MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_020127	AT	3	6	1453402	1453407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39002	NC_020127	TAA	2	6	1453490	1453495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39003	NC_020127	TAAA	2	8	1453500	1453507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39004	NC_020127	AATA	2	8	1453552	1453559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39005	NC_020127	TAT	2	6	1453562	1453567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39006	NC_020127	A	6	6	1453568	1453573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39007	NC_020127	TCCC	2	8	1453683	1453690	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39008	NC_020127	TATT	2	8	1453730	1453737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39009	NC_020127	GAT	2	6	1453759	1453764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39010	NC_020127	TAT	2	6	1453778	1453783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39011	NC_020127	AGG	2	6	1453817	1453822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39012	NC_020127	GAG	2	6	1453853	1453858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39013	NC_020127	AT	3	6	1453875	1453880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39014	NC_020127	TTA	2	6	1453934	1453939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39015	NC_020127	CTA	2	6	1453946	1453951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39016	NC_020127	TATT	2	8	1453981	1453988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39017	NC_020127	TTA	2	6	1454011	1454016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39018	NC_020127	TAT	2	6	1454020	1454025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_020127	T	7	7	1454084	1454090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39020	NC_020127	T	6	6	1454110	1454115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39021	NC_020127	AGC	2	6	1454136	1454141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39022	NC_020127	TA	4	8	1454146	1454153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39023	NC_020127	AAT	2	6	1454162	1454167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39024	NC_020127	T	6	6	1454181	1454186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39025	NC_020127	GTT	2	6	1454206	1454211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39026	NC_020127	T	7	7	1454210	1454216	0 %	100 %	0 %	0 %	442556476
39027	NC_020127	T	7	7	1454225	1454231	0 %	100 %	0 %	0 %	442556476
39028	NC_020127	T	8	8	1454238	1454245	0 %	100 %	0 %	0 %	442556476
39029	NC_020127	TAG	2	6	1454280	1454285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556476
39030	NC_020127	CTT	2	6	1454343	1454348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556476
39031	NC_020127	A	6	6	1454350	1454355	100 %	0 %	0 %	0 %	442556476
39032	NC_020127	ATT	2	6	1454396	1454401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556476
39033	NC_020127	AAG	2	6	1454416	1454421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556476
39034	NC_020127	AAC	2	6	1454446	1454451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556476
39035	NC_020127	AGC	2	6	1454452	1454457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556476
39036	NC_020127	ACC	2	6	1454461	1454466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556476
39037	NC_020127	TTG	2	6	1454469	1454474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556476
39038	NC_020127	GTT	2	6	1454520	1454525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556476
39039	NC_020127	AAG	2	6	1454611	1454616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556476
39040	NC_020127	ACT	2	6	1454647	1454652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556476
39041	NC_020127	TA	3	6	1454659	1454664	50 %	50 %	0 %	0 %	442556476
39042	NC_020127	T	6	6	1454675	1454680	0 %	100 %	0 %	0 %	442556476
39043	NC_020127	TAA	2	6	1454715	1454720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556476
39044	NC_020127	GTAAT	2	10	1454727	1454736	40 %	40 %	20 %	0 %	442556476
39045	NC_020127	TGG	2	6	1454761	1454766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556476
39046	NC_020127	AT	3	6	1454831	1454836	50 %	50 %	0 %	0 %	442556476
39047	NC_020127	ACT	2	6	1454859	1454864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39048	NC_020127	TA	3	6	1454873	1454878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39049	NC_020127	TTAT	2	8	1454886	1454893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39050	NC_020127	ATA	2	6	1454900	1454905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39051	NC_020127	AATGTT	2	12	1454917	1454928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39052	NC_020127	AT	3	6	1454957	1454962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39053	NC_020127	TCTA	2	8	1454977	1454984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39054	NC_020127	TAAGC	2	10	1455035	1455044	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39055	NC_020127	ACA	2	6	1455053	1455058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39056	NC_020127	AGA	3	9	1455071	1455079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39057	NC_020127	AT	3	6	1455120	1455125	50 %	50 %	0 %	0 %	442556477
