MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_020229	AAT	2	6	2647521	2647526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822139
52003	NC_020229	CCA	2	6	2647541	2647546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822139
52004	NC_020229	ACC	2	6	2647553	2647558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822139
52005	NC_020229	AATCA	2	10	2647594	2647603	60 %	20 %	0 %	20 %	448822139
52006	NC_020229	TCA	2	6	2647686	2647691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822139
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52008	NC_020229	TCG	2	6	2647768	2647773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822140
52009	NC_020229	ATC	2	6	2647794	2647799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822140
52010	NC_020229	CAT	2	6	2647874	2647879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822140
52011	NC_020229	ATTG	2	8	2647906	2647913	25 %	50 %	25 %	0 %	448822140
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52013	NC_020229	TCA	2	6	2648090	2648095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822141
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52016	NC_020229	ATC	2	6	2648281	2648286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822141
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52019	NC_020229	TCGCTT	2	12	2648625	2648636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	448822141
52020	NC_020229	AAAGC	2	10	2648646	2648655	60 %	0 %	20 %	20 %	448822141
52021	NC_020229	ATT	3	9	2648678	2648686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822141
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52042	NC_020229	GCC	2	6	2649616	2649621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822142
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52053	NC_020229	C	6	6	2650082	2650087	0 %	0 %	0 %	100 %	448822143
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52058	NC_020229	ATA	2	6	2650497	2650502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52059	NC_020229	TTA	2	6	2650503	2650508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52060	NC_020229	TCA	2	6	2650533	2650538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52062	NC_020229	CAA	2	6	2650577	2650582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52063	NC_020229	CAA	2	6	2650624	2650629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52064	NC_020229	ACTG	2	8	2650712	2650719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52065	NC_020229	CAA	2	6	2650740	2650745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52066	NC_020229	A	7	7	2650800	2650806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52100	NC_020229	AT	3	6	2652696	2652701	50 %	50 %	0 %	0 %	448822145
52101	NC_020229	CAA	2	6	2652704	2652709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822145
52102	NC_020229	AAC	2	6	2652771	2652776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52103	NC_020229	TA	3	6	2652804	2652809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52104	NC_020229	GTA	2	6	2652833	2652838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52105	NC_020229	AAAG	2	8	2652848	2652855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52106	NC_020229	AAC	2	6	2652892	2652897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52107	NC_020229	T	6	6	2652984	2652989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52108	NC_020229	ACG	2	6	2652999	2653004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822146
52109	NC_020229	ATCAA	2	10	2653010	2653019	60 %	20 %	0 %	20 %	448822146
52110	NC_020229	CCG	2	6	2653026	2653031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822146
52111	NC_020229	ACG	2	6	2653124	2653129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822146
52112	NC_020229	GAA	2	6	2653150	2653155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822146
52113	NC_020229	CCA	2	6	2653191	2653196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822146
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52115	NC_020229	TGAC	2	8	2653261	2653268	25 %	25 %	25 %	25 %	448822146
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52117	NC_020229	TTG	2	6	2653297	2653302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822146
52118	NC_020229	TGC	2	6	2653309	2653314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822146
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52147	NC_020229	A	6	6	2655069	2655074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52186	NC_020229	TGAT	2	8	2656647	2656654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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52234	NC_020229	ACT	2	6	2659329	2659334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822152
52235	NC_020229	TAC	2	6	2659553	2659558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822152
52236	NC_020229	GTC	2	6	2659618	2659623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822152
52237	NC_020229	CAATTG	2	12	2659634	2659645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	448822152
52238	NC_020229	GAATTG	2	12	2659688	2659699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822152
52239	NC_020229	CTG	2	6	2659729	2659734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822152
52240	NC_020229	TAA	2	6	2659947	2659952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822152
52241	NC_020229	GCT	2	6	2660074	2660079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822152
52242	NC_020229	ATA	2	6	2660150	2660155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822152
52243	NC_020229	AGA	2	6	2660178	2660183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822152
52244	NC_020229	GTG	2	6	2660210	2660215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822152
52245	NC_020229	TAC	2	6	2660298	2660303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822152
52246	NC_020229	CAA	2	6	2660304	2660309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822152
52247	NC_020229	GCTA	2	8	2660475	2660482	25 %	25 %	25 %	25 %	448822152
52248	NC_020229	TCTG	2	8	2660502	2660509	0 %	50 %	25 %	25 %	448822152
