MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020229	GT	4	8	654050	654057	0 %	50 %	50 %	0 %	448820149
13002	NC_020229	AGT	2	6	654159	654164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_020229	CCG	2	6	654165	654170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_020229	TGG	2	6	654174	654179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_020229	T	7	7	654182	654188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_020229	CCAG	2	8	654276	654283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13007	NC_020229	TTGC	2	8	654332	654339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_020229	AC	3	6	654346	654351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13009	NC_020229	CGT	2	6	654501	654506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820150
13010	NC_020229	TGC	2	6	654510	654515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820150
13011	NC_020229	TGG	2	6	654537	654542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820150
13012	NC_020229	GCG	2	6	654547	654552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448820150
13013	NC_020229	GTGA	2	8	654571	654578	25 %	25 %	50 %	0 %	448820150
13014	NC_020229	AGC	2	6	654587	654592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820150
13015	NC_020229	AGC	2	6	654650	654655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820150
13016	NC_020229	CAG	2	6	654661	654666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820150
13017	NC_020229	GAT	2	6	654669	654674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820150
13018	NC_020229	AT	3	6	654708	654713	50 %	50 %	0 %	0 %	448820150
13019	NC_020229	CG	3	6	654770	654775	0 %	0 %	50 %	50 %	448820150
13020	NC_020229	GC	3	6	654793	654798	0 %	0 %	50 %	50 %	448820150
13021	NC_020229	GCC	2	6	654979	654984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448820150
13022	NC_020229	GTG	2	6	655001	655006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820150
13023	NC_020229	GGA	2	6	655038	655043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448820150
13024	NC_020229	ATG	2	6	655064	655069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820150
13025	NC_020229	GACT	2	8	655082	655089	25 %	25 %	25 %	25 %	448820150
13026	NC_020229	CG	3	6	655150	655155	0 %	0 %	50 %	50 %	448820150
13027	NC_020229	TGAT	2	8	655193	655200	25 %	50 %	25 %	0 %	448820150
13028	NC_020229	TGA	2	6	655217	655222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820150
13029	NC_020229	CAA	2	6	655288	655293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820150
13030	NC_020229	AAG	2	6	655361	655366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820150
13031	NC_020229	TTAAA	2	10	655413	655422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020229	T	8	8	655477	655484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020229	GAT	2	6	655549	655554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020229	AAC	2	6	655723	655728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820151
13035	NC_020229	TGGGG	2	10	655794	655803	0 %	20 %	80 %	0 %	448820151
13036	NC_020229	CTTG	2	8	655824	655831	0 %	50 %	25 %	25 %	448820151
13037	NC_020229	TAT	2	6	655864	655869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820151
13038	NC_020229	A	6	6	655876	655881	100 %	0 %	0 %	0 %	448820151
13039	NC_020229	GAA	2	6	656040	656045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820151
13040	NC_020229	TGG	2	6	656076	656081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820151
13041	NC_020229	AGC	2	6	656087	656092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820151
13042	NC_020229	CTTA	2	8	656096	656103	25 %	50 %	0 %	25 %	448820151
13043	NC_020229	CAA	2	6	656119	656124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820151
13044	NC_020229	AATGA	2	10	656167	656176	60 %	20 %	20 %	0 %	448820151
13045	NC_020229	TTG	2	6	656185	656190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820151
13046	NC_020229	TCT	2	6	656231	656236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448820151
13047	NC_020229	CCA	2	6	656301	656306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448820151
13048	NC_020229	AGG	2	6	656348	656353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448820151
13049	NC_020229	ATT	2	6	656420	656425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820152
13050	NC_020229	AC	5	10	656474	656483	50 %	0 %	0 %	50 %	448820152
13051	NC_020229	ACG	2	6	656608	656613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820152
13052	NC_020229	CGA	2	6	656700	656705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820152
13053	NC_020229	GAC	2	6	656860	656865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820152
13054	NC_020229	TCT	2	6	656880	656885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448820152
13055	NC_020229	CAG	2	6	656964	656969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820152
13056	NC_020229	GAT	2	6	657004	657009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820152
13057	NC_020229	CAGT	2	8	657081	657088	25 %	25 %	25 %	25 %	448820152
13058	NC_020229	TTC	2	6	657089	657094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448820152
13059	NC_020229	TCT	2	6	657114	657119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448820152
13060	NC_020229	GTAG	2	8	657199	657206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020229	T	6	6	657291	657296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_020229	G	9	9	657330	657338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_020229	CA	3	6	657344	657349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_020229	ATT	2	6	657477	657482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_020229	AAG	2	6	657506	657511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_020229	GAC	2	6	657586	657591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820153