39058	NC_020127	TGT	2	6	1455150	1455155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556477
39059	NC_020127	T	7	7	1455185	1455191	0 %	100 %	0 %	0 %	442556477
39060	NC_020127	CTACAC	2	12	1455194	1455205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556477
39061	NC_020127	TAA	2	6	1455219	1455224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556477
39062	NC_020127	AGA	3	9	1455411	1455419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
39063	NC_020127	AGA	2	6	1455455	1455460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
39064	NC_020127	TAC	2	6	1455516	1455521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556477
39065	NC_020127	TCT	2	6	1455523	1455528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556477
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39067	NC_020127	AT	3	6	1455560	1455565	50 %	50 %	0 %	0 %	442556477
39068	NC_020127	AGA	2	6	1455597	1455602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
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39070	NC_020127	AAT	2	6	1455710	1455715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556478
39071	NC_020127	TCT	2	6	1455720	1455725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556478
39072	NC_020127	TGA	2	6	1455731	1455736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556478
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39074	NC_020127	GAT	2	6	1455783	1455788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556478
39075	NC_020127	AAG	2	6	1455799	1455804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556478
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39081	NC_020127	GTCCT	2	10	1455961	1455970	0 %	40 %	20 %	40 %	442556478
39082	NC_020127	GCA	2	6	1455990	1455995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556478
39083	NC_020127	TGA	2	6	1456034	1456039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556478
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39086	NC_020127	AATTG	2	10	1456145	1456154	40 %	40 %	20 %	0 %	442556478
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39090	NC_020127	ATT	2	6	1456272	1456277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556478
39091	NC_020127	A	6	6	1456314	1456319	100 %	0 %	0 %	0 %	442556478
39092	NC_020127	TTA	2	6	1456374	1456379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556478
39093	NC_020127	CTT	2	6	1456500	1456505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556478
39094	NC_020127	CTTAT	2	10	1456606	1456615	20 %	60 %	0 %	20 %	442556478
39095	NC_020127	C	6	6	1456639	1456644	0 %	0 %	0 %	100 %	442556478
39096	NC_020127	ATTTAA	2	12	1456678	1456689	50 %	50 %	0 %	0 %	442556478
39097	NC_020127	AT	3	6	1456710	1456715	50 %	50 %	0 %	0 %	442556479
39098	NC_020127	ATT	2	6	1456740	1456745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556479
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39103	NC_020127	CTT	2	6	1456834	1456839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556479
39104	NC_020127	CATT	2	8	1456879	1456886	25 %	50 %	0 %	25 %	442556479
39105	NC_020127	GTG	2	6	1456943	1456948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556479
39106	NC_020127	CAG	2	6	1457002	1457007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556479
39107	NC_020127	TGGA	2	8	1457021	1457028	25 %	25 %	50 %	0 %	442556479
39108	NC_020127	AT	3	6	1457040	1457045	50 %	50 %	0 %	0 %	442556479
39109	NC_020127	TCC	2	6	1457049	1457054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556479
39110	NC_020127	GA	3	6	1457104	1457109	50 %	0 %	50 %	0 %	442556479
39111	NC_020127	AG	3	6	1457125	1457130	50 %	0 %	50 %	0 %	442556479
39112	NC_020127	CTT	2	6	1457165	1457170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556479
39113	NC_020127	GTTT	2	8	1457187	1457194	0 %	75 %	25 %	0 %	442556479
39114	NC_020127	AGC	2	6	1457202	1457207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556479
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39117	NC_020127	T	6	6	1457254	1457259	0 %	100 %	0 %	0 %	442556479
39118	NC_020127	TGT	2	6	1457269	1457274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556479
39119	NC_020127	ATG	2	6	1457311	1457316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556479
39120	NC_020127	TA	3	6	1457444	1457449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39122	NC_020127	T	11	11	1457495	1457505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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