MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_020127	TTA	2	6	951273	951278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556044
25502	NC_020127	ATTT	2	8	951382	951389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25503	NC_020127	CAA	2	6	951427	951432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556045
25504	NC_020127	CTT	2	6	951461	951466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556045
25505	NC_020127	AGT	2	6	951473	951478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556045
25506	NC_020127	TTC	2	6	951488	951493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556045
25507	NC_020127	T	7	7	951521	951527	0 %	100 %	0 %	0 %	442556045
25508	NC_020127	CATT	2	8	951585	951592	25 %	50 %	0 %	25 %	442556045
25509	NC_020127	A	6	6	951612	951617	100 %	0 %	0 %	0 %	442556045
25510	NC_020127	CAA	2	6	951667	951672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556045
25511	NC_020127	CTT	2	6	951688	951693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556045
25512	NC_020127	TCA	2	6	951750	951755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556045
25513	NC_020127	TAA	2	6	951764	951769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556045
25514	NC_020127	ATT	2	6	951809	951814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556045
25515	NC_020127	GCTT	2	8	951839	951846	0 %	50 %	25 %	25 %	442556045
25516	NC_020127	CAT	2	6	951874	951879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556045
25517	NC_020127	TAA	2	6	951905	951910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556045
25518	NC_020127	CAA	2	6	951911	951916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556045
25519	NC_020127	TTAT	2	8	951918	951925	25 %	75 %	0 %	0 %	442556045
25520	NC_020127	GCG	2	6	951938	951943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556045
25521	NC_020127	TAA	2	6	952006	952011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556045
25522	NC_020127	GAA	2	6	952063	952068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556045
25523	NC_020127	A	6	6	952107	952112	100 %	0 %	0 %	0 %	442556045
25524	NC_020127	A	6	6	952114	952119	100 %	0 %	0 %	0 %	442556045
25525	NC_020127	AACA	2	8	952124	952131	75 %	0 %	0 %	25 %	442556045
25526	NC_020127	ATT	2	6	952151	952156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556045
25527	NC_020127	ATA	2	6	952194	952199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556045
25528	NC_020127	CAA	2	6	952222	952227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556045
25529	NC_020127	A	6	6	952226	952231	100 %	0 %	0 %	0 %	442556045
25530	NC_020127	CAA	2	6	952234	952239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556045
25531	NC_020127	TCA	2	6	952257	952262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556045
25532	NC_020127	AT	3	6	952269	952274	50 %	50 %	0 %	0 %	442556045
25533	NC_020127	ATA	2	6	952279	952284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556045
25534	NC_020127	ATTT	2	8	952338	952345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25535	NC_020127	ATCA	2	8	952349	952356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25536	NC_020127	CTTC	2	8	952400	952407	0 %	50 %	0 %	50 %	442556046
25537	NC_020127	TAAAT	2	10	952421	952430	60 %	40 %	0 %	0 %	442556046
25538	NC_020127	AGCAAT	2	12	952447	952458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442556046
25539	NC_020127	TAC	2	6	952530	952535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556046
25540	NC_020127	ATA	2	6	952554	952559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556046
25541	NC_020127	AAC	2	6	952627	952632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556046
25542	NC_020127	AATA	2	8	952662	952669	75 %	25 %	0 %	0 %	442556046
25543	NC_020127	ATC	2	6	952714	952719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556046
25544	NC_020127	AAT	2	6	952750	952755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556046
25545	NC_020127	TAA	2	6	952774	952779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556046
25546	NC_020127	TCC	2	6	952783	952788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556046
25547	NC_020127	TTG	2	6	952812	952817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556046
25548	NC_020127	CAG	2	6	952818	952823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556046
25549	NC_020127	TCT	2	6	952911	952916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556046
25550	NC_020127	ATT	2	6	952921	952926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556046
25551	NC_020127	TGC	2	6	952948	952953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556046
25552	NC_020127	ACTG	2	8	953018	953025	25 %	25 %	25 %	25 %	442556046
25553	NC_020127	GCT	2	6	953045	953050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556046
25554	NC_020127	ACA	2	6	953051	953056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556046
25555	NC_020127	AGA	2	6	953057	953062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556046
25556	NC_020127	ACTC	2	8	953097	953104	25 %	25 %	0 %	50 %	442556046
25557	NC_020127	TGGT	2	8	953116	953123	0 %	50 %	50 %	0 %	442556046
25558	NC_020127	AGAA	2	8	953146	953153	75 %	0 %	25 %	0 %	442556046
25559	NC_020127	CAA	2	6	953244	953249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556046
25560	NC_020127	T	6	6	953250	953255	0 %	100 %	0 %	0 %	442556046
