MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_020229	GAT	2	6	1567673	1567678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821031
31003	NC_020229	CAT	2	6	1567684	1567689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821031
31004	NC_020229	TGA	2	6	1567846	1567851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821031
31005	NC_020229	GGT	2	6	1567854	1567859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821031
31006	NC_020229	AAG	2	6	1567906	1567911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821031
31007	NC_020229	TTG	2	6	1567954	1567959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821031
31008	NC_020229	ACG	2	6	1567960	1567965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821031
31009	NC_020229	CTG	2	6	1567996	1568001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821032
31010	NC_020229	AAC	2	6	1568018	1568023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821032
31011	NC_020229	GCT	2	6	1568034	1568039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821032
31012	NC_020229	GATGC	2	10	1568091	1568100	20 %	20 %	40 %	20 %	448821032
31013	NC_020229	ACCA	2	8	1568164	1568171	50 %	0 %	0 %	50 %	448821032
31014	NC_020229	TGA	2	6	1568279	1568284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31015	NC_020229	GAT	2	6	1568289	1568294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31016	NC_020229	GTC	2	6	1568373	1568378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821032
31017	NC_020229	CAC	2	6	1568483	1568488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821032
31018	NC_020229	ATA	2	6	1568599	1568604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821032
31019	NC_020229	TGT	2	6	1568615	1568620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821032
31020	NC_020229	CGG	2	6	1568703	1568708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821032
31021	NC_020229	GAT	2	6	1568750	1568755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31022	NC_020229	TCA	2	6	1568827	1568832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821032
31023	NC_020229	GAC	2	6	1568837	1568842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821032
31024	NC_020229	AAG	2	6	1568889	1568894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821032
31025	NC_020229	ATT	2	6	1568967	1568972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821032
31026	NC_020229	TGA	2	6	1569016	1569021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31027	NC_020229	TGA	2	6	1569026	1569031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31028	NC_020229	GCA	2	6	1569093	1569098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821032
31029	NC_020229	ATCAAA	2	12	1569115	1569126	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	448821032
31030	NC_020229	TGA	2	6	1569136	1569141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821032
31031	NC_020229	GGTT	2	8	1569172	1569179	0 %	50 %	50 %	0 %	448821032
31032	NC_020229	CTT	2	6	1569188	1569193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821032
31033	NC_020229	CAA	2	6	1569319	1569324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821033
31034	NC_020229	ATG	2	6	1569329	1569334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
31035	NC_020229	CCAA	2	8	1569377	1569384	50 %	0 %	0 %	50 %	448821033
31036	NC_020229	GC	4	8	1569484	1569491	0 %	0 %	50 %	50 %	448821033
31037	NC_020229	TCA	2	6	1569506	1569511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821033
31038	NC_020229	TGC	2	6	1569513	1569518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821033
31039	NC_020229	GAC	2	6	1569549	1569554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821033
31040	NC_020229	TGA	2	6	1569609	1569614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
31041	NC_020229	CAT	2	6	1569637	1569642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821033
31042	NC_020229	TAATT	2	10	1569645	1569654	40 %	60 %	0 %	0 %	448821033
31043	NC_020229	AT	3	6	1569696	1569701	50 %	50 %	0 %	0 %	448821033
31044	NC_020229	TGC	2	6	1569738	1569743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821033
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31046	NC_020229	CAATC	2	10	1569810	1569819	40 %	20 %	0 %	40 %	448821033
31047	NC_020229	TGA	2	6	1569857	1569862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
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31049	NC_020229	TTA	2	6	1569994	1569999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821033
31050	NC_020229	TGG	2	6	1570023	1570028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821033
31051	NC_020229	GAT	2	6	1570032	1570037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
31052	NC_020229	TGA	2	6	1570053	1570058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
31053	NC_020229	GCG	2	6	1570132	1570137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821033
31054	NC_020229	ATT	2	6	1570142	1570147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821033
31055	NC_020229	CAT	2	6	1570264	1570269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821033
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31057	NC_020229	CG	3	6	1570351	1570356	0 %	0 %	50 %	50 %	448821033
31058	NC_020229	TCA	2	6	1570359	1570364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821033
31059	NC_020229	TAG	2	6	1570397	1570402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821033
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31061	NC_020229	ATT	2	6	1570455	1570460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821033
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31063	NC_020229	ATC	2	6	1570551	1570556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821034
31064	NC_020229	CAT	2	6	1570559	1570564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821034
31065	NC_020229	TCA	2	6	1570626	1570631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821034
31066	NC_020229	ATG	2	6	1570721	1570726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821034
31067	NC_020229	GCAA	2	8	1570800	1570807	50 %	0 %	25 %	25 %	448821034
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31070	NC_020229	TGG	2	6	1570901	1570906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821034
31071	NC_020229	TTGC	2	8	1570922	1570929	0 %	50 %	25 %	25 %	448821034
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31078	NC_020229	TACCGA	2	12	1571397	1571408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	448821035
