MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_020127	AAGC	2	8	1268459	1268466	50 %	0 %	25 %	25 %	442556320
34003	NC_020127	ATG	2	6	1268480	1268485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556320
34004	NC_020127	GGA	2	6	1268519	1268524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556320
34005	NC_020127	AAG	2	6	1268540	1268545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556320
34006	NC_020127	TTA	2	6	1268559	1268564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556320
34007	NC_020127	TAT	2	6	1268653	1268658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556320
34008	NC_020127	T	6	6	1268712	1268717	0 %	100 %	0 %	0 %	442556320
34009	NC_020127	AAG	2	6	1268739	1268744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556320
34010	NC_020127	AAT	2	6	1268753	1268758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556320
34011	NC_020127	TA	3	6	1268774	1268779	50 %	50 %	0 %	0 %	442556320
34012	NC_020127	AG	3	6	1268780	1268785	50 %	0 %	50 %	0 %	442556320
34013	NC_020127	A	6	6	1268846	1268851	100 %	0 %	0 %	0 %	442556320
34014	NC_020127	GTT	2	6	1268960	1268965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556320
34015	NC_020127	ATA	2	6	1268967	1268972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556320
34016	NC_020127	TTTAC	2	10	1269022	1269031	20 %	60 %	0 %	20 %	442556320
34017	NC_020127	TTAT	2	8	1269068	1269075	25 %	75 %	0 %	0 %	442556320
34018	NC_020127	TATT	2	8	1269082	1269089	25 %	75 %	0 %	0 %	442556320
34019	NC_020127	GA	3	6	1269100	1269105	50 %	0 %	50 %	0 %	442556320
34020	NC_020127	AGT	2	6	1269155	1269160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34021	NC_020127	TG	3	6	1269186	1269191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34022	NC_020127	TA	3	6	1269221	1269226	50 %	50 %	0 %	0 %	442556321
34023	NC_020127	TAA	2	6	1269298	1269303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556321
34024	NC_020127	ATT	2	6	1269324	1269329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556321
34025	NC_020127	TCCT	2	8	1269367	1269374	0 %	50 %	0 %	50 %	442556321
34026	NC_020127	T	9	9	1269389	1269397	0 %	100 %	0 %	0 %	442556321
34027	NC_020127	GTT	2	6	1269528	1269533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556321
34028	NC_020127	T	7	7	1269550	1269556	0 %	100 %	0 %	0 %	442556321
34029	NC_020127	ATT	2	6	1269629	1269634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556321
34030	NC_020127	CTT	2	6	1269679	1269684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556321
34031	NC_020127	GCATT	2	10	1269706	1269715	20 %	40 %	20 %	20 %	442556321
34032	NC_020127	T	6	6	1269736	1269741	0 %	100 %	0 %	0 %	442556321
34033	NC_020127	T	7	7	1269743	1269749	0 %	100 %	0 %	0 %	442556321
34034	NC_020127	A	8	8	1269764	1269771	100 %	0 %	0 %	0 %	442556321
34035	NC_020127	TGT	2	6	1269776	1269781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556321
34036	NC_020127	AGC	2	6	1269782	1269787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556321
34037	NC_020127	AAT	2	6	1269788	1269793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556321
34038	NC_020127	CAC	2	6	1269850	1269855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556321
34039	NC_020127	T	7	7	1269952	1269958	0 %	100 %	0 %	0 %	442556321
34040	NC_020127	AGTA	2	8	1269992	1269999	50 %	25 %	25 %	0 %	442556321
34041	NC_020127	ATA	2	6	1270014	1270019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556321
34042	NC_020127	TATTTT	3	18	1270038	1270055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442556322
34043	NC_020127	AGT	2	6	1270075	1270080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556322
34044	NC_020127	ATT	2	6	1270082	1270087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34045	NC_020127	T	7	7	1270102	1270108	0 %	100 %	0 %	0 %	442556322
34046	NC_020127	T	6	6	1270157	1270162	0 %	100 %	0 %	0 %	442556322
34047	NC_020127	TTA	2	6	1270187	1270192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
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34049	NC_020127	T	7	7	1270299	1270305	0 %	100 %	0 %	0 %	442556322
34050	NC_020127	TTA	2	6	1270333	1270338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34051	NC_020127	TA	3	6	1270337	1270342	50 %	50 %	0 %	0 %	442556322
34052	NC_020127	ATT	2	6	1270390	1270395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34053	NC_020127	T	6	6	1270399	1270404	0 %	100 %	0 %	0 %	442556322
34054	NC_020127	TTA	2	6	1270407	1270412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34055	NC_020127	TAT	2	6	1270455	1270460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34056	NC_020127	AGG	2	6	1270465	1270470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556322
34057	NC_020127	CCTA	2	8	1270489	1270496	25 %	25 %	0 %	50 %	442556322
34058	NC_020127	ATT	2	6	1270499	1270504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34059	NC_020127	ATTT	2	8	1270585	1270592	25 %	75 %	0 %	0 %	442556322
