MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37004	NC_020127	TAA	2	6	1378607	1378612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556417
37005	NC_020127	TG	3	6	1378662	1378667	0 %	50 %	50 %	0 %	442556417
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37010	NC_020127	T	7	7	1378802	1378808	0 %	100 %	0 %	0 %	442556418
37011	NC_020127	T	7	7	1378883	1378889	0 %	100 %	0 %	0 %	442556418
37012	NC_020127	GAT	2	6	1378905	1378910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556418
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37014	NC_020127	TAT	2	6	1378978	1378983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556418
37015	NC_020127	TACA	2	8	1379047	1379054	50 %	25 %	0 %	25 %	442556418
37016	NC_020127	T	6	6	1379125	1379130	0 %	100 %	0 %	0 %	442556418
37017	NC_020127	CAG	2	6	1379164	1379169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556418
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37033	NC_020127	AT	3	6	1380047	1380052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37034	NC_020127	ATA	2	6	1380066	1380071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37035	NC_020127	AT	3	6	1380106	1380111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37036	NC_020127	TTA	2	6	1380139	1380144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37038	NC_020127	ATTT	2	8	1380174	1380181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37039	NC_020127	GTATA	2	10	1380187	1380196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37040	NC_020127	T	7	7	1380237	1380243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37041	NC_020127	A	6	6	1380247	1380252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37042	NC_020127	AAAT	2	8	1380266	1380273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37043	NC_020127	CA	3	6	1380307	1380312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37044	NC_020127	T	6	6	1380313	1380318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37045	NC_020127	ATTA	2	8	1380319	1380326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37046	NC_020127	TTTA	2	8	1380412	1380419	25 %	75 %	0 %	0 %	442556419
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37109	NC_020127	AAT	2	6	1382367	1382372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556420
37110	NC_020127	TTTTA	2	10	1382444	1382453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37111	NC_020127	TAT	2	6	1382459	1382464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37112	NC_020127	T	6	6	1382471	1382476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37113	NC_020127	TA	3	6	1382518	1382523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37114	NC_020127	ATA	2	6	1382599	1382604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37116	NC_020127	AT	4	8	1382632	1382639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37117	NC_020127	TAA	2	6	1382641	1382646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37118	NC_020127	T	8	8	1382647	1382654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37119	NC_020127	CTAGT	2	10	1382656	1382665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37120	NC_020127	TAA	2	6	1382668	1382673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37121	NC_020127	A	7	7	1382672	1382678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37123	NC_020127	T	6	6	1382715	1382720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37127	NC_020127	T	6	6	1382881	1382886	0 %	100 %	0 %	0 %	442556421
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37239	NC_020127	AC	3	6	1387477	1387482	50 %	0 %	0 %	50 %	442556424
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37480	NC_020127	GAA	2	6	1396859	1396864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556434
37481	NC_020127	GTT	2	6	1396865	1396870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556434
37482	NC_020127	GTA	2	6	1396893	1396898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556434
37483	NC_020127	T	7	7	1397014	1397020	0 %	100 %	0 %	0 %	442556434
37484	NC_020127	TAT	2	6	1397028	1397033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556434
37485	NC_020127	TAT	2	6	1397053	1397058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556434
37486	NC_020127	CTTCT	2	10	1397069	1397078	0 %	60 %	0 %	40 %	442556434
37487	NC_020127	TCT	2	6	1397105	1397110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556434
37488	NC_020127	ATC	2	6	1397130	1397135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556434
37489	NC_020127	ATG	2	6	1397184	1397189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556434
37490	NC_020127	ATAA	2	8	1397195	1397202	75 %	25 %	0 %	0 %	442556434
37491	NC_020127	T	6	6	1397219	1397224	0 %	100 %	0 %	0 %	442556434
37492	NC_020127	AT	3	6	1397255	1397260	50 %	50 %	0 %	0 %	442556434
37493	NC_020127	TAT	2	6	1397301	1397306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556434
37494	NC_020127	AAG	2	6	1397335	1397340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556434
37495	NC_020127	GCT	2	6	1397342	1397347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556434
37496	NC_020127	ATCT	2	8	1397395	1397402	25 %	50 %	0 %	25 %	442556434
37497	NC_020127	ATG	2	6	1397415	1397420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556434
37498	NC_020127	TAAT	2	8	1397445	1397452	50 %	50 %	0 %	0 %	442556434
37499	NC_020127	A	6	6	1397458	1397463	100 %	0 %	0 %	0 %	442556434
37500	NC_020127	ACA	2	6	1397473	1397478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556434

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