6	1673202	1673207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33091	NC_020229	ATC	2	6	1673209	1673214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33092	NC_020229	TTG	2	6	1673222	1673227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33093	NC_020229	GGT	2	6	1673252	1673257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821140
33094	NC_020229	TAG	2	6	1673261	1673266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821140
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33099	NC_020229	A	6	6	1673439	1673444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33100	NC_020229	GCCA	2	8	1673446	1673453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33101	NC_020229	A	6	6	1673455	1673460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33102	NC_020229	TGC	2	6	1673474	1673479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33103	NC_020229	CG	3	6	1673486	1673491	0 %	0 %	50 %	50 %	448821141
33104	NC_020229	CTT	2	6	1673532	1673537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821141
33105	NC_020229	GCG	2	6	1673589	1673594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821141
33106	NC_020229	CCT	2	6	1673676	1673681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33107	NC_020229	GTC	2	6	1673703	1673708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33108	NC_020229	AAT	2	6	1673724	1673729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33109	NC_020229	TAA	2	6	1673741	1673746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33110	NC_020229	TTTAC	2	10	1673775	1673784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33111	NC_020229	TTTC	2	8	1673831	1673838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33112	NC_020229	AGG	2	6	1673888	1673893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33113	NC_020229	TCAAAA	2	12	1673909	1673920	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	448821142
33114	NC_020229	ATTGAT	2	12	1673935	1673946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	448821142
33115	NC_020229	ATG	2	6	1673948	1673953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821142
33116	NC_020229	GTC	2	6	1673965	1673970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821142
33117	NC_020229	CGC	2	6	1674052	1674057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821142
33118	NC_020229	GC	3	6	1674067	1674072	0 %	0 %	50 %	50 %	448821142
33119	NC_020229	GTT	2	6	1674079	1674084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821142
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33122	NC_020229	AGG	2	6	1674285	1674290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33130	NC_020229	CGT	2	6	1674780	1674785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821143
33131	NC_020229	GCT	2	6	1674790	1674795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821143
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33145	NC_020229	GCT	2	6	1675309	1675314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821143
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33163	NC_020229	ACGG	2	8	1676059	1676066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33164	NC_020229	T	7	7	1676090	1676096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33165	NC_020229	TAAT	2	8	1676101	1676108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33166	NC_020229	ATT	2	6	1676122	1676127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33167	NC_020229	GGT	2	6	1676139	1676144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33200	NC_020229	TGG	2	6	1677882	1677887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821144
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33207	NC_020229	TGA	2	6	1678209	1678214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33209	NC_020229	TAT	2	6	1678334	1678339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821145
33210	NC_020229	GAA	2	6	1678371	1678376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821145
33211	NC_020229	ATC	2	6	1678393	1678398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821145
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33217	NC_020229	GGC	2	6	1678476	1678481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821145
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33220	NC_020229	CGAC	2	8	1678584	1678591	25 %	0 %	25 %	50 %	448821145
33221	NC_020229	TGA	2	6	1678646	1678651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821145
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33227	NC_020229	GGC	2	6	1679017	1679022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821145
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33230	NC_020229	AGCA	2	8	1679240	1679247	50 %	0 %	25 %	25 %	448821145
33231	NC_020229	CTG	2	6	1679261	1679266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821145
33232	NC_020229	AGA	2	6	1679324	1679329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821146
33233	NC_020229	TTG	2	6	1679440	1679445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821146
33234	NC_020229	AGA	2	6	1679462	1679467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821146
33235	NC_020229	GTC	2	6	1679526	1679531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821146
33236	NC_020229	TG	3	6	1679684	1679689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33237	NC_020229	TGAC	2	8	1679696	1679703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33238	NC_020229	CTTA	2	8	1679721	1679728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33239	NC_020229	ATC	2	6	1679769	1679774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821147
33240	NC_020229	ATGA	2	8	1679860	1679867	50 %	25 %	25 %	0 %	448821147
33241	NC_020229	AAT	2	6	1679876	1679881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821147
33242	NC_020229	CAC	2	6	1679900	1679905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33243	NC_020229	GTG	2	6	1680149	1680154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821148
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33247	NC_020229	GAC	2	6	1680466	1680471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821148
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33249	NC_020229	A	6	6	1680585	1680590	100 %	0 %	0 %	0 %	448821148
33250	NC_020229	AAG	2	6	1680614	1680619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821148
33251	NC_020229	GCT	2	6	1680635	1680640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821148
33252	NC_020229	TAA	2	6	1680678	1680683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33253	NC_020229	ATT	2	6	1680821	1680826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821149
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33256	NC_020229	TAAT	2	8	1681041	1681048	50 %	50 %	0 %	0 %	448821149
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33302	NC_020229	CAA	2	6	1682861	1682866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821149
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33330	NC_020229	GTTTA	2	10	1684309	1684318	20 %	60 %	20 %	0 %	448821150
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33347	NC_020229	CGA	2	6	1684975	1684980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821150
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33349	NC_020229	GAT	2	6	1684991	1684996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821150
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33465	NC_020229	GCTGA	2	10	1690438	1690447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33466	NC_020229	T	7	7	1690488	1690494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33467	NC_020229	ATC	2	6	1690528	1690533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33468	NC_020229	TAT	2	6	1690627	1690632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33469	NC_020229	CTT	2	6	1690656	1690661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33470	NC_020229	ATTT	2	8	1690712	1690719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33471	NC_020229	GGC	2	6	1690765	1690770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33472	NC_020229	ATAAA	2	10	1690809	1690818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33473	NC_020229	AG	3	6	1690819	1690824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33474	NC_020229	AGTT	2	8	1690891	1690898	25 %	50 %	25 %	0 %	448821158
33475	NC_020229	ACCG	2	8	1690923	1690930	25 %	0 %	25 %	50 %	448821158
33476	NC_020229	CAT	2	6	1690971	1690976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821158
33477	NC_020229	TAAA	2	8	1690996	1691003	75 %	25 %	0 %	0 %	448821158
33478	NC_020229	CAA	2	6	1691036	1691041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821158
33479	NC_020229	GCT	2	6	1691055	1691060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821158
33480	NC_020229	GT	3	6	1691161	1691166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33481	NC_020229	TGA	2	6	1691170	1691175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33482	NC_020229	GT	3	6	1691252	1691257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33483	NC_020229	TGAA	2	8	1691304	1691311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33484	NC_020229	GGCG	2	8	1691389	1691396	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33485	NC_020229	TGC	2	6	1691412	1691417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33486	NC_020229	GT	3	6	1691513	1691518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33487	NC_020229	TAC	2	6	1691570	1691575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33488	NC_020229	AAT	2	6	1691581	1691586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33489	NC_020229	AAT	2	6	1691593	1691598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33490	NC_020229	T	6	6	1691607	1691612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33491	NC_020229	TGA	2	6	1691683	1691688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33492	NC_020229	AAGT	2	8	1691819	1691826	50 %	25 %	25 %	0 %	448821159
33493	NC_020229	GCG	2	6	1691852	1691857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821159
33494	NC_020229	GCT	2	6	1691865	1691870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821159
33495	NC_020229	CGT	2	6	1692008	1692013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821159
33496	NC_020229	GCT	2	6	1692069	1692074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821159
33497	NC_020229	ACT	2	6	1692111	1692116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821159
33498	NC_020229	CAG	2	6	1692160	1692165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821159
33499	NC_020229	CTA	2	6	1692319	1692324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821159
33500	NC_020229	GAC	2	6	1692356	1692361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821159

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