52249	NC_020229	TTC	2	6	2660612	2660617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822152
52250	NC_020229	CTAC	2	8	2660730	2660737	25 %	25 %	0 %	50 %	448822152
52251	NC_020229	GGA	2	6	2660794	2660799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52252	NC_020229	TTA	2	6	2660834	2660839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822153
52253	NC_020229	TTA	2	6	2660844	2660849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822153
52254	NC_020229	GTC	3	9	2660877	2660885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822153
52255	NC_020229	CTC	2	6	2660996	2661001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448822153
52256	NC_020229	CT	3	6	2661005	2661010	0 %	50 %	0 %	50 %	448822153
52257	NC_020229	TGC	2	6	2661019	2661024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822153
52258	NC_020229	GATC	2	8	2661028	2661035	25 %	25 %	25 %	25 %	448822153
52259	NC_020229	CAA	2	6	2661062	2661067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822153
52260	NC_020229	GAA	2	6	2661170	2661175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822154
52261	NC_020229	CAA	2	6	2661347	2661352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822154
52262	NC_020229	A	6	6	2661398	2661403	100 %	0 %	0 %	0 %	448822154
52263	NC_020229	AATT	2	8	2661453	2661460	50 %	50 %	0 %	0 %	448822154
52264	NC_020229	CAG	2	6	2661505	2661510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822155
52265	NC_020229	CAAAC	2	10	2661555	2661564	60 %	0 %	0 %	40 %	448822155
52266	NC_020229	TG	3	6	2661677	2661682	0 %	50 %	50 %	0 %	448822155
52267	NC_020229	TGA	2	6	2661713	2661718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822155
52268	NC_020229	AAC	2	6	2661755	2661760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822155
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52271	NC_020229	A	6	6	2661811	2661816	100 %	0 %	0 %	0 %	448822155
52272	NC_020229	CG	3	6	2661846	2661851	0 %	0 %	50 %	50 %	448822155
52273	NC_020229	ATT	2	6	2661895	2661900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822155
52274	NC_020229	CTCAT	2	10	2662034	2662043	20 %	40 %	0 %	40 %	448822155
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52277	NC_020229	CAT	3	9	2662087	2662095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822155
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52279	NC_020229	ATC	2	6	2662205	2662210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822155
52280	NC_020229	CGAC	2	8	2662254	2662261	25 %	0 %	25 %	50 %	448822155
52281	NC_020229	ACGGTC	2	12	2662273	2662284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	448822155
52282	NC_020229	AGG	3	9	2662331	2662339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448822155
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52285	NC_020229	TTAT	2	8	2662378	2662385	25 %	75 %	0 %	0 %	448822156
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52292	NC_020229	TCAC	2	8	2662562	2662569	25 %	25 %	0 %	50 %	448822156
52293	NC_020229	TCA	3	9	2662668	2662676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822156
52294	NC_020229	TAC	2	6	2662688	2662693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822156
52295	NC_020229	TGA	2	6	2662737	2662742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822156
52296	NC_020229	TAGC	2	8	2662800	2662807	25 %	25 %	25 %	25 %	448822156
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52298	NC_020229	TTA	2	6	2662935	2662940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822156
52299	NC_020229	TCA	2	6	2662953	2662958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822156
52300	NC_020229	CAAT	2	8	2662969	2662976	50 %	25 %	0 %	25 %	448822156
52301	NC_020229	CTT	2	6	2663005	2663010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822156
52302	NC_020229	TAT	2	6	2663017	2663022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822156
52303	NC_020229	TCA	2	6	2663079	2663084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822156
52304	NC_020229	ATC	2	6	2663105	2663110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822156
52305	NC_020229	GGT	2	6	2663111	2663116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822156
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52307	NC_020229	T	6	6	2663217	2663222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52308	NC_020229	CAT	2	6	2663403	2663408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822157
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52311	NC_020229	TTG	2	6	2663694	2663699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822157
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52313	NC_020229	TA	3	6	2663812	2663817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52314	NC_020229	AACT	2	8	2663818	2663825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52315	NC_020229	CAG	2	6	2663838	2663843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52316	NC_020229	ATA	2	6	2663871	2663876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52317	NC_020229	ACA	2	6	2663880	2663885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52318	NC_020229	CTTT	2	8	2663952	2663959	0 %	75 %	0 %	25 %	448822158
52319	NC_020229	GCCA	2	8	2663982	2663989	25 %	0 %	25 %	50 %	448822158
52320	NC_020229	ATC	2	6	2664154	2664159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822158
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52322	NC_020229	TAA	2	6	2664232	2664237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52323	NC_020229	AAC	2	6	2664279	2664284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822159
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52331	NC_020229	TATT	2	8	2664651	2664658	25 %	75 %	0 %	0 %	448822159
52332	NC_020229	CGT	2	6	2664708	2664713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52333	NC_020229	TTATT	2	10	2664741	2664750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52334	NC_020229	ATA	2	6	2664752	2664757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52335	NC_020229	T	6	6	2664772	2664777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52336	NC_020229	ACTTA	2	10	2664783	2664792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52337	NC_020229	CTA	2	6	2664794	2664799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52338	NC_020229	CAT	2	6	2664868	2664873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822160
