MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_020127	TA	3	6	1284840	1284845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34502	NC_020127	TAT	2	6	1284849	1284854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34503	NC_020127	TAAT	2	8	1284863	1284870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34504	NC_020127	ATTT	2	8	1284894	1284901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34505	NC_020127	AAG	2	6	1284940	1284945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34506	NC_020127	CTT	2	6	1285010	1285015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556334
34507	NC_020127	TAC	2	6	1285032	1285037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556334
34508	NC_020127	TAC	2	6	1285082	1285087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556334
34509	NC_020127	T	6	6	1285128	1285133	0 %	100 %	0 %	0 %	442556334
34510	NC_020127	CTT	2	6	1285136	1285141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556334
34511	NC_020127	AT	3	6	1285148	1285153	50 %	50 %	0 %	0 %	442556334
34512	NC_020127	TAA	2	6	1285166	1285171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556334
34513	NC_020127	GATA	3	12	1285178	1285189	50 %	25 %	25 %	0 %	442556334
34514	NC_020127	TTG	2	6	1285232	1285237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556334
34515	NC_020127	CTG	2	6	1285238	1285243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556334
34516	NC_020127	TCT	2	6	1285279	1285284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556334
34517	NC_020127	AAAT	2	8	1285340	1285347	75 %	25 %	0 %	0 %	442556334
34518	NC_020127	TGT	2	6	1285372	1285377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556334
34519	NC_020127	GAAT	2	8	1285401	1285408	50 %	25 %	25 %	0 %	442556334
34520	NC_020127	AGT	2	6	1285503	1285508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556334
34521	NC_020127	AGC	2	6	1285662	1285667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556334
34522	NC_020127	CTTT	2	8	1285708	1285715	0 %	75 %	0 %	25 %	442556334
34523	NC_020127	GCA	2	6	1285804	1285809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556334
34524	NC_020127	AAT	2	6	1285812	1285817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556334
34525	NC_020127	TTTG	2	8	1285843	1285850	0 %	75 %	25 %	0 %	442556334
34526	NC_020127	TAC	3	9	1285913	1285921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556334
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34528	NC_020127	ATG	2	6	1285963	1285968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556334
34529	NC_020127	ATT	2	6	1285989	1285994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34530	NC_020127	TTATA	2	10	1286000	1286009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34531	NC_020127	TAT	2	6	1286014	1286019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34532	NC_020127	AT	3	6	1286035	1286040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34533	NC_020127	TAT	2	6	1286053	1286058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34534	NC_020127	TA	3	6	1286063	1286068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_020127	ATA	2	6	1286074	1286079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34536	NC_020127	AT	7	14	1286089	1286102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34537	NC_020127	ATT	2	6	1286107	1286112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_020127	ATA	2	6	1286126	1286131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34539	NC_020127	ATT	2	6	1286156	1286161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34540	NC_020127	TTTTTA	2	12	1286162	1286173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34541	NC_020127	AT	4	8	1286178	1286185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34542	NC_020127	CTATAA	2	12	1286201	1286212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34543	NC_020127	AAT	2	6	1286219	1286224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34544	NC_020127	TAG	2	6	1286248	1286253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34545	NC_020127	TAAA	2	8	1286264	1286271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34546	NC_020127	AAGAA	2	10	1286272	1286281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34547	NC_020127	TAAA	2	8	1286305	1286312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34548	NC_020127	CCAT	3	12	1286361	1286372	25 %	25 %	0 %	50 %	442556335
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34554	NC_020127	T	6	6	1286630	1286635	0 %	100 %	0 %	0 %	442556335
34555	NC_020127	TCT	2	6	1286655	1286660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556335
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34557	NC_020127	GAAA	2	8	1286720	1286727	75 %	0 %	25 %	0 %	442556335
34558	NC_020127	GGT	2	6	1286742	1286747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556335
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34570	NC_020127	TG	3	6	1287512	1287517	0 %	50 %	50 %	0 %	442556336
34571	NC_020127	TG	3	6	1287528	1287533	0 %	50 %	50 %	0 %	442556336
34572	NC_020127	TGA	2	6	1287536	1287541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556336
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34588	NC_020127	T	6	6	1288234	1288239	0 %	100 %	0 %	0 %	442556337
34589	NC_020127	GATT	2	8	1288265	1288272	25 %	50 %	25 %	0 %	442556337
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34602	NC_020127	ACA	2	6	1288775	1288780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556337
34603	NC_020127	A	6	6	1288816	1288821	100 %	0 %	0 %	0 %	442556337
34604	NC_020127	A	8	8	1288864	1288871	100 %	0 %	0 %	0 %	442556337
34605	NC_020127	TAA	2	6	1288881	1288886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556337
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34610	NC_020127	GT	4	8	1289062	1289069	0 %	50 %	50 %	0 %	442556338
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34616	NC_020127	T	6	6	1289280	1289285	0 %	100 %	0 %	0 %	442556338
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34722	NC_020127	TAACT	2	10	1293119	1293128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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