MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 5701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020130	A	6	6	170335	170340	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5002	NC_020130	AGA	2	6	170352	170357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5003	NC_020130	TCA	2	6	170380	170385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
5004	NC_020130	A	6	6	170407	170412	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5005	NC_020130	TAGTGA	2	12	170445	170456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5006	NC_020130	AAG	2	6	170471	170476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5007	NC_020130	AGT	2	6	170512	170517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5008	NC_020130	CA	3	6	170549	170554	50 %	0 %	0 %	50 %	442556617
5009	NC_020130	AGAAAA	2	12	170558	170569	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556617
5010	NC_020130	A	6	6	170581	170586	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5011	NC_020130	A	6	6	170606	170611	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5012	NC_020130	AG	3	6	170624	170629	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5013	NC_020130	AAGT	2	8	170687	170694	50 %	25 %	25 %	0 %	442556617
5014	NC_020130	A	7	7	170708	170714	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5015	NC_020130	AGA	2	6	170730	170735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5016	NC_020130	AG	4	8	170748	170755	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5017	NC_020130	T	6	6	170761	170766	0 %	100 %	0 %	0 %	442556617
5018	NC_020130	AGC	2	6	170778	170783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5019	NC_020130	ACA	3	9	170805	170813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5020	NC_020130	AAC	2	6	170873	170878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5021	NC_020130	TAA	2	6	170918	170923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556617
5022	NC_020130	AAC	2	6	170924	170929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5023	NC_020130	AG	4	8	170937	170944	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5024	NC_020130	TTC	2	6	170952	170957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556617
5025	NC_020130	TCA	3	9	170968	170976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
5026	NC_020130	ATA	2	6	170986	170991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556617
5027	NC_020130	TGA	2	6	171009	171014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5028	NC_020130	AAG	2	6	171017	171022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5029	NC_020130	CCA	2	6	171052	171057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556617
5030	NC_020130	TCC	2	6	171063	171068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556617
5031	NC_020130	AGG	2	6	171096	171101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556617
5032	NC_020130	TCT	2	6	171106	171111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556617
5033	NC_020130	ATC	2	6	171168	171173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
5034	NC_020130	A	6	6	171178	171183	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5035	NC_020130	GAA	2	6	171184	171189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5036	NC_020130	TGG	2	6	171192	171197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556617
5037	NC_020130	AATC	2	8	171199	171206	50 %	25 %	0 %	25 %	442556617
5038	NC_020130	G	6	6	171249	171254	0 %	0 %	100 %	0 %	442556617
5039	NC_020130	CTG	3	9	171257	171265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5040	NC_020130	TCT	3	9	171274	171282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556617
5041	NC_020130	GTA	2	6	171296	171301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5042	NC_020130	ACA	2	6	171306	171311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5043	NC_020130	A	6	6	171439	171444	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5044	NC_020130	GAT	2	6	171457	171462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5045	NC_020130	A	6	6	171479	171484	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5046	NC_020130	A	7	7	171492	171498	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5047	NC_020130	AAG	2	6	171511	171516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5048	NC_020130	ACA	2	6	171520	171525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5049	NC_020130	GAGGAA	2	12	171526	171537	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5050	NC_020130	AGAAA	2	10	171569	171578	80 %	0 %	20 %	0 %	442556617
5051	NC_020130	A	6	6	171576	171581	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5052	NC_020130	AGA	4	12	171609	171620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5053	NC_020130	T	6	6	171624	171629	0 %	100 %	0 %	0 %	442556617
5054	NC_020130	AG	3	6	171637	171642	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5055	NC_020130	A	6	6	171649	171654	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5056	NC_020130	TTC	2	6	171659	171664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556617
5057	NC_020130	AAG	2	6	171671	171676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5058	NC_020130	GCT	2	6	171688	171693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5059	NC_020130	TTG	2	6	171718	171723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556617
5060	NC_020130	AAC	2	6	171731	171736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5061	NC_020130	GA	3	6	171739	171744	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5062	NC_020130	ATC	2	6	171761	171766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
5063	NC_020130	GAA	2	6	171789	171794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5064	NC_020130	A	6	6	171793	171798	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5065	NC_020130	AAG	2	6	171826	171831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5066	NC_020130	AGA	2	6	171858	171863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5067	NC_020130	ACA	2	6	171864	171869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5068	NC_020130	AAAG	2	8	171874	171881	75 %	0 %	25 %	0 %	442556617