13067	NC_020229	AAG	2	6	657611	657616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820153
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13070	NC_020229	GAC	2	6	657727	657732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820153
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13073	NC_020229	A	6	6	657863	657868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_020229	GCAAG	2	10	657877	657886	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13075	NC_020229	AAT	2	6	657993	657998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_020229	GAC	2	6	658045	658050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13078	NC_020229	A	6	6	658068	658073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_020229	TA	3	6	658093	658098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020229	AAAGG	2	10	658176	658185	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020229	TA	3	6	658234	658239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_020229	ATT	3	9	658404	658412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820154
13083	NC_020229	TAT	2	6	658455	658460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820154
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13085	NC_020229	CATTA	2	10	658572	658581	40 %	40 %	0 %	20 %	448820154
13086	NC_020229	T	6	6	658846	658851	0 %	100 %	0 %	0 %	448820154
13087	NC_020229	A	6	6	658880	658885	100 %	0 %	0 %	0 %	448820154
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13092	NC_020229	TAT	2	6	659010	659015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820155
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13094	NC_020229	TTG	2	6	659135	659140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820155
13095	NC_020229	TGT	2	6	659266	659271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_020229	GAC	2	6	659291	659296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_020229	AATAA	2	10	659319	659328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_020229	CAAT	2	8	659395	659402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_020229	CGT	2	6	659421	659426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_020229	A	7	7	659566	659572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_020229	A	6	6	659577	659582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020229	ATG	2	6	659632	659637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020229	TTG	2	6	659704	659709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820156
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13106	NC_020229	TGC	2	6	659850	659855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820156
13107	NC_020229	TGG	2	6	659856	659861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820156
13108	NC_020229	TTTA	2	8	659966	659973	25 %	75 %	0 %	0 %	448820156
13109	NC_020229	A	6	6	660044	660049	100 %	0 %	0 %	0 %	448820156
13110	NC_020229	TTC	2	6	660192	660197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448820156
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13112	NC_020229	GAT	2	6	660265	660270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820156
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13114	NC_020229	TTGA	2	8	660310	660317	25 %	50 %	25 %	0 %	448820156
13115	NC_020229	TAATT	2	10	660330	660339	40 %	60 %	0 %	0 %	448820156
13116	NC_020229	TTG	2	6	660368	660373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820156
13117	NC_020229	CGT	2	6	660398	660403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820156
13118	NC_020229	GTGA	2	8	660421	660428	25 %	25 %	50 %	0 %	448820156
13119	NC_020229	GT	3	6	660500	660505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_020229	T	6	6	660518	660523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_020229	ATG	2	6	660527	660532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020229	ATC	2	6	660582	660587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448820157
13123	NC_020229	CCAC	2	8	660691	660698	25 %	0 %	0 %	75 %	448820157
13124	NC_020229	AGC	2	6	660746	660751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820157
13125	NC_020229	GGATG	2	10	660842	660851	20 %	20 %	60 %	0 %	448820157
13126	NC_020229	GAA	2	6	660900	660905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820157
13127	NC_020229	ATC	2	6	660916	660921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448820157
13128	NC_020229	TGC	2	6	660932	660937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820157
13129	NC_020229	GTT	2	6	660987	660992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820157
13130	NC_020229	GAA	2	6	661047	661052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820157
13131	NC_020229	GTT	2	6	661103	661108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448820157
13132	NC_020229	GCC	2	6	661110	661115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448820157
13133	NC_020229	ATT	2	6	661153	661158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820157
13134	NC_020229	TGAC	2	8	661159	661166	25 %	25 %	25 %	25 %	448820157
13135	NC_020229	GAA	2	6	661181	661186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820157
13136	NC_020229	CGC	2	6	661202	661207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448820157
13137	NC_020229	GAT	2	6	661218	661223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820157
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13141	NC_020229	ATT	2	6	661383	661388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820157
13142	NC_020229	GC	3	6	661444	661449	0 %	0 %	50 %	50 %	448820157
13143	NC_020229	CTTC	2	8	661498	661505	0 %	50 %	0 %	50 %	448820157
13144	NC_020229	CAT	2	6	661517	661522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448820157
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13150	NC_020229	CAT	2	6	661787	661792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448820157
13151	NC_020229	TGA	2	6	661847	661852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820157