34060	NC_020127	CTG	2	6	1270608	1270613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556322
34061	NC_020127	TTA	2	6	1270640	1270645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
34062	NC_020127	CTG	2	6	1270659	1270664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556322
34063	NC_020127	CAG	2	6	1270671	1270676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556322
34064	NC_020127	TTAC	2	8	1270682	1270689	25 %	50 %	0 %	25 %	442556322
34065	NC_020127	CTTC	2	8	1270712	1270719	0 %	50 %	0 %	50 %	442556322
34066	NC_020127	TAT	2	6	1270753	1270758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556322
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34069	NC_020127	CTT	2	6	1270826	1270831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556322
34070	NC_020127	T	7	7	1270830	1270836	0 %	100 %	0 %	0 %	442556322
34071	NC_020127	TAGT	2	8	1270839	1270846	25 %	50 %	25 %	0 %	442556322
34072	NC_020127	AG	3	6	1270898	1270903	50 %	0 %	50 %	0 %	442556322
34073	NC_020127	TCA	2	6	1270950	1270955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556323
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34079	NC_020127	A	6	6	1271278	1271283	100 %	0 %	0 %	0 %	442556323
34080	NC_020127	GGTT	2	8	1271319	1271326	0 %	50 %	50 %	0 %	442556323
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34085	NC_020127	CAT	2	6	1271453	1271458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556323
34086	NC_020127	TAT	3	9	1271523	1271531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556323
34087	NC_020127	ATA	2	6	1271540	1271545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556323
34088	NC_020127	CA	3	6	1271547	1271552	50 %	0 %	0 %	50 %	442556323
34089	NC_020127	ATT	2	6	1271599	1271604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556323
34090	NC_020127	CTA	2	6	1271625	1271630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556323
34091	NC_020127	TAT	2	6	1271649	1271654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556323
34092	NC_020127	ATA	2	6	1271660	1271665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556323
34093	NC_020127	ATTA	2	8	1271674	1271681	50 %	50 %	0 %	0 %	442556323
34094	NC_020127	ATG	2	6	1271686	1271691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34095	NC_020127	TTAC	2	8	1271717	1271724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34096	NC_020127	ACTA	2	8	1271732	1271739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34097	NC_020127	ATTT	2	8	1271775	1271782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34100	NC_020127	T	7	7	1271931	1271937	0 %	100 %	0 %	0 %	442556324
34101	NC_020127	TCC	2	6	1272011	1272016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556324
34102	NC_020127	GGA	2	6	1272066	1272071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556324
34103	NC_020127	GTC	2	6	1272143	1272148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556324
34104	NC_020127	GACA	2	8	1272160	1272167	50 %	0 %	25 %	25 %	442556324
34105	NC_020127	TCA	2	6	1272174	1272179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556324
34106	NC_020127	TAA	2	6	1272220	1272225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556324
34107	NC_020127	GTAG	2	8	1272277	1272284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34108	NC_020127	GAA	2	6	1272301	1272306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34109	NC_020127	TAT	2	6	1272312	1272317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34110	NC_020127	TTA	2	6	1272327	1272332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34111	NC_020127	GTAT	2	8	1272401	1272408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34112	NC_020127	CCA	2	6	1272451	1272456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556325
34113	NC_020127	GAAA	2	8	1272487	1272494	75 %	0 %	25 %	0 %	442556325
34114	NC_020127	CTG	2	6	1272521	1272526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556325
34115	NC_020127	T	7	7	1272552	1272558	0 %	100 %	0 %	0 %	442556325
34116	NC_020127	GAT	2	6	1272638	1272643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556325
34117	NC_020127	ACA	2	6	1272664	1272669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556325
34118	NC_020127	TGTT	2	8	1272685	1272692	0 %	75 %	25 %	0 %	442556325
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34120	NC_020127	ATT	2	6	1272714	1272719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556325
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34230	NC_020127	A	6	6	1275957	1275962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34234	NC_020127	TAA	2	6	1276048	1276053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34239	NC_020127	ATAG	2	8	1276182	1276189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34240	NC_020127	TGT	2	6	1276241	1276246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556327
34241	NC_020127	A	6	6	1276261	1276266	100 %	0 %	0 %	0 %	442556327
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