5069	NC_020130	GCA	2	6	171933	171938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5070	NC_020130	GAA	2	6	171940	171945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5071	NC_020130	AGA	2	6	171978	171983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5072	NC_020130	AAG	2	6	171988	171993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5073	NC_020130	GAA	2	6	172009	172014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5074	NC_020130	AAGA	2	8	172073	172080	75 %	0 %	25 %	0 %	442556617
5075	NC_020130	AGT	2	6	172117	172122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
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5078	NC_020130	AAG	2	6	172220	172225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5079	NC_020130	AAG	2	6	172238	172243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5080	NC_020130	TAG	2	6	172244	172249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5081	NC_020130	CAGAAG	2	12	172253	172264	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	442556617
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5083	NC_020130	GAT	2	6	172375	172380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5084	NC_020130	AGTACT	2	12	172390	172401	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556617
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5086	NC_020130	GAA	2	6	172451	172456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5087	NC_020130	AAG	2	6	172466	172471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5088	NC_020130	AAGT	2	8	172479	172486	50 %	25 %	25 %	0 %	442556617
5089	NC_020130	GTA	2	6	172496	172501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5090	NC_020130	CAT	2	6	172505	172510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
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5092	NC_020130	AGA	2	6	172586	172591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5093	NC_020130	A	7	7	172591	172597	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5094	NC_020130	A	7	7	172599	172605	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5095	NC_020130	GAA	2	6	172618	172623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5096	NC_020130	CAG	2	6	172636	172641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5097	NC_020130	A	6	6	172663	172668	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
5098	NC_020130	CGT	2	6	172669	172674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5099	NC_020130	TTA	2	6	172675	172680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556617
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5101	NC_020130	CAT	2	6	172756	172761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
5102	NC_020130	GAA	2	6	172762	172767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5103	NC_020130	ACA	2	6	172776	172781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5104	NC_020130	GA	3	6	172815	172820	50 %	0 %	50 %	0 %	442556617
5105	NC_020130	ACA	2	6	172821	172826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
5106	NC_020130	ACC	2	6	172873	172878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556617
5107	NC_020130	GT	3	6	172907	172912	0 %	50 %	50 %	0 %	442556617
5108	NC_020130	AGA	2	6	172934	172939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
5109	NC_020130	GGT	2	6	172942	172947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556617
5110	NC_020130	CCTGAT	2	12	172960	172971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	442556617
5111	NC_020130	GGA	2	6	172972	172977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556617
5112	NC_020130	AGT	2	6	172987	172992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5113	NC_020130	TAT	2	6	173011	173016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556617
5114	NC_020130	CAG	2	6	173021	173026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556617
5115	NC_020130	CAT	2	6	173060	173065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556617
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5117	NC_020130	TG	3	6	173197	173202	0 %	50 %	50 %	0 %	442556617
5118	NC_020130	AGT	2	6	173260	173265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
5119	NC_020130	TCAG	2	8	173301	173308	25 %	25 %	25 %	25 %	442556617
5120	NC_020130	TGT	2	6	173311	173316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556617
5121	NC_020130	GCT	2	6	173341	173346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556617
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5123	NC_020130	GTA	2	6	173462	173467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
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5146	NC_020130	TAG	2	6	174695	174700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_020130	GTA	2	6	174896	174901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_020130	TA	3	6	178200	178205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_020130	AAG	2	6	178207	178212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_020130	TAA	2	6	178253	178258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_020130	AGT	2	6	178290	178295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5247	NC_020130	A	6	6	178315	178320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_020130	TAAT	2	8	178322	178329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_020130	GAG	2	6	178372	178377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_020130	GTT	2	6	178384	178389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_020130	GAG	2	6	178436	178441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_020130	TAG	2	6	178456	178461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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