MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_020127	TAT	2	6	1416416	1416421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38002	NC_020127	GTA	2	6	1416428	1416433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38003	NC_020127	GAG	2	6	1416454	1416459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38004	NC_020127	CAG	2	6	1416528	1416533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556445
38005	NC_020127	AGT	2	6	1416683	1416688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556445
38006	NC_020127	TGGTAG	2	12	1416736	1416747	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	442556445
38007	NC_020127	ACA	2	6	1416769	1416774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556445
38008	NC_020127	ATTG	2	8	1416782	1416789	25 %	50 %	25 %	0 %	442556445
38009	NC_020127	ATA	2	6	1416801	1416806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556445
38010	NC_020127	TGA	2	6	1416853	1416858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556445
38011	NC_020127	ATA	2	6	1416897	1416902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556445
38012	NC_020127	A	6	6	1416921	1416926	100 %	0 %	0 %	0 %	442556445
38013	NC_020127	ATT	2	6	1417068	1417073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38014	NC_020127	A	6	6	1417085	1417090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38015	NC_020127	A	6	6	1417097	1417102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38016	NC_020127	T	6	6	1417108	1417113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38017	NC_020127	AGA	2	6	1417148	1417153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38018	NC_020127	TAA	3	9	1417161	1417169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38019	NC_020127	AGA	2	6	1417172	1417177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38020	NC_020127	AG	3	6	1417182	1417187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38021	NC_020127	ACA	2	6	1417191	1417196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38022	NC_020127	TATT	3	12	1417210	1417221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38023	NC_020127	A	6	6	1417259	1417264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38024	NC_020127	ACA	2	6	1417292	1417297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38025	NC_020127	ATA	2	6	1417316	1417321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38026	NC_020127	A	6	6	1417321	1417326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38027	NC_020127	ATT	2	6	1417388	1417393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38028	NC_020127	TAT	2	6	1417439	1417444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38029	NC_020127	TAA	2	6	1417452	1417457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38030	NC_020127	A	7	7	1417456	1417462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38031	NC_020127	TAT	2	6	1417493	1417498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_020127	GTA	2	6	1417512	1417517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38033	NC_020127	TAA	2	6	1417527	1417532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38034	NC_020127	TATT	2	8	1417543	1417550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38035	NC_020127	TAGT	2	8	1417553	1417560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_020127	TAT	2	6	1417564	1417569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38037	NC_020127	TAT	2	6	1417612	1417617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38038	NC_020127	ATATT	2	10	1417621	1417630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38039	NC_020127	TA	3	6	1417643	1417648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38040	NC_020127	TAT	2	6	1417661	1417666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38041	NC_020127	GTA	2	6	1417711	1417716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38042	NC_020127	AT	3	6	1417717	1417722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38043	NC_020127	GTA	2	6	1417754	1417759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38044	NC_020127	TA	3	6	1417758	1417763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38045	NC_020127	TAGT	2	8	1417782	1417789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38046	NC_020127	AACA	2	8	1417853	1417860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38047	NC_020127	CCTTA	2	10	1417879	1417888	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38048	NC_020127	ATAGTA	2	12	1417899	1417910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38049	NC_020127	A	7	7	1417915	1417921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38050	NC_020127	TTAG	2	8	1417946	1417953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38051	NC_020127	AAT	2	6	1417959	1417964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38052	NC_020127	GTG	2	6	1417970	1417975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556446
38053	NC_020127	AGAA	2	8	1418129	1418136	75 %	0 %	25 %	0 %	442556446
38054	NC_020127	ATGAT	2	10	1418141	1418150	40 %	40 %	20 %	0 %	442556446
38055	NC_020127	TGG	3	9	1418190	1418198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556446
38056	NC_020127	CAG	3	9	1418219	1418227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556446
38057	NC_020127	CTG	2	6	1418297	1418302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556446
