MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 62849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_020229	AAT	2	6	2544590	2544595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50002	NC_020229	T	7	7	2544612	2544618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50003	NC_020229	ATA	2	6	2544654	2544659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50004	NC_020229	ACT	2	6	2544690	2544695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50005	NC_020229	ACT	2	6	2544713	2544718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50006	NC_020229	AGG	2	6	2544730	2544735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50007	NC_020229	TTA	2	6	2544766	2544771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50008	NC_020229	GTC	2	6	2544784	2544789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50009	NC_020229	TCAA	2	8	2544815	2544822	50 %	25 %	0 %	25 %	448822039
50010	NC_020229	ATT	2	6	2544922	2544927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50011	NC_020229	ATG	2	6	2544944	2544949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822039
50012	NC_020229	CTTTCG	2	12	2544997	2545008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	448822039
50013	NC_020229	TTG	2	6	2545037	2545042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822039
50014	NC_020229	TCAC	2	8	2545049	2545056	25 %	25 %	0 %	50 %	448822039
50015	NC_020229	TAT	2	6	2545104	2545109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50016	NC_020229	GAC	2	6	2545176	2545181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50017	NC_020229	TGC	2	6	2545242	2545247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50018	NC_020229	TCG	2	6	2545319	2545324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50019	NC_020229	ATC	2	6	2545330	2545335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822039
50020	NC_020229	TTG	2	6	2545346	2545351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822039
50021	NC_020229	GTC	2	6	2545429	2545434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50022	NC_020229	TGT	2	6	2545476	2545481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822039
50023	NC_020229	TCAT	2	8	2545493	2545500	25 %	50 %	0 %	25 %	448822039
50024	NC_020229	TTA	2	6	2545606	2545611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50025	NC_020229	GT	3	6	2545613	2545618	0 %	50 %	50 %	0 %	448822039
50026	NC_020229	TCA	2	6	2545631	2545636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822039
50027	NC_020229	CG	3	6	2545756	2545761	0 %	0 %	50 %	50 %	448822039
50028	NC_020229	GCG	2	6	2545808	2545813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822039
50029	NC_020229	ATT	2	6	2545894	2545899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50030	NC_020229	CTG	2	6	2545930	2545935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50031	NC_020229	GTT	2	6	2545975	2545980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822039
50032	NC_020229	TAA	2	6	2546061	2546066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822039
50033	NC_020229	GTC	2	6	2546120	2546125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50034	NC_020229	CAA	2	6	2546202	2546207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822039
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50036	NC_020229	CAA	2	6	2546272	2546277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822039
50037	NC_020229	TTC	2	6	2546281	2546286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822039
50038	NC_020229	ATT	2	6	2546298	2546303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822039
50039	NC_020229	A	6	6	2546338	2546343	100 %	0 %	0 %	0 %	448822039
50040	NC_020229	GTG	2	6	2546384	2546389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822039
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50042	NC_020229	CTG	2	6	2546501	2546506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822039
50043	NC_020229	CGC	2	6	2546533	2546538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822039
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50045	NC_020229	CGC	2	6	2546557	2546562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822039
50046	NC_020229	TTCA	2	8	2546635	2546642	25 %	50 %	0 %	25 %	448822039
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50049	NC_020229	CAA	2	6	2546857	2546862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822040
50050	NC_020229	C	6	6	2546864	2546869	0 %	0 %	0 %	100 %	448822040
50051	NC_020229	T	6	6	2546920	2546925	0 %	100 %	0 %	0 %	448822040
50052	NC_020229	AAACA	2	10	2546938	2546947	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50053	NC_020229	ATGA	2	8	2546992	2546999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50054	NC_020229	GATA	2	8	2547010	2547017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50055	NC_020229	GCCG	2	8	2547050	2547057	0 %	0 %	50 %	50 %	448822041
50056	NC_020229	ACGTC	2	10	2547107	2547116	20 %	20 %	20 %	40 %	448822041
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50059	NC_020229	GCTTG	2	10	2547282	2547291	0 %	40 %	40 %	20 %	448822041
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50091	NC_020229	TGT	2	6	2548822	2548827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50101	NC_020229	CGG	2	6	2549262	2549267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822043
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50103	NC_020229	CCAA	2	8	2549324	2549331	50 %	0 %	0 %	50 %	448822043
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50110	NC_020229	T	6	6	2549803	2549808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50111	NC_020229	AATT	2	8	2549819	2549826	50 %	50 %	0 %	0 %	448822044
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50113	NC_020229	GA	3	6	2549954	2549959	50 %	0 %	50 %	0 %	448822044
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50116	NC_020229	CCAA	2	8	2550232	2550239	50 %	0 %	0 %	50 %	448822044
50117	NC_020229	ACCA	2	8	2550272	2550279	50 %	0 %	0 %	50 %	448822044
50118	NC_020229	CAAC	2	8	2550294	2550301	50 %	0 %	0 %	50 %	448822044
50119	NC_020229	GAA	2	6	2550370	2550375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822044
50120	NC_020229	AAT	2	6	2550449	2550454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822044
50121	NC_020229	CAAT	2	8	2550525	2550532	50 %	25 %	0 %	25 %	448822044