52339	NC_020229	A	6	6	2664898	2664903	100 %	0 %	0 %	0 %	448822160
52340	NC_020229	TGA	2	6	2664947	2664952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822160
52341	NC_020229	CGT	2	6	2664983	2664988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822160
52342	NC_020229	TTG	2	6	2665049	2665054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822160
52343	NC_020229	CGG	2	6	2665067	2665072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822160
52344	NC_020229	ACAA	2	8	2665081	2665088	75 %	0 %	0 %	25 %	448822160
52345	NC_020229	CAT	2	6	2665093	2665098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822160
52346	NC_020229	TAAAA	2	10	2665153	2665162	80 %	20 %	0 %	0 %	448822160
52347	NC_020229	TCAG	2	8	2665236	2665243	25 %	25 %	25 %	25 %	448822160
52348	NC_020229	T	6	6	2665383	2665388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52349	NC_020229	AATTA	2	10	2665400	2665409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52350	NC_020229	TGA	2	6	2665466	2665471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822161
52351	NC_020229	CTA	2	6	2665507	2665512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822161
52352	NC_020229	ACCA	2	8	2665513	2665520	50 %	0 %	0 %	50 %	448822161
52353	NC_020229	CTA	2	6	2665531	2665536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822161
52354	NC_020229	CAA	2	6	2665588	2665593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822161
52355	NC_020229	GAA	2	6	2665701	2665706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822161
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52357	NC_020229	ACA	2	6	2665800	2665805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52358	NC_020229	AGG	2	6	2665933	2665938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52359	NC_020229	T	7	7	2665982	2665988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52363	NC_020229	CGA	2	6	2666080	2666085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52365	NC_020229	T	6	6	2666155	2666160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52366	NC_020229	GCC	2	6	2666203	2666208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822162
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52369	NC_020229	CG	3	6	2666346	2666351	0 %	0 %	50 %	50 %	448822162
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52373	NC_020229	CAT	2	6	2666561	2666566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822162
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52377	NC_020229	TCTTCA	2	12	2666800	2666811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	448822162
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52384	NC_020229	TGC	2	6	2667345	2667350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822162
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52452	NC_020229	T	7	7	2669709	2669715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52453	NC_020229	GGC	2	6	2669734	2669739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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52464	NC_020229	GTTGA	2	10	2670345	2670354	20 %	40 %	40 %	0 %	448822166
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52467	NC_020229	CAC	2	6	2670491	2670496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822166
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52471	NC_020229	GCCA	2	8	2670701	2670708	25 %	0 %	25 %	50 %	448822166
52472	NC_020229	CG	3	6	2670824	2670829	0 %	0 %	50 %	50 %	448822166
52473	NC_020229	GATC	2	8	2670896	2670903	25 %	25 %	25 %	25 %	448822166
52474	NC_020229	ATC	2	6	2670978	2670983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822166
52475	NC_020229	CCA	2	6	2671012	2671017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822166
52476	NC_020229	AT	3	6	2671171	2671176	50 %	50 %	0 %	0 %	448822166
52477	NC_020229	CGT	2	6	2671220	2671225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822166
52478	NC_020229	AAG	2	6	2671228	2671233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822166
52479	NC_020229	ACC	2	6	2671291	2671296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822166
52480	NC_020229	CGT	2	6	2671317	2671322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822166
52481	NC_020229	CCG	2	6	2671368	2671373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822166
52482	NC_020229	TGT	2	6	2671383	2671388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822166
52483	NC_020229	CTT	2	6	2671391	2671396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822166
52484	NC_020229	TAAG	2	8	2671401	2671408	50 %	25 %	25 %	0 %	448822166
52485	NC_020229	CAAA	2	8	2671415	2671422	75 %	0 %	0 %	25 %	448822166
52486	NC_020229	ATT	2	6	2671569	2671574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52487	NC_020229	TCA	2	6	2671733	2671738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822167
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52489	NC_020229	ACCG	2	8	2671795	2671802	25 %	0 %	25 %	50 %	448822167
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52491	NC_020229	CTT	2	6	2671870	2671875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822167
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52493	NC_020229	TGA	2	6	2671936	2671941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822167
52494	NC_020229	CAG	2	6	2671973	2671978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822167
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52496	NC_020229	TGA	2	6	2672049	2672054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822167
52497	NC_020229	CAT	2	6	2672167	2672172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822167
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52499	NC_020229	CAG	2	6	2672213	2672218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822167
52500	NC_020229	GTT	2	6	2672249	2672254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822167

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