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31080	NC_020229	AACC	2	8	1571465	1571472	50 %	0 %	0 %	50 %	448821035
31081	NC_020229	CGG	2	6	1571498	1571503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821035
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31084	NC_020229	ATCG	2	8	1571910	1571917	25 %	25 %	25 %	25 %	448821035
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31086	NC_020229	GAT	2	6	1571958	1571963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821035
31087	NC_020229	TGG	2	6	1572018	1572023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821035
31088	NC_020229	ATC	2	6	1572100	1572105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821035
31089	NC_020229	GTC	2	6	1572117	1572122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821035
31090	NC_020229	AGA	2	6	1572201	1572206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821035
31091	NC_020229	CTA	2	6	1572213	1572218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821035
31092	NC_020229	TGA	2	6	1572221	1572226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821035
31093	NC_020229	GTA	2	6	1572363	1572368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821035
31094	NC_020229	TAAAA	2	10	1572392	1572401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31095	NC_020229	T	6	6	1572432	1572437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31096	NC_020229	TTG	2	6	1572448	1572453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31097	NC_020229	GTA	2	6	1572501	1572506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31098	NC_020229	TAT	2	6	1572579	1572584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31099	NC_020229	ATT	2	6	1572593	1572598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31100	NC_020229	ACAG	2	8	1572640	1572647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31101	NC_020229	TGAT	2	8	1572733	1572740	25 %	50 %	25 %	0 %	448821036
31102	NC_020229	GAC	2	6	1572830	1572835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821036
31103	NC_020229	ACTTG	2	10	1572917	1572926	20 %	40 %	20 %	20 %	448821036
31104	NC_020229	GGT	2	6	1573011	1573016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_020229	TAAG	2	8	1573110	1573117	50 %	25 %	25 %	0 %	448821037
31106	NC_020229	TGA	2	6	1573189	1573194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821037
31107	NC_020229	TGA	2	6	1573243	1573248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821037
31108	NC_020229	CGA	2	6	1573256	1573261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821037
31109	NC_020229	TGA	2	6	1573263	1573268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821037
31110	NC_020229	ATCA	2	8	1573278	1573285	50 %	25 %	0 %	25 %	448821037
31111	NC_020229	TGA	2	6	1573429	1573434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821037
31112	NC_020229	TCA	2	6	1573571	1573576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821037
31113	NC_020229	TTAC	2	8	1573591	1573598	25 %	50 %	0 %	25 %	448821037
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31115	NC_020229	GAT	2	6	1573676	1573681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821037
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31117	NC_020229	CAA	2	6	1573763	1573768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821037
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31128	NC_020229	CTT	2	6	1574248	1574253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31152	NC_020229	GAC	2	6	1575859	1575864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821039
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31219	NC_020229	GGC	2	6	1579377	1579382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821041
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31222	NC_020229	GTT	2	6	1579533	1579538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31223	NC_020229	TCA	2	6	1579574	1579579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821042
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31227	NC_020229	ATT	2	6	1579764	1579769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821042
31228	NC_020229	CGT	2	6	1579814	1579819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821042
31229	NC_020229	TGA	2	6	1579820	1579825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821042
31230	NC_020229	TCT	2	6	1579972	1579977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821042
31231	NC_020229	TGAA	2	8	1579978	1579985	50 %	25 %	25 %	0 %	448821042
31232	NC_020229	ATG	2	6	1579995	1580000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821042
31233	NC_020229	GAC	2	6	1580039	1580044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821042
31234	NC_020229	A	7	7	1580060	1580066	100 %	0 %	0 %	0 %	448821042
31235	NC_020229	AAC	2	6	1580088	1580093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
31236	NC_020229	ATG	2	6	1580101	1580106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821043
31237	NC_020229	GCG	2	6	1580160	1580165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821043
31238	NC_020229	CAA	2	6	1580166	1580171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
31239	NC_020229	TGAGC	2	10	1580261	1580270	20 %	20 %	40 %	20 %	448821043
31240	NC_020229	TTG	2	6	1580361	1580366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821043
31241	NC_020229	TAT	2	6	1580373	1580378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821043
31242	NC_020229	CAA	2	6	1580379	1580384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
31243	NC_020229	GAT	2	6	1580451	1580456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821043
31244	NC_020229	CGGT	2	8	1580482	1580489	0 %	25 %	50 %	25 %	448821043
31245	NC_020229	CAA	2	6	1580502	1580507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
31246	NC_020229	GCA	2	6	1580523	1580528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821043
31247	NC_020229	TTGAC	2	10	1580536	1580545	20 %	40 %	20 %	20 %	448821043
31248	NC_020229	ACG	2	6	1580607	1580612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821043
31249	NC_020229	GC	3	6	1580636	1580641	0 %	0 %	50 %	50 %	448821043
31250	NC_020229	GGC	2	6	1580648	1580653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821043
31251	NC_020229	TGAGAT	2	12	1580810	1580821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821043