50122	NC_020229	ACT	2	6	2550583	2550588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822044
50123	NC_020229	AT	3	6	2550609	2550614	50 %	50 %	0 %	0 %	448822045
50124	NC_020229	ATA	2	6	2550623	2550628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822045
50125	NC_020229	CCATG	2	10	2550640	2550649	20 %	20 %	20 %	40 %	448822045
50126	NC_020229	TCG	2	6	2550651	2550656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822045
50127	NC_020229	TGA	2	6	2550675	2550680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822045
50128	NC_020229	ACA	2	6	2550681	2550686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822045
50129	NC_020229	TCA	2	6	2550714	2550719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822045
50130	NC_020229	AAT	2	6	2550759	2550764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822045
50131	NC_020229	ATA	2	6	2550789	2550794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822045
50132	NC_020229	TAA	2	6	2550799	2550804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822045
50133	NC_020229	T	7	7	2550805	2550811	0 %	100 %	0 %	0 %	448822045
50134	NC_020229	TAA	2	6	2550848	2550853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822045
50135	NC_020229	TGT	2	6	2550933	2550938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822045
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50137	NC_020229	CTG	2	6	2551076	2551081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822045
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50139	NC_020229	CTC	2	6	2551302	2551307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448822046
50140	NC_020229	TTG	2	6	2551323	2551328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822046
50141	NC_020229	GTGC	2	8	2551364	2551371	0 %	25 %	50 %	25 %	448822046
50142	NC_020229	GCTAAT	2	12	2551384	2551395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	448822046
50143	NC_020229	ATA	2	6	2551426	2551431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822046
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50145	NC_020229	ATTAAC	2	12	2551524	2551535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	448822046
50146	NC_020229	TGG	2	6	2551581	2551586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822046
50147	NC_020229	TTTGA	2	10	2551623	2551632	20 %	60 %	20 %	0 %	448822046
50148	NC_020229	TAA	2	6	2551633	2551638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822046
50149	NC_020229	TCA	2	6	2551651	2551656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822046
50150	NC_020229	CCT	2	6	2551673	2551678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50151	NC_020229	AAT	2	6	2551729	2551734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50152	NC_020229	A	6	6	2551857	2551862	100 %	0 %	0 %	0 %	448822047
50153	NC_020229	ACA	2	6	2551938	2551943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822047
50154	NC_020229	ACC	2	6	2551985	2551990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822047
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50156	NC_020229	ACT	2	6	2552023	2552028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822047
50157	NC_020229	G	6	6	2552030	2552035	0 %	0 %	100 %	0 %	448822047
50158	NC_020229	CCG	2	6	2552054	2552059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822047
50159	NC_020229	GTTT	2	8	2552200	2552207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50160	NC_020229	ATC	2	6	2552229	2552234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50162	NC_020229	ATT	2	6	2552397	2552402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822048
50163	NC_020229	TTGA	2	8	2552409	2552416	25 %	50 %	25 %	0 %	448822048
50164	NC_020229	TTGA	2	8	2552457	2552464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50165	NC_020229	GTG	2	6	2552573	2552578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50166	NC_020229	CAC	2	6	2552661	2552666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50167	NC_020229	AACT	2	8	2552710	2552717	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50168	NC_020229	GCTG	2	8	2552760	2552767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50169	NC_020229	CAAG	2	8	2552827	2552834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50170	NC_020229	GCG	2	6	2552866	2552871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822049
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50172	NC_020229	ACCA	2	8	2552932	2552939	50 %	0 %	0 %	50 %	448822049
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50181	NC_020229	CCAG	2	8	2553350	2553357	25 %	0 %	25 %	50 %	448822049
50182	NC_020229	CAC	2	6	2553386	2553391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822049
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50190	NC_020229	TTC	2	6	2553757	2553762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822049
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50195	NC_020229	CTT	2	6	2553872	2553877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50196	NC_020229	TGG	2	6	2553922	2553927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822050
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50221	NC_020229	CGG	2	6	2555759	2555764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822051
50222	NC_020229	TCAA	2	8	2555768	2555775	50 %	25 %	0 %	25 %	448822051
50223	NC_020229	GAC	2	6	2555793	2555798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822051
50224	NC_020229	CCTA	2	8	2555855	2555862	25 %	25 %	0 %	50 %	448822051
50225	NC_020229	AAG	2	6	2555927	2555932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822051
50226	NC_020229	GATG	2	8	2556027	2556034	25 %	25 %	50 %	0 %	448822051
50227	NC_020229	TTAC	2	8	2556036	2556043	25 %	50 %	0 %	25 %	448822051
50228	NC_020229	AAG	2	6	2556083	2556088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822051
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50230	NC_020229	T	6	6	2556118	2556123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50231	NC_020229	AAG	2	6	2556133	2556138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822052
50232	NC_020229	A	6	6	2556150	2556155	100 %	0 %	0 %	0 %	448822052
50233	NC_020229	AAGC	2	8	2556166	2556173	50 %	0 %	25 %	25 %	448822052
50234	NC_020229	GAT	2	6	2556223	2556228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822052
