MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_020127	TA	3	6	1150570	1150575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31002	NC_020127	TAA	2	6	1150601	1150606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31003	NC_020127	GAA	2	6	1150628	1150633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31004	NC_020127	TTA	2	6	1150660	1150665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_020127	ATTT	2	8	1150677	1150684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_020127	TA	3	6	1150692	1150697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_020127	T	6	6	1150707	1150712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_020127	T	6	6	1150729	1150734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_020127	TATT	2	8	1150747	1150754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_020127	GTT	2	6	1150758	1150763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_020127	T	7	7	1150762	1150768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_020127	AGC	2	6	1150776	1150781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31013	NC_020127	T	7	7	1150824	1150830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_020127	GGA	2	6	1150858	1150863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556205
31015	NC_020127	A	8	8	1150890	1150897	100 %	0 %	0 %	0 %	442556205
31016	NC_020127	G	6	6	1150936	1150941	0 %	0 %	100 %	0 %	442556205
31017	NC_020127	CTA	2	6	1150955	1150960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556205
31018	NC_020127	ATA	2	6	1150979	1150984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556205
31019	NC_020127	GGT	2	6	1151114	1151119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556205
31020	NC_020127	GAAG	2	8	1151131	1151138	50 %	0 %	50 %	0 %	442556205
31021	NC_020127	TCA	2	6	1151202	1151207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556205
31022	NC_020127	GAC	2	6	1151212	1151217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556205
31023	NC_020127	A	6	6	1151232	1151237	100 %	0 %	0 %	0 %	442556205
31024	NC_020127	TGT	2	6	1151250	1151255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556205
31025	NC_020127	AGA	3	9	1151307	1151315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556205
31026	NC_020127	AT	3	6	1151334	1151339	50 %	50 %	0 %	0 %	442556205
31027	NC_020127	A	6	6	1151347	1151352	100 %	0 %	0 %	0 %	442556205
31028	NC_020127	CTA	2	6	1151372	1151377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556205
31029	NC_020127	GAA	2	6	1151386	1151391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556205
31030	NC_020127	GAA	2	6	1151404	1151409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556205
31031	NC_020127	ATT	2	6	1151415	1151420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556205
31032	NC_020127	GTA	2	6	1151440	1151445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556205
31033	NC_020127	CTTC	2	8	1151452	1151459	0 %	50 %	0 %	50 %	442556205
31034	NC_020127	GCT	2	6	1151476	1151481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556205
31035	NC_020127	AGA	2	6	1151559	1151564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556205
31036	NC_020127	TCCT	2	8	1151582	1151589	0 %	50 %	0 %	50 %	442556205
31037	NC_020127	CCAT	2	8	1151616	1151623	25 %	25 %	0 %	50 %	442556205
31038	NC_020127	TATAT	2	10	1151631	1151640	40 %	60 %	0 %	0 %	442556205
31039	NC_020127	TGA	3	9	1151648	1151656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556205
31040	NC_020127	ACA	2	6	1151684	1151689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556205
31041	NC_020127	ATG	2	6	1151722	1151727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556205
31042	NC_020127	AG	3	6	1151757	1151762	50 %	0 %	50 %	0 %	442556205
31043	NC_020127	AGT	2	6	1151809	1151814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556205
31044	NC_020127	GTT	2	6	1151824	1151829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556205
31045	NC_020127	TTG	2	6	1151831	1151836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556205
31046	NC_020127	TCT	2	6	1151995	1152000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556205
31047	NC_020127	TTA	2	6	1152004	1152009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556205
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31049	NC_020127	TGA	2	6	1152148	1152153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556206
31050	NC_020127	TA	3	6	1152203	1152208	50 %	50 %	0 %	0 %	442556206
31051	NC_020127	TGC	2	6	1152298	1152303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556206
31052	NC_020127	GGC	2	6	1152310	1152315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556206
31053	NC_020127	CTT	3	9	1152378	1152386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556206
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31055	NC_020127	TGC	2	6	1152478	1152483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556206
31056	NC_020127	GCT	2	6	1152491	1152496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556206
31057	NC_020127	A	7	7	1152526	1152532	100 %	0 %	0 %	0 %	442556206
31058	NC_020127	TGC	2	6	1152541	1152546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556206
31059	NC_020127	A	6	6	1152551	1152556	100 %	0 %	0 %	0 %	442556206
31060	NC_020127	GAT	2	6	1152563	1152568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556206
31061	NC_020127	AGTA	2	8	1152577	1152584	50 %	25 %	25 %	0 %	442556206
31062	NC_020127	AGA	2	6	1152592	1152597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556206
31063	NC_020127	TAT	2	6	1152610	1152615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556206
31064	NC_020127	TAA	2	6	1152620	1152625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556206
31065	NC_020127	TAT	2	6	1152637	1152642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31066	NC_020127	ATT	2	6	1152673	1152678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31067	NC_020127	GTA	2	6	1152687	1152692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556207
31068	NC_020127	T	6	6	1152726	1152731	0 %	100 %	0 %	0 %	442556207
