MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_020127	GTC	2	6	1208703	1208708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556271
32503	NC_020127	TTG	2	6	1208814	1208819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556271
32504	NC_020127	GGA	2	6	1208839	1208844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_020127	TTA	2	6	1208874	1208879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556272
32506	NC_020127	ATAA	2	8	1208921	1208928	75 %	25 %	0 %	0 %	442556272
32507	NC_020127	TAC	2	6	1208941	1208946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556272
32508	NC_020127	GGTAT	2	10	1208985	1208994	20 %	40 %	40 %	0 %	442556272
32509	NC_020127	TGC	2	6	1209043	1209048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556272
32510	NC_020127	ATT	2	6	1209125	1209130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556272
32511	NC_020127	A	6	6	1209200	1209205	100 %	0 %	0 %	0 %	442556272
32512	NC_020127	AAC	2	6	1209264	1209269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556272
32513	NC_020127	AGA	2	6	1209286	1209291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556272
32514	NC_020127	TTA	2	6	1209381	1209386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556272
32515	NC_020127	GTA	2	6	1209428	1209433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556272
32516	NC_020127	TTA	2	6	1209564	1209569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556272
32517	NC_020127	TGA	2	6	1209574	1209579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556272
32518	NC_020127	GTG	2	6	1209594	1209599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556272
32519	NC_020127	TGA	2	6	1209652	1209657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556272
32520	NC_020127	A	6	6	1209770	1209775	100 %	0 %	0 %	0 %	442556272
32521	NC_020127	TGA	2	6	1209781	1209786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556272
32522	NC_020127	CTT	2	6	1209797	1209802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556272
32523	NC_020127	A	6	6	1209848	1209853	100 %	0 %	0 %	0 %	442556272
32524	NC_020127	CAT	2	6	1209878	1209883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556272
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32529	NC_020127	TCAA	2	8	1210082	1210089	50 %	25 %	0 %	25 %	442556273
32530	NC_020127	ATC	2	6	1210096	1210101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556273
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32533	NC_020127	AAG	2	6	1210187	1210192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556273
32534	NC_020127	A	6	6	1210237	1210242	100 %	0 %	0 %	0 %	442556273
32535	NC_020127	TGA	2	6	1210244	1210249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556273
32536	NC_020127	AAT	2	6	1210275	1210280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32537	NC_020127	ATA	3	9	1210283	1210291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_020127	TAT	7	21	1210324	1210344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_020127	TAT	2	6	1210346	1210351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32540	NC_020127	TTTTC	2	10	1210377	1210386	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32541	NC_020127	TCT	2	6	1210417	1210422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32542	NC_020127	AAT	2	6	1210434	1210439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32543	NC_020127	TAA	3	9	1210441	1210449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32544	NC_020127	TTA	2	6	1210463	1210468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32545	NC_020127	AAAT	2	8	1210470	1210477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32546	NC_020127	TTA	2	6	1210493	1210498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32547	NC_020127	TTA	2	6	1210503	1210508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32548	NC_020127	ATT	2	6	1210525	1210530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32549	NC_020127	AAT	2	6	1210531	1210536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32550	NC_020127	ATG	2	6	1210554	1210559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556274
32551	NC_020127	TG	3	6	1210582	1210587	0 %	50 %	50 %	0 %	442556274
32552	NC_020127	TAG	2	6	1210720	1210725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556274
32553	NC_020127	T	7	7	1210745	1210751	0 %	100 %	0 %	0 %	442556274
32554	NC_020127	ACA	3	9	1210766	1210774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556274
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32563	NC_020127	TGT	2	6	1211423	1211428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556274
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32569	NC_020127	A	8	8	1211693	1211700	100 %	0 %	0 %	0 %	442556274
32570	NC_020127	TTG	2	6	1211764	1211769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556274
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32579	NC_020127	TG	3	6	1212087	1212092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32580	NC_020127	ATAA	2	8	1212109	1212116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32582	NC_020127	TTA	2	6	1212138	1212143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32589	NC_020127	TGA	2	6	1212270	1212275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556275
32590	NC_020127	TGT	2	6	1212291	1212296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556275
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32592	NC_020127	TCC	2	6	1212407	1212412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556275
32593	NC_020127	ATTT	2	8	1212517	1212524	25 %	75 %	0 %	0 %	442556275
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32601	NC_020127	TGC	2	6	1212813	1212818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556275
32602	NC_020127	CAG	2	6	1212881	1212886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556275
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32604	NC_020127	T	6	6	1213043	1213048	0 %	100 %	0 %	0 %	442556275
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32606	NC_020127	T	6	6	1213083	1213088	0 %	100 %	0 %	0 %	442556275
32607	NC_020127	T	6	6	1213116	1213121	0 %	100 %	0 %	0 %	442556275
32608	NC_020127	ATGA	2	8	1213126	1213133	50 %	25 %	25 %	0 %	442556275
32609	NC_020127	TGG	2	6	1213188	1213193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556275
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32613	NC_020127	GT	3	6	1213419	1213424	0 %	50 %	50 %	0 %	442556275
32614	NC_020127	TTA	2	6	1213456	1213461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556275
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32616	NC_020127	GATT	2	8	1213557	1213564	25 %	50 %	25 %	0 %	442556275
32617	NC_020127	TA	3	6	1213580	1213585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32618	NC_020127	ACA	2	6	1213646	1213651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32978	NC_020127	AT	3	6	1228036	1228041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32979	NC_020127	A	7	7	1228078	1228084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32980	NC_020127	A	6	6	1228093	1228098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32981	NC_020127	CGT	2	6	1228120	1228125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32985	NC_020127	AAAT	2	8	1228205	1228212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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