38058	NC_020127	GTT	2	6	1418323	1418328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556446
38059	NC_020127	CTA	2	6	1418354	1418359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556446
38060	NC_020127	ATT	2	6	1418365	1418370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556446
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38062	NC_020127	A	6	6	1418457	1418462	100 %	0 %	0 %	0 %	442556446
38063	NC_020127	TTA	2	6	1418476	1418481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38064	NC_020127	TA	3	6	1418485	1418490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38065	NC_020127	TATTT	2	10	1418497	1418506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38066	NC_020127	TTTA	2	8	1418511	1418518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38067	NC_020127	TCA	2	6	1418526	1418531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38068	NC_020127	GA	3	6	1418592	1418597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38069	NC_020127	TGA	2	6	1418616	1418621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38070	NC_020127	ATTTT	2	10	1418622	1418631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38071	NC_020127	TTG	2	6	1418635	1418640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38072	NC_020127	TAT	2	6	1418657	1418662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38073	NC_020127	TATTT	2	10	1418686	1418695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38074	NC_020127	TAGTT	2	10	1418703	1418712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38075	NC_020127	AG	3	6	1418737	1418742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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38079	NC_020127	TTG	2	6	1418816	1418821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38080	NC_020127	TAA	2	6	1418849	1418854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38081	NC_020127	A	7	7	1418857	1418863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38082	NC_020127	A	6	6	1418907	1418912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38083	NC_020127	ACG	2	6	1418919	1418924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38084	NC_020127	GAT	2	6	1418968	1418973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38086	NC_020127	TTG	2	6	1419018	1419023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38089	NC_020127	CAT	2	6	1419211	1419216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556447
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38091	NC_020127	TA	3	6	1419246	1419251	50 %	50 %	0 %	0 %	442556447
38092	NC_020127	A	6	6	1419277	1419282	100 %	0 %	0 %	0 %	442556447
38093	NC_020127	T	6	6	1419511	1419516	0 %	100 %	0 %	0 %	442556447
38094	NC_020127	AGG	2	6	1419537	1419542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556447
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38096	NC_020127	TC	3	6	1419595	1419600	0 %	50 %	0 %	50 %	442556447
38097	NC_020127	GGA	2	6	1419602	1419607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556447
38098	NC_020127	TGA	2	6	1419665	1419670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556448
38099	NC_020127	GAA	2	6	1419685	1419690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556448
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38103	NC_020127	GCT	2	6	1419760	1419765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556448
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38109	NC_020127	CTC	2	6	1419926	1419931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556448
38110	NC_020127	CAGTA	2	10	1419954	1419963	40 %	20 %	20 %	20 %	442556448
38111	NC_020127	A	7	7	1420007	1420013	100 %	0 %	0 %	0 %	442556448
38112	NC_020127	A	6	6	1420022	1420027	100 %	0 %	0 %	0 %	442556448
38113	NC_020127	CAA	2	6	1420060	1420065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556448
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38120	NC_020127	TGC	2	6	1420239	1420244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38121	NC_020127	TAT	2	6	1420248	1420253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556448
38122	NC_020127	GCA	2	6	1420276	1420281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38123	NC_020127	GTC	2	6	1420284	1420289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38124	NC_020127	CAG	2	6	1420316	1420321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38125	NC_020127	CAG	2	6	1420355	1420360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38126	NC_020127	TGG	4	12	1420434	1420445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556448
38127	NC_020127	GAT	2	6	1420515	1420520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556448
38128	NC_020127	GCT	2	6	1420651	1420656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556448
38129	NC_020127	CTT	2	6	1420695	1420700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556448