31069	NC_020127	TAT	2	6	1152772	1152777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556207
31070	NC_020127	TTA	2	6	1152854	1152859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556207
31071	NC_020127	A	6	6	1152883	1152888	100 %	0 %	0 %	0 %	442556207
31072	NC_020127	TTAA	2	8	1152908	1152915	50 %	50 %	0 %	0 %	442556207
31073	NC_020127	TA	3	6	1152980	1152985	50 %	50 %	0 %	0 %	442556207
31074	NC_020127	AAGAT	2	10	1153026	1153035	60 %	20 %	20 %	0 %	442556207
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31079	NC_020127	GTT	2	6	1153130	1153135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556207
31080	NC_020127	GAT	2	6	1153172	1153177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556207
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31083	NC_020127	AT	3	6	1153317	1153322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_020127	TAA	2	6	1153367	1153372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556208
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31087	NC_020127	AAGCTA	2	12	1153499	1153510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442556208
31088	NC_020127	AG	4	8	1153534	1153541	50 %	0 %	50 %	0 %	442556208
31089	NC_020127	ATA	2	6	1153548	1153553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556208
31090	NC_020127	T	7	7	1153556	1153562	0 %	100 %	0 %	0 %	442556208
31091	NC_020127	ATTAG	2	10	1153585	1153594	40 %	40 %	20 %	0 %	442556208
31092	NC_020127	AAT	2	6	1153596	1153601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556208
31093	NC_020127	CTG	2	6	1153610	1153615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556208
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31095	NC_020127	TC	3	6	1153659	1153664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31096	NC_020127	TGA	2	6	1153689	1153694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556209
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31099	NC_020127	AAGTCC	2	12	1153815	1153826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442556209
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31102	NC_020127	ATA	2	6	1154056	1154061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556209
31103	NC_020127	CTT	2	6	1154063	1154068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_020127	A	6	6	1154081	1154086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_020127	TTA	2	6	1154109	1154114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556210
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31107	NC_020127	AT	3	6	1154136	1154141	50 %	50 %	0 %	0 %	442556210
31108	NC_020127	AAG	2	6	1154154	1154159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556210
31109	NC_020127	AGC	2	6	1154165	1154170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556210
31110	NC_020127	TCT	2	6	1154256	1154261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556210
31111	NC_020127	TA	3	6	1154264	1154269	50 %	50 %	0 %	0 %	442556210
31112	NC_020127	GT	3	6	1154339	1154344	0 %	50 %	50 %	0 %	442556210
31113	NC_020127	TTC	2	6	1154362	1154367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556210
31114	NC_020127	AT	3	6	1154419	1154424	50 %	50 %	0 %	0 %	442556210
31115	NC_020127	TTC	2	6	1154464	1154469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556210
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31117	NC_020127	TTC	2	6	1154666	1154671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556210
31118	NC_020127	TAA	2	6	1154696	1154701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556210
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31120	NC_020127	CTT	2	6	1154890	1154895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556210
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31150	NC_020127	AG	3	6	1155968	1155973	50 %	0 %	50 %	0 %	442556210
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31156	NC_020127	TATG	2	8	1156129	1156136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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31231	NC_020127	ATT	2	6	1158951	1158956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31237	NC_020127	T	7	7	1159195	1159201	0 %	100 %	0 %	0 %	442556213
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31239	NC_020127	GTAA	2	8	1159266	1159273	50 %	25 %	25 %	0 %	442556213
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31269	NC_020127	ATT	2	6	1160195	1160200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31271	NC_020127	AT	3	6	1160228	1160233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31272	NC_020127	TATAA	2	10	1160250	1160259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31337	NC_020127	TTTTA	2	10	1162586	1162595	20 %	80 %	0 %	0 %	442556217
31338	NC_020127	T	6	6	1162604	1162609	0 %	100 %	0 %	0 %	442556217
31339	NC_020127	TCTA	2	8	1162675	1162682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31340	NC_020127	TA	3	6	1162681	1162686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31341	NC_020127	CAA	2	6	1162796	1162801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556218
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31346	NC_020127	AAT	2	6	1163003	1163008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556218
31347	NC_020127	AGTCAT	2	12	1163010	1163021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556218
31348	NC_020127	ATG	2	6	1163029	1163034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556218
31349	NC_020127	ACC	2	6	1163073	1163078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556218
31350	NC_020127	CAT	2	6	1163151	1163156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556218
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31352	NC_020127	TTA	2	6	1163242	1163247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556218
31353	NC_020127	AT	3	6	1163301	1163306	50 %	50 %	0 %	0 %	442556219
31354	NC_020127	CTA	2	6	1163332	1163337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556219
31355	NC_020127	CAATA	2	10	1163372	1163381	60 %	20 %	0 %	20 %	442556219
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