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50236	NC_020229	CAA	2	6	2556298	2556303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822052
50237	NC_020229	TGA	2	6	2556324	2556329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822052
50238	NC_020229	ATCA	2	8	2556355	2556362	50 %	25 %	0 %	25 %	448822052
50239	NC_020229	CTG	2	6	2556383	2556388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822052
50240	NC_020229	AC	3	6	2556640	2556645	50 %	0 %	0 %	50 %	448822052
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50244	NC_020229	TTAAA	2	10	2556987	2556996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50245	NC_020229	T	6	6	2557062	2557067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50246	NC_020229	ATTC	2	8	2557073	2557080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50247	NC_020229	TTG	2	6	2557115	2557120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822053
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50262	NC_020229	TTCG	2	8	2558297	2558304	0 %	50 %	25 %	25 %	448822055
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50335	NC_020229	AGTA	2	8	2562017	2562024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50336	NC_020229	TTG	2	6	2562042	2562047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822059
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50338	NC_020229	GCT	2	6	2562074	2562079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822059
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50340	NC_020229	CCA	2	6	2562299	2562304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822059
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50347	NC_020229	TGC	2	6	2562748	2562753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822059
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50353	NC_020229	CG	3	6	2562996	2563001	0 %	0 %	50 %	50 %	448822059
50354	NC_020229	TCT	2	6	2563083	2563088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822059
50355	NC_020229	CAT	2	6	2563089	2563094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822059
50356	NC_020229	AG	3	6	2563201	2563206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50357	NC_020229	A	7	7	2563227	2563233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50358	NC_020229	GCC	2	6	2563234	2563239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50359	NC_020229	ACC	2	6	2563267	2563272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50361	NC_020229	ATT	2	6	2563313	2563318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50362	NC_020229	TTCATC	2	12	2563383	2563394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50365	NC_020229	ATA	3	9	2563501	2563509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50366	NC_020229	A	6	6	2563543	2563548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50367	NC_020229	ACC	2	6	2563568	2563573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50374	NC_020229	TACCT	2	10	2564025	2564034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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50414	NC_020229	CG	3	6	2566092	2566097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50415	NC_020229	ATC	2	6	2566151	2566156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822063
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50419	NC_020229	ATTTTG	2	12	2566300	2566311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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50471	NC_020229	GTT	2	6	2569172	2569177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
50472	NC_020229	CAC	2	6	2569245	2569250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822067
50473	NC_020229	GTAAC	2	10	2569288	2569297	40 %	20 %	20 %	20 %	448822067
50474	NC_020229	GTC	2	6	2569313	2569318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822067
50475	NC_020229	TCA	2	6	2569469	2569474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822067
50476	NC_020229	TTGC	2	8	2569607	2569614	0 %	50 %	25 %	25 %	448822067
50477	NC_020229	TTA	3	9	2569682	2569690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822067
50478	NC_020229	GTT	3	9	2569697	2569705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
50479	NC_020229	ATC	2	6	2569712	2569717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822067
50480	NC_020229	ACCG	2	8	2569768	2569775	25 %	0 %	25 %	50 %	448822067
50481	NC_020229	TTA	2	6	2569925	2569930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822067
50482	NC_020229	CTT	2	6	2569962	2569967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822067
50483	NC_020229	ATG	2	6	2569997	2570002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822067
50484	NC_020229	TTG	2	6	2570047	2570052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
50485	NC_020229	CCATT	2	10	2570201	2570210	20 %	40 %	0 %	40 %	448822067
50486	NC_020229	GATT	2	8	2570227	2570234	25 %	50 %	25 %	0 %	448822067
50487	NC_020229	GTT	2	6	2570266	2570271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
50488	NC_020229	CAT	2	6	2570434	2570439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822067
50489	NC_020229	TGA	2	6	2570443	2570448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822067
50490	NC_020229	GCC	2	6	2570462	2570467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822067
50491	NC_020229	GCTT	2	8	2570519	2570526	0 %	50 %	25 %	25 %	448822067
50492	NC_020229	TGGCT	2	10	2570658	2570667	0 %	40 %	40 %	20 %	448822067
50493	NC_020229	CCG	2	6	2570727	2570732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822067
50494	NC_020229	AGC	2	6	2570740	2570745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822067
50495	NC_020229	GGA	2	6	2570773	2570778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448822067
50496	NC_020229	GTA	2	6	2570855	2570860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822067
50497	NC_020229	CGT	3	9	2570863	2570871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822067
50498	NC_020229	TTG	2	6	2570980	2570985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
50499	NC_020229	AGC	2	6	2570998	2571003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822067
50500	NC_020229	GCA	2	6	2571075	2571080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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