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38133	NC_020127	ACTAT	2	10	1420827	1420836	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38134	NC_020127	AT	3	6	1420838	1420843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38135	NC_020127	TAA	2	6	1420848	1420853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38155	NC_020127	AAC	2	6	1421662	1421667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38159	NC_020127	AAG	2	6	1421762	1421767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38163	NC_020127	TAA	2	6	1421863	1421868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38166	NC_020127	AAT	2	6	1421926	1421931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38169	NC_020127	TTA	2	6	1421969	1421974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38173	NC_020127	TA	3	6	1422058	1422063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38190	NC_020127	AAAATT	2	12	1422379	1422390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38245	NC_020127	TA	4	8	1424207	1424214	50 %	50 %	0 %	0 %	442556450
38246	NC_020127	ATG	2	6	1424218	1424223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556450
38247	NC_020127	TTG	2	6	1424242	1424247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556450
38248	NC_020127	TGT	2	6	1424303	1424308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556450
38249	NC_020127	ACC	2	6	1424312	1424317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556450
38250	NC_020127	GTT	2	6	1424349	1424354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556450
38251	NC_020127	AAC	2	6	1424395	1424400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556450
38252	NC_020127	TAT	2	6	1424444	1424449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556450
38253	NC_020127	ATTT	2	8	1424455	1424462	25 %	75 %	0 %	0 %	442556450
38254	NC_020127	A	6	6	1424483	1424488	100 %	0 %	0 %	0 %	442556450
38255	NC_020127	TTA	2	6	1424506	1424511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556450
38256	NC_020127	TGA	2	6	1424561	1424566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556450
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38258	NC_020127	ATG	2	6	1424602	1424607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556450
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38261	NC_020127	AGGCT	2	10	1424679	1424688	20 %	20 %	40 %	20 %	442556450
38262	NC_020127	TGGTAT	2	12	1424704	1424715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	442556451
38263	NC_020127	AT	3	6	1424714	1424719	50 %	50 %	0 %	0 %	442556451
38264	NC_020127	ATT	2	6	1424750	1424755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556451
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38280	NC_020127	TA	3	6	1425441	1425446	50 %	50 %	0 %	0 %	442556451
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38284	NC_020127	TTG	2	6	1425579	1425584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556451
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38307	NC_020127	TTC	2	6	1426644	1426649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556453
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38311	NC_020127	GT	3	6	1426810	1426815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38312	NC_020127	GTT	2	6	1426874	1426879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556454
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38349	NC_020127	ATG	2	6	1428114	1428119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556455
38350	NC_020127	CAA	2	6	1428157	1428162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556455
38351	NC_020127	A	6	6	1428172	1428177	100 %	0 %	0 %	0 %	442556455
38352	NC_020127	T	6	6	1428178	1428183	0 %	100 %	0 %	0 %	442556455
38353	NC_020127	GAT	2	6	1428197	1428202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556455
38354	NC_020127	AAGC	2	8	1428252	1428259	50 %	0 %	25 %	25 %	442556455
38355	NC_020127	AACTG	2	10	1428304	1428313	40 %	20 %	20 %	20 %	442556455
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38357	NC_020127	TGG	2	6	1428389	1428394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556456
38358	NC_020127	T	7	7	1428431	1428437	0 %	100 %	0 %	0 %	442556456
38359	NC_020127	TAT	2	6	1428446	1428451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556456
38360	NC_020127	ATG	2	6	1428457	1428462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
38361	NC_020127	TAA	2	6	1428470	1428475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556456
38362	NC_020127	AGA	2	6	1428488	1428493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556456
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38485	NC_020127	TTA	2	6	1433190	1433195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556462
38486	NC_020127	AAT	2	6	1433260	1433265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556462
38487	NC_020127	AAAG	2	8	1433299	1433306	75 %	0 %	25 %	0 %	442556462
38488	NC_020127	GTT	2	6	1433319	1433324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556462
38489	NC_020127	TCCAT	2	10	1433491	1433500	20 %	40 %	0 %	40 %	442556462
38490	NC_020127	TCA	2	6	1433519	1433524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556462
38491	NC_020127	CCT	2	6	1433669	1433674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556462
38492	NC_020127	CAT	2	6	1433688	1433693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556462
38493	NC_020127	AAT	2	6	1433746	1433751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556462
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38499	NC_020127	A	6	6	1433998	1434003	100 %	0 %	0 %	0 %	442556462
38500	NC_020127	AAG	2	6	1434151	1434156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556462

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