MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

< Previous12...2627282930313233343536...125126Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_020229	TGT	2	6	758811	758816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820239
15003	NC_020229	GAT	3	9	758859	758867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820239
15004	NC_020229	ATGA	2	8	758971	758978	50 %	25 %	25 %	0 %	448820239
15005	NC_020229	ATT	2	6	759243	759248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820240
15006	NC_020229	GC	3	6	759318	759323	0 %	0 %	50 %	50 %	448820240
15007	NC_020229	GTA	2	6	759331	759336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820240
15008	NC_020229	CTG	2	6	759400	759405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820240
15009	NC_020229	AGG	2	6	759467	759472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448820240
15010	NC_020229	CGA	2	6	759484	759489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820240
15011	NC_020229	GTTACC	2	12	759518	759529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	448820240
15012	NC_020229	ACC	2	6	759613	759618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448820240
15013	NC_020229	GTA	2	6	759631	759636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820240
15014	NC_020229	GCT	2	6	759657	759662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820240
15015	NC_020229	GCT	2	6	759695	759700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820240
15016	NC_020229	CCATGC	2	12	759767	759778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	448820240
15017	NC_020229	GTG	2	6	759805	759810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820240
15018	NC_020229	ACA	2	6	759882	759887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820240
15019	NC_020229	ATT	2	6	759899	759904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820240
15020	NC_020229	T	6	6	759988	759993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_020229	TCT	2	6	760077	760082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_020229	T	7	7	760143	760149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_020229	GCTT	2	8	760184	760191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15024	NC_020229	T	6	6	760190	760195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020229	ACT	2	6	760200	760205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15026	NC_020229	TGG	3	9	760340	760348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820241
15027	NC_020229	TGG	2	6	760356	760361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820241
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15032	NC_020229	CAG	2	6	760637	760642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820241
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15036	NC_020229	GCCA	2	8	760808	760815	25 %	0 %	25 %	50 %	448820241
15037	NC_020229	TTG	2	6	760848	760853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820241
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15039	NC_020229	AC	3	6	761242	761247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15040	NC_020229	AAT	2	6	761250	761255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_020229	AT	4	8	761344	761351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_020229	AGTG	2	8	761353	761360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020229	ATT	2	6	761417	761422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020229	A	6	6	761447	761452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020229	AGG	2	6	761454	761459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15049	NC_020229	CA	3	6	761711	761716	50 %	0 %	0 %	50 %	448820242
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15053	NC_020229	TTG	2	6	762023	762028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820242
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15055	NC_020229	GAC	2	6	762142	762147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820242
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15060	NC_020229	GTT	2	6	762573	762578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820243
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15103	NC_020229	CTTG	2	8	764240	764247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15104	NC_020229	TTTA	2	8	764287	764294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_020229	GAG	2	6	764352	764357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_020229	CAAT	2	8	764372	764379	50 %	25 %	0 %	25 %	448820245
15107	NC_020229	ATG	2	6	764475	764480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820245
15108	NC_020229	TGG	2	6	764551	764556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820245
15109	NC_020229	A	6	6	764627	764632	100 %	0 %	0 %	0 %	448820245
15110	NC_020229	AT	3	6	764653	764658	50 %	50 %	0 %	0 %	448820245
15111	NC_020229	A	6	6	764729	764734	100 %	0 %	0 %	0 %	448820245
15112	NC_020229	AAT	2	6	764748	764753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448820245
15113	NC_020229	ATT	2	6	764793	764798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020229	TAGT	2	8	764802	764809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_020229	AAG	2	6	764812	764817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_020229	T	7	7	764862	764868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_020229	GT	3	6	764997	765002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_020229	GTG	2	6	765036	765041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_020229	CGTC	2	8	765087	765094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15120	NC_020229	GAC	2	6	765117	765122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15122	NC_020229	CAA	2	6	765266	765271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820246
15123	NC_020229	CGA	2	6	765293	765298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820246
15124	NC_020229	AT	3	6	765356	765361	50 %	50 %	0 %	0 %	448820246
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15147	NC_020229	CAGG	2	8	766582	766589	25 %	0 %	50 %	25 %	448820246
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15232	NC_020229	CTG	2	6	771024	771029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820251
15233	NC_020229	CGATG	2	10	771043	771052	20 %	20 %	40 %	20 %	448820251
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15242	NC_020229	AACTT	2	10	771689	771698	40 %	40 %	0 %	20 %	448820251
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