13152	NC_020229	ATT	2	6	661946	661951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820157
13153	NC_020229	GTT	2	6	661988	661993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13154	NC_020229	TAA	2	6	662040	662045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13155	NC_020229	GCT	2	6	662056	662061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13156	NC_020229	TTAA	2	8	662113	662120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13157	NC_020229	GAG	2	6	662144	662149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13158	NC_020229	ACGGG	2	10	662153	662162	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13159	NC_020229	GAA	2	6	662190	662195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820158
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13161	NC_020229	GGTC	2	8	662339	662346	0 %	25 %	50 %	25 %	448820158
13162	NC_020229	CGA	2	6	662365	662370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820158
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13166	NC_020229	G	6	6	662568	662573	0 %	0 %	100 %	0 %	448820158
13167	NC_020229	T	6	6	662703	662708	0 %	100 %	0 %	0 %	448820158
13168	NC_020229	TTA	2	6	662731	662736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820158
13169	NC_020229	AAG	2	6	662752	662757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820158
13170	NC_020229	CTTA	2	8	662766	662773	25 %	50 %	0 %	25 %	448820158
13171	NC_020229	TAA	2	6	662829	662834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448820158
13172	NC_020229	GTC	2	6	662911	662916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820158
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13176	NC_020229	TAG	2	6	663031	663036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13177	NC_020229	GT	3	6	663150	663155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13178	NC_020229	TTG	3	9	663296	663304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13179	NC_020229	TAT	2	6	663332	663337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13180	NC_020229	AGTA	2	8	663340	663347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13181	NC_020229	GGA	2	6	663362	663367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448820159
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13188	NC_020229	AGTT	2	8	663718	663725	25 %	50 %	25 %	0 %	448820159
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13199	NC_020229	GCT	2	6	664221	664226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820159
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13203	NC_020229	GTT	2	6	664433	664438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13204	NC_020229	TGG	2	6	664439	664444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13205	NC_020229	TGGAC	2	10	664466	664475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13206	NC_020229	ATTA	2	8	664516	664523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13207	NC_020229	T	7	7	664573	664579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13217	NC_020229	GCCA	2	8	665167	665174	25 %	0 %	25 %	50 %	448820160
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13227	NC_020229	GCA	2	6	665420	665425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448820160
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13230	NC_020229	GGC	2	6	665639	665644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448820160
13231	NC_020229	GTTA	2	8	665645	665652	25 %	50 %	25 %	0 %	448820160
13232	NC_020229	A	6	6	665687	665692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_020229	AGG	2	6	665732	665737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448820161
13234	NC_020229	ATC	2	6	665763	665768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448820161
13235	NC_020229	GATTG	2	10	665793	665802	20 %	40 %	40 %	0 %	448820161
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13237	NC_020229	A	6	6	665921	665926	100 %	0 %	0 %	0 %	448820161
13238	NC_020229	AGA	2	6	665939	665944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820161
13239	NC_020229	TAT	2	6	666004	666009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448820161
13240	NC_020229	GAA	2	6	666019	666024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448820161
13241	NC_020229	ATA	2	6	666032	666037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448820161
13242	NC_020229	AGT	2	6	666076	666081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820161
13243	NC_020229	ATG	2	6	666083	666088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820161
13244	NC_020229	TGC	2	6	666111	666116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448820161
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13488	NC_020229	CAA	2	6	677874	677879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448820174
13489	NC_020229	TGG	2	6	677890	677895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820174
13490	NC_020229	GAT	2	6	677953	677958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820174
13491	NC_020229	GAT	2	6	678103	678108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448820174
13492	NC_020229	TAA	2	6	678151	678156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448820174
13493	NC_020229	TGG	2	6	678244	678249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448820174
13494	NC_020229	GT	3	6	678308	678313	0 %	50 %	50 %	0 %	448820174
13495	NC_020229	GT	3	6	678343	678348	0 %	50 %	50 %	0 %	448820174
13496	NC_020229	TGGC	2	8	678402	678409	0 %	25 %	50 %	25 %	448820174
13497	NC_020229	ACTGG	2	10	678491	678500	20 %	20 %	40 %	20 %	448820174
13498	NC_020229	GCG	2	6	678509	678514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448820174
13499	NC_020229	GAT	2	6	678598	678603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_020229	ATC	2	6	678622	678627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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