MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 39124

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_020127	TAT	2	6	693632	693637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555840
18503	NC_020127	AGC	2	6	693662	693667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555840
18504	NC_020127	ATTC	2	8	693686	693693	25 %	50 %	0 %	25 %	442555840
18505	NC_020127	TTATTT	2	12	693724	693735	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	442555840
18506	NC_020127	T	6	6	693733	693738	0 %	100 %	0 %	0 %	442555840
18507	NC_020127	TTG	2	6	693751	693756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555840
18508	NC_020127	AAT	2	6	693761	693766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555840
18509	NC_020127	TAC	2	6	693775	693780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555840
18510	NC_020127	A	8	8	693781	693788	100 %	0 %	0 %	0 %	442555840
18511	NC_020127	AAG	2	6	693796	693801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555840
18512	NC_020127	TGAT	2	8	693805	693812	25 %	50 %	25 %	0 %	442555840
18513	NC_020127	TGGA	2	8	693857	693864	25 %	25 %	50 %	0 %	442555840
18514	NC_020127	ATT	2	6	693906	693911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555840
18515	NC_020127	TGG	2	6	693950	693955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555840
18516	NC_020127	TGAT	2	8	693967	693974	25 %	50 %	25 %	0 %	442555840
18517	NC_020127	TATAC	2	10	694013	694022	40 %	40 %	0 %	20 %	442555840
18518	NC_020127	T	7	7	694116	694122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_020127	ATTT	2	8	694124	694131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18520	NC_020127	TAA	2	6	694139	694144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_020127	CTA	2	6	694180	694185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555841
18522	NC_020127	TAA	2	6	694270	694275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555841
18523	NC_020127	AATG	2	8	694372	694379	50 %	25 %	25 %	0 %	442555841
18524	NC_020127	TGCT	2	8	694431	694438	0 %	50 %	25 %	25 %	442555841
18525	NC_020127	TGT	2	6	694486	694491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555841
18526	NC_020127	T	6	6	694497	694502	0 %	100 %	0 %	0 %	442555841
18527	NC_020127	ACA	2	6	694514	694519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555841
18528	NC_020127	A	8	8	694537	694544	100 %	0 %	0 %	0 %	442555841
18529	NC_020127	TACT	2	8	694551	694558	25 %	50 %	0 %	25 %	442555841
18530	NC_020127	TGA	2	6	694561	694566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555841
18531	NC_020127	GCA	2	6	694580	694585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555841
18532	NC_020127	AT	3	6	694654	694659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_020127	C	6	6	694666	694671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18534	NC_020127	A	6	6	694679	694684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_020127	T	6	6	694705	694710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_020127	TAAA	2	8	694724	694731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_020127	CTCCTG	2	12	694740	694751	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18538	NC_020127	ACT	2	6	694752	694757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_020127	GA	3	6	694763	694768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_020127	TAG	2	6	694816	694821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555842
18541	NC_020127	AT	3	6	694885	694890	50 %	50 %	0 %	0 %	442555842
18542	NC_020127	GCA	2	6	694947	694952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555842
18543	NC_020127	ACC	2	6	694997	695002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
18544	NC_020127	ACG	2	6	695006	695011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555842
18545	NC_020127	AACCAT	2	12	695134	695145	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442555842
18546	NC_020127	ACC	2	6	695171	695176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
18547	NC_020127	TAGT	2	8	695181	695188	25 %	50 %	25 %	0 %	442555842
18548	NC_020127	TGG	2	6	695246	695251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555842
18549	NC_020127	GCA	2	6	695277	695282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555842
18550	NC_020127	ACC	2	6	695321	695326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
18551	NC_020127	AAG	2	6	695362	695367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555842
18552	NC_020127	TA	3	6	695377	695382	50 %	50 %	0 %	0 %	442555842
18553	NC_020127	TGG	2	6	695387	695392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555842
18554	NC_020127	ATA	2	6	695432	695437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555842
18555	NC_020127	CAG	2	6	695452	695457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555842
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18557	NC_020127	ACC	2	6	695531	695536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
18558	NC_020127	T	7	7	695560	695566	0 %	100 %	0 %	0 %	442555842
18559	NC_020127	AGA	2	6	695576	695581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555842
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18561	NC_020127	TAT	2	6	695608	695613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555842
18562	NC_020127	A	6	6	695651	695656	100 %	0 %	0 %	0 %	442555842
18563	NC_020127	GGT	2	6	695657	695662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555842
18564	NC_020127	ATT	2	6	695735	695740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555842
18565	NC_020127	CTG	2	6	695749	695754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555842
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18570	NC_020127	ATGT	2	8	696115	696122	25 %	50 %	25 %	0 %	442555842
18571	NC_020127	CCA	2	6	696126	696131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
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18574	NC_020127	AT	3	6	696223	696228	50 %	50 %	0 %	0 %	442555842
18575	NC_020127	AAT	2	6	696231	696236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555842
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18577	NC_020127	TGT	2	6	696314	696319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555842
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18580	NC_020127	CAT	2	6	696493	696498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555842
18581	NC_020127	ACC	2	6	696575	696580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555842
18582	NC_020127	ATAA	2	8	696704	696711	75 %	25 %	0 %	0 %	442555842
18583	NC_020127	TTA	2	6	696768	696773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555842
18584	NC_020127	CTG	2	6	696832	696837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555842
18585	NC_020127	AGTTT	2	10	696902	696911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_020127	TA	4	8	696916	696923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_020127	TACCT	2	10	696927	696936	20 %	40 %	0 %	40 %	442555843
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18590	NC_020127	CAC	2	6	697068	697073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555843
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18592	NC_020127	CTA	2	6	697137	697142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555843
18593	NC_020127	TAA	2	6	697162	697167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555843
18594	NC_020127	CTA	2	6	697221	697226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555843
18595	NC_020127	CTG	2	6	697239	697244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555843
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18601	NC_020127	GCA	2	6	697508	697513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555843
18602	NC_020127	TGT	3	9	697523	697531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555843
18603	NC_020127	TAA	2	6	697543	697548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555843
18604	NC_020127	CTG	2	6	697576	697581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555843
18605	NC_020127	CTG	2	6	697714	697719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555843
18606	NC_020127	A	6	6	697722	697727	100 %	0 %	0 %	0 %	442555843
18607	NC_020127	TTA	2	6	697829	697834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555844
18608	NC_020127	TCT	2	6	697871	697876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555844
18609	NC_020127	TC	3	6	697903	697908	0 %	50 %	0 %	50 %	442555844
18610	NC_020127	TAT	2	6	697944	697949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555844
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18618	NC_020127	GATT	2	8	698324	698331	25 %	50 %	25 %	0 %	442555844
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18995	NC_020127	GAC	2	6	711967	711972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555857
18996	NC_020127	AGATT	2	10	712002	712011	40 %	40 %	20 %	0 %	442555857
18997	NC_020127	CCTG	2	8	712050	712057	0 %	25 %	25 %	50 %	442555857
18998	NC_020127	ACA	2	6	712071	712076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555857
18999	NC_020127	A	7	7	712095	712101	100 %	0 %	0 %	0 %	442555857
19000	NC_020127	ATCT	2	8	712177	712184	25 %	50 %	0 %	25 %	442555857

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