25561	NC_020127	ATT	2	6	953261	953266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556046
25562	NC_020127	GTA	2	6	953316	953321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556046
25563	NC_020127	T	6	6	953332	953337	0 %	100 %	0 %	0 %	442556047
25564	NC_020127	AAT	2	6	953338	953343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556047
25565	NC_020127	TTC	2	6	953347	953352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556047
25566	NC_020127	CAT	2	6	953360	953365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556047
25567	NC_020127	ACTC	2	8	953385	953392	25 %	25 %	0 %	50 %	442556047
25568	NC_020127	AATA	2	8	953397	953404	75 %	25 %	0 %	0 %	442556047
25569	NC_020127	TGT	2	6	953431	953436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556047
25570	NC_020127	AAAC	2	8	953437	953444	75 %	0 %	0 %	25 %	442556047
25571	NC_020127	AAC	2	6	953449	953454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556047
25572	NC_020127	CTT	2	6	953561	953566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556047
25573	NC_020127	TAA	2	6	953612	953617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556047
25574	NC_020127	T	6	6	953633	953638	0 %	100 %	0 %	0 %	442556047
25575	NC_020127	CAA	3	9	953657	953665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556047
25576	NC_020127	AGC	2	6	953694	953699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556047
25577	NC_020127	CAT	2	6	953717	953722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556047
25578	NC_020127	T	6	6	953792	953797	0 %	100 %	0 %	0 %	442556047
25579	NC_020127	TACT	2	8	953837	953844	25 %	50 %	0 %	25 %	442556047
25580	NC_020127	ATAA	2	8	953849	953856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25581	NC_020127	TAT	2	6	953867	953872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25582	NC_020127	CTAT	2	8	953885	953892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25583	NC_020127	TAT	2	6	953896	953901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25584	NC_020127	ATA	2	6	953931	953936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25585	NC_020127	TTG	2	6	953946	953951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25586	NC_020127	TAT	2	6	953965	953970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25587	NC_020127	TAT	2	6	953993	953998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556048
25588	NC_020127	TA	3	6	954001	954006	50 %	50 %	0 %	0 %	442556048
25589	NC_020127	GCT	2	6	954102	954107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556048
25590	NC_020127	AAT	2	6	954150	954155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556048
25591	NC_020127	GTG	2	6	954331	954336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556048
25592	NC_020127	ATG	2	6	954342	954347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556048
25593	NC_020127	A	6	6	954402	954407	100 %	0 %	0 %	0 %	442556048
25594	NC_020127	AGA	2	6	954479	954484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556048
25595	NC_020127	GCTG	2	8	954492	954499	0 %	25 %	50 %	25 %	442556048
25596	NC_020127	CAA	2	6	954525	954530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556048
25597	NC_020127	GTG	2	6	954604	954609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556048
25598	NC_020127	A	8	8	954644	954651	100 %	0 %	0 %	0 %	442556048
25599	NC_020127	GAG	2	6	954679	954684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556048
25600	NC_020127	TAC	2	6	954743	954748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556048
25601	NC_020127	ATT	2	6	954827	954832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556048
25602	NC_020127	AT	3	6	954857	954862	50 %	50 %	0 %	0 %	442556048
25603	NC_020127	AAC	2	6	954883	954888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556048
25604	NC_020127	ATT	2	6	954900	954905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556048
25605	NC_020127	AT	3	6	954934	954939	50 %	50 %	0 %	0 %	442556048
25606	NC_020127	ACA	2	6	954941	954946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556048
25607	NC_020127	A	7	7	954953	954959	100 %	0 %	0 %	0 %	442556048
25608	NC_020127	CCT	2	6	954970	954975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556048
25609	NC_020127	A	9	9	955062	955070	100 %	0 %	0 %	0 %	442556049
25610	NC_020127	AGAA	2	8	955117	955124	75 %	0 %	25 %	0 %	442556049
25611	NC_020127	TGTTTC	2	12	955171	955182	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442556049
25612	NC_020127	TTC	2	6	955216	955221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556049
25613	NC_020127	TAA	2	6	955301	955306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556049
25614	NC_020127	T	6	6	955316	955321	0 %	100 %	0 %	0 %	442556049
25615	NC_020127	CTG	2	6	955323	955328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556049
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25617	NC_020127	TA	3	6	955378	955383	50 %	50 %	0 %	0 %	442556049
25618	NC_020127	TAA	2	6	955402	955407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556049
25619	NC_020127	CTG	2	6	955422	955427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556049
25620	NC_020127	TAAT	2	8	955431	955438	50 %	50 %	0 %	0 %	442556049
25621	NC_020127	T	7	7	955450	955456	0 %	100 %	0 %	0 %	442556049
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