31252	NC_020229	AAC	2	6	1580852	1580857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
31253	NC_020229	TGA	2	6	1580867	1580872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821043
31254	NC_020229	ATT	2	6	1580885	1580890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821043
31255	NC_020229	GCG	2	6	1580897	1580902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821043
31256	NC_020229	CAG	2	6	1580928	1580933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821043
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31258	NC_020229	AGC	2	6	1581007	1581012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821043
31259	NC_020229	G	6	6	1581130	1581135	0 %	0 %	100 %	0 %	448821043
31260	NC_020229	TCA	2	6	1581151	1581156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821043
31261	NC_020229	CTA	2	6	1581167	1581172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821043
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31263	NC_020229	ACG	2	6	1581255	1581260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821043
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31265	NC_020229	CGAC	2	8	1581333	1581340	25 %	0 %	25 %	50 %	448821043
31266	NC_020229	CAA	2	6	1581369	1581374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821043
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31284	NC_020229	TTA	2	6	1582606	1582611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31285	NC_020229	TGA	2	6	1582633	1582638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31286	NC_020229	T	6	6	1582706	1582711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31287	NC_020229	GTC	2	6	1582712	1582717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31288	NC_020229	ACG	2	6	1582829	1582834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821045
31289	NC_020229	CGGT	2	8	1582874	1582881	0 %	25 %	50 %	25 %	448821045
31290	NC_020229	GTA	2	6	1582938	1582943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821045
31291	NC_020229	GCT	2	6	1582955	1582960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821045
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31299	NC_020229	AACG	2	8	1583261	1583268	50 %	0 %	25 %	25 %	448821045
31300	NC_020229	CAA	2	6	1583278	1583283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821045
31301	NC_020229	GTT	2	6	1583294	1583299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821045
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31330	NC_020229	ATTG	2	8	1584755	1584762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31331	NC_020229	AT	3	6	1584793	1584798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31332	NC_020229	A	7	7	1584809	1584815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31333	NC_020229	AAG	2	6	1585055	1585060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821046
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31341	NC_020229	ATT	2	6	1585488	1585493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31342	NC_020229	CAAAA	2	10	1585502	1585511	80 %	0 %	0 %	20 %	448821047
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31347	NC_020229	AAT	2	6	1585688	1585693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821047
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31349	NC_020229	GTG	2	6	1585802	1585807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821048
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31351	NC_020229	CGT	2	6	1585900	1585905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821048
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31356	NC_020229	GATT	2	8	1586229	1586236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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31359	NC_020229	ATTA	2	8	1586287	1586294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31360	NC_020229	TCA	2	6	1586323	1586328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821049
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31453	NC_020229	CAA	2	6	1591326	1591331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31465	NC_020229	TGA	2	6	1591839	1591844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821054
31466	NC_020229	ATAGA	2	10	1591877	1591886	60 %	20 %	20 %	0 %	448821054
31467	NC_020229	GTC	2	6	1591905	1591910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821054
31468	NC_020229	CG	3	6	1591955	1591960	0 %	0 %	50 %	50 %	448821054
31469	NC_020229	ACG	2	6	1591997	1592002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821054
31470	NC_020229	CAC	2	6	1592017	1592022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821054
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31473	NC_020229	AT	3	6	1592193	1592198	50 %	50 %	0 %	0 %	448821054
31474	NC_020229	TGGAA	2	10	1592219	1592228	40 %	20 %	40 %	0 %	448821054
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31476	NC_020229	TCA	2	6	1592373	1592378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821054
31477	NC_020229	TG	3	6	1592447	1592452	0 %	50 %	50 %	0 %	448821054
31478	NC_020229	CTT	2	6	1592464	1592469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821054
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31485	NC_020229	A	6	6	1592954	1592959	100 %	0 %	0 %	0 %	448821055
31486	NC_020229	CTT	2	6	1592977	1592982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821055
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31488	NC_020229	ATT	2	6	1593011	1593016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821055
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31492	NC_020229	AAC	2	6	1593262	1593267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31493	NC_020229	CAAT	2	8	1593363	1593370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31494	NC_020229	TAAT	2	8	1593413	1593420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31495	NC_020229	AAAT	2	8	1593606	1593613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31496	NC_020229	GGT	2	6	1593647	1593652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31497	NC_020229	TCA	2	6	1593654	1593659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31498	NC_020229	A	6	6	1593699	1593704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31499	NC_020229	ATT	2	6	1593708	1593713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31500	NC_020229	ATA	2	6	1593716	1593721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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